# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/sj09778.fasta.huge -Q ../query/KIAA0651.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0651, 1114 aa vs ./tmplib.23663 library 1986391 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5746+/-0.00675; mu= 3.9374+/- 0.454 mean_var=160.4751+/-39.365, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 136 in 1/39 Lambda= 0.101244 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050) 1449 224.4 6.9e-59 KIAA0380 ( 1539 res) hh00518 (1539) 537 91.3 1.2e-18 KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443) 519 88.6 6.8e-18 KIAA0720 ( 1091 res) hk01741s1 (1091) 229 46.2 3.1e-05 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 204 42.7 0.00054 KIAA2016 ( 1715 res) pf04366 (1715) 203 42.5 0.00061 >>KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050 aa) initn: 1479 init1: 1076 opt: 1449 Z-score: 1149.1 bits: 224.4 E(): 6.9e-59 Smith-Waterman score: 1581; 37.229% identity (67.108% similar) in 830 aa overlap (242-1015:11-826) 220 230 240 250 260 KIAA06 LANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIY----PSDSFRQSLLGSR .....:.: ... :. : .. :. KIAA05 WRRAACGRSGRASLKEHPRGTLLSDGSPALSRNVGMTVSQ 10 20 30 40 270 280 290 300 310 320 KIAA06 RGRSSLSLAKSVSTTN---IAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEEV .: . . . . :. :.:.. ::. .. .. . . :::.. . ..::.. :. KIAA05 KGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEM-DEADSAFLKFKQTADDSLSLT--SPNTESIFVEDP 50 60 70 80 90 330 340 350 360 370 380 KIAA06 IYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKI . : :..: : ..: :.:::::::... ...:.::.:.:::.:::.:::.:::::::: KIAA05 YTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHVRTLKI 100 110 120 130 140 150 390 400 410 420 430 440 KIAA06 MTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIH : ... .. :::.. .. ::::.:.: . :..::..: :::...: :: ::.::. KIAA05 MLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKERRQESLEEGSDRNYVIQ 160 170 180 190 200 210 450 460 470 480 490 500 KIAA06 RLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLK ..::::..:::: ..:.: . :. ::: :..:.. :: : ..:.::..:.:. .... KIAA05 KIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNKKFQNLIKKIGNFSIVR 220 230 240 250 260 270 510 520 530 540 550 560 KIAA06 RHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQL : :::::::::::::::::.:. ::.:.... :. .::: ::.:.:...:.:: . . KIAA05 RLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALNLIKDIISQVDAKVSEC 280 290 300 310 320 330 570 580 590 600 610 620 KIAA06 EKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLM ::: ::.:: ..:: .... . . : .:..:.:.: .: : :::..::.::.:..:. KIAA05 EKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLCWKTTSGRLKDILAILL 340 350 360 370 380 390 630 640 650 660 670 680 KIAA06 TDVLVFLQEKDQKYIFPTLD-KPSVVSLQNLIVRDIANQEKGMFLISAA--PPEMYEVHT ::::..::::::::.: ..: :: :.:::.::::..::.::.::::::. :::::..: KIAA05 TDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMFLISASLQGPEMYEIYT 400 410 420 430 440 450 690 700 710 720 730 KIAA06 ASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDE--------AYLRRIKMELQQKDRALV .:..::..:. ::..:..::..:. :. :.: . :: .. .:..::. .. KIAA05 SSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKVVEARATRLRDFQERLSMKDQLIA 460 470 480 490 500 510 740 750 760 770 780 790 KIAA06 ELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRS-ESLESPRGERLLQDAIREVEG . : :: .. ::... . :: :: ::::::. . :. .:: .:..:. :.:: KIAA05 QSLLEKQQIYLEMAEMGGLED------LPQ-PRGLFRGGDPSETLQGELILKSAMSEIEG 520 530 540 550 560 570 800 810 820 830 KIAA06 LKDLL---VGPG---VELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANG-----------EART ...:. .: . .: . : : .: . . . : :: . : KIAA05 IQSLICRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRD 580 590 600 610 620 630 840 850 860 870 KIAA06 FNG---SIELCRADSDSSQRDRNGNQL----------RSP---QEEALQRLVNLYGLLHG . : : .: .::: .... :. : : . : .::. .: :: . KIAA05 WRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDPRLPTVLESELVQRIQTLSQLLLN 640 650 660 670 680 690 880 890 900 910 920 930 KIAA06 LQAAVAQQDTLMEARFPEGPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQR-Q :::..:.::. .:.. :: :: : .: :. ::: : : :.. : KIAA05 LQAVIAHQDSYVETQRAAIQER-EKQFRLQSTRGNLLLEQERQRNFEKQREERAALEKLQ 700 710 720 730 740 940 950 960 970 980 990 KIAA06 