# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00518.fasta.huge -Q ../query/KIAA0380.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0380, 1539 aa vs ./tmplib.23147 library 1985966 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8802+/-0.00792; mu= -1.9610+/- 0.532 mean_var=380.3973+/-91.073, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.065759 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443) 1687 175.3 7.5e-44 KIAA0651 ( 1114 res) sj09778 (1114) 537 66.1 4.4e-11 KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050) 515 64.0 1.8e-10 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 412 54.4 2.1e-07 KIAA0720 ( 1091 res) hk01741s1 (1091) 407 53.8 2.3e-07 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 290 42.5 0.00042 KIAA2016 ( 1715 res) pf04366 (1715) 257 39.8 0.0058 >>KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443 aa) initn: 1597 init1: 621 opt: 1687 Z-score: 879.1 bits: 175.3 E(): 7.5e-44 Smith-Waterman score: 2115; 32.532% identity (61.323% similar) in 1497 aa overlap (94-1472:1-1432) 70 80 90 100 110 120 KIAA03 CVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVV :::.:::. ::::::::::.::.:.::::: KIAA03 AAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVV 10 20 30 130 140 150 160 170 180 KIAA03 KLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGP ::::::.:::::. : :.: : ... :. ... .. :: : .:::.: KIAA03 KLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSP 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 KIAA03 KPLQDPE--VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----PSEGRLSLD---- . . . :... ..:::.::..:...:: . :. : .:: .:.. . 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KIAA03 T-GLQSPDRDLGLESTL--ISSKPQS--HSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLK 1080 1090 1100 1110 1120 1200 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA03 GIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDD . . ..:.: :. : : .::... :..:.. .: . ...:: : KIAA03 EVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL----GLTEKSVQE---D 1130 1140 1150 1160 1170 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA03 LTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTR : .... : . .. ..:. .. .: ::. : . : . . ::: KIAA03 WQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTGDIATCY-SPRTS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA03 NSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQ---------S . .. .:. . .:: .:..... ... :. . .: .::. : KIAA03 TESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHS 1240 1250 1260 1270 1280 1370 1380 1390 1400 KIAA03 EPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA------PMSP-PQ . .: : .:.. . .:: :. . . : .::::. : ::. : KIAA03 DENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPA 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1410 1420 1430 1440 KIAA03 PDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPSLALRDVGMIFHT .: : :: . : .: : .:: : : . ..:.. 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KIAA06 HNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYP---SD-SFR 210 220 230 240 250 260 660 670 680 690 700 710 KIAA03 AAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPS---LGFCTDTL-LPHL . ..: .:. : ..:.:: .. . .: .: : : : : :.. . :: . : KIAA06 QSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESP-LGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESL 270 280 290 300 310 720 730 740 750 760 KIAA03 LEDDLGQ---LSDLE-PEPD--AQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHL ..... .::.: : : :..:. .: .. . .. . .:.:: ::. :: :. KIAA06 IDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHV 320 330 340 350 360 370 770 780 790 800 810 820 KIAA03 RTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREEG--P---- :::... .: : .: . . ::: . :: .::. . . . :... : KIAA06 RTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTR 380 390 400 410 420 430 830 840 850 860 870 KIAA03 --IIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAES .:....::....:.::. :.. .. ..::: .: ::.: : ...::: :.... KIAA06 NFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVTR 440 450 460 470 480 490 880 890 900 910 920 930 KIAA03 HPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNE .: ... :. ::.::::::. :..:..: :.. : : .:.:. :.: KIAA06 PAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVDE 500 510 520 530 540 550 940 950 960 970 980 990 KIAA03 AVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAE--FKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDK .. : :. ::. .:.: ::..:. .. : .: ::.::.: : :. . . KIAA06 GIYQLEKGARLQEIYNRMDP----RAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTATGR 560 570 580 590 600 610 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 TLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDK :. :::. :.::.::..:.: .. .: .: ..:. ...:..:... KIAA06 FKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSV------------VSLQNLIVRDIANQE 620 630 640 650 660 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA03 RAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGP- ...:.: .. ::..::. . . .:..::.......::. :. .:. KIAA06 KGMFLISAA---PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTC---PSREDFPLIETEDEAY 670 680 690 700 710 1120 1130 1140 1150 KIAA03 -REPAQQGPTPSR--VEL--DDSDVF----HGEPEPE--------ELPGGTGSQQRVQG- :. .. .: ::: . .: : . : . :: : .. ... KIAA06 LRRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESP 720 730 740 750 760 770 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA03 KHQVLLEDP--EQEGSAEEE-----ELGVLP-CPSTSLDGENRGIR----TRNPIHLAFP . . ::.: : :: . :: . : :. :. .. : : : .: KIAA06 RGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFN 780 790 800 810 820 830 1210 1220 1230 1240 1250 KIAA03 GPLFM-EGLADSALEDV----------ENLRHLI-LWSLLPGHTMETQAAQEP---EDDL : . . .. .::. .: : :..:. :..:: : ... .::. : . 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KIAA06 ELGSPEERLQDSSDPDTGSEEEGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA03 TTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASP >>KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050 aa) initn: 441 init1: 262 opt: 515 Z-score: 279.8 bits: 64.0 E(): 1.8e-10 Smith-Waterman score: 648; 26.766% identity (54.755% similar) in 736 aa overlap (604-1306:11-670) 580 590 600 610 620 630 KIAA03 PVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIR-LGRSESL : : :. : ::.: . : .: . : KIAA05 WRRAACGRSGRASLKEHPRGTLLSDGSPALSRNVGMTVSQ 10 20 30 40 640 650 660 670 680 KIAA03 KGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEA-TRLHQSASSSTSSLSTRSLENP--TPPFT :: . : . .. . .:: : : ...:.:..: : :.. . :. :.: KIAA05 KGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEMDEADSAFLKFKQTADDSLS-LTSPNTESIFVEDPYT 50 60 70 80 90 690 700 710 720 730 740 KIAA03 PKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQRE .. : ::: . : .: :..:. .: . : .:: KIAA05 ASL-RSEIESDG----------HEFE--------------AESWSLAVDA-AYAKKQKRE 100 110 120 130 750 760 770 780 790 800 KIAA03 I-DRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNS . ::.:. ::. ::. :.:::... .. . ...: . . ..:::: .:.: :. KIAA05 VVKRQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSH 140 150 160 170 180 190 810 820 830 840 850 860 KIAA03 WCEAMKKLR----EEGP----IIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELI . .:. : ::: .:..:.::.. .:.: :.... . ::: .. :. KIAA05 FLARLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHY 200 210 220 230 240 250 870 880 890 900 910 920 KIAA03 KTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEH : .....:: .... . ::: ... :. ::.::::.:.: ::..::.:: .. KIAA05 KLLLQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDY 260 270 280 290 300 310 930 940 950 960 970 980 KIAA03 EKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTT : : .: . ..:.. :. :.. :. .::. ..: . . .: :. :.. :. KIAA05 EDLTQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLT--FRKEDMLQ 320 330 340 350 360 370 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 RKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFS :.. :: : :. .. . :. ..:: :.:.:::..:.: .. .: ::: KIAA05 RQLHLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVF--------ASVDSK---P 380 390 400 410 420 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA03 PVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATR ::..:. ...: ::....:.:.: .: :: ..::. . .. :.:.:: ...::.. KIAA05 PVISLQKLIVREVANEEKAMFLISASLQGP-EMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESC-- 430 440 450 460 470 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA03 HPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKH : : : : .. ..: : :. : . .:. .. :. KIAA05 -PDEEEGPFSLP-----EEERKVVEARATRLRD---FQ---ERLSMKDQLIAQSLLE-KQ 480 490 500 510 520 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA03 QVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLDGENRGI-RTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSAL :. :: :. :. :. :: : ::. : .: . .. : :... ::. KIAA05 QIYLEMAEM-GGLED-----LPQP--------RGLFRGGDPSE-TLQGELILK----SAM 530 540 550 560 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA03 EDVENLRHLILWSL--LPGHTMETQAAQEPED--------DLTPTPS--------VISVT ..:... :: : :.. . .. : : : .:. : :. KIAA05 SEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKKKVSSTD 570 580 590 600 610 620 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA03 SHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQ-EDMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPEL .: : .: ..: .: ... : : :. : : : .:: KIAA05 