# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02921s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA0704.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0704, 919 aa vs ./tmplib.23663 library 1986586 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8819+/-0.00519; mu= 11.7102+/- 0.352 mean_var=120.5842+/-29.071, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.116796 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0772 ( 469 res) hk05119 ( 469) 786 143.9 4.2e-35 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 753 138.7 3.1e-33 KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) ( 865) 382 76.1 2e-14 KIAA1451 ( 939 res) bg00289 ( 939) 337 68.6 4e-12 >>KIAA0772 ( 469 res) hk05119 (469 aa) initn: 701 init1: 306 opt: 786 Z-score: 722.2 bits: 143.9 E(): 4.2e-35 Smith-Waterman score: 963; 38.356% identity (63.014% similar) in 438 aa overlap (522-903:24-459) 500 510 520 530 540 KIAA07 SPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQT-LGPVLD--SGREAKSRRRTCL :::. ... .: . . : ... ...:: : KIAA07 RMNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSL 10 20 30 40 50 550 560 570 580 590 600 KIAA07 PAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIP ::: : :..:.:.::.. .: .:::..::. .::::. :::. : .:. :. .:. : KIAA07 PAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQP 60 70 80 90 100 110 610 620 630 640 650 660 KIAA07 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS .::::: :::::.:: ::.. :.: :::::.:::::: :::: ::.:.::::::::::: KIAA07 QPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG-KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPIS 120 130 140 150 160 170 670 680 690 700 710 720 KIAA07 ACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNIL : :.:. : :.: .. : ::::::.: : :: . : .. . :.. : :.::.. 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KIAA16 LKFLPYSYFSKEAARKVTGVVSDSQGKAHYVLSGSWDEQMECSKVMHSSPSSPSSDGKQK 720 730 740 750 760 770 800 810 820 830 840 850 KIAA07 ------SSACVWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLE :. .:. :.:.. :..: :...:: ::: . . . :::.:.:::::..: KIAA16 TVYQTLSAKLLWKKYPLPENAENMYYFSELALTLNEHEEG----VAPTDSRLRPDQRLME 780 790 800 810 820 830 860 870 880 890 900 KIAA07 EGNLEEAEIQKQRIEQLQR-ERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLG .: .::. .:::.:. :: ::: :: KIAA16 KGRWDEANTEKQRLEEKQRLSRRRRLEACGPGSSCSSEEEKEADAYTPLWFEKRLDPLTG 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) (865 aa) initn: 237 init1: 97 opt: 382 Z-score: 351.0 bits: 76.1 E(): 2e-14 Smith-Waterman score: 382; 26.801% identity (59.078% similar) in 347 aa overlap (554-887:350-682) 530 540 550 560 570 580 KIAA07 DNERQTLGPVLDSGREAKSRRRTCLPAPCPSSSNISL-WNILRN-NIGKDLSKVAMPVEL : : :: :..:.. : :::.:..:. . 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KIAA15 GETFRCCWFHPQTDSRTFYIAEQVSHHPPVSAFHVSNRKDGFCISGSITAKSRFYGNSLS 440 450 460 470 480 490 700 710 720 730 740 750 KIAA07 IVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKVNFI . : . .:. .. . . . ..:: : .: :...:. ... ...: KIAA15 ALLDGKATLTFLNRAEDYTLTMPYAHCKGILYGTMTLELGGKVTIECAKNN-FQAQLEFK 500 510 520 530 540 550 760 770 780 790 800 810 KIAA07 KAKYW--STNAHEIEGTVFDRSGKAV-HRLFGKWHESIYCG--GGSSSACVWRANPMPKG .. ::. ..: : . ::. : : :.: .... :..::: : :.: KIAA15 