HALLQEELR--RCRRLGEERATEAGS-LEARLRESEQARALLEREAEEARRQLAALGQTE : .:. : : :. ... .::. :. : :..: : ::.: : .:: : . KIAA05 SQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRERLEQERAELERQRQAYQHDL 750 760 770 780 790 800 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA06 PLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHRNFEDRER :: .: :. .:. : KIAA05 ERLREA---QRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEG 810 820 830 840 850 860 >>KIAA0380 ( 1539 res) hh00518 (1539 aa) initn: 591 init1: 268 opt: 537 Z-score: 426.9 bits: 91.3 E(): 1.2e-18 Smith-Waterman score: 672; 24.890% identity (54.185% similar) in 908 aa overlap (235-1098:628-1459) 210 220 230 240 250 260 KIAA06 HNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYP---SD-SFR .: ::... ... .. : :: .. KIAA03 PEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMD 600 610 620 630 640 650 270 280 290 300 310 KIAA06 QSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESP-LGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESL . ..: .:. : ..:.:: .. . .: .: : : : ::.. . :: . : KIAA03 AAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIES---PSLGFCTDTL-LPHL 660 670 680 690 700 710 320 330 340 350 360 370 KIAA06 IDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHV ..... .::.: : : :..:. .: .. . .. . .:.:: ::. :: :. KIAA03 LEDDL---GQLSDLE-PEPD--AQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHL 720 730 740 750 760 380 390 400 410 420 430 KIAA06 RTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTR :::... .: : .: . . ::: . :: .::. . . . :... : KIAA03 RTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREEG--P---- 770 780 790 800 810 820 440 450 460 470 480 490 KIAA06 NFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVTR .:....::....:.::. :.. .. ..::: .: ::.: : ...::: :.... KIAA03 --IIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAES 830 840 850 860 870 500 510 520 530 540 550 KIAA06 PAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVDE .: ... :. ::.::::::. :..:..: :.. : : .:.:. :.: KIAA03 HPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNE 880 890 900 910 920 930 560 570 580 590 600 610 KIAA06 GIYQLEKGARLQEIYNRMDPRA--QTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTATGRFK .. : :. ::. .:.: : .. : . : .: ::.::.: : :. . . KIAA03 AVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTL 940 950 960 970 980 990 620 630 640 650 660 KIAA06 DVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVS------------LQNLIVRDIANQEKG :. :::. :.::.::..:.: .. .: .: : :. ...:..:..... KIAA03 DLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRA 1000 1010 1020 1030 1040 1050 670 680 690 700 710 720 KIAA06 MFLISAA---PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDF-PLIETEDEAYLRRI .:.: .. ::..::. . . .:..::.......::. . :. :. KIAA03 FFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 730 740 750 760 770 780 KIAA06 KMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPRGER .. .: ::: . .: : . : . :: : .. ... . . KIAA03 AQQGPTPSR--VEL--DDSDVF----HGEPEPE--------ELPGGTGSQQRVQG-KHQV 1120 1130 1140 1150 1160 790 800 810 820 830 840 KIAA06 LLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFNGSIE ::.: : :: . :: . : :. :. .. : : : .: : . KIAA03 LLEDP--EQEGSAEE-----EELGVLP-CPSTSLDGENRGIR----TRNPIHLAFPGPLF 1170 1180 1190 1200 1210 850 860 870 880 890 KIAA06 LCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLL--HGLQAAVAQQDTLMEARFPEGP . .. .::. .: : :..:. :..:: : ... .::. : . : KIAA03 M-EGLADSALEDV----------ENLRHLI-LWSLLPGHTMETQAAQEP---EDDLTPTP 1220 1230 1240 1250 900 910 920 930 940 950 KIAA06 ERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCR------RLG .. ..:. . : : :: . : . :.:: :. .. ::.. : : KIAA03 ----SVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPE-QEDMGLCSLEHLPPRTR 1260 1270 1280 1290 1300 1310 960 970 980 990 1000 KIAA06 EERATEAGSLEARLRE----SEQARAL-LEREAEEARRQLA-AL---GQTEPLPAEAPWA . :. :. : : .: : . . :.:: : ... :: ::.:: : :. . KIAA03 NSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPPEVEGG 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA06 RRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHR----NFEDRERQELGS . . :. .:.:. :. .::. . :.. . . : . . . :. KIAA03 TKAT---------GNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQLQGGN 1380 1390 1400 1410 1420 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA06 PEERLQDSSDPDTGSEEEGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES . : . : :. . .. : . . ..:..:. KIAA03 DDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPV 1430 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA03 GSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP 1490 1500 1510 1520 1530 >>KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443 aa) initn: 420 init1: 203 opt: 519 Z-score: 413.1 bits: 88.6 E(): 6.8e-18 Smith-Waterman score: 592; 25.458% identity (57.326% similar) in 546 aa overlap (236-732:542-1080) 210 220 230 240 250 260 KIAA06 NRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLG :..::.. : ... :..:. . : KIAA03 SAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASG 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 320 KIAA06 S----RRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLN-MRNRTLSVESLI . . :. . . .:.:. :. : : .: : ... :. .... :: . KIAA03 ASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVT 580 590 600 610 620 630 330 340 350 360 KIAA06 D----------EEVIYSELMSDFEMDEKDFAAD--SWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVI . . : ..: .:. :. :.:. .: .:. :. : : .:.:.:: KIAA03 EHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVI 640 650 660 670 680 690 370 380 390 400 410 420 KIAA06 YELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLER ::. :: ::::::.. ..: . .: : :. .. .: .... ..: . :. KIAA03 NELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAV 700 710 720 730 740 750 430 440 450 460 470 480 KIAA06 RRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDK :.. ... :: ..:. :.. ::::. :.. .. . ::: . ::.. : .:. KIAA03 RKR------NETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDS 760 770 780 790 800 490 500 510 520 530 540 KIAA06 RFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALG ::: :.. . . .: ... : ::.::::::.. : .... ::. . : KIAA03 RFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEW-PTEREKVKKAAD 810 820 830 840 850 860 550 560 570 580 590 600 KIAA06 LVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQ--TPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC ...:. :.... . :. ::.. :.: . . :. . .: .::.::.: KIAA03 HCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGP 870 880 890 900 910 920 610 620 630 640 650 KIAA06 LLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIF--------PTLDKPS----VVSLQNL :.::. . :. .::. :.::.::..:.. .. : :. :..:... KIAA03 LVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTV 930 940 950 960 970 980 660 670 680 690 700 KIAA06 IVRDIANQEKGMFLISAAP--PEMYEVHTASRDDRSTWIRVI--------QQSVRTCPSR .::..:...:..:.:: . ..::. . . .....: .: .::.. : KIAA03 LVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLP 990 1000 1010 1020 1030 1040 710 720 730 740 750 KIAA06 EDFPLIETEDEAYLRRIKME--------LQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGG .. : .:: ..: : ::. :: : KIAA03 QSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEV 1050 1060 1070 1080 1090 1100 760 770 780 790 800 810 KIAA06 SGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLE KIAA03 RDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQ 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>KIAA0720 ( 1091 res) hk01741s1 (1091 aa) initn: 166 init1: 81 opt: 229 Z-score: 185.8 bits: 46.2 E(): 3.1e-05 Smith-Waterman score: 283; 22.518% identity (52.837% similar) in 564 aa overlap (343-871:403-916) 320 330 340 350 360 370 KIAA06 TLSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELI ::: .:. .. .. .::....::. KIAA07 LPRGLRFDHDSWEEEYDEDEDEDNACLRLEDSWRELIDGH--EKLTRRQCHQQEAVWELL 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 KIAA06 QTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVV-----QGLFPCVDELSDIHTRF----LS .:: ..: :... :: .:. :. : :.. . :: . :....: :. .. KIAA07 HTEASYIRKLRVIINLFLCCLLN-LQ-ESGLLCEVEAERLFSNIPEIAQLHRRLWASVMA 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 480 KIAA06 QLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKEL .::. :. :: .. . ::.: . :. .. . : : ..: .. .. .. : KIAA07 PVLEKARR------TRALL--QPGDFL-KGFKMFGS--LFKPYIRYCMEEEGCMEYMRGL 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 KIAA06 YARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEER--Q . :. .: . . .: ... . ::.::::::.. .:... :: : . 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