PRPRDWRGPPNSPDLKLSD-SDIPGSSEESPQVVEAPGTESDPRLPTVLESELVQRIQTL 630 640 650 660 670 680 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA03 DRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPPEVEGGTKATGNCFYV KIAA05 SQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNLLLEQERQRNFEKQREERAA 690 700 710 720 730 740 >>KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676 aa) initn: 409 init1: 252 opt: 412 Z-score: 224.6 bits: 54.4 E(): 2.1e-07 Smith-Waterman score: 412; 26.943% identity (61.658% similar) in 386 aa overlap (722-1094:1164-1521) 700 710 720 730 740 750 KIAA03 MGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREID .: .: .:.: . ... . : KIAA12 NVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDP---SQQW--CADLQTLDTMQPIERK 1140 1150 1160 1170 1180 760 770 780 790 800 810 KIAA03 RQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCE :: :.::. :: .. :... .: .:: . ... . :.: .: : ::: ... . 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KIAA07 PALERVDAQSRRESLDILAPGRRRKNMSEFLGEA-SIPGQEPPTPSSCSLPSGSSGSTNS 270 280 290 300 310 320 660 670 680 690 700 KIAA03 MDAAAE--ATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIES-PSLG----FCTDT :. . :.:. ::. :. . . . :. :. . : : : :. KIAA07 GDSWKNRAASRFSGFFSSGPSTSAFGREVDKMEQLEGKLHTYSLFGLPRLPRGLRFDHDS 330 340 350 360 370 380 710 720 730 740 750 760 KIAA03 LLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLR . ::. . . :. : ..:.. . : ::.:. .::.. ::. ::::..: KIAA07 WEEEYDEDEDEDNACLRLE---DSWRELI--DGHEKLTRRQCHQQEAVWELLHTEASYIR 390 400 410 420 430 770 780 790 800 810 820 KIAA03 TLRVLDLIFY---QRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNS-WCEAM----KKLREEG :::. .: ... .:. . : ::: :.::. ..: : .: .: :. 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KIAA07 -----QEPPGSQQPLQS------LEEEEDEQEEEEEEEEEEEEGEDSGTSAASSPTIMRK 780 790 800 810 820 1170 1180 1190 1200 KIAA03 D---PEQE-----GSAEEEELGVL-PC-----------PSTSLDGE---NRGIRTRNPIH . :... ::.: . :. : : .: . : . . .: KIAA07 SSGSPDSQHCASDGSTETLAMVVVEPGDTLSSPEFDSGPFSSQSDETSLSTTASSATPTS 830 840 850 860 870 880 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA03 LAFP-GPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVT .: :: ..: . : .: : ... : . . ::. .:.: : KIAA07 ELLPLGP--VDGRSCSMDSAYGTLSPTSLQDFVAPGPMAELVPRAPESPRVPSPPP-SPR 890 900 910 920 930 940 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA03 SHPWDPGSPGQAPPG-----GEGDNTQL---AGLEGE--RPEQEDMGLCSLEHLPP-RTR . : . . :: .:.. :: :: .: : . :: : ::. KIAA07 LRRRTPVQLLSCPPHLLKSKSEASLLQLLAGAGTHGTPSAPSRSLSELCLAVPAPGIRTQ 950 960 970 980 990 1000 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA03 NSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGS--KVVPALPESGQSEPGPPEVE .: .: : . : : .. : .: ::: : :: :: : :: KIAA07 GSPQEAGPSWD---CRGAPSPGSGPGLVGCLAGEPAGSHRKRCGDLP-SGASPRVQPEPP 1010 1020 1030 1040 1050 1370 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA03 GGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS :..: KIAA07 PGVSAQHRKLTLAQLYRIRTTLLLNSTLTASEV 1060 1070 1080 1090 >>KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 (846 aa) initn: 168 init1: 101 opt: 290 Z-score: 165.5 bits: 42.5 E(): 0.00042 Smith-Waterman score: 302; 24.512% identity (52.495% similar) in 461 aa overlap (726-1161:394-819) 700 710 720 730 740 750 KIAA03 SIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQH---TVGKDVVAGLTQREIDR : : ::. . .. .. :. .: KIAA09 AVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRM 370 380 390 400 410 420 760 770 780 790 800 810 KIAA03 QEVINELFVTEASHLRTLRVL-DLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCE :: . :. ..:::.::.::.: : . .. ...: ::.. :: :. .. . . . KIAA09 QESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDH-HTLFSNVQRVQGVSERFLA 430 440 450 460 470 480 820 830 840 850 860 870 KIAA03 AMKKLREEGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQ .. . . .: :... :.. :. :: .. : : .:: : . . . ::. 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KIAA20 HRQTVKQGSPTKDIEIQFQRL---RISEDPDV-----HPEAEQQPG--PESGEGQKG--- 1590 1600 1610 1620 1630 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA03 GLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRT-RNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAE ::.:. .: ... : :. : . .. :. . :..: .:. . : . : KIAA20 ---GEQPKLVRGHFCPIKRKANSTKRDRGTLLKAQI-RHQSLDSQSENATIDLNSVLERE 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA03 VAGSKVVPALPESGQSEPGPPEVEGGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPD . .... .. : KIAA20 FSVQSLTSVVSEECFYETESHGKS 1700 1710 1539 residues in 1 query sequences 1985966 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:19:10 2008 done: Thu Dec 18 15:19:11 2008 Total Scan time: 0.850 Total Display time: 0.480 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]