# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00116.fasta.huge -Q ../query/KIAA0364.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0364, 1437 aa vs ./tmplib.23147 library 1986068 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9837+/-0.00519; mu= 17.5528+/- 0.354 mean_var=95.8286+/-22.419, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 3 in 1/39 Lambda= 0.131017 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 201 49.6 4.7e-06 KIAA0500 ( 213 res) hg00404 ( 213) 147 38.5 0.0016 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 150 39.9 0.0034 >>KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380 aa) initn: 49 init1: 49 opt: 201 Z-score: 200.6 bits: 49.6 E(): 4.7e-06 Smith-Waterman score: 285; 22.376% identity (50.099% similar) in 505 aa overlap (874-1346:28-509) 850 860 870 880 890 900 KIAA03 KDEGNYSCRTHTEKRPFKWSEPSEPLELVIKEMYPKPFFKTWASPVVTPGARVTFNCSTP .: .: . . .. .:. : .:.::.. 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