# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00186.fasta.nr -Q ../query/KIAA0415.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0415, 634 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827346 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0814+/-0.000185; mu= 13.1609+/- 0.010 mean_var=71.8183+/-14.242, 0's: 27 Z-trim: 29 B-trim: 2224 in 1/65 Lambda= 0.151341 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74138698|dbj|BAE27165.1| unnamed protein produc ( 807) 3108 688.1 2.9e-195 gi|194678723|ref|XP_590057.4| PREDICTED: hypotheti (1870) 2962 656.5 2.2e-185 gi|149254514|ref|XP_001480761.1| PREDICTED: hypoth ( 805) 2923 647.7 4.2e-183 gi|149254516|ref|XP_001480764.1| PREDICTED: hypoth ( 805) 2919 646.8 7.7e-183 gi|73958172|ref|XP_851709.1| PREDICTED: hypothetic ( 781) 2543 564.7 3.9e-158 gi|34785813|gb|AAH57548.1| C330006K01Rik protein [ ( 797) 2423 538.5 3e-150 gi|149254512|ref|XP_001480758.1| PREDICTED: hypoth ( 797) 2328 517.8 5.3e-144 gi|26334059|dbj|BAC30747.1| unnamed protein produc ( 640) 2306 512.9 1.3e-142 gi|118097800|ref|XP_414785.2| PREDICTED: hypotheti ( 841) 2178 485.1 4e-134 gi|219519727|gb|AAI44756.1| Unknown (protein for I ( 689) 2010 448.3 3.8e-123 gi|52350612|gb|AAH82786.1| C330006K01Rik protein [ ( 378) 1966 438.5 1.9e-120 gi|149034992|gb|EDL89712.1| rCG42560 [Rattus norve ( 569) 1923 429.2 1.7e-117 gi|68534073|gb|AAH99419.1| C330006K01Rik protein [ ( 352) 1698 380.0 7.3e-103 gi|49118972|gb|AAH73598.1| MGC82900 protein [Xenop ( 792) 1702 381.1 7.4e-103 gi|26349931|dbj|BAC38605.1| unnamed protein produc ( 470) 1334 300.6 7.6e-79 gi|47207584|emb|CAF91641.1| unnamed protein produc ( 710) 1226 277.1 1.3e-71 gi|47211018|emb|CAF95532.1| unnamed protein produc ( 319) 955 217.7 4.6e-54 gi|115755872|ref|XP_001200220.1| PREDICTED: simila ( 750) 922 210.8 1.3e-51 gi|210130706|gb|EEA78377.1| hypothetical protein B ( 558) 650 151.3 7.9e-34 gi|210101173|gb|EEA49242.1| hypothetical protein B ( 741) 650 151.4 9.8e-34 gi|72133041|ref|XP_795875.1| PREDICTED: similar to ( 823) 615 143.8 2.1e-31 gi|190587860|gb|EDV27902.1| hypothetical protein T ( 839) 558 131.3 1.2e-27 gi|60462266|gb|EAL60493.1| hypothetical protein DD ( 975) 330 81.6 1.3e-12 gi|163778979|gb|EDQ92593.1| predicted protein [Mon ( 731) 300 75.0 9.8e-11 gi|156227122|gb|EDO47927.1| predicted protein [Nem (1206) 274 69.5 7.4e-09 gi|162693707|gb|EDQ80058.1| predicted protein [Phy ( 579) 232 60.0 2.4e-06 gi|221485306|gb|EEE23587.1| conserved hypothetical (2032) 237 61.6 3e-06 gi|211964826|gb|EEB00022.1| hypothetical protein T (2034) 237 61.6 3e-06 gi|221506163|gb|EEE31798.1| conserved hypothetical (2034) 237 61.6 3e-06 gi|162695124|gb|EDQ81469.1| predicted protein [Phy ( 574) 219 57.2 1.7e-05 gi|210130707|gb|EEA78378.1| hypothetical protein B ( 720) 206 54.4 0.00015 gi|23297454|gb|AAN12973.1| unknown protein [Arabid ( 562) 203 53.7 0.00019 gi|20465414|gb|AAM20131.1| unknown protein [Arabid ( 562) 203 53.7 0.00019 gi|39545844|emb|CAE04752.3| OSJNBb0060E08.15 [Oryz ( 554) 198 52.6 0.0004 gi|113565521|dbj|BAF15864.1| Os04g0626900 [Oryza s ( 572) 198 52.6 0.00041 gi|116312003|emb|CAJ86360.1| OSIGBa0117N13.4 [Oryz ( 574) 197 52.4 0.00048 gi|222629600|gb|EEE61732.1| hypothetical protein O ( 593) 197 52.4 0.00049 gi|218195633|gb|EEC78060.1| hypothetical protein O ( 584) 195 52.0 0.00066 gi|222860647|gb|EEE98194.1| predicted protein [Pop ( 572) 186 50.0 0.0025 >>gi|74138698|dbj|BAE27165.1| unnamed protein product [M (807 aa) initn: 2008 init1: 1983 opt: 3108 Z-score: 3661.8 bits: 688.1 E(): 2.9e-195 Smith-Waterman score: 3108; 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