# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk01859s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0657.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0657, 1237 aa vs ./tmplib.23663 library 1986268 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0816+/-0.00471; mu= 12.5067+/- 0.320 mean_var=124.1457+/-30.335, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 72 in 1/39 Lambda= 0.115109 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1556 ( 1595 res) fh18619 (1595) 396 78.0 1.3e-14 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 251 53.9 2.3e-07 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 238 51.7 9.6e-07 KIAA1061 ( 693 res) hj00491 ( 693) 168 39.8 0.0019 >>KIAA1556 ( 1595 res) fh18619 (1595 aa) initn: 299 init1: 181 opt: 396 Z-score: 353.9 bits: 78.0 E(): 1.3e-14 Smith-Waterman score: 1046; 27.068% identity (55.665% similar) in 1112 aa overlap (75-1160:99-1132) 50 60 70 80 90 100 KIAA06 CHARNAHGHAQAGALLQVHQPPESPPADPDEAPAPVVEPLKCAPKTFWVNEGKHAKFRCY : :: ...::. :: :. ...:: KIAA15 LVVREAAPSDAGEVVFSVRGLTSKASLIVRERPAAIIKPLE----DQWVAPGEDVELRCE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 KIAA06 VMGKPEPEIEWHWEGRPLLPDRRRLMYRDR-----DGGFVLKVLYCQA-KDRGLYVCAAR . : :: : ::. . .. .: ... :. . :: : :.: .. KIAA15 LSRAGTPV---HW-----LKDRKAIRKSQKYDVVCEGTMAMLVIRGASLKDAGEYTCEVE 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 KIAA06 NSAGQTLSAVQLHVKEPRLRFTRPLQDVEGREHGIAVLECKVPNSRIPTAWFREDQRLLP : :...:::.: ::. : ... .:.: ::. ::. . ..: . .: KIAA15 ASK----STASLHVEEKANCFTEELTNLQVEEKGTAVFTCKTEHPAATVTWRKGLLELRA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 KIAA06 CRKYEQIEEGTVRRLIIHRLKADDDGIYLCEMRGRVRTVANVTVKG---PILKRLPRKLD :.. .:: . :: : :. :. : :.. :.... :.. :.: :.. : . .: KIAA15 SGKHQPSQEGLTLRLTISALEKADSDTYTCDI-GQAQSRAQLLVQGRRVHIIEDL-EDVD 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 KIAA06 VLEGENAVLLVETLEAGVEG-RWSRD-----GEELPVICQSSSGHMHALVLPGVTREDAG : :: .:.. . :. : .: : ..:: : ... : .:.:.: .. .:.: KIAA15 VQEGSSATFRCRISPANYEPVHWFLDKTPLHANELNEI-DAQPGGYHVLTLRQLALKDSG 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 KIAA06 EVTFSLGNSRTTTLLRVKCVKHSPPGPPIL-AEMFKGHKNTVLLTWKPPEPAPETPFIYR . : :..:... ::: : : . . : . .:. :.. . . : . KIAA15 TIYFEAGDQRASAALRVTE-KPSVFSRELTDATITEGEDLTLVCE----TSTCDIPVCWT 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 KIAA06 LERQEV-GSEDWIQC-FSIEKAGA-VEVPGDCVPSEGDYRFRICTVSGHGRSPHVVFHGS . . . :: .: .: : : . . : . . : :. : ..: : : :. KIAA15 KDGKTLRGSA---RCQLSHEGHRAQLLITGATLQDSGRYK---CEAGGACSSSIVRVHAR 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 