# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01393.fasta.huge -Q ../query/KIAA0522.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0522, 1555 aa vs ./tmplib.23663 library 1985950 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2769+/-0.0113; mu= -22.7615+/- 0.761 mean_var=777.7625+/-184.205, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.045989 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) ( 740) 1763 133.2 1.9e-31 KIAA0763 ( 843 res) hk04726 ( 843) 1691 128.5 5.6e-30 KIAA0248 ( 1880 res) ha02775s1 (1880) 458 47.1 4e-05 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 376 41.5 0.0015 >>KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) (740 aa) initn: 1769 init1: 1696 opt: 1763 Z-score: 656.5 bits: 133.2 E(): 1.9e-31 Smith-Waterman score: 1803; 44.032% identity (64.987% similar) in 754 aa overlap (626-1359:4-723) 600 610 620 630 640 650 KIAA05 PERLPSTEPPPQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRA : : . .: :.. ::: . : KIAA11 AAGPPGLEAEGRAPESAGPGPGGDAAETPGLPP 10 20 30 660 670 680 690 700 710 KIAA05 AHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPP--GRAPIPHR :: : . : .:...... :: . . . .: :.. . : :.: . 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KIAA11 DLQPSPPRQQTPPLPPPPPTP-----P--------GTLVQCQQIVKVIVLDKPCLARMEP 630 640 650 660 670 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA05 SSSSASSTHHHHHHHHHGHSH-GGLGVLPDGQSKLQALHAQYCQGP-GPAPPPYLPPQQP :.: : . : . :: : : ... : : : : :::: :.: KIAA11 LLSQALSCYTSSSSDSCGSTPLGGPG------SPVKVTH----QPPLPPPPPPYNHPHQF 680 690 700 710 720 1360 1370 1380 1390 1400 1410 KIAA05 SLPPPPQQPPPLPQLGSIPPPPASAPPVGPHRHFHAHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAG :: KIAA11 C-PPGSLLHGHRYSSGSRSLV 730 740 >>KIAA0763 ( 843 res) hk04726 (843 aa) initn: 2492 init1: 1406 opt: 1691 Z-score: 630.0 bits: 128.5 E(): 5.6e-30 Smith-Waterman score: 3248; 62.486% identity (79.402% similar) in 869 aa overlap (401-1234:1-829) 380 390 400 410 420 430 KIAA05 ALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRM :::::::::: ...:.::::::::::::.: KIAA07 VEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQM 10 20 30 440 450 460 470 480 KIAA05 NKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASL-DEGAMAGAR :::::::::: ::.::::::.::::::::::: ::... .::::: .:. ..:.. :: KIAA07 NKNFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHS-SYFEGKQVSVTNDGSQLGAL 40 50 60 70 80 490 500 510 520 530 540 KIAA05 SHRLERGLPYGGSCGGGIDGGG-SSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNC : :: . .: . :..:.. ::::::.::.::::::::::.:::: KIAA07 VS------P---ECGDLSEPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNC 90 100 110 120 130 140 550 560 570 580 590 KIAA05 HPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQ---------QEDSSATSFSDLPLYLDDT-----VP-Q . : : :. . :... : . : ..:.::. ::.:. .: . KIAA07 R-SLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLS 150 160 170 180 190 600 610 620 630 640 KIAA05 QSPERLPSTEPPPQGR-----PEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLEC :. .: ::: . : :..:: : .:: . . . :. :: KIAA07 QAGDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAH------------KEDKADTDTSCRSTPSLER 200 210 220 230 240 650 660 670 680 690 700 KIAA05 RDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRA .. :::. :::::::::::::::::::::.:::..:: .:: . . .:. :: :: . : KIAA07 QEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKH-GPHSGA 250 260 270 280 290 300 710 720 730 740 750 760 KIAA05 PIPHRHYPAPEGPA--PAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESL : . : : : : :: :: .: . .: :. : .: :. . ::: ::.:. 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KIAA07 ELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQK 600 610 620 630 640 650 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA05 LGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSA :::::::.::::::::::::::::: ::::::::: : :.. ::.:.:: ::.: :. 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