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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0379, 1059 aa vs ./tmplib.23147 library 1986446 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8875+/-0.00476; mu= 13.9570+/- 0.323 mean_var=84.4174+/-20.201, 0's: 0 Z-trim: 36 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.139591 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 617 135.5 3.7e-32 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 520 116.2 4e-26 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 500 112.3 8.1e-25 KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180) 393 90.5 1.5e-18 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 382 88.2 6.2e-18 KIAA0957 ( 693 res) hj05670 ( 693) 371 85.8 2.2e-17 KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 ( 578) 366 84.7 4e-17 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 344 80.4 1.1e-15 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 346 81.1 1.3e-15 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 338 79.6 4.4e-15 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 297 71.0 8.8e-13 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 296 71.1 1.4e-12 KIAA0946 ( 667 res) hj04787 ( 667) 288 69.1 2.4e-12 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 285 68.6 4.3e-12 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 284 68.5 5.9e-12 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 281 68.0 1e-11 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 277 66.8 1e-11 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 273 66.5 3.9e-11 KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 265 64.4 5.5e-11 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 264 64.7 1.3e-10 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 252 61.8 3.4e-10 KIAA0172 ( 1366 res) ha02512s1 (1366) 248 61.3 1e-09 KIAA1146 ( 271 res) hg00368 ( 271) 193 49.5 7.3e-07 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 198 51.0 7.5e-07 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 193 50.0 1.5e-06 KIAA1323 ( 396 res) fh13878 ( 396) 187 48.5 2.2e-06 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 190 49.6 3.1e-06 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 175 46.4 1.9e-05 KIAA1386 ( 1214 res) fj06274 (1214) 167 45.0 7.7e-05 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 164 44.2 9.8e-05 KIAA1518 ( 876 res) sh00483 ( 876) 161 43.6 0.00014 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 146 40.6 0.0011 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 144 40.1 0.0013 KIAA1417 ( 1379 res) fh14782 (1379) 144 40.4 0.0021 KIAA0838 ( 677 res) hk03864 ( 677) 137 38.6 0.0034 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 136 38.6 0.0052 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 468 init1: 468 opt: 617 Z-score: 669.1 bits: 135.5 E(): 3.7e-32 Smith-Waterman score: 1022; 32.792% identity (60.709% similar) in 677 aa overlap (59-730:153-774) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 EVRALIFKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAV . :...::. .::.::..:.. ...:. 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KIAA12 AEVNHEDVDGRTALSVAALCVPASKGHASVVSLLIDRGAEVDHCDKDGMTPLLVAAYEGH 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 KIAA03 FSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHL . . ....:: .: :.:: ::: :: .:: ..:::. :: KIAA12 VDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAA-------------- 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 KIAA03 AALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECLNLLLNTGADFNKKDKFG .:. :. ::: : :.: ::.: . ::. : : :..: : KIAA12 -------------------VDSIDSEGRTVLSIASAQGNVEVVRTLLDRGLDENHRDDAG 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 KIAA03 RSPLHYAAANCNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYAATSDTDGKCLEYLLRNDANP .:::.:: . . ::. .:: .:..:. : :. :... :.. ::.: .: KIAA12 WTPLHMAAFEGHRLICEALIEQGARTNEIDNDGRIPF-ILASQEGHYDCVQILLENKSNI 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 KIAA03 