# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00261.fasta.huge -Q ../query/KIAA0576.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0576, 1075 aa vs ./tmplib.23663 library 1986430 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2603+/-0.00596; mu= 23.1328+/- 0.409 mean_var=168.7270+/-42.285, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 88 in 1/39 Lambda= 0.098737 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 213 43.5 0.00014 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 211 43.1 0.00016 KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 206 42.9 0.00033 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 202 41.6 0.00035 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 202 41.8 0.00038 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 200 41.4 0.00043 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 196 40.8 0.00064 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 196 41.1 0.00072 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 180 38.6 0.0032 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 178 38.3 0.0039 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 174 37.6 0.0054 KIAA0211 ( 1317 res) ha02768 (1317) 177 38.8 0.0059 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 169 37.0 0.0092 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 168 36.8 0.01 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 95 init1: 55 opt: 213 Z-score: 174.2 bits: 43.5 E(): 0.00014 Smith-Waterman score: 302; 23.457% identity (47.795% similar) in 567 aa overlap (180-705:249-751) 150 160 170 180 190 200 KIAA05 QWLKMPGLKTGTINCGTKSSFRRGGHTWVSGKPILCPIMHCNKEFDNGHLLLGHL----- ::: : .:.: : .. : .: KIAA16 PSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKC--NECGKAFTQNSNLTSHRRIHSG 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 KIAA05 -KRFDHSPCDPT------ITLHGPFFSS---FACVVCYKKF----VTQQQYRDHLFDKEA : . : : : .:.: . .. . : : : : . : : .: KIAA16 EKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPY 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 KIAA05 TDD-------GHNNNLLPQIIQC----FACPNCFLLFSRKEECSKHMSGKNHFHQSFKLG . ::.: :.:. : : .: ::... . .: . : .. 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KIAA07 CPMCPEQFSSVEGVYCHL-DSHRQPDSSNHSVSPDPVLGSVASMSSATPDSSASVERGST 270 280 290 300 310 320 460 470 480 KIAA05 LECIAIP---KKKMNLKDKSHEGVA-----CVQKE-----------KSV-----VKTWFC . : .::: .. :. : ... :.. .. : KIAA07 PDSTLKPLRGQKKMRDDGQGWTKVVYSCPYCSKRDFNSLAVLEIHLKTIHADKPQQSHTC 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 KIAA05 E-CNQRFPSEDAVEKHVFS------------ANTMGYKCVVCGKVCDDSGVIRLHMSRIH . : . .:. ...:: . .: ...: : .. : . .. :. : KIAA07 QICLDSMPTLYNLNEHVRKLHKNHAYPVMQFGNISAFHCNYCPEMFADINSLQEHIRVSH 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 KIAA05 GGAHLN----NFLFWCRTCKKELTRKDTIMAHVTEFHNGHRYFYEMDEVEGETLPSSSTT : . : : :.: :. . .... :. . : . ..:. .. ... KIAA07 CGPNANPSDGNNAFFCNQCSMGFLTESSLTEHIQQAHCS----VGSAKLESPVVQPTQSF 450 460 470 480 490 600 610 620 630 KIAA05 LDNLT----ANKP--SSAITVIDHS-------PANSSPRGKW-QCRICEDMFDSQEYVKQ .. . .:.: .: . . : : : ..: : . :. :. .. KIAA07 MEVYSCPYCTNSPIFGSILKLTKHIKENHKNIPLAHSKKSKAEQSPVSSDVEVSSPKRQR 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 KIAA05 HCMSLASHKFHRYSCAHCRKPFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLIFNVEEAFL : : . .: : .: : ..:.. : . : . . : : : :. .:..: KIAA07 LSASANSISNGEYPCNQCDLKFSNFESFQTHLK-LHLELLLRKQACPQCKEDFDSQESLL 560 570 580 590 600 610 700 710 720 730 740 750 KIAA05 SHYEEHH-SIDYVFVSEKTETSIKTEDDFPV----IETSNQLTCG-CRESYICKVNRKED .: :. . . .: :. . .... ::. ..: : :.: . ::. . 