KIAA06 AHLVPTARLVAGLEDVQVYDGEDAVFSLDLSTIIQGTWFLNGEELKSNEPEGQVEPGALR :. :. .:.:..: .: :.. ::.. . . :... ..:: . KIAA15 ----PV-RFQEALKDLEVLEGGAATLRCVLSSVAAPVKWCYGNNV--------LRPGD-K 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 KIAA06 YRIEQKGLQHRLILHAVKHQDSGALVGFSCP-GVQD-SAALTIQESPVHILSP-QDKVSL : ..:.: . .:... .. :::: .:: : : ::.::. :..... ..: . KIAA15 YSLRQEGAMLELVVRNLRPQDSGR---YSCSFGDQTTSATLTVTALPAQFIGKLRNKEA- 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 KIAA06 TFTTSERVVLTCELSRVDFPATWYKDGQKVEESELLVVKMDGRKHRLILPEAKVQDSGEF : . ..: ::::.. :. : : .. ..... ...:: .: . . :..:. KIAA15 --TEGATATLRCELSKAA-PVEWRKGSETLRDGDRYCLRQDGAMCELQIRGLAMVDAAEY 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 680 KIAA06 ECRT--EGVSAFFGVTVQDPPVHIVDPREHVFVHAITSECVMLACEVDREDAPVRWYKDG : : .:: ..:.. :.:.. .: ..: . . : ::... :::.: : KIAA15 SCVCGEERTSA--SLTIRPMPAHFIGRLRH--QESIEGATATLRCELSKA-APVEWRKGR 620 630 640 650 660 670 690 700 710 720 730 740 KIAA06 QEVEESDFVVLENEGPHRRLVLPATQPSDGGEFQCVAGDECAYFTVTITDVSSWIVYPSG . ....: :...: .: . . .:.::..:: :.: . :.:. . . . : KIAA15 ESLRDGDRHSLRQDGAVCELQICGLAVADAGEYSCVCGEERTSATLTVKALPA--KFTEG 680 690 700 710 720 730 750 760 770 780 790 800 KIAA06 KVYVAAVRLERVVLTCELCRPWAEVRWTKDGEEVVESPALLLQKEDTVRRLVLPAVQLED ::. ..: ::: . : :.: : :.. .. .:..: : .: . .. . : KIAA15 LRNEEAVEGATAMLWCELSKV-APVEWRKGPENLRDGDRYILRQEGTRCELQICGLAMAD 740 750 760 770 780 810 820 830 840 850 860 KIAA06 SGEYLCEIDDESASFTVTVTEPPVRIIYPRDEVTLIAVTLECVVLMCELSREDAPVRWYK .::::: .: .: :.:. :.:.: .: . : .::.:::. :::.: : KIAA15 AGEYLCVCGQERTSATLTIRALPARFI--EDVKNQEAREGATAVLQCELNSA-APVEWRK 790 800 810 820 830 840 870 880 890 900 910 KIAA06 DGLEVEESEALVLERDGPRCRLVLPAAQPEDGGEFVCDAGDDSAFFTVTVTEPPVQFL-A . ..... :..:: .:.: . . : ::. : :.. . .:: :..: . KIAA15 GSETLRDGDRYSLRQDGTKCELQIRGLAMADTGEYSCVCGQERTSAMLTVRALPIKFTEG 850 860 870 880 890 900 920 930 940 950 960 970 KIAA06 LETTPSPLCVAPGEPVVLSCELSRAGAPVVWSHNGRPVQEGEGLELHAEGPRRVLCIQAA :.. . . : .:: ::::. ::: : .. . ...:. :. .: : : :.. KIAA15 LRNEEA----TEGATAVLRCELSKM-APVEWWKGHETLRDGDRHSLRQDGARCELQIRGL 910 920 930 940 950 960 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA06 GPAHAGLYTCQSGAAPGAPSLSFTVQVAEPPVRVVAPEAAQTRVRSTPGGDLELVVHLSG :: : :. : : .::.. : . . :. ... ..: : : .:: KIAA15 VAEDAGEYLCMCGKE--RTSAMLTVRAM--PSKFI--EGLRNE-EATEGDTATLWCELS- 970 980 990 1000 1010 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA06 PGGPVRWYKDGERLASQGRVQLEQAGARQVLRVQGARSGDAGEYLCDAPQDSRIFLVSVE ..::.: : : : . : .:.: :.: :...: ::::: : :. ..:. KIAA15 KAAPVEWRKGHETLRDGDRHSLRQDGSRCELQIRGLAVVDAGEYSCVCGQERTSATLTVR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA06 