# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj02322.fasta.huge -Q ../query/KIAA0686.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0686, 1200 aa vs ./tmplib.23663 library 1986305 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4019+/-0.00536; mu= 14.0372+/- 0.364 mean_var=117.1456+/-27.369, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.118498 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0768 ( 872 res) hk05006 ( 872) 372 75.8 3.3e-14 KIAA0786 ( 1021 res) hk05490 (1021) 363 74.3 1.1e-13 KIAA0821 ( 1566 res) hh02631 (1566) 355 73.2 3.6e-13 KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854) 273 59.5 8.8e-09 KIAA0758 ( 1370 res) hh15259 (1370) 162 40.1 0.0028 >>KIAA0768 ( 872 res) hk05006 (872 aa) initn: 254 init1: 153 opt: 372 Z-score: 346.9 bits: 75.8 E(): 3.3e-14 Smith-Waterman score: 379; 22.527% identity (54.029% similar) in 546 aa overlap (658-1148:119-638) 630 640 650 660 670 680 KIAA06 EKSKTILDSCPYLSILALHWYPQQINGHKFEGKEGDYIRIPERLLDVQDAEIMA------ ::. : ...:: . . .. : KIAA07 AFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLED-LKFPENMGHGSTIQLSANTLKQN 90 100 110 120 130 140 690 700 710 720 730 KIAA06 GKSTCKLVQFTEYSSQQWFISGNNLPTLKNKVLSLSVKGQ---SSQLLTN--DNEVLYRI :.. : :. :.. ..: .: ..: . .::.. . .: ..: ..: .. 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KIAA07 FESEYSRKKY--YYVAGYLFPATVVG----VSAAIDYKS----YGTEKACWLHVDNYFIW 510 520 530 540 550 960 970 980 990 1000 1010 KIAA06 LFTAALVPLTCLVVVFVVFIHAYQVKPQWKAYDDVFRGRTNAAEIPLILYLFALISVTWL : . .. . : ..:.:. .:: . : : .. . . . :. :...:: KIAA07 SFIGPVTFIILLNIIFLVITLCKMVKHSNTLKPDSSRLENIKSWVLGAFALLCLLGLTWS 560 570 580 590 600 610 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA06 WGGLHMAYRHFWMLVLFVIFNSLQGLYVFMVYFILHNQMCCPMKASYTVEMNGHPGPSTA .: : . . . : ::.:::..::...:. . :.... 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KIAA08 VFLMVTLHKMIRSSSVLKPDSSRLDNI-----KSWALGAIALLF-LLGLTWAFGLLFINK 1120 1130 1140 1150 1160 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA06 RHFWMLVLFVIFNSLQGLYVFMVYFIL----HNQMCCPMKASYTVEMNGHPGPSTAFFTP . : ::. ::..::...:. . : :... .. :: . . :: : KIAA08 ESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQKKVHKEYSKCLRHSYCC-IRSPPGG-----TH 1170 1180 1190 1200 1210 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA06 GSGMPPAGGEISKSTQNLIGAMEEVPPDWERASFQQ--GSQASPDLKPSPQNGATFPSSG :: : . ..:. :.. .. :. . .: .: . :.. .: KIAA08 GSLKTSA---MRSNTRYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTESSFMAGDINSTPTLNRGTMGNH 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1140 1150 1160 1170 1180 1190 KIAA06 GYGQGSLIADEESQEFDDLIFALKTGAGLSVSDNESGQGSQEGGTLTDSQIVELRRIPIA KIAA08 