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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0644, 887 aa vs ./tmplib.23663 library 1986618 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1437+/-0.00736; mu= 8.2159+/- 0.499 mean_var=265.5517+/-68.332, 0's: 0 Z-trim: 29 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.078705 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 442 63.8 5.8e-11 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 352 54.1 1e-07 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 322 50.9 1.4e-06 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 307 48.8 3.1e-06 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 308 49.3 4e-06 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 294 47.2 7.9e-06 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 266 43.9 6.3e-05 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 256 43.4 0.00024 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 237 40.7 0.00069 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 240 41.5 0.00076 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 233 40.5 0.0011 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 226 39.4 0.0015 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 224 39.1 0.0016 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 223 39.2 0.0023 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 221 39.1 0.0029 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 222 39.5 0.0033 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 206 37.2 0.0075 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 208 37.8 0.0092 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 203 36.8 0.0097 >>KIAA0416 ( 529 res) hh00236 (529 aa) initn: 709 init1: 269 opt: 442 Z-score: 288.7 bits: 63.8 E(): 5.8e-11 Smith-Waterman score: 467; 28.571% identity (51.710% similar) in 497 aa overlap (50-530:1-427) 20 30 40 50 60 70 KIAA06 AETRAGLRTKDGGGAGRRCEVRKRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIR-PLHAGREAME : . :: . :: .. :: : . 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KIAA08 SHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFG-EPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQ 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 KIAA06 KLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLES-LVKLRLD :: : :..:... . ... : .:. : ..:.:. : : :..: : :. ..:. 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KIAA08 SEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQTHLKEL 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 KIAA06 ------WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSC :::.:. : .:. : . : .: :.: :: : :. . .: :.. : KIAA08 ILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQH---SVNVSCAHPEWLAGQSILNVD---LKDFVC 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 KIAA06 ADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARE : KIAA08 DDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYW 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618 aa) initn: 777 init1: 240 opt: 322 Z-score: 210.2 bits: 50.9 E(): 1.4e-06 Smith-Waterman score: 433; 26.110% identity (49.911% similar) in 563 aa overlap (7-486:24-570) 10 20 30 KIAA06 YPGSAERPAPPDLAGRS--PPAET--RAGLRTKDGGGA-GRRC :: .: :: ::. :: : ::.: : . 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KIAA08 IQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHM 230 240 250 260 270 280 280 290 300 KIAA06 GKLRFLNLSANEL---------------QP------------SLR-------HAATFA-- ::: . : .:.: .: ::: . . :. KIAA08 PKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPTIGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCS 290 300 310 320 330 340 310 320 KIAA06 --------PLRSLSS----------------------------------LILSANSLQHL : .::: . : :... . KIAA08 GQGEAGRVPTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSI 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 KIAA06 GPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLE : :. .: ..: .::....::.:: ::..: : : ::....:: ... :..:. KIAA08 PPGAFSPYRKLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQ 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 KIAA06 ALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCD : :..:... ..: .: : : ::: .: ...:. :.. :. : : : . :: KIAA08 LLLLNANKINCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQSLAKGTFTSLRAIQTLHLAQNPFICD 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 KIAA06 CRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLT : :. :..:. . . : ..: : : .: . . ..... KIAA08 CNLK----WLADFLRTNPIETSGARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRCSAKEQYFIPGTED 530 540 550 560 570 580 510 520 530 540 550 560 KIAA06 ADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRSALRL KIAA08 YQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRLNNNEISILEATGM 590 600 610 620 630 640 >>KIAA1246 ( 832 res) hh00149a (832 aa) initn: 277 init1: 159 opt: 307 Z-score: 203.9 bits: 48.8 E(): 3.1e-06 Smith-Waterman score: 310; 32.622% identity (54.573% similar) in 328 aa overlap (46-361:3-306) 20 30 40 50 60 70 KIAA06 RSPPAETRAGLRTKDGGGAGRRCEVRKRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIRP-LH--A : :: ..: . : : : :. :: : . 