# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00621mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0699.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0699, 847 aa vs ./tmplib.23663 library 1986658 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5662+/-0.00991; mu= -6.5044+/- 0.670 mean_var=362.1852+/-87.007, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.067392 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003) 260 40.0 0.0016 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 256 40.0 0.0031 >>KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003 aa) initn: 141 init1: 71 opt: 260 Z-score: 155.3 bits: 40.0 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 336; 21.765% identity (53.930% similar) in 827 aa overlap (27-798:215-981) 10 20 30 40 50 KIAA06 EYARLVMEAQPEWLRAEVKRLSHELAETTREKIQAAEYGLAVLEEKHQLKLQFEEL :... : .: . : ::...... .. : KIAA10 VKESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRV-VQEENQHMQMTIQAL 190 200 210 220 230 240 60 70 80 90 100 110 KIAA06 EVDYEAIRSEMEQLKEAFGQAHTNHKKVAADGESREESLI--QESASKEQYYVRKVLELQ . : :. ...:: . ....:.. :: : . : .: .:: . .::.:: . 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