LLTNPVLQPRGGTSPYNTLIAESVGFNPSSPPVFNSPGSYREPKHPLGGREACGMDTLPL 1280 1290 1300 1310 1320 1330 >>KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854 aa) initn: 310 init1: 128 opt: 273 Z-score: 249.6 bits: 59.5 E(): 8.8e-09 Smith-Waterman score: 397; 22.470% identity (56.478% similar) in 494 aa overlap (707-1173:2207-2663) 680 690 700 710 720 730 KIAA06 AEIMAGKSTCKLVQFTEYSSQQWFISGNNLPTLKNKVLSLSVKGQSSQL---LTNDNEVL : ... :.:.::. . : : . : KIAA02 VASVIIYRTLAGLLPHNYDPDKRSLRVPKRPIINTPVVSISVHDDEELLPRALDKPVTVQ 2180 2190 2200 2210 2220 2230 740 750 760 770 780 KIAA06 YRIYAAEPRIIPQTSLCLLWNQA-----AASWLSDSQFCKVIEETADYVECACSHMSVYA .:. .: : : .:..::.. ...: ... :.:. .. ..: : :.::. .: KIAA02 FRLLETEERTKP---ICVFWNHSILVSGTGGW--SARGCEVVFRNESHVSCQCNHMTSFA 2240 2250 2260 2270 2280 2290 790 800 810 820 830 840 KIAA06 VY---ARTDNLSSYNEAFFTSGFICISGLCLA--VLSHIFCARYSMFAAKL--LTHMMAA : .: .: .: .. . :. :: .:. .: . .. .. . . ..: KIAA02 VLMDVSRRENGEILPLKTLT--YVAL-GVTLAALLLTFFFLTLLRILRSNQHGIRRNLTA 2300 2310 2320 2330 2340 850 860 870 880 890 900 KIAA06 SLG-TQILFLASAYASPQLAEESCSAMAAVTHYLYLCQFSWMLIQSVNFWYVLVMNDEHT .:: .:..:: . . .:...: . :.:::: ::: :....... .:. . . 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KIAA02 NSDTLLFHYLFATCNCIQGPFIFLSYVVLSKEVRKALKLACSRKPSPDPALTTKSTLTSS 2520 2530 2540 2550 2560 2570 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA06 FFTPGSGMPPAGGEISKSTQNLIGAMEEVPPDWERASFQQGSQASPDLKPS--PQNGATF . :. : : :.. . . :... : .......:. : ...: KIAA02 YNCPS---PYADGRLYQPYGDSAGSLH---------STSRSGKSQPSYIPFLLREESALN 2580 2590 2600 2610 2620 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA06 PSSG--GYGQ-GSLIADEESQEFDDLIFALKTGAGLSVSDNESGQGSQEGGTLTDSQIVE :..: : :. :::. . ..:. : . . ::. :..:: KIAA02 PGQGPPGLGDPGSLFLEGQDQQHDP---DTDSDSDLSLEDDQSGSYASTHSSDSEEEEEE 2630 2640 2650 2660 2670 1190 1200 KIAA06 LRRIPIADTHL KIAA02 EEEEAAFPGEQGWDSLLGPGAERLPLHSTPKDGGPGPGKAPWPGDFGTTAKESSGNGAPE 2680 2690 2700 2710 2720 2730 >>KIAA0758 ( 1370 res) hh15259 (1370 aa) initn: 125 init1: 69 opt: 162 Z-score: 150.7 bits: 40.1 E(): 0.0028 Smith-Waterman score: 233; 19.323% identity (51.199% similar) in 709 aa overlap (464-1119:687-1366) 440 450 460 470 480 490 KIAA06 RSAETIGRTIISPAISGKDFVITEGTLVFEPGQRSTVLD-VILTPETGSLNSFPKRFQIV ::. : : :: . : :.. . ::. : KIAA07 WCSKTVDVCCHFTNAANNSVWSPSMKLNLVPGENITCQDPVIGVGEPGKVIQKLCRFSNV 660 670 680 690 700 710 500 510 520 530 540 KIAA06 LFDPK---GGARIDKVYGTANITLVSDADSQAIWGLADQ----LHQPVNDDILNRVLHTI .:. ::. : :. .: : : .: .. ...: .:..: :. . KIAA07 PSSPESPIGGTITYKCVGSQWEEKRNDCISAPINSLLQMAKALIKSPSQDEMLPTYLKDL 720 730 740 750 760 770 550 560 570 580 590 KIAA06 SMKV-----ATENTDEQLSAMMHLIE-------KITTEGKIQAFSVASRTLFYEILCSLI :... .. .:.:...... ....: ...:... : .: . KIAA07 SISIDKAEHEISSSPGSLGAIINILDLLSTVPTQVNSEMMTHVLSTVNVILGKPVLNTWK 780 790 800 810 820 830 600 610 620 630 640 650 KIAA06 NPKRKDTRGFSHFAEVTENFAFSLLTNVTCGSPGEKSKTILD-SCPYLSILALHWYPQQI ... : :.. . .: :. .: .. . : :.: .. : .. . : :.. KIAA07 VLQQQWTNQSSQLLHSVERFSQALQSGDS--PPLSFSQTNVQMSSTVIKSSHPETYQQRF 840 850 860 870 880 890 660 670 680 690 700 710 KIAA06 NGHKFEGKEGDYIRIPERLLDVQ-DAEIMAGKSTCKLVQFTEYSSQQWFISGNNLPTLKN :. :. . : ..: :. :. : . . .:. :. ::. .. KIAA07 VFPYFD-LWGNVVIDKSYLENLQSDSSIV----TMAFPTLQAILAQD--IQENNFA--ES 900 910 920 930 940 720 730 740 750 760 KIAA06 KVLSLSVKGQSSQLLTNDNEVLYRIYAAEPRIIPQ--TSLCLLWN----QAAASWLSDSQ :.. .: .... . .:: . :. . :..:: . ...: ::. KIAA07 LVMTTTV--------SHNTTMPFRISMTFKNNSPSGGETKCVFWNFRLANNTGGW--DSS 950 960 970 980 990 770 780 790 800 810 820 KIAA06 FCKVIEETADYVECACSHMSVYAVYARTDNLSSYNEAFFTSGFICISGLCLAVLSHIFC- : : : .: : : :.:.. ... :. . . . .: :. ...:: : KIAA07 GCYVEEGDGDNVTCICDHLTSFSILMSPDSPDPSSLLGILLDIISYVGVGFSILSLAACL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 830 840 850 860 KIAA06 ------------ARYSMFAAKLLTHMMAASLGTQILFLASAYASPQ---LAEESCSAMAA : :.. .... :. : .. :.. : . . : . .: : . KIAA07 VVEAVVWKSVTKNRTSYMRHTCIVNIAASLLVANTWFIVVAAIQDNRYILCKTACVAATF 1060 1070 1080 1090 1100 1110 870 880 890 900 910 920 KIAA06 VTHYLYLCQFSWMLIQSVNFWYVLVMNDEHTER--RYLLFFLLSWGLPAFVVILLIVILK :..:: : ::: .. ..: ::. ..: : . . : :..: : . .. . . KIAA07 FIHFFYLSVFFWMLTLGLMLFYRLVFILHETSRSTQKAIAFCLGYGCPLAISVITLGATQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 930 940 950 960 970 980 KIAA06 GIYHQSMSQIYGLIHGDL-CFIPNVYAALFTAALVPLTCLVVVFVVFIHAYQVKPQWKAY . ... : : .. . ::. ... .::. .. . :: . KIAA07 PREVYTRKNVCWLNWEDTKALLAFAIPALIIVVVNITITIVVITKILRPSIGDKPCKQEK 1180 1190 1200 1210 1220 1230 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 DDVFRGRTNAAEIPLILYLFALISVTWLWGGLHMAYRHFWMLVLFVIFNSLQGLYVFMVY ...:. . . . .: : ...: .. : ..... ..:.:.: .:::.... KIAA07 SSLFQISKSIGVLTPLLGLTWGFGLTTVFPGTNLVFH-----IIFAILNVFQGLFILLFG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 FILHNQMCCPMKASYTV-EMNGHPGPSTAFFTPGSGMP--PAGGEISKSTQNLIG---AM . .. . .... . ... . ::.. ::. : .. ::. .::.: .. KIAA07 CLWDLKVQEALLNKFSLSRWSSQHSKSTSL---GSSTPVFSMSSPISRRFNNLFGKTGTY 1300 1310 1320 1330 1340 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 EEVPPDWERASFQQGSQASPDLKPSPQNGATFPSSGGYGQGSLIADEESQEFDDLIFALK . :. .:....:.:: KIAA07 NVSTPEATSSSLENSSSASSLLN 1350 1360 1370 1200 residues in 1 query sequences 1986305 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:03 2008 done: Thu Dec 18 15:12:05 2008 Total Scan time: 0.720 Total Display time: 0.250 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]