# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00733.fasta.nr -Q ../query/KIAA0384.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0384, 967 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826009 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6143+/-0.00019; mu= 12.2707+/- 0.011 mean_var=83.5487+/-16.534, 0's: 35 Z-trim: 45 B-trim: 2982 in 2/65 Lambda= 0.140315 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|168278593|dbj|BAG11176.1| catenin delta-1 [synt ( 939) 6264 1278.4 0 gi|3152821|gb|AAC39806.1| p120 catenin isoform 1AC ( 939) 6255 1276.6 0 gi|109106143|ref|XP_001097712.1| PREDICTED: cateni ( 939) 6253 1276.2 0 gi|114642298|ref|XP_001141713.1| PREDICTED: cateni ( 939) 6244 1274.3 0 gi|14916543|sp|O60716.1|CTND1_HUMAN RecName: Full= ( 968) 6244 1274.4 0 gi|109106133|ref|XP_001096747.1| PREDICTED: cateni ( 968) 6242 1274.0 0 gi|148695341|gb|EDL27288.1| catenin (cadherin asso ( 966) 6239 1273.3 0 gi|51476280|emb|CAH18130.1| hypothetical protein [ ( 938) 6234 1272.3 0 gi|114642290|ref|XP_001140660.1| PREDICTED: cateni ( 968) 6233 1272.1 0 gi|3152827|gb|AAC39809.1| p120 catenin isoform 1A ( 933) 6184 1262.2 0 gi|109106153|ref|XP_001098301.1| PREDICTED: cateni ( 933) 6182 1261.8 0 gi|49899225|gb|AAH75795.1| CTNND1 protein [Homo sa ( 933) 6175 1260.4 0 gi|114642306|ref|XP_001142874.1| PREDICTED: cateni ( 933) 6173 1260.0 0 gi|3152835|gb|AAC39813.1| p120 catenin isoform 1AB ( 962) 6173 1260.0 0 gi|109106137|ref|XP_001097408.1| PREDICTED: cateni ( 962) 6171 1259.6 0 gi|109106223|ref|XP_001095087.1| PREDICTED: cateni ( 940) 6164 1258.2 0 gi|114642294|ref|XP_001141450.1| PREDICTED: cateni ( 962) 6162 1257.8 0 gi|109106141|ref|XP_001094621.1| PREDICTED: cateni ( 978) 6159 1257.2 0 gi|114642324|ref|XP_001139900.1| PREDICTED: cateni ( 940) 6155 1256.3 0 gi|73982252|ref|XP_859418.1| PREDICTED: similar to ( 938) 6132 1251.7 0 gi|73982248|ref|XP_849632.1| PREDICTED: similar to ( 967) 6121 1249.5 0 gi|166214912|sp|P30999.2|CTND1_MOUSE RecName: Full ( 938) 6106 1246.4 0 gi|194218124|ref|XP_001497241.2| PREDICTED: cateni ( 937) 6087 1242.6 0 gi|73982228|ref|XP_858970.1| PREDICTED: similar to ( 932) 6061 1237.3 0 gi|149022411|gb|EDL79305.1| catenin (cadherin asso ( 932) 6056 1236.3 0 gi|73982250|ref|XP_540607.2| PREDICTED: similar to ( 961) 6050 1235.1 0 gi|148695340|gb|EDL27287.1| catenin (cadherin asso ( 932) 6035 1232.0 0 gi|194673532|ref|XP_593164.4| PREDICTED: similar t ( 960) 5971 1219.1 0 gi|126333092|ref|XP_001367108.1| PREDICTED: simila ( 965) 5964 1217.7 0 gi|3152819|gb|AAC39805.1| p120 catenin isoform 2AC ( 885) 5925 1209.8 0 gi|109106171|ref|XP_001096974.1| PREDICTED: cateni ( 885) 5923 1209.3 0 gi|114642340|ref|XP_001141286.1| PREDICTED: cateni ( 885) 5914 1207.5 0 gi|3152817|gb|AAC39804.1| p120 catenin isoform 2AB ( 914) 5914 1207.5 0 gi|109106147|ref|XP_001096427.1| PREDICTED: cateni ( 914) 5912 1207.1 0 gi|114642336|ref|XP_001140487.1| PREDICTED: cateni ( 914) 5903 1205.3 0 gi|3152833|gb|AAC39812.1| p120 catenin isoform 2A ( 879) 5854 1195.4 0 gi|109106183|ref|XP_001097810.1| PREDICTED: cateni ( 879) 5852 1195.0 0 gi|114642344|ref|XP_001142345.1| PREDICTED: cateni ( 879) 5843 1193.2 0 gi|3152823|gb|AAC39807.1| p120 catenin isoform 2AB ( 908) 5843 1193.2 0 gi|109106169|ref|XP_001096644.1| PREDICTED: cateni ( 908) 5841 1192.8 0 gi|114642338|ref|XP_001141048.1| PREDICTED: cateni ( 908) 5832 1190.9 0 gi|55729036|emb|CAH91255.1| hypothetical protein [ ( 879) 5829 1190.3 0 gi|109106131|ref|XP_001095545.1| PREDICTED: cateni ( 915) 5801 1184.7 0 gi|3152813|gb|AAC39802.1| p120 catenin isoform 1B ( 941) 5794 1183.3 0 gi|114642332|ref|XP_001140237.1| PREDICTED: cateni ( 915) 5792 1182.8 0 gi|109106149|ref|XP_001096539.1| PREDICTED: cateni ( 941) 5792 1182.8 0 gi|109106173|ref|XP_001098993.1| PREDICTED: cateni ( 912) 5785 1181.4 0 gi|114642302|ref|XP_001140742.1| PREDICTED: cateni ( 941) 5783 1181.0 0 gi|114642322|ref|XP_001142256.1| PREDICTED: cateni ( 912) 5776 1179.6 0 gi|74183390|dbj|BAE36576.1| unnamed protein produc ( 917) 5760 1176.4 0 >>gi|168278593|dbj|BAG11176.1| catenin delta-1 [syntheti (939 aa) initn: 6264 init1: 6264 opt: 6264 Z-score: 6847.5 bits: 1278.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 6264; 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