# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01354a.fasta.nr -Q ../query/KIAA0615.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0615, 943 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826287 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7951+/-0.000191; mu= 11.8252+/- 0.011 mean_var=92.8226+/-18.107, 0's: 36 Z-trim: 40 B-trim: 376 in 1/65 Lambda= 0.133121 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114662446|ref|XP_520627.2| PREDICTED: Nedd4 bin ( 961) 6237 1208.5 0 gi|109128446|ref|XP_001109863.1| PREDICTED: Nedd4 ( 962) 6179 1197.4 0 gi|158515401|sp|O75113.3|N4BP1_HUMAN RecName: Full ( 896) 5936 1150.7 0 gi|182888093|gb|AAI60019.1| NEDD4 binding protein ( 896) 5927 1149.0 0 gi|82568915|gb|AAI08289.1| N4BP1 protein [Homo sap ( 828) 5491 1065.2 0 gi|119603135|gb|EAW82729.1| Nedd4 binding protein ( 810) 5366 1041.2 0 gi|73950420|ref|XP_535311.2| PREDICTED: similar to ( 884) 4978 966.7 0 gi|109507840|ref|XP_214648.4| PREDICTED: similar t ( 938) 4940 959.4 0 gi|194208571|ref|XP_001491059.2| PREDICTED: simila ( 933) 4878 947.5 0 gi|158564327|sp|Q6A037.2|N4BP1_MOUSE RecName: Full ( 893) 4831 938.5 0 gi|74184736|dbj|BAE27970.1| unnamed protein produc ( 893) 4786 929.9 0 gi|67968003|dbj|BAE00483.1| unnamed protein produc ( 701) 4499 874.7 0 gi|59808608|gb|AAH89324.1| N4bp1 protein [Mus musc ( 694) 3673 716.0 1.5e-203 gi|193785550|dbj|BAG50916.1| unnamed protein produ ( 359) 2427 476.5 9.6e-132 gi|74148028|dbj|BAE22344.1| unnamed protein produc ( 383) 2026 399.5 1.5e-108 gi|149636979|ref|XP_001506644.1| PREDICTED: simila (1238) 1689 335.2 1.2e-88 gi|74217968|dbj|BAE41972.1| unnamed protein produc ( 297) 1527 303.6 9e-80 gi|148679085|gb|EDL11032.1| mCG11550 [Mus musculus ( 474) 1483 295.3 4.5e-77 gi|82082531|sp|Q5ZLE9.1|N4BP1_CHICK RecName: Full= ( 931) 1404 280.3 2.8e-72 gi|109499503|ref|XP_577315.2| PREDICTED: similar t ( 506) 1250 250.6 1.4e-63 gi|109471643|ref|XP_001068669.1| PREDICTED: simila ( 361) 1246 249.7 1.8e-63 gi|109471645|ref|XP_001068717.1| PREDICTED: simila ( 329) 1245 249.5 2e-63 gi|109471640|ref|XP_001068465.1| PREDICTED: simila ( 361) 1232 247.0 1.2e-62 gi|109462432|ref|XP_001063174.1| PREDICTED: simila ( 300) 1228 246.2 1.7e-62 gi|109459064|ref|XP_344922.3| PREDICTED: similar t ( 312) 1227 246.0 2.1e-62 gi|109471638|ref|XP_001068419.1| PREDICTED: simila ( 329) 1205 241.8 4e-61 gi|109471634|ref|XP_001068318.1| PREDICTED: simila ( 339) 1172 235.5 3.3e-59 gi|109471632|ref|XP_578218.2| PREDICTED: similar t ( 336) 1160 233.1 1.6e-58 gi|149032638|gb|EDL87508.1| similar to Nedd4 bindi ( 473) 1101 221.9 5.5e-55 gi|62646746|ref|XP_578220.1| PREDICTED: similar to ( 257) 1092 220.0 1.1e-54 gi|82176585|sp|Q7ZXG4.1|N4BP1_XENLA RecName: Full= ( 848) 1086 219.2 6.3e-54 gi|82183664|sp|Q6DJS0.1|N4BP1_XENTR RecName: Full= ( 819) 1080 218.1 1.4e-53 gi|13278429|gb|AAH04022.1| N4bp1 protein [Mus musc ( 381) 1006 203.6 1.4e-49 gi|37589190|gb|AAH59205.1| Zgc:66437 [Danio rerio] ( 849) 983 199.5 5.7e-48 gi|158564242|sp|Q1LVK9.2|N4BP1_DANRE RecName: Full ( 849) 970 197.0 3.2e-47 gi|94733126|emb|CAK04516.1| novel protein (zgc:664 ( 858) 970 197.0 3.2e-47 gi|47205721|emb|CAF88970.1| unnamed protein produc ( 513) 966 196.0 3.7e-47 gi|163916370|gb|AAI57721.1| LOC100137686 protein [ ( 827) 877 179.1 7.5e-42 gi|109499505|ref|XP_001064644.1| PREDICTED: simila ( 195) 866 176.5 1.1e-41 gi|109465738|ref|XP_001054886.1| PREDICTED: simila ( 207) 857 174.8 3.7e-41 gi|126278224|ref|XP_001380295.1| PREDICTED: hypoth ( 772) 846 173.1 4.4e-40 gi|109519149|ref|XP_001081697.1| PREDICTED: simila ( 190) 834 170.3 7.4e-40 gi|26336803|dbj|BAC32084.1| unnamed protein produc ( 274) 830 169.7 1.7e-39 gi|126278220|ref|XP_001380281.1| PREDICTED: simila (1896) 805 165.5 2.1e-37 gi|154425921|gb|AAI51401.1| LOC100124517 protein [ ( 676) 799 164.0 2.1e-37 gi|28071086|emb|CAD61924.1| unnamed protein produc ( 678) 799 164.0 2.1e-37 gi|26327849|dbj|BAC27665.1| unnamed protein produc ( 552) 797 163.6 2.3e-37 gi|194038837|ref|XP_001927174.1| PREDICTED: simila ( 663) 797 163.7 2.7e-37 gi|148704283|gb|EDL36230.1| RIKEN cDNA 9130227C08R (2203) 797 164.0 6.7e-37 gi|158256792|dbj|BAF84369.1| unnamed protein produ ( 678) 788 161.9 9e-37 >>gi|114662446|ref|XP_520627.2| PREDICTED: Nedd4 binding (961 aa) initn: 6237 init1: 6237 opt: 6237 Z-score: 6470.1 bits: 1208.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6237; 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