# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02596.fasta.nr -Q ../query/KIAA0676.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0676, 1262 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824160 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5244+/-0.000188; mu= 13.6332+/- 0.011 mean_var=85.6662+/-16.603, 0's: 27 Z-trim: 42 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.138570 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|148887044|sp|Q66K14.2|TBC9B_HUMAN RecName: Full (1250) 8303 1670.7 0 gi|154426176|gb|AAI51548.1| TBC1D9B protein [Bos t (1255) 7527 1515.6 0 gi|73970423|ref|XP_538581.2| PREDICTED: similar to (1558) 7424 1495.1 0 gi|38614382|gb|AAH62928.1| TBC1 domain family, mem (1246) 6891 1388.4 0 gi|74190966|dbj|BAE28254.1| unnamed protein produc (1246) 6887 1387.6 0 gi|148701778|gb|EDL33725.1| mCG67972, isoform CRA_ (1240) 6818 1373.8 0 gi|26330676|dbj|BAC29068.1| unnamed protein produc (1225) 6772 1364.6 0 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761.6 0 gi|29126855|gb|AAH48085.1| Tbc1d9b protein [Mus mu ( 710) 3490 708.3 4.1e-201 gi|114579209|ref|XP_001162070.1| PREDICTED: simila (1146) 3462 702.9 2.9e-199 gi|109103991|ref|XP_001106238.1| PREDICTED: simila (1134) 3443 699.1 4e-198 gi|114579207|ref|XP_001162139.1| PREDICTED: simila (1140) 3440 698.5 6.1e-198 gi|222079982|dbj|BAH16632.1| TBC1 domain family, m (1140) 3434 697.3 1.4e-197 gi|156231067|ref|NP_001095896.1| TBC1 domain famil (1140) 3434 697.3 1.4e-197 gi|109103989|ref|XP_001106300.1| PREDICTED: simila (1134) 3431 696.7 2.1e-197 gi|109485967|ref|XP_001055675.1| PREDICTED: simila ( 997) 3405 691.5 7e-196 gi|109485965|ref|XP_001055799.1| PREDICTED: simila (1135) 3405 691.5 7.7e-196 gi|74216114|dbj|BAE23728.1| unnamed protein produc ( 985) 3397 689.8 2.1e-195 gi|40674787|gb|AAH65081.1| TBC1 domain family, mem (1134) 3397 689.9 2.3e-195 gi|109486983|ref|XP_001058045.1| PREDICTED: simila (1135) 3392 688.9 4.7e-195 gi|74200630|dbj|BAE24715.1| unnamed protein produc (1134) 3390 688.5 6.2e-195 gi|109486985|ref|XP_001058169.1| PREDICTED: simila (1132) 3389 688.3 7.1e-195 gi|118084290|ref|XP_425583.2| PREDICTED: similar t (1090) 3368 684.1 1.3e-193 >>gi|148887044|sp|Q66K14.2|TBC9B_HUMAN RecName: Full=TBC (1250 aa) initn: 8303 init1: 8303 opt: 8303 Z-score: 8963.5 bits: 1670.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 8303; 100.000% identity (100.000% similar) in 1250 aa overlap (13-1262:1-1250) 10 20 30 40 50 60 KIAA06 PRGPRPGASGSAMWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGHGRGGGLTGLLVGTLDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGHGRGGGLTGLLVGTLDV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA06 VLDSSARVAPYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 VLDSSARVAPYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDIT 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA06 TFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 TFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGR 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA06 VPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 VPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFF 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 KIAA06 SMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 SMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNE 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 KIAA06 CYRATFRLPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 CYRATFRLPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLRE 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 KIAA06 VTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSR 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 AKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMF 830 840 850 860 870 880 910 920 930 940 950 960 KIAA06 RLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 RLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFT 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA06 EDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 EDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKE 950 960 970 980 990 1000 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA06 KEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 KEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKF 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA06 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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|741 KAKHLASQYWGGNRSAAVHRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPVLAGRM 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 KIAA06 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYF :::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::: gi|741 FRLLDQNKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKALYKLHLPPALIPEEAESALEAAHYF 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 KIAA06 TEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSE---ERGEEKGTSSPDYRHYLRM :::::::: : ::.:::::.: :: :::::: ::::::::: gi|741 TEDSSSEA------------------LLQEQQEGSGNEDTPERREEKGTSPPDYRHYLRM 950 960 970 980 990 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA06 WAKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|741 WAKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEV 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA06 GKKFSARTGRKPRD--------CATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTH :::::: : .:::: ::::::::.:.:::: ..: ::::::: 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