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KIAA15 SEKMT--TYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIH--------TG 160 170 180 190 200 370 380 390 400 410 420 KIAA05 EKSITQVAEKFILRGYCPDCNQVFVDETST-QNHKQNSGHKVRVINSVEESVLLYCHSSE :: : .:.:.: ... ..:: ..:.: : : KIAA15 EKPYK-----------CKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEK-----PYE------C---- 210 220 230 240 430 440 450 460 470 480 KIAA05 GNKDPSSDLHLLLDQSKFSSLKRTMSIKESSSLECIAIPKKKMNLKDKSHEGVACVQKEK :. .. . .: . .. . :. . :: :. . . :. .: :. . KIAA15 --KECGKAFTVLQELTQHQRLHTG-----EKPYEC-----KECGKAFRVHQQLARHQRIH 250 260 270 280 490 500 510 520 530 KIAA05 SVVKTWFC-ECNQRFPSEDAVEKH--VFSANTMGYKCVVCGK--VCDDSGVIRLHMSRIH . : . : .:.. : . . .: . .:. . :.: ::: :: . .:.:. .:: KIAA15 TGEKPYECKDCGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKL-YECKECGKAFVCGPD--LRVHQ-KIH 290 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 KIAA05 GGAHLNNFLFWCRTCKKELTRKDTIMAHVTEFHNGHRYFYEMDEVEGETLPSSSTTLDNL : . . :. : : . . . .: . .:.:.. :: : :.:. . . . KIAA15 FGEK----PYECKECGKAFRICQQLTVHQS-IHTGEKP-YECKEC-GKTFRLRQQLVRHQ 350 360 370 380 390 600 610 620 630 640 KIAA05 ---TANKP----------SSAITVIDHSPANSSPRGKWQCRICEDMFDSQEYVKQHCMSL : .:: :: .:.:. . . : ..:. : : . :: .:. KIAA15 RIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGER-PYECEECGKAFRLLSQLTQH-QSI 400 410 420 430 440 450 650 660 670 680 690 700 KIAA05 ASHKFHRYSCAHCRKPFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLIFNVEEAFLSHYEE . . . : : .:::::. . : .: :. : .: : : : : . .::..... KIAA15 HTGE-KPYECKECRKPFRLLSQLTQH-QSIHTGEKP--YECKECGKAFRLY-SFLTQHQR 460 470 480 490 500 510 710 720 730 740 750 760 KIAA05 HHSIDYVFVSEKTETSIKTEDDFPVIETSNQLTCGCRESYICKVNRKEDYSRCLQIMLDK :. KIAA15 IHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI 520 530 540 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 74 init1: 74 opt: 202 Z-score: 166.3 bits: 41.8 E(): 0.00038 Smith-Waterman score: 294; 22.464% identity (50.543% similar) in 552 aa overlap (188-703:166-673) 160 170 180 190 200 210 KIAA05 KTGTINCGTKSSFRRGGHTWVSGKPILCPIMHCNKEF--DNGHLLLGHLKRFDHSPCDPT .. .:.: ..: :: . ..: : KIAA19 LGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPE 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 KIAA05 ITLHGPFF---SSFACVVCYKKFVTQQQYRDHLFDKEATDDGHNNNLLPQIIQCFACPNC ..:: . ..: :.:. :. :.: .. ::. .:. : .: KIAA19 --CESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTK-----HVFVQQQR--------LPSREECY-CWEC 200 210 220 230 280 290 300 310 320 330 KIAA05 FLLFSRKEECSKHMSGKNHF-HQSFKLGD-NKGIAHPISFPSFAKKLLISLCKDVPFQVK ::. . :.:. . : .. .. :. .:...: :.... . : :.. 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KIAA19 CGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKG-NLIQHQRSHTGERPYECRECRK 410 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 550 KIAA05 RFPSEDA-VEKHVFSANTMGYKCVVCGKVCDDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCK : ... .:.. .. :.: ::: .::. .:.:. :.: : . : : : KIAA19 LFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQ-RVHTGEKP----FECSECG 470 480 490 500 510 520 560 570 580 590 600 KIAA05 KELTRKDTIMAHVTEFHNGHRYFYEMDEVEGETLPSSSTTLDNL---TANKPSSA----- : . .. ... : . :.:.: :: : :... .::. : . ::..: KIAA19 KSFPQSCSLLRH-RRVHTGERP-YECGEC-GKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGK 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 KIAA05 --ITVIDHSPANSSPRGKWQCRICEDMFDSQEYVKQHCMSLASHKFHRYSCAHCRKPFHK ....: .... : ..:: : : . .: . : . . . : :..: : : . KIAA19 FFSSLLEHRRVHTGER-PYECRECGKTFTRRSAHFKH-QRLHT-RGKPYECSECGKSFAE 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 KIAA05 IETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLIFNVEEAFLSHYEEHHSIDYVFVSEKTETSIKT .: .: . : .: : :. : :. ..: : . : KIAA19 TFSLTEH-RRVHTGERP--YECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 KIAA05 EDDFPVIETSNQLTCGCRESYICKVNRKEDYSRCLQIMLDKGKLWFRCSLCSATAQNLTD >>KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 (579 aa) initn: 137 init1: 64 opt: 