# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00035.fasta.huge -Q ../query/KIAA0444.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0444, 978 aa vs ./tmplib.23147 library 1986527 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9479+/-0.00741; mu= 3.6059+/- 0.502 mean_var=237.8124+/-55.123, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.083168 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432) 718 100.3 3.1e-21 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 712 99.6 5.6e-21 KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966) 708 99.0 6.2e-21 KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041) 699 97.9 1.3e-20 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 562 81.7 1.6e-15 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 545 79.3 4.1e-15 KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048) 435 65.9 3e-11 KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385) 285 48.1 9.4e-06 >>KIAA1564 ( 2432 res) fh20840s1 (2432 aa) initn: 775 init1: 593 opt: 718 Z-score: 473.1 bits: 100.3 E(): 3.1e-21 Smith-Waterman score: 718; 48.163% identity (76.327% similar) in 245 aa overlap (2-231:931-1173) 10 20 KIAA04 GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAV--- :. .::: ::.:.::::::::. : KIAA15 EVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKIL 910 920 930 940 950 960 30 40 50 60 70 80 KIAA04 ----EA-PVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDF :: ..:. .. ...:.:.:::.:..:.: ::. ::.:::::::.. ::.:::. KIAA15 TEFREACHIIPH-DFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDY 970 980 990 1000 1010 90 100 110 120 130 140 KIAA04 LEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYD : . : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.: KIAA15 LIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFD 1020 1030 1040 1050 1060 1070 150 160 170 180 190 200 KIAA04 SDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGS :::::.::.:: .: :::::.: : .::..:: : :... . :. :. : . :.. .... KIAA15 SDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ-SMSG 1080 1090 1100 1110 1120 1130 210 220 230 240 250 KIAA04 KSGSMT------KQELDDILKFGT-EELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAA ..:..: :.:..:.:. :. ....: :: KIAA15 RDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEG 1140 1150 1160 1170 1180 1190 260 270 280 290 300 310 KIAA04 SAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQ KIAA15 KGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRH 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 761 init1: 609 opt: 712 Z-score: 468.5 bits: 99.6 E(): 5.6e-21 Smith-Waterman score: 720; 47.347% identity (75.102% similar) in 245 aa overlap (2-231:1006-1248) 10 20 30 KIAA04 GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAP : .:.: ::.:.:::::::: . ..: KIAA03 EVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYL--IKGAEEK 980 990 1000 1010 1020 1030 40 50 60 70 80 KIAA04 VL--------PNGS-YDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLED .: : .: . .....:.:::.:..:.: :.. ::.:::::::.. ::.::: KIAA03 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED 1040 1050 1060 1070 1080 1090 90 100 110 120 130 140 KIAA04 FLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIY .: .. : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::. KIAA03 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF 1100 1110 1120 1130 1140 1150 150 160 170 180 190 200 KIAA04 DSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLG ::::::.::.:: .: ::::::: : .::.::: : :... . :. :. : . :.. : KIAA03 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 210 220 230 240 250 KIAA04 SKSG-----SMTKQELDDILKFGTE-ELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAA .:. ...:.:..:.:. :. ..... :: KIAA03 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG 1220 1230 1240 1250 1260 1270 260 270 280 290 300 310 KIAA04 SAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQ KIAA03 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP 1280 1290 1300 1310 1320 1330 >>KIAA1416 ( 1966 res) hh02957s1 (1966 aa) initn: 797 init1: 605 opt: 708 Z-score: 467.7 bits: 99.0 E(): 6.2e-21 Smith-Waterman score: 714; 34.023% identity (57.895% similar) in 532 aa overlap (2-520:475-924) 10 20 30 KIAA04 GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAP : .::: ::.:.:::::::: . ..: KIAA14 EVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYL--INGAEEK 450 460 470 480 490 500 40 50 60 70 80 KIAA04 VLP---------NGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLED .: . ... .......:::.:..:.: ::. ::::::::::.. ::.::: KIAA14 ILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILED 510 520 530 540 550 560 90 100 110 120 130 140 KIAA04 FLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIY .: . : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::. KIAA14 YLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF 570 580 590 600 610 620 150 160 170 180 190 200 KIAA04 DSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLG ::::::.::.:: .: :::::.:.: :::..:: : :... . :. :. : . : : KIAA14 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAV----LQ 630 640 650 660 670 210 220 230 240 250 260 KIAA04 SKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKH : :: . . :...: : ..: .. .: : : KIAA14 SMSGRENATN-------GVQQLSKKEIEDLLRKGAY-------------GALM------- 680 690 700 710 270 280 290 300 310 320 KIAA04 GSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREE :..: : :. . : : :: :.. : ..: .. :.: :..:. KIAA14 ------DEED-EGSKFCEEDIDQI--LLRRTHTITIESEGKG-----STFAKASFVA--- 720 730 740 750 330 340 350 360 370 380 KIAA04 DGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN--LGKGKRIRKQVNYNDASQ .: .: :. . ::..:.: .. . . .:: . :.:::. .: . KIAA14 SG----NRTDISLD---DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVK 760 770 780 790 800 390 400 410 420 430 440 KIAA04 EDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARVG ::. :.:: .: : ::.: .. : :.. : . :.. . :: KIAA14 EDELM--EFSDLES-----------DSEEKPCAKPRRPQDKSQGYA-RSECF-----RVE 810 820 830 840 450 460 470 480 490 KIAA04 GNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA--YVSLFMRH :. : :.. : . .. .. . ::. . . : . ..... .. :. KIAA14 KNLLVYGWG-RWTDILSHGRYKRQLTEQDVET---ICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWD 850 860 870 880 890 900 500 510 520 530 540 550 KIAA04 LCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIPEGP : : ::: .: : : . ::: KIAA14 LITPTADG-QTRAL-VNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQE 910 920 930 940 950 960 >>KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041 aa) initn: 799 init1: 578 opt: 699 Z-score: 461.7 bits: 97.9 E(): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 720; 30.421% identity (56.006% similar) in 641 aa overlap (2-604:56-608) 10 20 30 KIAA04 GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAP :. .:.: ::.:.:::::::: . ..: KIAA13 EVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYL--INGAEEK 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 KIAA04 VL--------PNG-SYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLED .: :.. ... .......:::.:..:.: :: ::.:::::::.. ::.::: KIAA13 ILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILED 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 KIAA04 FLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIY .: . : :::::: . :.::: ::::: : ...: ::: ::::::::::..::: ::. KIAA13 YLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 KIAA04 DSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLG ::::::.::.:: .: :::::.: : .::..:: : :... . :. :. : . :.. .. KIAA13 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQD-IN 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 KIAA04 SKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKH :.:. :...: : .:: .. .: : : KIAA13 RKGGTN-----------GVQQLSKMEVEDLLRKGAY-------------GALM------- 270 280 290 270 280 290 300 310 320 KIAA04 GSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREE :..: : :. . : :...:.: : .:. .. :.: :..:. KIAA13 ------DEED-EGSKFCEED---IDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVA--- 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 KIAA04 DGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDASQ .: .: :. . ::..:.: . . . . .. ..: . :.:::... .. . KIAA13 SG----NRTDISLD---DPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFE 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 KIAA04 EDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRR---QSRRQLKSDRDKPLPPLLA : ::: :.: . : : .::: .:: ..:: :... KIAA13 E-----DELM----EFS----ELDSDSDERPT--RSRRLNDKARRYLRAE--------CF 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 KIAA04 RVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA--YVSLF :: :. ..:.. : . . .. ..: . .: . . : : :.... .. : KIAA13 RVEKNLLIFGWG-RWKDILTHGRFKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSF 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 KIAA04 MRHLCEPGADG-AETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYS-TPDL . .: : :: :.:. . . ::: : : . . . :.. .. . .:.. KIAA13 IWELITPTKDGQAQTLQN---HSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEV 490 500 510 520 530 560 570 580 590 KIAA04 IPEGPEGKK-------------------PGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKME . . :: .:... . .:::. : .:: : :: KIAA13 VLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYME 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 KIAA04 AQLGYMD-EKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAP . . : : : KIAA13 IPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTS 600 610 620 630 640 650 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 694 init1: 319 opt: 562 Z-score: 370.7 bits: 81.7 E(): 1.6e-15 Smith-Waterman score: 562; 33.645% identity (64.486% similar) in 321 aa overlap (48-361:1866-2178) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 NHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKML :::. : .:..:. ::::::::.:::.:: KIAA03 ELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMTRML 1840 1850 1860 1870 1880 1890 80 90 100 110 120 130 KIAA04 DLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATAD :.::.:: :.:. : :.::. :: ..:::: . :::.::::.::.:.::. :: KIAA03 DVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERFNAD-KRIFCFILSTRSGGVGVNLTGAD 1900 1910 1920 1930 1940 1950 140 150 160 170 180 190 KIAA04 TVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV ::..::::::: : :: .: :::::.. : :::.... .::: : . :..: :: ... KIAA03 TVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRDVHIYRLISERTVEENILKKANQKRMLGDMAI 1960 1970 1980 1990 2000 2010 200 210 220 230 240 250 KIAA04 RPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAAS . : . .. . .: . ... . :: ...: . . .. :. .. : . KIAA03 EGG-NFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSSSVPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAED 2020 2030 2040 2050 2060 2070 260 270 280 290 300 310 KIAA04 AKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSF----- . ...: .. .: . . : .. . .. ...: :.. .. .... KIAA03 EEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLT 2080 2090 2100 2110 2120 2130 320 330 340 350 360 370 KIAA04 KVAQYVVRE-EDGVEEVEREIIKQ-EENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR . .:... : ..::: :: .:: ::.:. :. .: .:.. : KIAA03 PIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAA------RKDLDQAKEEVFRLPQEEEEGP 2140 2150 2160 2170 2180 380 390 400 410 420 430 KIAA04 KQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDK KIAA03 GAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLRGARAETQGANHTPVISAHQTRSTT 2190 2200 2210 2220 2230 2240 >>KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561 aa) initn: 602 init1: 335 opt: 545 Z-score: 363.2 bits: 79.3 E(): 4.1e-15 Smith-Waterman score: 545; 47.568% identity (76.757% similar) in 185 aa overlap (42-226:1100-1281) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 DLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFS ::. .::::. :. .: .:...::::::.: KIAA12 RSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 80 90 100 110 120 130 KIAA04 QMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGI :::.:.::::... :. . : :.::. . :.. . :. . . : :::::::::::: KIAA12 QMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRN-DIFVFLLSTRAGGLGI 1130 1140 1150 1160 1170 1180 140 150 160 170 180 190 KIAA04 NLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMM ::..:::::.::::::: : ::..::::.::.:.: .::.. ....:::: : ::.: KIAA12 NLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSE 1190 1200 1210 1220 1230 1240 200 210 220 230 240 250 KIAA04 LTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKG . ..:. : . : .. .:. ..: . ::: : KIAA12 IQRMVISGG-NFKPDTLKPKEVVSLL-LDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKR 1250 1260 1270 1280 1290 1300 260 270 280 290 300 310 KIAA04 GNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSS KIAA12 EKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEIS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 >>KIAA1122 ( 1048 res) hj01698 (1048 aa) initn: 493 init1: 262 opt: 435 Z-score: 293.9 bits: 65.9 E(): 3e-11 Smith-Waterman score: 435; 41.566% identity (77.108% similar) in 166 aa overlap (43-208:871-1034) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 LKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQ :. .:::. .: .:..:...: ::..::: KIAA11 FEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQ 850 860 870 880 890 900 80 90 100 110 120 130 KIAA04 MTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN .: :::.:: .:... ..: :.:: . : . ::.::. . : :::::.::::::: KIAA11 FTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTD-MDIFVFLLSTKAGGLGIN 910 920 930 940 950 140 150 160 170 180 190 KIAA04 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMML :..:..::..: : ::.:: :: .: ::.::.:.:.. ........:: . .. ..:. : KIAA11 LTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKL 960 970 980 990 1000 1010 200 210 220 230 240 250 KIAA04 THLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGG . .. :.. ::: KIAA11 EQDMTTVDEGDE-GSMPADIATLLKTSMGL 1020 1030 1040 >>KIAA0809 ( 1385 res) hk10195 (1385 aa) initn: 257 init1: 228 opt: 285 Z-score: 195.2 bits: 48.1 E(): 9.4e-06 Smith-Waterman score: 334; 32.683% identity (62.927% similar) in 205 aa overlap (41-223:632-831) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 MDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIF ......: :..:: ..... : ..:.: KIAA08 LQGVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVF 610 620 630 640 650 660 80 90 100 110 KIAA04 SQMTKMLDLLEDFL-----------EYEGYK-------YERIDGGITGGLRQEAIDRFNA :: . : :.:.:: : .: . : :.::. . :.. :..:: KIAA08 SQSLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFND 670 680 690 700 710 720 120 130 140 150 160 170 KIAA04 PGA-QQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYR :. . :::::::: ::.:: :. :...:..::: .: :: :..: ::.: .::: KIAA08 PSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYR 730 740 750 760 770 780 180 190 200 210 220 KIAA04 FVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV---RPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDD .:. ..:..: . :. .. :: : : ..:..:....:.: .: KIAA08 LVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPML-----NFTRKEVENLLHFVEKEPAPQV 790 800 810 820 830 230 240 250 260 270 280 KIAA04 VEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISK KIAA08 SLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRT 840 850 860 870 880 890 978 residues in 1 query sequences 1986527 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:51 2008 done: Thu Dec 18 15:21:52 2008 Total Scan time: 0.670 Total Display time: 0.320 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]