GIRDKQGYNAVHYSAAYGHRLCLQLIASETPLDVLMETSGTDM-LSDSDNRATISPLHLA : .: ::.. .: ::: ..:. :. :.:. .:.:.: : :.. KIAA12 DQRGYDGRNALRVAALEGHRDIVELLFSH----------GADVNCKDADGRPT---LYIL 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 KIAA03 AYHGHHQALEVLVQSLLDLDVRNSSGRTPLDLAAFKGHVECVDVLINQGASILVKDYILK : ... : .... .... .. ::: : .. ..::.: :.::: :.. . : : KIAA12 ALENQLTMAEYFLENGANVEASDAEGRTALHVSCWQGHMEMVQVLIAYHADVNAADN-EK 620 630 640 650 660 670 630 640 650 660 670 680 KIAA03 RTPIHAAATNGHSECLRLLIGNAEPQNAVDIQDGNGQTPLMLSVLNGHTDCVYSLLNKGA :. ...:: .:: . ..::: : .:: ..: : : ... .:: : : ::..:: KIAA12 RSALQSAAWQGHVKVVQLLI---EHGAVVDHTCNQGATALCIAAQEGHIDVVQVLLEHGA 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 KIAA03 NVDAKDKWGRTALHRGAVTGHEECVDALLQHGAKCLLRDSRGRTPIHLSAACGHIGVLGA . . :..::::.. .: .:: . . : ..::. : .. . .:.: KIAA12 DPNHADQFGRTAMRVAAKNGHSQIIKLLEKYGASSL--NGCSPSPVHTMEQKPLQSLSSK 730 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 KIAA03 LLQSAASMDANPATADNHGYTALHWACYNGHETCVELLLEQEVFQKTEGNAFSPLHCAVI KIAA12 VQSLTIKSNSSGSTGGGDMQPSLRGLPNGPTHAFSSPSESPDSTVDRQKSSLSNNSLKSS 790 800 810 820 830 840 >>KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777 aa) initn: 641 init1: 391 opt: 520 Z-score: 561.0 bits: 116.2 E(): 4e-26 Smith-Waterman score: 565; 28.571% identity (56.190% similar) in 525 aa overlap (95-616:26-521) 70 80 90 100 110 120 KIAA03 LLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANK :...::.. ::. :.. :::: ::: . 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KIAA12 GTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRN-PN 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 KIAA03 VNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTL ::. .:::.: : ... .:. : ....:. .. :..:.: : :.: :: .. .: KIAA12 VNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRAL 240 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 KIAA03 ITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNL . . :: :: . :. :. .: . : .:. . : . :.: : :. :. KIAA12 LQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNI 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 KIAA03 ECLNLLLNTGADFNKKDKFGRSPLHYAAANCNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYA : ..:::. :: . :: : .::: .:. : . .. .: : .: KIAA12 EVVELLLDKGAKVSAVDKKGDTPLH-----------IAIRGRSRKLAELLLR--NP---- 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 KIAA03 ATSDTDGKCLEYLLRNDANPGIRDKQGYNAVHYSAAYGHRLCLQLIASETPLDVLMETSG ::. : . .: : . ... . .: : .: .:: :.: KIAA12 ----KDGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSI-LTQIFGAR---HLSPTETDGDMLGYDLY 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 KIAA03 TDMLSDSDNRATISP---LHLAAYHGHHQALEVLVQSLLDLDVRNSSGRTPLDLAAFKGH .. :.: .. :..: . : : : ... :...: : .... .:. : :. KIAA12 SSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSF--LLKKLED-EMKTFAGQQIEPLFQFSWL 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 660 KIAA03 VECVDVLINQGASILVKDYILKRTPIHAAATNGHSECLRLLIGNAEPQNAVDIQDGNGQT . . .:. : ..: KIAA12 IVFLTLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFFIVIYFGGRREGESWNWAWVL 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486 aa) initn: 1258 init1: 313 opt: 500 Z-score: 537.4 bits: 112.3 E(): 8.1e-25 Smith-Waterman score: 817; 26.673% identity (53.346% similar) in 1091 aa overlap (2-973:108-1176) 10 20 30 KIAA03 GAEATAMAFLKLRDQPSLVQAIFNGDPDEVR ::.:: : :. ::..: .:: . :: KIAA06 AFADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMRAESTANA--GQSDNRSLAEACSEGDVNAVR 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 90 KIAA03 ALIFKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKW-LTPLHRAVAS :... ..:: . .: .. : : : :. ..:. : :. . : .: : :. . KIAA06 KLLIEGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGIKGDITSLMAAANG 140 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 KIAA03 CSEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTAL . :..:: :.:::::.... .: : : :. : ...:. .... .. :.: : KIAA06 GHVKIVKLLLAHKADVNAQSSTGNTALTYACAGGYVDVVKVLLESGASIEDHNENGHTPL 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 KIAA03 HHAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRR-AIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKD .:. .:: :...::: ::.::. ... .. :. : : ::.:.:..:. ::. : KIAA06 MEAGSAGHVEVARLLLENGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLEMVRFLLEAGADQEHKT 260 270 280 290 300 310 210 220 230 240 250 260 KIAA03 KKSYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGA . .: : : .: . :.. ::: :...: : ..:: .: .:. .. ::. :: KIAA06 DEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGA 320 330 340 350 360 370 270 280 290 300 310 320 KIAA03 IVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGK-TPLHMTALHGRFSRS ... :..:.::: :: : . . ::.:.::..: .... . : : .. : . . KIAA06 SLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEM-VALLLGQGANINAQTEETQETALTLACCGGFLEVA 380 390 400 410 420 430 330 340 350 360 370 380 KIAA03 QTIIQSGAVID--CEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAA . .:..:: :. : .::: ::. :: :.. :...::.. : : : KIAA06 DFLIKAGADIELGC-----STPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYAC 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 440 KIAA03 LSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECLNLLLNTGADFNKKDKFG-R .: .: ::..: :.. .. ::: : :: .:.. ...:.. ::. :. . . KIAA06 ENGHTDVADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHVCTVQFLISKGANVNRTTANNDH 490 500 510 520 530 540 450 460 470 480 490 KIAA03 SPLHYAAANCNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYAATSD-TDGKC--LEY---LLR . : : :. . . :.. ::. . . : : : :: . :. : :.: :: KIAA06 TVLSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTSVVCYLLDYPNNLLS 550 560 570 580 590 600 500 510 520 KIAA03 -------------NDANPGIR---------------DKQGYNA-----VHYSAAYGHRLC .: : . : :: :. .. .:: .. KIAA06 APPPDVTQLTPPSHDLNRAPRVPVQALPMVVPPQEPDKPPANVATTLPIRNKAASKQKSS 610 620 630 640 650 660 530 540 550 560 KIAA03 LQL----------IASETPLDVLMETSGTDMLSDSDNR--------ATISPLHLA----- .: :....: ... :..: :.. ..: : .. :.:: KIAA06 SHLPANSQDVQGYITNQSPESIVEEAQGK--LTELEQRIKEAIEKNAQLQSLELAHADQL 670 680 690 700 710 720 570 580 590 600 KIAA03 --------------AYHGHHQALEVL--VQSLLDLDVRNSSGRTPLDLAAFKGHVE---- . ... :: : :. :.: .... . :.. : . ... KIAA06 TKEKIEELNKTREEQIQKKQKILEELQKVERELQLKTQQQLKKQYLEVKAQRIQLQQQQQ 730 740 750 760 770 780 610 620 630 640 KIAA03 --C--VDVL--INQGASILVKDY---------ILKRTPIHAAATNGHSECLRLLIGNAEP : . .: .. : .. :: .:: : ..:: : . : . .: : KIAA06 QSCQHLGLLTPVGVGEQLSEGDYARLQQVDPVLLKDEPQQTAAQMGFAPIQPLAMPQALP 790 800 810 820 830 840 650 660 670 680 690 KIAA03 QNAVDIQDGN------------GQTPLMLSVLNGHTDCVYSLLNKGANVDAKDKWGRTAL : . :. :: : . : : . . . ..: : . . .: KIAA06 LAAGPLPPGSIANLTELQGVIVGQPVLGQAQLAGLGQGILTETQQGLMVASPAQTLNDTL 850 860 870 880 890 900 700 710 720 730 740 750 KIAA03 HR-GAVTGHEECVDALLQHGAKCLLRDSRGRTPIHLSAACGHIGVLGALLQSAASMDANP ::.:. .. :. . . . :: . . .:.: ..: . KIAA06 DDIMAVSGRASAMSNTPTHSIAASISQPQTPTPSPIISP-------SAMLPIYPAIDIDA 910 920 930 940 950 960 760 770 780 790 800 810 KIAA03 ATADNHGYTALHWACYNGHETCVELLLEQEV-FQKTEGNAFSPLHCAVINDNEGAAEMLI : .:: ::: :: .::: :. :::. . ... . ..:.:: :. . :..:.:. KIAA06 QTESNHD-TALTLACAGGHEELVQTLLERGASIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILL 970 980 990 1000 1010 820 830 840 850 860 870 KIAA03 DTLGASIVNATDSKGRTPLHAAAFTDHVECLQLLLSHNAQVNSVDSTGKTPLMMAAENGQ :. ::.: .. ::: : . : ..:::...:. . . . ::: .:: .: KIAA06 DN-GADIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVELLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGY 1020 1030 1040 1050 1060 1070 880 890 900 910 920 930 KIAA03 TNTVEMLVSSASAELTLQDNSK--NTALHLACSKGHETSALLILEKITDRNLINATNAAL .: ...:.. :.::.. . .:: . : :: .:: ... :.:. .: : :: KIAA06 VNIIKILLN-AGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHTAAVKLLLDMGSDINAQIETNR-- 1080 1090 1100 1110 1120 1130 940 950 960 970 980 990 KIAA03 QTPLHVAARNGLTMVVQELLGKGASVLAVDENGYTPALACAPNKDVADCLALILATMMPV .: : .: .: : ::. :: . :.: ..: :: . : KIAA06 NTALTLACFQGRTEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKGADVN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 SSSSPLSSLTFNAINRYTNTSKTVSFEALPIMRNEPSSYCSFNNIGGEQEYLYTDVDELN