# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02596.fasta.huge -Q ../query/KIAA0676.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0676, 1262 aa vs ./tmplib.23663 library 1986243 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2671+/-0.00576; mu= 12.4242+/- 0.392 mean_var=141.5922+/-33.605, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.107784 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0882 ( 1291 res) hk07544s1 (1291) 5154 814.0 0 KIAA1055 ( 868 res) hh09512 ( 868) 476 86.4 2.2e-17 KIAA0019 ( 838 res) ha00537 ( 838) 356 67.7 8.9e-12 KIAA1108 ( 763 res) hh03387s1 ( 763) 339 65.0 5.2e-11 KIAA0603 ( 1348 res) hg01488b (1348) 320 62.3 6e-10 KIAA1533 ( 651 res) fh00910(revised) ( 651) 200 43.3 0.00015 KIAA1201 ( 761 res) fg03153 ( 761) 189 41.7 0.00055 KIAA1322 ( 702 res) fh13826 ( 702) 179 40.1 0.0015 KIAA0608 ( 775 res) hh00889b ( 775) 174 39.4 0.0028 >>KIAA0882 ( 1291 res) hk07544s1 (1291 aa) initn: 4910 init1: 2367 opt: 5154 Z-score: 4333.2 bits: 814.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 5190; 62.866% identity (83.513% similar) in 1298 aa overlap (3-1262:14-1291) 10 20 30 40 KIAA06 PRGP--RPGASGSAMWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGH--- :: :: :.. .::..:::::.:::::.::::::.:.::::.:: KIAA08 ARLSRWWVQDWTHGPIVRPPAAARTMWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGD 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA06 -GRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARVAPYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLE : ::::.:::::::::::::::::::::::.:: :: ::::.:::.::::::.:::::: KIAA08 GGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARVAPYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 KIAA06 NNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMP .:::::::::..:.::::::.:::.::::: :: . . :.: ::::: .:... :::: KIAA08 QNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 KIAA06 EGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATL : ::::::::::::::.::::::.::..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::: KIAA08 EEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 KIAA06 LFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPH :.:. :.:.::..: :::.::::.:::::::::::.:::::::.::: .:..::. : KIAA08 LLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKS 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 KIAA06 -RNISALKRDLDARAKNECYRATFRLPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYI ...::::::::::::.: ::: ::::.::.:::::.:::::::::.:: ::::.:.::: KIAA08 PKKVSALKRDLDARAKSERYRALFRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYI 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 KIAA06 CFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRI ::.::::. : ::::::::::::::::::::::::::::...:::::::::::::::::: KIAA08 CFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRI 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 KIAA06 SDFLQKTPSKQ------PGSIGSRKASVVD-PSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-S :::::.: :: :: .: : . ::. : .::... . :. . :: . KIAA08 SDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-----GERQFN 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 KIAA06 FCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTR . .. .:::.: :. .... :: :... : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: KIAA08 LNGNSVPTATQTLMTMYRRRSP-EEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTR 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 KIAA06 ALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMP :::::::::.:::::::.::: :: .:::::: .::::: :::.:::::::::::::.: KIAA08 ELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLP 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 KIAA06 EHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCER ::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::..:::::::::::::: KIAA08 EHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCER 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 KIAA06 MLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFE ::::::::::::::::::.::::.::..::: . ::::::::.::::::::::::::::: KIAA08 MLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFE 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 KIAA06 SAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSP ::::.::::::::::::.:.::::::::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. : KIAA08 SAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLP 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 KIAA06 PIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAK :::::..:::.. .: :::::.:...:::::...::. ::::::::::::::.::::.: KIAA08 PIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTK 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 KIAA06 RSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDAS :.:::.: .. .:.:.:::.:: .:::.::.: ::: : . :.::::::::::::: KIAA08 RNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFE 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 KIAA06 QFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKV ::. .:: : :::::.:. .::.:.:.::::: ::::::.:::.:.:. :::::::::. KIAA08 QFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKL 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 KIAA06 LYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQE :::.: :: :. . .: .::.::..:: :: . : . ... :: :.... KIAA08 LYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDITPECTHVVG-LDSRSKQGADDGFVTV--- 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA06 GSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSE : . ..: : ..: . :.:::.:. :....... :::::.:: ::::::::.:::::: KIAA08 -SLKPDKG--KRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSE 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA06 DPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQ :: ::.:::: :.:.::::.:::::: : :. ... . .. .: :: : KIAA08 DPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLF 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 PPAA-GDPQ---------AKAGGDTHLGT-APQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDET : . :.: :. . :.. . . : .. .: .: . .:. :.:.:::.: KIAA08 PKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDT 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 KDDMSMSSYSVVSTGS-----LQCEDLADDTVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQ ::: :::::::.:.:: :.:::...::::: .:.. . : . ..: :: :.::: KIAA08 KDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQ 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA06 ILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVE---RQFSTASDHEQPGVSG .:::.::: .::..:.: : . .: . :... . ...:::.: ..:: KIAA08 FLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASDYEISAMSG 1250 1260 1270 1280 1290 >>KIAA1055 ( 868 res) hh09512 (868 aa) initn: 344 init1: 193 opt: 476 Z-score: 403.9 bits: 86.4 E(): 2.2e-17 Smith-Waterman score: 476; 32.453% identity (64.151% similar) in 265 aa overlap (494-751:591-854) 470 480 490 500 510 520 KIAA06 SQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPE :. ..: . :. . . . :. :::. KIAA10 EEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWE-NYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPH 570 580 590 600 610 530 540 550 560 570 KIAA06 SLRGELWLLFSGAWNEMV---THPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMP--EHPA :...: .. :.::.. :..:. : . :...:: :: :..: .: . KIAA10 EHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYS 620 630 640 650 660 670 580 590 600 610 620 630 KIAA06 FQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLP- . :: :: :: :...::: :::::..: ...: ::: .:.::: ::.. : ..: KIAA10 CPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPR 680 690 700 710 720 730 640 650 660 670 680 690 KIAA06 DYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV-ISSISLSWFLTLFLSVMPFESA :::. ..:. ::: .:..: . ::.: .... : . :...:::..:.. . . KIAA10 DYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDIL 740 750 760 770 780 790 700 710 720 730 740 750 KIAA06 VVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPI : : :.::: :::.. :::.. . :..: .: . .: . .... .: KIAA10 FKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAP 800 810 820 830 840 850 760 770 780 790 800 810 KIAA06 PHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRS KIAA10 TTWRKSGWS 860 >>KIAA0019 ( 838 res) ha00537 (838 aa) initn: 335 init1: 160 opt: 356 Z-score: 303.3 bits: 67.7 E(): 8.9e-12 Smith-Waterman score: 356; 27.138% identity (59.480% similar) in 269 aa overlap (471-732:60-327) 450 460 470 480 490 500 KIAA06 QPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFE : .. . : .. ..: : .... KIAA00 AKYDRGREGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHNVAVERQKHLEIERTTKWLK 30 40 50 60 70 80 510 520 530 540 550 KIAA06 YGRGVCMYR-TAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYS . .: :. : : . . :::: .::::.: :. . :..: ... : : KIAA00 MLKGWEKYKNTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMKEETRDLYSKLKHRARGC-S 90 100 110 120 130 140 560 570 580 590 600 610 KIAA06 LATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIA--ALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLL ..:. :..:.. .: :... :. .: .::.::.. : .::::.:. .:..::. KIAA00 PDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALLLM 150 160 170 180 190 200 620 630 640 650 660 670 KIAA06 YGSEEEAFWLLVALC---ERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV : .::.::: :: : .. . .. : : :.. :: .:...... . KIAA00 YMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHEKILNKFLSKLKQHLDSQEI 210 220 230 240 250 260 680 690 700 710 720 730 KIAA06 ISSI-SLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDEG .:. ...::. ::. :: . : : ...:: .:. .. ..: . ..:. : : KIAA00 YTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKLSMEE 270 280 290 300 310 320 740 750 760 770 780 790 KIAA06 EAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAED KIAA00 LVEFFQETLAKDFFFEDDFVIEQLQISMTELKRAKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPELQ 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1108 ( 763 res) hh03387s1 (763 aa) initn: 302 init1: 120 opt: 339 Z-score: 289.5 bits: 65.0 E(): 5.2e-11 Smith-Waterman score: 354; 23.501% identity (54.916% similar) in 417 aa overlap (427-815:288-687) 400 410 420 430 440 450 KIAA06 FLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-SF : . :. ..: : . .::. KIAA11 QQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRE 260 270 280 290 300 310 460 470 480 490 500 KIAA06 CAQEAPTASQGLLKLFQKNSPME----DLGAKGAKEKMKEES---------WHIHFFEYG :.: . ::.. ..:. .. :: : : ..: . :. . : KIAA11 LWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPG 320 330 340 350 360 370 510 520 530 540 550 KIAA06 RGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGY-------YAELVEKST :. . : .. : .:.:. :::.: ... .. :. : ::... : KIAA11 RSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLT 380 390 400 410 420 430 560 570 580 590 600 610 KIAA06 GKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIA--ALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTS .. . : :: :..: :: :. .:: . .: .: ::.. . .::::....:.. KIAA11 SQQ----HAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAG 440 450 460 470 480 490 620 630 640 650 660 670 KIAA06 VLLLYGSEEEAFWLLVALCERM-LPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDL .:::. :::::: .: : : : : .. ... . .: .:. .: ..... KIAA11 ILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEH 500 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 730 KIAA06 GVISSI-SLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSD . :. . ::::.: : .:. .. . : .: .: .::..:::..: .. KIAA11 EIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSH--------- 560 570 580 590 600 740 750 760 770 780 790 KIAA06 EGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRAL-LSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLR . . . . :...:. .. .:.: . . .. . :.:: . :.. .. :. KIAA11 --KPLILQHENLETIVD--FIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQ 610 620 630 640 650 660 800 810 820 830 840 KIAA06 AEDIEQ--MRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQY : :.. . .::. ... ... .. KIAA11 EELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKL 670 680 690 700 710 720 >>KIAA0603 ( 1348 res) hg01488b (1348 aa) initn: 318 init1: 123 opt: 320 Z-score: 270.5 bits: 62.3 E(): 6e-10 Smith-Waterman score: 334; 23.950% identity (55.042% similar) in 476 aa overlap (366-802:796-1254) 340 350 360 370 380 390 KIAA06 FISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDR : ::. ::.. : .: . ..: KIAA06 FYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTS-VTPRRISWRQR 770 780 790 800 810 820 400 410 420 430 440 KIAA06 DFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESSPAPQE--------GSEQPASPAS :: :... ..:.:: . . : . .. : . ::. .: : ..: . KIAA06 IFL--RVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELL-PLSPLSPTMEEEPLVIFLSGEDDPEKIEE 830 840 850 860 870 880 450 460 470 480 490 500 KIAA06 PLSSRQSFCAQEAPTASQGLL-KLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVC .:.. . .: :: .. ..:. .: :: ...... .. .. . : : .: KIAA06 RKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE--GA--SRDELQSRKVKLDYEEVG--AC 890 900 910 920 930 510 520 530 540 KIAA06 MYRT------------AKTR-------ALVLKGIPESLRGELWLLFSGAW-------NEM . .. :: : .:. .:.:.: :::.: ... . :.. KIAA06 QKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQ 940 950 960 970 980 990 550 560 570 580 590 KIAA06 VTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALR--RVLTAYAFR : ::... :.. . : :: :..: :: :. .:: . : .: ::.. KIAA06 QPPDISYKELLKQLTAQQ----HAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 600 610 620 630 640 650 KIAA06 NPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERM-LPDYYNTRVVGALVDQGIFEEL . .::::....:..::::. :::.:: .: : . . : ... ... . .: KIAA06 DKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRL 1060 1070 1080 1090 1100 1110 660 670 680 690 700 710 KIAA06 TRDFLPQLSEKMQDLGVISSI-SLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVAL .:. .: ..... . :. . :::::: : . . .. . : .: .: .::..::: KIAA06 LHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVAL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 720 730 740 750 760 770 KIAA06 AVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIF ..:... .. : . . . .: : .. : . . : .. . :.. ::. . KIAA06 SLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDM-NTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVE-Y 1180 1190 1200 1210 1220 780 790 800 810 820 830 KIAA06 ELLKVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLY ..:. .. :: :: : .. .: KIAA06 HVLQDELQE-SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLL 1230 1240 1250 1260 1270 1280 >>KIAA1533 ( 651 res) fh00910(revised) (651 aa) initn: 146 init1: 69 opt: 200 Z-score: 173.5 bits: 43.3 E(): 0.00015 Smith-Waterman score: 200; 31.008% identity (65.116% similar) in 129 aa overlap (135-261:2-129) 110 120 130 140 150 160 KIAA06 NLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFG-MP .:..: . .:. . .:: :. .: KIAA15 NSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLP 10 20 30 170 180 190 200 210 220 KIAA06 EGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATL :.:.:. :::. . .. :: :::. : .:::: .. :... .: ..: :.:. : KIAA15 EAERLIVDYSCALQR-EILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTA 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 KIAA06 -LFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRP :.:..:.. :.... ::. : . : :. .: . :. KIAA15 KLIPNAIQICTESEKHFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSE 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 KIAA06 HRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYI KIAA15 LGLTSEDEDYVSPLQLNGLGTPKEVGDVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTPNL 160 170 180 190 200 210 >>KIAA1201 ( 761 res) fg03153 (761 aa) initn: 