# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01205s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0422.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0422, 1160 aa vs ./tmplib.23147 library 1986345 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7898+/-0.00607; mu= 20.1475+/- 0.412 mean_var=132.6714+/-31.971, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 154 in 1/39 Lambda= 0.111349 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0511 ( 933 res) he00818 ( 933) 1049 180.9 7.7e-46 KIAA1060 ( 887 res) hh13580 ( 887) 872 152.4 2.7e-37 KIAA0037 ( 1088 res) ha00929 (1088) 867 151.8 5.3e-37 KIAA0520 ( 1364 res) hg02989s1 (1364) 682 122.2 5.3e-28 >>KIAA0511 ( 933 res) he00818 (933 aa) initn: 1970 init1: 842 opt: 1049 Z-score: 914.8 bits: 180.9 E(): 7.7e-46 Smith-Waterman score: 2014; 40.395% identity (67.179% similar) in 911 aa overlap (330-1156:11-910) 300 310 320 330 340 350 KIAA04 IRMRAAVLSGLGLSTLHLILAWQLNRGDAFLWKQLGANVLLFLCTNVIGICTHYPAEVSQ : ... :::.:.::. ..:: ..: :. .. KIAA05 QQQEELKGMQLLREILANVFLYLCAIAVGIMSYYMADRKH 10 20 30 40 360 370 380 390 400 410 KIAA04 RQAFQETRGYIQARLHLQHENRQQERLLLSVLPQHVAMEMKEDIN---TKKEDMMFHKIY :.:: :.: ......:.....::: :.::.::.::: :: .:.. ..:....:. .: KIAA05 RKAFLEARQSLEVKMNLEEQSQQQENLMLSILPKHVADEMLKDMKKDESQKDQQQFNTMY 50 60 70 80 90 100 420 430 440 450 460 470 KIAA04 IQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCLRIKILGDCYY . .:.::::::::: :::.:.: :.::::: :::::::::::::. : ::::::::::: KIAA05 MYRHENVSILFADIVGFTQLSSACSAQELVKLLNELFARFDKLAAKYHQLRIKILGDCYY 110 120 130 140 150 160 480 490 500 510 520 530 KIAA04 CVSGLPEARADHAHCCVEMGVDMIEAISLVREVTGVNVNMRVGIHSGRVHCGVLGLRKWQ :. :::. : ::: : . ::. :.:::: ::: : ..:.::::.:.: : :::: ..:: KIAA05 CICGLPDYREDHAVCSILMGLAMVEAISYVREKTKTGVDMRVGVHTGTVLGGVLGQKRWQ 170 180 190 200 210 220 540 550 560 570 580 590 KIAA04 FDVWSNDVTLANHMEAGGRAGRIHITRATLQYLNGDYEVEPGRGGERNAYLKEQHIETFL .::::.:::.::.::::: ::.::...:.. :.:...:::: :: : ::.:. :::.: KIAA05 YDVWSTDVTVANKMEAGGIPGRVHISQSTMDCLKGEFDVEPGDGGSRCDYLEEKGIETYL 230 240 250 260 270 280 600 610 620 630 640 KIAA04 ILG--------ASQKRKEEKAMLAKLQRTRANSMEGLMPRWVPD-RAFSR--TKDSKAFR :.. :.:. . .:. . .: .:. :. : : :... . KIAA05 IIASKPEVKKTATQNGLNGSALPNGAPASSKSSSPALIETKEPNGSAHSSGSTSEKPEEQ 290 300 310 320 330 340 650 660 670 680 690 KIAA04 QMGIDDSSKDNRGTQ-----------DALNPEDEVDEFLSRAIDARSIDQLRKDHVRRFL . :. : : . :: . : :....:..:. : :. : . :: KIAA05 DAQADNPSFPNPRRRLRLQDLADRVVDASEDEHELNQLLNEALLERESAQVVKKR-NTFL 350 360 370 380 390 700 710 720 730 740 KIAA04 LT--FQREDLEKKYSRKVDPRFGAYVACALLVFCFICFIQLLIFP-----HSTLMLGIYA :. :. ..: .:: . . . :: .:. .:. ....:: : . :.:.: KIAA05 LSMRFMDPEMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLLCTALVEILIDPWLMTNYVTFMVG--- 400 410 420 430 440 450 750 760 770 780 790 KIAA04 SIFLLLLITVLICAVYSCGSLFPKALQRLSRSIVRSR-AHST-------------AVGIF :.::.: . :.. ::: : .: : :.: :..: .: .. KIAA05 EILLLILTICSLAAIFP--RAFPKKLVAFSTWIDRTRWARNTWAMLAIFILVMANVVDML 