# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00165s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0545.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0545, 1368 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7815222 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2058+/-0.000199; mu= 11.0516+/- 0.011 mean_var=119.0481+/-22.845, 0's: 24 Z-trim: 58 B-trim: 239 in 1/63 Lambda= 0.117547 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|92058729|sp|O60292.3|SI1L3_HUMAN RecName: Full= (1781) 9256 1582.0 0 gi|187957714|gb|AAI50621.1| Signal-induced prolife (1781) 9256 1582.0 0 gi|114676967|ref|XP_524247.2| PREDICTED: signal-in (1777) 9217 1575.4 0 gi|73948409|ref|XP_855409.1| PREDICTED: similar to (1700) 8723 1491.6 0 gi|148692119|gb|EDL24066.1| mCG122846 [Mus musculu (1776) 8710 1489.4 0 gi|149056394|gb|EDM07825.1| rCG54282 [Rattus norve (1776) 8655 1480.1 0 gi|126329121|ref|XP_001366781.1| PREDICTED: simila (1737) 5450 936.5 0 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signal (1674) 3114 540.4 3.9e-150 gi|124487493|ref|NP_001074806.1| signal-induced pr (1722) 3111 539.9 5.6e-150 gi|85681894|sp|Q9P2F8.2|SI1L2_HUMAN RecName: Full= (1722) 3109 539.5 7.1e-150 gi|152012571|gb|AAI50335.1| SIPA1L2 protein [Homo (1498) 3108 539.3 7.2e-150 gi|119590377|gb|EAW69971.1| signal-induced prolife (1704) 3108 539.4 8e-150 >>gi|92058729|sp|O60292.3|SI1L3_HUMAN RecName: Full=Sign (1781 aa) initn: 9256 init1: 9256 opt: 9256 Z-score: 8480.5 bits: 1582.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 9256; 100.000% identity (100.000% similar) in 1368 aa overlap (1-1368:414-1781) 10 20 30 KIAA05 DLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVS :::::::::::::::::::::::::::::: gi|920 LTASRAHSLGGLDPAFTSTEDLNCKENLEQDLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVS 390 400 410 420 430 440 40 50 60 70 80 90 KIAA05 FSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAYRTNASISVLEVPKEQQRTQSRPRQYSIEHVDLGARY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|920 FSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAYRTNASISVLEVPKEQQRTQSRPRQYSIEHVDLGARY 450 460 470 480 490 500 100 110 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