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KIAA08 RAR-LALALALASVLSGPPAV--ACPTKCTCSAAS-VDCHGLGLRAVPR----GIPRNAE 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 KIAA06 TYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQAL .: : :: :: .:: : .:: : :. ::. .. .:. :..::.: :..: ::.: KIAA08 RLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVL 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 KIAA06 APGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLL . :: : . :.:. . : .:.:. .. .:.::.: .. . :..: : .: KIAA08 PELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLE 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 KIAA06 YLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPS---------LRHAAT-------FA : :..: : . ..: .. :.: : : .:.: . ::. : .: KIAA08 ILTLNNNNISRILVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMA 230 240 250 260 270 280 310 KIAA06 P--LRSLS------------------------------------SLI------------- : ::... ... KIAA08 PVHLRGFNVADVQKKEYVCPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPAN 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 KIAA06 ---------LSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEG : ::.. . : . .: ... ::.. .::.:: ::..: : : : KIAA08 LPEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYG 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 KIAA06 NRLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFA :..... .:.. : ::. : :..:... :. :: : : ::: .: :...: .:: KIAA08 NKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFA 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 480 KIAA06 ASPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDD .. : : : ..:::.:. :..:. ... . : ..: : : .: .. . . KIAA08 PLQSIQTLHLAQNPFVCDCHLK----WLADYLQDNPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKS 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 KIAA06 QQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGV .... .. : KIAA08 KKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLN 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1497 ( 730 res) hg01608 (730 aa) initn: 330 init1: 192 opt: 294 Z-score: 196.5 bits: 47.2 E(): 7.9e-06 Smith-Waterman score: 396; 26.869% identity (54.439% similar) in 428 aa overlap (72-474:5-421) 50 60 70 80 90 KIAA06 KRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIRPLHAGREAMEAARALRLLLVVCGC-----LALP .: : . : :. .:. .: : . KIAA14 NFGVSGVELAQQASMARMSFVIAACQLVLGLLMT 10 20 30 100 110 120 130 KIAA06 PLAEPV-----CPERCDCQ-----HPQHLL-------CTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLT :.: ::. : :. :: :.. : .: :.: : .:: KIAA14 SLTESSIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIP--SNLSSDTQVLL 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 KIAA06 YSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALA : .: :.. :. ....: .: .::.. :.. ... . .:..: :.: .: . .. KIAA14 --LQSNNIAK-TVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQITEMT 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 KIAA06 PGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLY : : .:. :: : :.:: .: .: ::..:..:.:..: : .. . : :: KIAA14 DYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEI 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 KIAA06 LHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQH : . : . . : :..:: : :.. : .: .. : :: :: . :.: . 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KIAA18 NNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTF 420 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 430 KIAA06 EPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALS-GDIFAASPALYRLDL . : .:. : :..: : .: :: . : .:.:::: .: : .. ::. ..:: KIAA18 DALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTA-LTRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDL 480 490 500 510 520 530 440 450 460 470 480 490 KIAA06 DGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCAD . : : : : . ::: : :... .. : :. : : KIAA18 QENPWDCTCDIMGLKDWTE--HANSPVIINEVTCESPAKHAG 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 KIAA06 PSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELV >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 291 init1: 254 opt: 256 Z-score: 170.0 bits: 43.4 E(): 0.00024 Smith-Waterman score: 273; 29.146% identity (56.281% similar) in 199 aa overlap (295-493:71-263) 270 280 290 300 310 320 KIAA06 NRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRI :. . . :: :. : : : .... : KIAA02 TLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSI--LDLRFNRIREIQPGA 50 60 70 80 90 330 340 350 360 370 380 KIAA06 FQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDL :..: :. : : .::. .. :: :: :. : : :..... .. : ::: : : KIAA02 FRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYL 100 110 120 130 140 150 390 400 410 420 430 440 KIAA06 SGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLR :.. .: : .: :: .:..: :.:: .. : : .. :: ::.: :::.. 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