460 470 480 490 500 510 800 810 820 830 KIAA04 SVLLVFT---SAIANMYFIGNML-----------LSLLASSVFLHISSIGKLA-MIFVLG : : .: .: :.: :. : :::.:. .....: . ::. :..: : KIAA05 SCLQYYTGPSNATAGMETEGSCLENPKYYNYVAVLSLIATIMLVQVSHMVKLTLMLLVAG 520 530 540 550 560 570 840 850 860 870 880 KIAA04 LIYLVLLLLGPPATIFDNYDL---------LLGVHGLASSNETFDGLD-CPAAGRVALKY . . : : .::.:: ..... . . : ..: : : : :: KIAA05 AVATINLYAWRP--VFDEYDHKRFREHDLPMVALEQMQGFNPGLNGTDRLPL---VPSKY 580 590 600 610 620 890 900 910 920 930 940 KIAA04 MTPVILLVFALALYLHAQQVESTARLDFLWKLQATGEKEEMEELQAYNRRLLHNILPKDV :..... :..: ...::. :: ::::... .::.. :.. .:. :. :.::. : KIAA05 SMTVMVFLMMLSFYYFSRHVEKLARTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWNEALVTNMLPEHV 630 640 650 660 670 680 950 960 970 980 990 1000 KIAA04 AAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSEFYVELEANNEGVECLRLLNEIIADFD : :::. ..:..::: :. . ..:::::. ::..::.: :: :.::::.:::::.::: KIAA05 ARHFLGSKKRDEELYSQTYDEIGVMFASLPNFADFYTEESINNGGIECLRFLNEIISDFD 690 700 710 720 730 740 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA04 EIISEERFRQLEKIKTIGSTYMAASGL----NASTY------DQVGR---SHITALADYA .... .:: . ::::::::::::::. :.. . :. : .:.. :::.: KIAA05 SLLDNPKFRVITKIKTIGSTYMAASGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERERWQHLADLADFA 750 760 770 780 790 800 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA04 MRLMEQMKHINEHSFNNFQMKIGLNMGPVVAGVIGARKPQYDIWGNTVNVSSRMDSTGVP . . . . .::..:::::...::.: : :.:::::::::.::::::::::.:::.:::: KIAA05 LAMKDTLTNINNQSFNNFMLRIGMNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTVNVASRMESTGVM 810 820 830 840 850 860 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA04 DRIQVTTDLYQVLAAKGYQLECRGVVKVKGKGEMTTYFLNGGPSS :::. . .: :... :: . ::::::. :.::.: KIAA05 GNIQVVEETQVILREYGFRFVRRGPIFVKGKGELLTFFLKGRDKLATFPNGPSVTLPHQV 870 880 890 900 910 920 KIAA05 VDNS 930 >>KIAA1060 ( 887 res) hh13580 (887 aa) initn: 2098 init1: 864 opt: 872 Z-score: 761.3 bits: 152.4 E(): 2.7e-37 Smith-Waterman score: 2154; 42.445% identity (69.435% similar) in 867 aa overlap (356-1155:9-873) 330 340 350 360 370 380 KIAA04 GDAFLWKQLGANVLLFLCTNVIGICTHYPAEVSQRQAFQETRGYIQARLHLQHENRQQER :.. .:..:.: . :..:..:. :.::::: KIAA10 GAYHKHLMELALQQTYQDTCNCIKSRIKLEFEKRQQER 10 20 30 390 400 410 420 430 KIAA04 LLLSVLPQHVAMEMKEDINTK----KEDMM-----FHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSL ::::.:: :.::::: .: . : .: ::..:...: :::::.::: ::: : KIAA10 LLLSLLPAHIAMEMKAEIIQRLQGPKAGQMENTNNFHNLYVKRHTNVSILYADIVGFTRL 40 50 60 70 80 90 440 450 460 470 480 490 KIAA04 ASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCLRIKILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMG ::.:. ::: :::::..::..: ::.:.:::::::::::::::: . .::. ::.:: KIAA10 ASDCSPGELVHMLNELFGKFDQIAKENECMRIKILGDCYYCVSGLPISLPNHAKNCVKMG 100 110 120 130 140 150 500 510 520 530 540 550 KIAA04 VDMIEAISLVREVTGVNVNMRVGIHSGRVHCGVLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGRA .:: :::. ::..:::..:::::.::: : :::.::.:::.::::.:::::::::::: KIAA10 LDMCEAIKKVRDATGVDINMRVGVHSGNVLCGVIGLQKWQYDVWSHDVTLANHMEAGGVP 160 170 180 190 200 210 560 570 580 590 600 610 KIAA04 GRIHITRATLQYLNGDYEVEPGRGGERNAYLKEQHIETFLILGASQKRKEEKAMLAKLQ- ::.::. .::..::: :.:: : : :. :::.. ..:..... . .:. . .. . KIAA10 GRVHISSVTLEHLNGAYKVEEGDGDIRDPYLKQHLVKTYFVINPKGERRSPQHLFRPRHT 220 230 240 250 260 270 620 630 640 650 KIAA04 ----RTRAN-SMEGLMPRWVPDRAFSRT--KDSKAFRQ---------MGIDD-SSKDNRG . ::. : . : . :.. .:: . .. :: . ... : KIAA10 LDGAKMRASVRMTRYLESWGAAKPFAHLHHRDSMTTENGKISTTDVPMGQHNFQNRTLRT 280 290 300 310 320 330 660 670 680 690 700 710 KIAA04 TQDALNPEDEVDEFLSRAIDARSIDQ--LRKDHVRRFLLTFQREDLEKKYSRKVDPRFGA .. :.:..: . .:::. . .. :... ..:. : : . :::.: . : : KIAA10 KSQKKRFEEELNERMIQAIDGINAQKQWLKSEDIQRISLLFYNKVLEKEYRATALPAFKY 340 350 360 370 380 390 720 730 740 750 760 770 KIAA04 YVACALLVFCFICFIQLLIFPHSTLMLGI-YASIFLLLLITVLIC---AVYSCGSLFPKA ::.:: :.: : ..:.:..:.... ::: ... :::: . ...: . .:.. KIAA10 YVTCACLIFFCIFIVQILVLPKTSV-LGISFGAAFLLLAFILFVCFAGQLLQCSKKASPL 400 410 420 430 440 450 780 790 800 810 820 KIAA04 LQRLSRS--IVRSRA-HSTAVGIFSVLLVFTSAIANMYFIGNMLLSLLASSVFLHIS--- :. : .: :. .: .. :... ... :. ::.:... .. .. . : KIAA10 LMWLLKSSGIIANRPWPRISLTIITTAIILMMAVFNMFFLSDSEETIPPTANTTNTSFSA 460 470 480 490 500 510 830 840 850 860 KIAA04 SIGKLAMIFVLGLIYL-------VLLLLGPPATIFDNYDL---------------LLGVH : ...:.. . .:..: .: :.. . . ::.: :: .: KIAA10 SNNQVAILRAQNLFFLPYFIYSCILGLISCSVFLRVNYELKMLIMMVALVGYNTILLHTH 520 530 540 550 560 570 870 880 890 900 910 920 KIAA04 GLASSNETFDGLDCPAAGRVALKYMTPVILLVFALALYLHAQQVESTARLDFLWKLQATG . . .. . .. :. . :: : : : .: ..: . ..: : ::::::: . KIAA10 AHVLGDYSQVLFERPGIWK-DLKTMGSVSLSIFFITLLVLGRQNEYYCRLDFLWKNKFKK 580 590 600 610 620 630 930 940 950 960 970 980 KIAA04 EKEEMEELQAYNRRLLHNILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSEFY :.::.: .. :: ::.:.:: :: ::::: .:.:::.:: .:: :::::: .:.::: KIAA10 EREEIETMENLNRVLLENVLPAHVAEHFLARSLKNEELYHQSYDCVCVMFASIPDFKEFY 640 650 660 670 680 690 990 1000 1010 1020 1030 KIAA04 VELEANNEGVECLRLLNEIIADFDEIISEERFRQLEKIKTIGSTYMAASGLNA------S .: ..:.::.::::::::::::::...:. .: .:::::::::::::.::.: : KIAA10 TESDVNKEGLECLRLLNEIIADFDDLLSKPKFSGVEKIKTIGSTYMAATGLSAVPSQEHS 700 710 720 730 740 750 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA04 TYDQVGRSHITALADYAMRLMEQMKHINEHSFNNFQMKIGLNMGPVVAGVIGARKPQYDI . :: .....:. :. .. ::.::::.:....:.: :::.::::::.:::::: KIAA10 QEPERQYMHIGTMVEFAFALVGKLDAINKHSFNDFKLRVGINHGPVIAGVIGAQKPQYDI 760 770 780 790 800 810 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA04 WGNTVNVSSRMDSTGVPDRIQVTTDLYQVLAAKGYQLECRGVVKVKGKGEMTTYFLNGGP :::::::.:::::::: :.:::: . :: . :: :::...:::::.. :::.: KIAA10 WGNTVNVASRMDSTGVLDKIQVTEETSLVLQTLGYTCTCRGIINVKGKGDLKTYFVNTEM 820 830 840 850 860 870 1160 KIAA04 SS KIAA10 SRSLSQSNVAS 880 >>KIAA0037 ( 1088 res) ha00929 (1088 aa) initn: 2021 init1: 862 opt: 867 Z-score: 756.1 bits: 