# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02861mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0703.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0703, 1051 aa vs ./tmplib.23663 library 1986454 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0709+/-0.00476; mu= 20.5896+/- 0.324 mean_var=79.2298+/-19.469, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 152 in 2/38 Lambda= 0.144089 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1347 ( 918 res) fj00739 ( 918) 3927 827.0 0 KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049) 515 117.8 7.8e-27 KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203) 166 45.3 5.8e-05 >>KIAA1347 ( 918 res) fj00739 (918 aa) initn: 3495 init1: 1509 opt: 3927 Z-score: 4407.5 bits: 827.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 3927; 66.815% identity (87.791% similar) in 901 aa overlap (153-1047:15-907) 130 140 150 160 170 KIAA07 LHGVFEQVPAPWWTSLCPWPIMEAAAFQSGSLYPVASFLAA---PMSELVPDLSFQVDLH .. :: . : :.::.. : :.::. KIAA13 RLHVFKKIPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVASIL--QADLQ 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 KIAA07 TGLSEFSVTQRRLAHGWNEFVADNSEPVWKKYLDQFKNPLILLLLGSALVSVLTKEYEDA .::.. :..:: :::::: ...::.::::..:::::::.:::.::..::: ....:: KIAA13 NGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLLASAVISVLMHQFDDA 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 KIAA07 VSIATAVLVVVTVAFIQEYRSEKSLEELTKLVPPECNCLREGKLQHLLARELVPGDVVSL :::..:.:.::::::.::::::::::::.:::::::.:.:::::.: :::.:::::.: : KIAA13 VSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCL 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 350 KIAA07 SIGDRIPADIRLTEVTDLLVDESSFTGEAEPCSKTDSPLTGG--GDLTTLSNIVFMGTLV :.:::.:::.:: :..:: .::::.:::. ::::. .: .. :::.. :::.:::::: KIAA13 SVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLV 170 180 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 KIAA07 QYGRGQGVVIGTGESSQFGEVFKMMQAEETPKTPLQKSMDRLGKQLTLFSFGIIGLIMLI . :...::::::::.:.::::::::::::.:::::::::: :::::...::::::.:::. KIAA13 RCGKAKGVVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLV 230 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 470 KIAA07 GWSQGKQLLSMFTIGVSLAVAAIPEGLPIVVMVTLVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGC :: ::..: ::::.:::::::::::::::: :::.:::.::.:::.::::::::::::: KIAA13 GWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGC 290 300 310 320 330 340 480 490 500 510 520 530 KIAA07 CSVLCSDKTGTLTANEMTVTQLVTSDGLRAEVSGVGYDGQGTVCLLPSKEVIKEFSNVSV :.:.::::::::: ::::::.. :::::.:::.::::. : : . . .:.. : : .: KIAA13 CNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIV--DGDVVHGFYNPAV 350 360 370 380 390 400 540 550 560 570 580 590 KIAA07 GKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALMALAMKMDLSDIKNSYIRKKEIPFSSEQKWM ...:::::: :.::::.:..::.::::::.:::::: :. ....:::: : ::::::::: KIAA13 SRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYIRKAEYPFSSEQKWM 410 420 430 440 450 460 600 610 620 630 640 650 KIAA07 AVKCSLKTE-DQEDIYFMKGALEEVIRYCTMYNNGGIPLPLTPQQRSFCLQEEKRMGSLG :::: .:. :. .: ::::: :.::.::: :.. : : :: :::. ::. :::: : KIAA13 AVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYQSKGQTLTLTQQQRDVYQQEKARMGSAG 470 480 490 500 510 520 660 670 680 690 700 710 KIAA07 LRVLALASGPELGRLTFLGLVGIIDPPRVGVKEAVQVLSESGVSVKMITGDALETALAIG :::::::::::::.::::::::::::::.:::::: .: ::::.::::::. :::.::. KIAA13 LRVLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGVKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIA 530 540 550 560 570 580 720 730 740 750 760 770 KIAA07 RNIGLCNGKLQAMSGEEVDSVEKGELADRVGKVSVFFRTSPKHKLKIIKALQESGAIVAM .:: . :..::::.:... .:.. : ::.::.:.::.::.::::.::..:..::: KIAA13 SRLGLYSKTSQSVSGEEIDAMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAM 590 600 610 620 630 640 780 790 800 810 820 830 KIAA07 TGDGVNDAVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEAANMILVDDDFSAIMNAVEEGKGIFYNIKN ::::::::::::.::::.::::::::: ::::.::::::::..::.:.::::::. :::: KIAA13 TGDGVNDAVALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKN 650 660 670 680 690 700 840 850 860 870 880 890 KIAA07 FVRFQLSTSISALSLITLSTVFNLPSPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDAFRQ ::::::::::.::.::.:.:..:.:.::::::::::::::::::::::::::::::..:. KIAA13 FVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRK 710 720 730 740 750 760 900 910 920 930 940 950 KIAA07 PPRSVRDTILSRALILKILMSAAIIISGTLFIFWKEMPEDRASTPRTTTMTFTCFVFFDL :::. .:.::.. ::::::.:. ::. ::::.::.:. .: . ::: ::::::::::::. KIAA13 PPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWREL-RDNVITPRDTTMTFTCFVFFDM 770 780 790 800 810 960 970 980 990 1000 1010 KIAA07 FNALTCRSQTKLIFEIGFLRNHMFLYSVLGSILGQLAVIYIPPLQRVFQTENLGALDLLF ::::. ::::: .::::. :.:: :.:::::.::: :::.::::.:::::.:. ::::: KIAA13 FNALSSRSQTKSVFEIGLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLF 820 830 840 850 860 870 1020 1030 1040 1050 KIAA07 LTGLASSVFILSELLKLCEKYCCSPKRVQMHPEDV : ::.::: :..:..: :. : ...: : KIAA13 LLGLTSSVCIVAEIIKKVER---SREKIQKHVSSTSSSFLEV 880 890 900 910 >>KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049 aa) initn: 1202 init1: 468 opt: 515 Z-score: 573.6 bits: 117.8 E(): 7.8e-27 Smith-Waterman score: 1209; 33.135% identity (61.621% similar) in 839 aa overlap (174-936:82-902) 150 160 170 180 190 200 KIAA07 MEAAAFQSGSLYPVASFLAAPMSELVPDLSFQVDLHTGLSEFSVTQRRLAH-GWNEFVAD .:::: ::.. . .: ::. : : .. KIAA07 KKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKGLTN-QRAQDVLARDGPNALTPP 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 KIAA07 NSEPVWKKYLDQ-FKNPLILLLLGSALVSV---LTKEYEDAVS-------IATAVLVVVT . : : :. : : . ::: .:. : . . .:: : .. :..:.:: KIAA07 PTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVT 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 KIAA07 --VAFIQEYRSEKSLEELTKLVPPECNCLREGKLQHLLARELVPGDVVSLSIGDRIPADI .. :: .: : .. . ..:: . .:::. ... :.:.: ::.: .. :::.:::. KIAA07 GCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADL 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 KIAA07 RLTEVTDLLVDESSFTGEAEPCSKTDSP-LTGGGDLTTLSNIVFMGTLVQYGRGQGVVIG :. ::.::.:::.:: .: :: .: . : : :: :..: : ..:.::. KIAA07 RIISSHGCKVDNSSLTGESEP--QTRSPEFTHENPLET-RNICFFSTNCVEGTARGIVIA 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 KIAA07 TGESSQFGEVFKMMQAEETPKTPLQKSMDRLGKQLT---LF---SFGIIGLIMLIGWSQG ::. . .:.. . .. :. .::. .... . .: .: :: ...::. .: .. KIAA07 TGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEA 290 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 KIAA07 KQLLSMFTIGVSLAVAAIPEGLPIVVMVTLVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGCCSVLC .: ::. :: .:::: .: : :.: . :::.: .::.: ::::: :..: KIAA07 ----VIFLIGI--IVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTIC 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 KIAA07 SDKTGTLTANEMTVTQLVTSDGLRA-----EVSGVGYDGQGTVCLLPSKEVIKEFSNVSV :::::::: :.:::... .. .. . ::. .: .. :. ........ KIAA07 SDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRS-----PTWTALSRIAGLCN 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 590 KIAA07 GKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALMALAMKMDLSDIKNSYIRKK---EIPFSSEQ . .:: .: . : . :. .:.::. .... ..... :. ::::.: . KIAA07 RAVFKAG--QENISVSKRDTAGDASESALLK-CIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNSTN 460 470 480 490 500 510 600 610 620 630 640 650 KIAA07 KWMAVKCSLKTEDQEDIYFMKGALEEVIRYCTMYNNGGIPLPLTPQQRSFCLQEEKRMGS :.. . : . :::: :... :. : .:: .... . ..:. KIAA07 KYQLSIHEREDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYMELGG 520 530 540 550 560 570 660 670 680 690 KIAA07 LGLRVLA-----LASG--P--------ELG----RLTFLGLVGIIDPPRVGVKEAVQVLS :: :::. : :: : ::. .: :.::...:::::..: .:: KIAA07 LGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCR 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 KIAA07 ESGVSVKMITGDALETALAIGRNIGLC--------------NGKLQAMSGEEVDS-VEKG .:..: :.::: :: ::....:. : .. .. .:. . : .: KIAA07 SAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKACVVHG 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 KIAA07 --------ELADRVGKVS---VFFRTSPKHKLKIIKALQESGAIVAMTGDGVNDAVALKS : :.. : :: ::::..:: :... :..:::::.:::::::. :::. KIAA07 SDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKK 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 840 KIAA07 ADIGIAMGQTGTDVSKEAANMILVDDDFSAIMNAVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSISAL :::::::: .:.::::.::.:::.::.:..:...::::. :: :.:. . . :...: . KIAA07 ADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEI 760 770 780 790 800 810 850 860 870 880 890 900 KIAA07 SLITLSTVFNLPSPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDAFRQPPR-SVRDTILSR . . : . :.: ::... :: :.. : :: ::. : ...: ... :: : : .... KIAA07 TPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTDKLVNE 820 830 840 850 860 870 910 920 930 940 950 960 KIAA07 ALILKILMSAAIIIS-GTLFIFWKEMPEDRASTPRTTTMTFTCFVFFDLFNALTCRSQTK :: . ..: . : .: .. . :. KIAA07 RLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDSYGQEWT 880 890 900 910 920 930 >>KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203 aa) initn: 332 init1: 161 opt: 166 Z-score: 180.9 bits: 45.3 E(): 5.8e-05 Smith-Waterman score: 315; 22.267% identity (51.687% similar) in 741 aa overlap (148-796:182-880) 120 130 140 150 160 170 KIAA07 LSLPHLHGVFEQVPAPWWTSLCPWPIMEAAAFQSGSLYPVASFLAAPMSELVPDLSFQVD :... .. ::: .. .: . .:: : KIAA18 TELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYSYDALEKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQED 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 KIAA07 LHTGLSEFSVTQRRLAHGWNEFVADNSEPVWKKYLDQFKNPLILLLLGSALVSVLTKEYE ::. ....... . :.:. . ..: .. :.... . . . : :: KIAA18 -----SEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFK---ERATAPFFVFQVFCVGLWCLD-EYW 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 KIAA07 DAVSIATAVLVVVTVAFIQEYRSEKSLEELTKL--VPPECNCLREGKLQHLLARELVPGD .. ..::. ....:. . ... :. :. : . : : . . . :.:::: KIAA18 YYSVFTLSMLVAFEASLVQQ--QMRNMSEIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGD 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 KIAA07 VVSLSIGDR---IPADIRLTEVTDLLVDESSFTGEAEPCSKTDSPLTGGG-----DLTTL .::.. . . .: :. : . .:::. .:::. : : :. . :: . KIAA18 IVSIGRSPQENLVPCDVLLLR-GRCIVDEAMLTGESVPQMKE--PIEDLSPDRVLDLQAD 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 KIAA07 S--NIVFMGT-LVQYGRGQGVVIGTGESSQFGEVFKMMQAEETPKTPLQKSM----DRL- : ...: :: .::. : .. : .. .. . . .: . : ... :. KIAA18 SRLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVT 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 KIAA07 GKQLTLFSFGIIGLIMLIG-----WSQG-----KQLLSMFTIGVSLAVAAIPEGLPIVVM ...: : : .. :.. :. : .: .. ..: . . ....: ::: . KIAA18 ANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELS 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 KIAA07 VTLVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGCCSVLCSDKTGTLTANEMTVTQLVTSDGLRAEV ... ... .:: . . . : : : :::::::.. ..: .. ::: KIAA18 LAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVA---GLR--- 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 KIAA07 SGVGYDGQGTVCLLPSKEVIKEFSNVSVGKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALMAL ::. : . : : . . .: .:.. . ....:.: : :... KIAA18 -----DGK-EVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQ---------LDDGTLVGDPLEKAMLT- 560 570 580 590 570 580 590 600 610 KIAA07 AMKMDLS--------DIKNSYIR-KKEIPFSSEQKWMAVKCSLKTEDQEDIYFM---KGA :. :. .::.. .. .... :.: : :.: : . . :. .. ::: KIAA18 AVDWTLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGA 600 610 620 630 640 650 620 630 640 650 660 670 KIAA07 LEEVIRYCTMYNNGGIPLPLTPQQRSFCLQEEKRMGSLGLRVLALASGP---ELGR---- : . .:... : : . .. .: :. .:: . :. . :. : KIAA18 PETL---HSMFSQ--CP-PDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALE 660 670 680 690 700 680 690 700 710 KIAA07 --LTFLGLVGIIDPPRVGVKEAVQVLSESGVSVKMITGDALETALAI------------- : :.:.. . : .. : ... ..... : ::::: :: . KIAA18 CSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTL 710 720 730 740 750 760 720 730 740 KIAA07 --------GRN-----------IGLCNGKLQAMSGE-----------EVDSVEKGELADR ::. . : :. .:.. : ...... .: KIAA18 ILQPPSEKGRQCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRL 770 780 790 800 810 820 750 760 770 780 790 800 KIAA07 VGKVSVFFRTSPKHKLKIIKALQESGAIVAMTGDGVNDAVALKSADIGIAMGQTGTDVSK . .:.:: :..::.: .: .:.: : .. : :::.::. ::: ::.:.:. KIAA18 IPHVQVFARVAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVV 830 840 850 860 870 880 810 820 830 840 850 860 KIAA07 EAANMILVDDDFSAIMNAVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSISALSLITLSTVFNLPSPLN KIAA18 ERRRRPRDSPTLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVK 890 900 910 920 930 940 1051 residues in 1 query sequences 1986454 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:42 2008 done: Thu Dec 18 15:12:43 2008 Total Scan time: 0.690 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]