EPLLVKLVSDLTPLTVHEGDDATFRCEVSPPDADVTWLRNGAVVTPGPQRQSCCSYGG-C : .... :. ..:: :...::.: : : : :.:. . : .: : . : : KIAA15 A-LPARFIEDVKNQEAREGATAVLQCELSKA-APVEW-RKGSETLRGGDRYSLRQDGTRC 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 RMCGQRKARTCVSKWRQAEWVQRGPCAGCEVGSPCPTTLACPWPRMGTSTASSSMVSYWP .. KIAA15 ELQIHGLSVADTGEYSCVCGQERTSATLTVRALPARFTQDLKTKEASEGATATLQCELSK 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 73 init1: 73 opt: 251 Z-score: 224.1 bits: 53.9 E(): 2.3e-07 Smith-Waterman score: 300; 25.115% identity (52.535% similar) in 434 aa overlap (621-1025:240-648) 600 610 620 630 640 KIAA06 KVEESELLVVKMDGRKHRLILPEAKVQDSGEFECRTEGVSAFFGVTVQDPPVHIVDPR-- :. : .: :. .:. .. :: KIAA02 TLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSV---ATITPEELNCERPRIT 210 220 230 240 250 260 650 660 670 680 690 700 KIAA06 -EHVFVHAITSECVMLACEVDREDAP-VRWYKDGQEVE-ESDFVV-LENEGPHRRLVLPA : . . ... :...:... . : . : ....:. ..: . : ..: :.. KIAA02 SEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG---TLMIQN 270 280 290 300 310 320 710 720 730 740 750 KIAA06 TQPSDGGEFQCVAGD---ECAYFTVTITDVSS-----WIVYPSGKVYVAAVRLERVVLTC :: .: : .::.: . : ::. .: ... :.. ... : :.: : KIAA02 TQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVG---ESVTLEC 330 340 350 360 370 380 760 770 780 790 800 810 KIAA06 ELC-RPWAEVRWTK-DGEEVVESPALLLQKEDTVRRLVLPAVQLEDSGEYLC----EIDD .: .. ::. : . .: . . : . : ::::: : .::. KIAA02 SATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGG---LYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDS 390 400 410 420 430 820 830 840 850 860 KIAA06 ESASFTVTVTEPPVRIIYPRDEVTLIAVTLECVVLMCELSREDAPV-RWYKDGLEVEESE :. . : : . :.:.:.. . :.. ..:: . . :: : : : .. .. KIAA02 VHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVD---FQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDR 440 450 460 470 480 490 870 880 890 900 910 920 KIAA06 ALVLERDGPRCRLVLPAAQPEDGGEFVCDA----GDDSAFFTVTVTEPPVQFLALETTPS .. .: : . .. .: :.. :.: :.... .:: .: : . . . :: KIAA02 RHLVLSSGT---LRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTV-QPRVTPV-FASIPS 500 510 520 530 540 930 940 950 960 970 980 KIAA06 PLCVAPGEPVVLSCELSRAGAP---VVWSHNGRPVQEGEGLELHAEGPRRVLCIQAAGPA : : : : : : : : ..:...: :: :. ..: .:. : :. .::: KIAA02 DTTVEVGANVQLPC--SSQGEPEPAITWNKDG--VQVTESGKFHI-SPEGFLTINDVGPA 550 560 570 580 590 600 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 HAGLYTCQSGAAPGAPSLSFTVQVAEPPV-RVVAPEAAQTRVRSTPGGDLELVVHLSGPG :: : : . . :. :.:....: : : : : .: . :.. 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