151.8 E(): 5.3e-37 Smith-Waterman score: 2181; 39.130% identity (64.570% similar) in 1081 aa overlap (164-1154:7-1075) 140 150 160 170 180 190 KIAA04 LGFEDTEVTTTAGGTAEVAPDAVPRSGRSCWRRLVQ--VFQSKQFRSAKLERLYQRYFFQ :: .. : .. .. . ::..: . KIAA00 RHACQGWRMPAKGRYFLNEGEEGPDQDALYEKYQLT 10 20 30 200 210 220 230 240 KIAA04 MNQSSLTL---LMAVLVLLTAVLLAF-HAAPARPQPAY-VALLACA--AALFVGLMVVCN ... : : :.:. . .. ...:: .. :.: : .:.:. : ::: : ..: : KIAA00 SQHGPLLLTLLLVAATACVALIIIAFSQGDPSRHQAILGMAFLVLAVFAALSVLMYVEC- 40 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 300 KIAA04 RHSFRQDSMWVVSYVVLGILAAVQVGGALAADPRSPSAGLWCPV----FFVYIAYTLLPI .:. :. . ..: : .: .:. : . .: : : :.:...:::::. KIAA00 --LLRR---WLRALALLTWACLVALGYVLVFDAWTKAACAWEQVPFFLFIVFVVYTLLPF 100 110 120 130 140 150 310 320 330 340 350 KIAA04 RMRAAVLSGLGLSTLHLILAWQLNRG----DAFLWKQLGANVLLFLCTNVIGICTHYPAE ::.:: : .. ::.. .: : .. . :: ::...::: :. : .. . KIAA00 SMRGAVAVGAVSTASHLLVLGSLMGGFTTPSVRVGLQLLANAVIFLCGNLTGAFHKHQMQ 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 KIAA04 VSQRQAFQETRGYIQARLHLQHENRQQERLLLSVLPQHVAMEMKEDINTK-KE------- ..:. : : :: : .:. :.:::: ::::::: :..: :: : . :: KIAA00 DASRDLFTYTVKCIQIRRKLRIEKRQQENLLLSVLPAHISMGMKLAIIERLKEHGDRRCM 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 KIAA04 -DMMFHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCLR : ::..:...:.:::::.::: :::.:::.:. .:::..:::::..::..: :.:.: KIAA00 PDNNFHSLYVKRHQNVSILYADIVGFTQLASDCSPKELVVVLNELFGKFDQIAKANECMR 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 KIAA04 IKILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMGVDMIEAISLVREVTGVNVNMRVGIHSGRVHC ::::::::::::::: . ::. ::.::.:: .::. :::.:::..::::::::: : : KIAA00 IKILGDCYYCVSGLPVSLPTHARNCVKMGLDMCQAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVLC 340 350 360 370 380 390 530 540 550 560 570 580 KIAA04 GVLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGRAGRIHITRATLQYLNGDYEVEPGRGGERNAYL ::.::::::.::::.::.:::.:::.: ::.:::.:::..:. :::: :.: .:. :: KIAA00 GVIGLRKWQYDVWSHDVSLANRMEAAGVPGRVHITEATLKHLDKAYEVEDGHGQQRDPYL 400 410 420 430 440 450 590 600 610 620 630 KIAA04 KEQHIETFLILGA-SQKRKEEKAMLAKLQ-----RTRAN-SMEGLMPRWVPDRAFSRT-- ::..:.:.:.. ::. . : . . . ::. : . : : :.. KIAA00 KEMNIRTYLVIDPRSQQPPPPSQHLPRPKGDAALKMRASVRMTRYLESWGAARPFAHLNH 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 KIAA04 KDSKAFRQMGIDDSSKD------NRGTQD-ALNP-----EDEVDEFLSRAIDARSIDQ-- ..: . . . .. . .: : : ...: .: :. . ::.. : . KIAA00 RESVSSGETHVPNGRRPKSVPQRHRRTPDRSMSPKGRSEDDSYDDEMLSAIEGLSSTRPC 520 530 540 550 560 570 690 700 710 720 730 740 KIAA04 -LRKDHVRRFLLTFQREDLEKKYSRKVDPRFGAYVACALLVFCFICFIQLLIFPHSTLM- ..: : : .. .:..: :: ::: :.: : ....:..:... . KIAA00 CSKSDDFYTFGSIFLEKGFEREYRLAPIPRARHDFACASLIFVCILLVHVLLMPRTAALG 580 590 600 610 620 630 750 760 770 780 KIAA04 --LGIYASIFLLLLITVLICAVYSC----GSLFP-------KALQRLSRSIVRSRAHSTA .:. : .. :.: . : :.: . : ::. ... . :. 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