LKPFFGGSTSINQISGKI--TSGEEVLASLSGHWDRDVFIKEEGSGSSALFWT----PSG 560 570 580 590 600 610 820 830 840 850 860 870 KIAA07 YEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQKQRIEQLQRE . . : .. :.: .. : .. .. : . .:. ..: .: .:. ::. KIAA15 EVRRQRLRQHTVPLEE-----QTELE-SERLWQHVTRAISKGDQHRATQEKFALEEAQRQ 620 630 640 650 660 880 890 900 910 KIAA07 RRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLGFSKLDHPVLW : : .:. . .:..: KIAA15 RARERQESLMPWKPQLFHLDPITQEWHYRYEDHSPWDPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVA 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1451 ( 939 res) bg00289 (939 aa) initn: 252 init1: 86 opt: 337 Z-score: 309.6 bits: 68.6 E(): 4e-12 Smith-Waterman score: 350; 23.679% identity (55.603% similar) in 473 aa overlap (466-907:351-813) 440 450 460 470 480 490 KIAA07 ESLLLDSPAVAKSGDNLAEENSRDENRALVHQLSNESRLSITDSLSE--FFDAQEVLLSP ..: . . ....:: : : :.. . KIAA14 KRTMIREGKEHDLSVSSDSTHVTFYGLLRANNLHSGDNFQLNDSEIERQHFKDQDMYSDK 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 KIAA07 SSSENEISDD--DSYVSDISDNLSLDNLSNDLDN--ERQTLGPVLDSGREAKSRRRTCLP :..::. : :. : :.. . :. . :. : . . :. .. .:... KIAA14 SDKENDQEHDESDNEVMGKSEESDTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYTEQSHEELGEA 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 KIAA07 APCPSSSNIS------LWNILRN-NIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLD . .. ..: .:..:.. : :::::..:. . :: . :..: . ....:. KIAA14 GEASQTETVSEENKSLIWTLLKQVRPGMDLSKVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLS 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 KIAA07 KAAQIPSPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECI----REDKGFQFFS .:: .: :. :. . .:.. .. .. .::.::.::::..:. : .. ... KIAA14 EAALEENPYFRLKKVVKWYLSGFYKKP-KGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIA 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 710 KIAA07 EQVSHHPPISACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWN ::::::::::: .. .:. : . .. :.::.:.:. . : ...:. :. . . KIAA14 EQVSHHPPISAFYVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMT 560 570 580 590 600 610 720 730 740 750 760 770 KIAA07 KVTSCIHNILSGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKVNFIKAKYW---STNAHEIEGTVFD . ..:: : .: : . : . . : . .: : . : ...: : . KIAA14 MPYAHCKGILYGTMTLELGGTVNITC--QKTGYSAILEFKLKPFLGSSDCVNQISGKL-- 620 630 640 650 660 670 780 790 800 810 820 KIAA07 RSGKAV-HRLFGKWHESIYCGGGSS--SACVWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEM-DP . :: : : :.: .. .. : : :: : . . . . .....:. : KIAA14 KLGKEVLATLEGHWDSEVFITDKKTDNSEVFW--NPTPDI--KQWRLIRHTVKFEEQGDF 680 690 700 710 720 730 830 840 850 860 870 880 KIAA07 SSKSLLPPTDTRFRP-DQR--FLEEGNLEEAEIQKQRIEQLQRERR--RVLEENHVEHQP :..: . . :: :. ::::. : : .. . :. ...: . . . KIAA14 ESEKLWQRVTRAINAKDQTEATQEKYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWSCKLFELDPLTGEW 740 750 760 770 780 790 890 900 910 KIAA07 RFFRKSDDDSWVSNGTYLELRKDLGFSKLDHPVLW .. . .: : . .....:: KIAA14 HY-KFADTRPWDPLNDMIQFEKDGVIQTKVKHRTPMVSVPKMKHKPTRQQKKVAKGYSSP 800 810 820 830 840 850 919 residues in 1 query sequences 1986586 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:45 2008 done: Thu Dec 18 15:12:46 2008 Total Scan time: 0.640 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]