200 Z-score: 165.3 bits: 41.4 E(): 0.00043 Smith-Waterman score: 218; 24.204% identity (51.911% similar) in 314 aa overlap (378-676:303-577) 350 360 370 380 390 400 KIAA05 FRVHCRNAGPVAVAEKSITQVAEKFILRGYCPDCNQVFVDETSTQNHKQ-NSGHKVRVIN : ::...:. .. :.. ..:.: . : KIAA18 YAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCN 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 KIAA05 SVEESVLLYCHSSEGNKDPSSDLHLLLDQSKFSSLKRTMSIKESSSLECIAIPKKKMNLK .: . : .. .: . ..:.. :. :.:.. ::::: ...... KIAA18 ECGKS---FSHRANLTKHQRTHTRILFECSEC---KKTFT--ESSSLAT----HQRIHVG 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 KIAA05 DKSHEGVAC----------VQKE--KSVVKTWFC-ECNQRFPSEDAVEKHVFS-ANTMGY .. .: : ::.. .. :: . : ::.. : .:. :: . .. : KIAA18 ERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPY 390 400 410 420 430 440 520 530 540 550 560 570 KIAA05 KCVVCGKVCDDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCKKELTRKDTIMAHVTEFHNGHR :: :::. . . . :. :.: : . . : : : .... .. : ..:.:.. KIAA18 KCQECGKAFSHCSSLTKHQ-RVHTGEKP----YECSECGKTFSQSTHLVQH-QRIHTGEK 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 KIAA05 YFYEMDEVEGETLPSSSTTLDNLTANKPSSAITVIDHSPANSSPRGKWQCRICEDMFDSQ :: .: :.:. :: :.. .. : ..: ..: : : . 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KIAA20 SFQCNE----SGKAFNYSSLLRKHQIIH--LADKYKCDVCGKLFNQKRNLACH----RRC 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 KIAA05 DDGHNNNLLPQIIQCFACPNCFLLFSRKEECSKHMSGKNHFHQSFKLGDNKGIAHPISFP :.: : . : .: ::. . : ..: . : . . . : KIAA20 HTGEN----P-----YKCNECGKTFSQTSSLTCH----RRLHTGEKPYKCEECDKAFHFK 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 KIAA05 SFAKKLLISLCKDVPFQVKCVACHKTLRSHMELTAHFRVH-------CRNAGPVAVAEKS :. .. : .. :. :: : ::.:.. :: : :.: : . : . ..: KIAA20 SILERHRIIHTEEKPY--KCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSS 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 KIAA05 IT-----QVAEKFILRGYCPDCNQVFVDETSTQNHKQ-NSGHKVRVINSVEESVLLYCHS .: ...:: : .:...: ..: :.. ..:.: . :: : : KIAA20 LTCHHRLHTGEKPY---KCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPY---KCEECDKAY--S 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 KIAA05 SEGNKDPSSDLHLLLDQSKFSSLKRTMSIKESSSLECIAIPKKKMNLKDKSHEGVACVQK ..: . .: . : . .:.: ..::: : . . : : . KIAA20 FRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFS--RTSSLTC----------HRRRHTGEQPYKC 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 KIAA05 EKSVVKTWFCECNQRFPSEDAVEKHV-FSANTMGYKCVVCGKVCDDSGVIRLHMSRIHGG : ::.. : .. .:.: . .. ::: :::. . .. . : :.: : KIAA20 E---------ECDKAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHH-RLHTG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 KIAA05 AHLNNFLFWCRTCKKELTRKDTIMAHVTEFHNGHRYFYEMDEVEGETLPSSSTTLDNLTA . . : :.: .. :... : ..:.:.. :. : :.:. .. :: KIAA20 EKA----YKCNECSKTFSWKSSLTCH-RRLHSGEKP-YKCKEC-GKTFNQQ------LTL 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 KIAA05 NKPSSAITVIDHSPANSSPRGKWQCRICEDMFDSQEYVKQHCMSLASHKFHRYSCAHCRK .. :: : : ..:. . .. . .. : ... ... . :.: .: : KIAA20 KRHRRL-----HSGEN--P---YKCEDSDKAYSFKSNLEIH-QKIHTEQ-NPYKCNECGK 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 KIAA05 PFHKIETLYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLIFNVEEAFLSHYEEHHSIDYVFVSEKTET : . .: : . : .: : : :: : :. :. : :. : : . KIAA20 TFSRTSSLTCH-RRLHTGEKPYK--CEECDKAFRVK----SNLEGHRRIHTGEKPYKCNE 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 KIAA05 SIKTEDDFPVIETSNQLTCG-----CRESYICKVNRKEDYSRCLQIMLDKGKLWFRCSLC :: . . ..: : : : : : .. : . : :. ..:. : KIAA20 CGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNE---CGKNFSQKSSLICHHRLHTGEKPYKCNEC 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 KIAA05 SATAQNLTDMNTH--IHQVHKEKSDEEEQQYVIKCGTCTKAFHDPESAQQHFHRKHCFLQ . : .. .... : .: .:. 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