# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf06424.fasta.huge -Q ../query/KIAA0451.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0451, 983 aa vs ./tmplib.23147 library 1986522 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4776+/-0.00782; mu= 0.1181+/- 0.532 mean_var=229.6156+/-54.936, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 133 in 1/39 Lambda= 0.084640 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 2650 337.4 9.6e-93 KIAA0949 ( 1559 res) af07325 (1559) 252 44.5 0.00012 >>KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760 aa) initn: 3350 init1: 1389 opt: 2650 Z-score: 1756.9 bits: 337.4 E(): 9.6e-93 Smith-Waterman score: 3271; 52.122% identity (72.754% similar) in 1013 aa overlap (1-982:845-1759) 10 20 30 KIAA04 QLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWV :::.:..::: ::::::::::::.:::::: KIAA11 RAMLFDENKKLTAENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWV 820 830 840 850 860 870 40 50 60 70 80 90 KIAA04 SDEKDARGYLQALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDA :::::::::::::::::::::::::.::::.:. : ::.:: ::::::::::::::.: KIAA11 SDEKDARGYLQALASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEA 880 890 900 910 920 930 100 110 120 130 140 KIAA04 EIRAKQAIQEELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEE-LRSEKGIEHQ :::::: .:::: ::: .:. : :::::: :: ::: :.: : : :: .:.. :.. KIAA11 EIRAKQLVQEELRKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLP 940 950 960 970 980 990 150 160 170 180 190 KIAA04 DSQHSFLAFLNTPTDALD-QFETVDST------PLSVHTPTL------------RKKGCP : : :.. ..:: : : :.: ... : .:.. : : KIAA11 DFQDSIFEYFNTAPLAHDLTFRTSSASEQETQAPKPEASPSMSVAASEQQEDMARPPQRP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 200 210 220 230 240 KIAA04 GSTGFP---------PKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHI ... .: :: :.::: .:::..::.: .:::::::::::: .::::.:.::. KIAA11 SAVPLPTTQALALAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHV 1060 1070 1080 1090 1100 1110 250 260 270 280 290 300 KIAA04 TCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFK .: . :: .::.::::.: :::.: :.::::::.:::..:::.::::::::: :.::: : KIAA11 SCKDGAPQVCPIPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCK 1120 1130 1140 1150 1160 1170 310 320 330 340 350 360 KIAA04 LFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSA :::::. :::..::.:. :::.:.::.:::::::::::::::.:.::::::::::: :.: KIAA11 LFLYDLPEGKSTQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 370 380 390 400 410 420 KIAA04 SNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQA .. :.:.:...::::.::::.: :..::.::..:.. :.:: :::::.:::::. . 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KIAA09 LALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLLEEQAKLQ 650 660 670 680 690 700 40 50 60 70 80 90 KIAA04 DEKD-ARGYLQALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDA .. : .... :.. . : :. : . : :. .:. .... . : ......... KIAA09 QQMDLQKNHIFRLTQGLQEALD--RADLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQ 710 720 730 740 750 760 100 110 120 130 140 KIAA04 EIRAKQAIQEELNK-VKASNI-ITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTE-ELRS--EKG . . . .: .... .: ... . .:: . .:. .:.:. .. :. :::: :.. KIAA09 QTKLIDFLQAKMDQPAKKKKVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEA 770 780 790 800 810 820 150 160 170 180 190 KIAA04 IEHQDSQHSFLAFLNTPTDALDQF------ETVDSTPLSVHT---PTLRKKGCPGSTGFP ... ..: . ::. : .:. .. . : .. :. :.: : KIAA09 AHRKATDHPHPS---TPATARQQIAMSAIVRSPEHQPSAMSLLAPPSSRRKESSTPEEFS 830 840 850 860 870 880 200 210 220 230 240 KIAA04 PKRKT-------HQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPT . : :.: : ::: : . : . ::. .: : :: : . :. 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KIAA09 KLEGDDRLDMNCTLPFSDQVVLVGTEEGLYALNVLKNSLTHVPGIGAVFQIYIIKDLEKL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 470 480 490 500 510 KIAA04 AVISGRNRHVRL---------FPMSALDGRETDFYKLSET-KGCQTVTSGKVRHGALTCL .:.:..: . : . .: : .. .. :. :::. .::...: :. KIAA09 LMIAGEERALCLVDVKKVKQSLAQSHLPAQPDISPNIFEAVKGCHLFGAGKIENG--LCI 1180 1190 1200 1210 1220 1230 520 530 540 550 560 570 KIAA04 CVAMKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGN :.:: .:. . .. ... :::.. . . . . .. .: . : . .. . . KIAA09 CAAMPSKVVILRYNENLSKYCIRKEIETSEPCSCIHFTNYSILIG-TNKFYEIDMK-QYT 1240 1250 1260 1270 1280 1290 580 590 600 610 620 630 KIAA04 PYSMLHSNDHTLS---FIAHQPMDAICAVEISS----KEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQ .: .:::.:. : : . . :...: .::::::. .:...: ::::: KIAA09 LEEFLDKNDHSLAPAVFAASSNSFPVSIVQVNSAGQREEYLLCFHEFGVFVDSYGRRSRT 1300 1310 1320 1330 1340 1350 640 650 660 670 680 690 KIAA04 QELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGL ..: : : . : ::: : :......... 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