# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj07625.fasta.huge -Q ../query/KIAA0560.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0560, 1521 aa vs ./tmplib.23663 library 1985984 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9696+/-0.00562; mu= 18.4343+/- 0.383 mean_var=114.3226+/-26.729, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.119952 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0221 ( 1151 res) ha02799 (1151) 324 68.4 9.2e-12 KIAA0625 ( 2663 res) hg04796s1 (2663) 284 62.0 1.8e-09 KIAA1404 ( 1925 res) eg01672 (1925) 243 54.7 2.1e-07 >>KIAA0221 ( 1151 res) ha02799 (1151 aa) initn: 269 init1: 133 opt: 324 Z-score: 303.0 bits: 68.4 E(): 9.2e-12 Smith-Waterman score: 354; 24.187% identity (52.439% similar) in 492 aa overlap (1049-1517:623-1081) 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA05 KGRSYEEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASELLRSGLDRS-KYLLVKEAKIIAMTCTH :.: .: :. . :. .: .: ::. 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