# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01842.fasta.nr -Q ../query/KIAA0354.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0354, 730 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7800974 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8171+/-0.000192; mu= 9.9972+/- 0.011 mean_var=93.8283+/-18.032, 0's: 33 Z-trim: 190 B-trim: 249 in 1/65 Lambda= 0.132406 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|73971833|ref|XP_538734.2| PREDICTED: similar to ( 893) 4627 894.5 0 gi|46577296|sp|O15062.1|ZBTB5_HUMAN RecName: Full= ( 677) 4499 870.0 0 gi|149740983|ref|XP_001504333.1| PREDICTED: simila ( 677) 4368 845.0 0 gi|117306252|gb|AAI26575.1| Zinc finger and BTB do ( 676) 4310 833.9 0 gi|149045801|gb|EDL98801.1| zinc finger and BTB do ( 670) 4182 809.4 0 gi|46577372|sp|Q7TQG0.1|ZBTB5_MOUSE RecName: Full= ( 670) 4170 807.2 0 gi|74213477|dbj|BAE35551.1| unnamed protein produc ( 670) 4160 805.2 0 gi|89271862|emb|CAJ82329.1| zinc finger and BTB do ( 669) 3427 665.2 2.1e-188 gi|133737063|gb|AAI33717.1| Zinc finger and BTB do ( 669) 3423 664.5 3.6e-188 gi|54037972|gb|AAH84205.1| LOC495054 protein [Xeno ( 675) 3395 659.1 1.5e-186 gi|123230172|emb|CAM17791.1| zinc finger and BTB d ( 190) 1187 236.9 5.2e-60 gi|189514583|ref|XP_001337764.2| PREDICTED: simila ( 710) 1060 213.1 2.9e-52 gi|189514578|ref|XP_692878.3| PREDICTED: similar t ( 601) 1031 207.5 1.2e-50 gi|47216116|emb|CAG11184.1| unnamed protein produc ( 701) 943 190.7 1.5e-45 gi|83027605|ref|XP_897297.1| PREDICTED: similar to ( 135) 875 177.2 3.5e-42 gi|47215536|emb|CAG06266.1| unnamed protein produc ( 634) 528 111.4 1e-21 gi|54648443|gb|AAH84912.1| LOC495412 protein [Xeno ( 701) 426 92.0 8.2e-16 gi|126333655|ref|XP_001366786.1| PREDICTED: hypoth ( 475) 406 88.0 8.6e-15 gi|189536012|ref|XP_693378.3| PREDICTED: similar t ( 856) 409 88.8 9.1e-15 gi|29748010|gb|AAH50909.1| zinc finger protein 238 ( 589) 406 88.1 1e-14 gi|114638071|ref|XP_522038.2| PREDICTED: hypotheti ( 572) 404 87.7 1.3e-14 gi|33517138|sp|Q9H5J0.1|ZBTB3_HUMAN RecName: Full= ( 574) 404 87.7 1.3e-14 gi|194218333|ref|XP_001916392.1| PREDICTED: zinc f ( 619) 404 87.7 1.4e-14 gi|73983799|ref|XP_855026.1| PREDICTED: similar to ( 566) 400 86.9 2.2e-14 gi|50417722|gb|AAH77915.1| Bcl6-prov protein [Xeno ( 701) 396 86.3 4.3e-14 gi|170285133|gb|AAI61229.1| Bcl6 protein [Xenopus ( 702) 392 85.5 7.4e-14 gi|148701428|gb|EDL33375.1| zinc finger and BTB do ( 498) 389 84.8 8.4e-14 gi|26339954|dbj|BAC33640.1| unnamed protein produc ( 518) 389 84.8 8.7e-14 gi|46577529|sp|Q91X45.2|ZBTB3_MOUSE RecName: Full= ( 518) 389 84.8 8.7e-14 gi|15214571|gb|AAH12410.1| Zbtb3 protein [Mus musc ( 578) 389 84.9 9.5e-14 gi|194375874|dbj|BAG57281.1| unnamed protein produ ( 487) 387 84.4 1.1e-13 gi|20141020|sp|Q99592.1|ZN238_HUMAN RecName: Full= ( 522) 387 84.4 1.1e-13 gi|158256252|dbj|BAF84097.1| unnamed protein produ ( 531) 387 84.4 1.2e-13 gi|47207137|emb|CAF90716.1| unnamed protein produc ( 544) 386 84.3 1.3e-13 gi|117306258|gb|AAI26551.1| Zinc finger protein 23 ( 531) 385 84.1 1.5e-13 gi|114573557|ref|XP_525117.2| PREDICTED: zinc fing ( 531) 384 83.9 1.7e-13 gi|54311160|gb|AAH36677.2| Zinc finger protein 238 ( 531) 384 83.9 1.7e-13 gi|149040832|gb|EDL94789.1| rCG20176 [Rattus norve ( 531) 383 83.7 2e-13 gi|149749107|ref|XP_001492255.1| PREDICTED: zinc f ( 531) 383 83.7 2e-13 gi|109020035|ref|XP_001103976.1| PREDICTED: simila ( 656) 384 83.9 2e-13 gi|149062303|gb|EDM12726.1| similar to Zbtb3 prote ( 497) 382 83.5 2.1e-13 gi|149062302|gb|EDM12725.1| similar to Zbtb3 prote ( 517) 382 83.5 2.2e-13 gi|20141065|sp|Q9WUK6.1|ZN238_MOUSE RecName: Full= ( 522) 382 83.5 2.2e-13 gi|59889576|ref|NP_001012330.1| zinc finger protei ( 531) 382 83.5 2.2e-13 gi|20140935|sp|Q9JKY3.1|ZN238_RAT RecName: Full=Zi ( 522) 381 83.3 2.5e-13 gi|73961439|ref|XP_547497.2| PREDICTED: similar to ( 531) 379 82.9 3.3e-13 gi|119597503|gb|EAW77097.1| zinc finger protein 23 ( 236) 374 81.7 3.5e-13 gi|32451598|gb|AAH54529.1| Zinc finger protein 238 ( 522) 378 82.7 3.8e-13 gi|197127897|gb|ACH44395.1| putative zinc finger p ( 400) 375 82.1 4.6e-13 gi|28302205|gb|AAH46572.1| MGC53446 protein [Xenop ( 501) 375 82.1 5.4e-13 >>gi|73971833|ref|XP_538734.2| PREDICTED: similar to Zin (893 aa) initn: 4490 init1: 4457 opt: 4627 Z-score: 4775.6 bits: 894.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 4627; 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