KIAA06 APPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLIGRGAHIDVRNKKGNTPLWLAANGGHLDVVQLL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180 aa) initn: 443 init1: 233 opt: 393 Z-score: 424.9 bits: 90.5 E(): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 393; 37.387% identity (65.766% similar) in 222 aa overlap (65-282:111-330) 40 50 60 70 80 90 KIAA03 FKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEE : . : :: :: ::::.:. . .. KIAA02 GGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKD 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA03 AVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALV---PLLSNVNVSDRAGRTALH .:.:::...: .:. :.. :::.:: . .. .. :. : . :: .. ..:::: KIAA02 VVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALH 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA03 HAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVS-HGAEVTCKDK :: :: :.::.:: . .. . ..: . . :: .:..::::.:.. : ..:. : KIAA02 CAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTK 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 KIAA03 KSYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAI : .:::: :: .: .::. ::: :.: : . .:.. :: : :. ::. :. :. KIAA02 K-HTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMGSA-LHEAALFGKTDVVQILLAAGTD 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA03 VNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQT :: :...:.: : KIAA02 VNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSI 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1334 ( 989 res) fh15842 (989 aa) initn: 770 init1: 365 opt: 382 Z-score: 413.9 bits: 88.2 E(): 6.2e-18 Smith-Waterman score: 382; 31.278% identity (65.198% similar) in 227 aa overlap (84-309:32-258) 60 70 80 90 100 110 KIAA03 AAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQVLL-KHSADVNARDKN : .:: . . : : :: :..:... .:.. KIAA13 FGRLNALNMKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSE 10 20 30 40 50 60 120 130 140 150 160 170 KIAA03 WQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLLSRGANI .: .:.:::. :.: .... .:...: .:..::: :: ..: : .. ::. KIAA13 GKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPA 70 80 90 100 110 120 180 190 200 210 220 230 KIAA03 NAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSYTPLHAAASSGMISVVKYLL .. :.. . :.:.:: .: ...:..: : . .. :: . :: :...: . ..:: KIAA13 ESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLL 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 KIAA03 DLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGA : :.:.: : : : : .:: :.. .:. :: :: .: . :.. ::.. : ... KIAA13 DHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAG 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 KIAA03 LCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIA . :: . :...:. KIAA13 IQSLLLSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPR 250 260 270 280 290 300 >>KIAA0957 ( 693 res) hj05670 (693 aa) initn: 529 init1: 355 opt: 371 Z-score: 403.8 bits: 85.8 E(): 2.2e-17 Smith-Waterman score: 399; 33.740% identity (61.382% similar) in 246 aa overlap (186-430:18-260) 160 170 180 190 200 210 KIAA03 SGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSYTP ::: :. : : :...::.:. :.. :: KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVAVT-KHGRTP 10 20 30 40 220 230 240 250 260 270 KIAA03 LHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKN :: ::..: . ::. :: : :.. . .: :: : :. .. :: : ..... KIAA09 LHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCALDRQD 50 60 70 80 90 100 280 290 300 310 320 330 KIAA03 EKGFTPLHFAAASTHG-ALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQS . : : :: :: :: . .::: ::.: :.: :.: ::.. ... . ..... . KIAA09 KDGNTALH--EASWHGFSQSAKLLVKAGANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLLLA 110 120 130 140 150 160 340 350 360 370 380 390 KIAA03 GAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCC :. : ... :.: ::.::::.: .: :.:. .. ... : ::.:: . . KIAA09 GSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALNHKKVA 170 180 190 200 210 220 400 410 