164 init1: 94 opt: 189 Z-score: 163.4 bits: 41.7 E(): 0.00055 Smith-Waterman score: 189; 33.913% identity (63.478% similar) in 115 aa overlap (149-261:114-227) 120 130 140 150 160 170 KIAA06 ITTFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFG-MPEGEKLVNYYSCSYW .:. . .:: : .:. :.:. :::. KIAA12 VQRSCSSQSGRSGGKNSKKSQSWYNVLSPTYKQRNEDFRKLFKQLPDTERLIVDYSCALQ 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 KIAA06 KGRVPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATL-LFPESIRVDTRDQ . . :: :::. : .:::: .. :. :.:. :: . :. : :.:..:.: : .. KIAA12 RD-ILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETLLTVRLKDICSMTKEKTARLIPNAIQVCTDSE 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 KIAA06 ELFFSMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDAR . ::. : .:. .: .: . :. KIAA12 KHFFTSFGARDRTYMMMFRLWQNALLEKPLCPKELWHFVHQCYGNELGLTSDDEDYVPPD 210 220 230 240 250 260 >>KIAA1322 ( 702 res) fh13826 (702 aa) initn: 140 init1: 92 opt: 179 Z-score: 155.5 bits: 40.1 E(): 0.0015 Smith-Waterman score: 239; 24.484% identity (53.982% similar) in 339 aa overlap (410-719:299-632) 380 390 400 410 420 430 KIAA06 STKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGS-RKASVVDP-STESSPAPQE ::: :. . :: .: :: . .. KIAA13 WKLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDR 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 KIAA06 GSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEE--SWH .. ::.:: ..... . . :.. :: :. . . . . ..:.. . .:. KIAA13 PANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCR-VEESIGNAVLTWN 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 KIAA06 IHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEM-VTHPGYYAEL---- ... . :. . :.: : .::: :.::..: : : ::. .:: . : KIAA13 NEILPNWE--TMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIG--NELNITHELFDICLARAK 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 KIAA06 ------------VEKSTGKYSLATEE-----IERDLHRSMPEHPAFQNELGIA-ALRRVL ::. . .: : .: :. :. :..:. ::. :. .: KIAA13 ERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSIL 450 460 470 480 490 500 600 610 620 630 640 650 KIAA06 TAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQ- ::. : .:: :.:.....::.: . .:: . : .. . : .. KIAA13 GAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYF 510 520 530 540 550 560 660 670 680 690 700 710 KIAA06 GIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISL-SWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKV . :: . .. ::.: ... .. .: : .:..::. . .:.. : : : : .: . KIAA13 AAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEF 570 580 590 600 610 620 720 730 740 750 760 770 KIAA06 ILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPP ....::..: KIAA13 LFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVL 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0608 ( 775 res) hh00889b (775 aa) initn: 98 init1: 98 opt: 174 Z-score: 150.7 bits: 39.4 E(): 0.0028 Smith-Waterman score: 228; 23.324% identity (51.475% similar) in 373 aa overlap (388-727:346-712) 360 370 380 390 400 410 KIAA06 LREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKT-------P ::... :. : :. : ..:. KIAA06 GGFADFFTRNLFPKRTKELKSVVHSAPGWKLFGKVPPRENL-QKTSKIIQQEYEARTGRT 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 KIAA06 SKQPGSIGSRKASVVDP-STESSPAPQEGSEQPA-SPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLL : : . . :: .: :: . .. :. :: : : :: . . : . .. . KIAA06 CKPPPQSSRRKNFEFEPLSTTALILEDRPSNLPAKSVEEALRHRQEYDEMVAEAKKREIK 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 KIAA06 KLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGE . ... :.. . . : ... . : : ..: : .:.: :.::. KIAA06 EAHKRKRIMKERFKQEENIASAMVIWINEILPNWE--VMRSTRRVRELWWQGLPPSVRGK 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 KIAA06 LWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELV---------------EKSTGKYSLATEE-----IERD .: : : ::. : : .. :..: :.: .: :. : KIAA06 VWSLAVG--NELNITPELYEIFLSRAKERWKSFSETSSENDTEGVSVADREASLELIKLD 500 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 KIAA06 LHRSMPEHPAFQNELGIA-ALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWL . :..: ::. .:. .: ::. : .:: :.:.....::.: : .:: KIAA06 ISRTFPSLYIFQKGGPYHDVLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAFIA 560 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 680 KIAA06 LVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQ--GIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISL-SWFL .. : .. . :: ... . . :: . .. : .: .... .. .: : .:.. KIAA06 FANLLNKPCQLAF-FRVDHSMMLKYFATFEVFFEENLSKLFLHFKSYSLTPDIYLIDWIF 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 KIAA06 TLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLD ::. . .:.. : . : : .: . .....:..: . :: KIAA06 TLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGLGILRLYEDILLQMDFIHIAQFLTKLPED 670 680 690 700 710 720 750 760 770 780 790 800 KIAA06 NVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLK KIAA06 ITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVMKDIKEGDKNSSPALKS 730 740 750 760 770 1262 residues in 1 query sequences 1986243 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:11:40 2008 done: Thu Dec 18 15:11:42 2008 Total Scan time: 0.770 Total Display time: 0.300 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]