420 430 440 450 KIAA03 RKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECLNLLLNTGADFNKKDKFGRSPLHYAAAN . :: .: : .. :.: :..: .: : :: KIAA09 KILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVALLLTKAPQGSVSAGDTPSSEQAVARKE 230 240 250 260 270 280 460 470 480 490 500 510 KIAA03 CNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYAATSDTDGKCLEYLLRNDANPGIRDKQGYNA KIAA09 EAREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFSDPTPPADQQPGHQKNLHAHNHPKKRNRHR 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 (578 aa) initn: 578 init1: 183 opt: 366 Z-score: 399.3 bits: 84.7 E(): 4e-17 Smith-Waterman score: 366; 29.832% identity (59.664% similar) in 238 aa overlap (149-384:82-312) 120 130 140 150 160 170 KIAA03 IAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKK :: .:.. . .: :. .:. .. . .. KIAA08 EQDLQHRKRKHERKRSTGGRRKKVSFEASVALLEASLRNDAEEVRYFLKNKVSPDLCNED 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 KIAA03 DRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDM :.: . :.::::.::::.:. ::.. .:::::::. : :..:: :.. :.:. KIAA08 GLTALHQCCIDNFEEIVKLLLSHGANVNAKDNELWTPLHAAATCGHINLVKILVQYGADL 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 290 KIAA03 NEPNAYGNTPLHVACYNGQ--DVVVNELIDCGAIVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLE :. :: : . : . ::. . . : .. :: .: . :. : :. KIAA08 LAVNSDGNMPYDL-CEDEPTLDVIETCMAYQGITQEKINEMRVAPEQQMIADIH---CM- 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 KIAA03 LLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYG .. : :.. . .: : ::... .: . .. ... :. .: .: .: ::: :: .: KIAA08 --IAAGQDLDWIDAQGATLLHIAGANGYLRAAELLLDHGVRVDVKDWDGWEPLHAAAFWG 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 KIAA03 HELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLH . . . :.. ::. . : .:. : KIAA08 QMQMAELLVSHGASLSARTSMDEMPIDLCEEEEFKVLLLELKHKHDVIMKSQLRHKSSLS 290 300 310 320 330 340 >>KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 (803 aa) initn: 672 init1: 320 opt: 344 Z-score: 373.6 bits: 80.4 E(): 1.1e-15 Smith-Waterman score: 400; 33.071% identity (62.205% similar) in 254 aa overlap (11-257:353-603) 10 20 30 KIAA03 GAEATAMAFLKLRDQPS-LVQAIFNGDPDEVRALIFKKED ::: .:. : . .:. ..: .. : KIAA18 LGRPTPGLSQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGID 330 340 350 360 370 380 40 50 60 70 80 90 KIAA03 VNFQ--DNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQ ::. ..::.:::::: : ..: ..:. .:: ... . ::: .:. . :::. KIAA18 PNFKMEHQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVK 390 400 410 420 430 440 100 110 120 130 140 150 KIAA03 VLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSN----VNVSDRAGRTALHHA :.: .: :. .: . .: ::.:: . :.. :::: :: .: .: : . : KIAA18 YLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHY---EVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWA 450 460 470 480 490 160 170 180 190 200 210 KIAA03 AFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSY . : ..::::::.:..:: :... .::::. : ......:.. .. . .. KIAA18 TEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGD 500 510 520 530 540 550 220 230 240 250 260 270 KIAA03 TPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQ .::: :: . . : .:. :.. : :.:::. : :.: KIAA18 SPLHIAARENRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAP 560 570 580 590 600 610 280 290 300 310 320 330 KIAA03 KNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQ KIAA18 DRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNCVTSPMNIDRNITHLQ 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644 aa) initn: 573 init1: 305 opt: 346 Z-score: 372.0 bits: 81.1 E(): 1.3e-15 Smith-Waterman score: 453; 33.046% identity (56.609% similar) in 348 aa overlap (56-385:692-1034) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 DPDEVRALIFKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLH : .... .::::.:: :: . :. KIAA17 TGISSSHLQALWIGYSTEGLSAALASLRNLYTPNVKVSRLLILGGANVNYR----TEVLN 670 680 690 700 710 90 100 110 120 130 KIAA03 RAVASC------SEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNV : : ::.: .::. .: ... ..: .: : ::: .: . :. : KIAA17 NAPILCVQSHLGHEEVVTLLLEFGACLDGTSENGMTALCYAAAAGHMKLVCLLTKKGVRV 720 730 740 750 760 770 140 150 160 170 180 190 KIAA03 NVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLL----SRGANINAFDKKD---RRAIHWAAYMGHI . :. :. :: :.:. :::.... :: : : . .:. ..:. :: ::: KIAA17 DHLDKKGQCALVHSALRGHGDILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHS 780 790 800 810 820 830 200 210 220 230 240 KIAA03 EVVKLLVS----HGAEVTCKDKK-SYTPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNT ::. :.. : .::. : . : : :::. : . : . :: :. ... : : KIAA17 SVVQCLLGMEKEHEVEVNGTDTLWGETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVP 840 850 860 870 880 890 250 260 270 280 290 300 KIAA03 PLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNM :: : .:. .: :.. : :: ....: ::: :: : . .:.:...:: .. KIAA17 PLFCAARQGHWQIVRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLST-VEFLLSKGAALSS 900 910 920 930 940 950 310 320 330 340 350 360 KIAA03 KSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITS .:.: . : . :.:. . : ... ::.:: :::: ::: .:: :: . :. . KIAA17 LDKEGLSALSWACLKGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEK 960 970 980 990 1000 1010 370 380 390 400 410 420 KIAA03 GADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECL :: . :: :: : KIAA17 GAVIEHVDHSGMRPLDRAIGCRNTSVVVALLRKGAKLGNAAWAMATSKPDILIILLQKLM 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864 aa) initn: 567 init1: 327 opt: 338 Z-score: 362.6 bits: 79.6 E(): 4.4e-15 Smith-Waterman score: 501; 30.404% identity (56.770% similar) in 421 aa overlap (56-453:733-1144) 30 40 50 60 70 80 KIAA03 DPDEVRALIFKKEDVNFQDNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKWLTPLH : . .. .::::.:: .: . :. KIAA16 VGVSSSILQGLWISYSTEGLSMALASLRNLYTPNIKVSRLLILGGANINYRTEV----LN 710 720 730 740 750 90 100 110 120 130 KIAA03 RAVASCSE------EAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNV : : . : : .::. .:.:.: ... ::: ::: .. . : ..: KIAA16 NAPILCVQSHLGYTEMVALLLEFGANVDASSESGLTPLGYAAAAGYLSIVVLLCKKRAKV 760 770 780 790 800 810 140 150 160 170 180 190 KIAA03 NVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLLS-----RGANINAFDKKD--RRAIHWAAYMGHI . :. :. :: :::. :: :.::.:.. : . ..: :. ..:. :: ::. KIAA16 DHLDKNGQCALVHAALRGHLEVVKFLIQCDWTMAGQQQGVFKKSHAIQQALIAAASMGYT 820 830 840 850 860 870 200 210 220 230 240 KIAA03 EVVKLLVS----HGAEVTCKDKKSY------TPLHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPN :.:. :.. :: . .:. : : :::. : . : . ::. :. . .:: KIAA16 EIVSYLLDLPEKDEEEVERAQINSFDSLWGETALTAAAGRGKLEVCRLLLEQGAAVAQPN 880 890 900 910 920 930 250 260 270 280 290 300 KIAA03 AYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKNEKGFTPLHFAAASTHGALCLELLVGNG : .:: . .:. .:. :. :: ::. ...: ::: .::. : . ...:...: KIAA16 RRGAVPLFSTVRQGHWQIVDLLLTHGADVNMADKQGRTPLMMAASEGHLGT-VDFLLAQG 940 950 960 970 980 990 310 320 330 340 350 360 KIAA03 ADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVIDCEDKNGNTPLHIAARYGHELLIN :.. . .:.: : : . :.:..: ......::. : :::: ::: .:: :: ... KIAA16 ASIALMDKEGLTALSWACLKGHLSVVRSLVDNGAATDHADKNGRTPLDLAAFYGDAEVVQ 1000 1010 1020 1030 1040 1050 370 380 390 400 410 420 KIAA03 TLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLSSGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGG :. :: . :: :: :. .. ::..: : : .. . .. KIAA16 FLVDHGAMIEHVDYSGMRPLDRAVGCRNTSVVVTLLKKGAKIG-PATWA---MATSKPDI 1060 1070 1080 1090 1100 1110 430 440 450 460 470 480 KIAA03 NLECLNLLLNTGADFNKKDKFGRSPLHYAAANCNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLH . :. :.. : : :: : .. .: : KIAA16 MIILLSKLMEEGDMFYKKGKVKEAAQRYQYALKKFPREGFGEDLKTFRELKVSLLLNLSR 1120 1130 1140 1150 1160 1170 490 500 510 520 530 540 KIAA03 YAATSDTDGKCLEYLLRNDANPGIRDKQGYNAVHYSAAYGHRLCLQLIASETPLDVLMET KIAA16 CRRKMNDFGMAEEFATKALELKPKSYEAYYARARAKRSSRQFAAALEDLNEAIKLCPNNR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1059 residues in 1 query sequences 1986446 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:07 2008 done: Thu Dec 18 15:19:08 2008 Total Scan time: 0.690 Total Display time: 0.350 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]