# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02753.fasta.huge -Q ../query/KIAA0723.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0723, 853 aa vs ./tmplib.23663 library 1986652 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3195+/-0.00697; mu= 13.3731+/- 0.471 mean_var=201.5770+/-48.173, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.090335 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0284 ( 1573 res) pf09542 (1573) 191 38.3 0.0082 >>KIAA0284 ( 1573 res) pf09542 (1573 aa) initn: 74 init1: 74 opt: 191 Z-score: 142.3 bits: 38.3 E(): 0.0082 Smith-Waterman score: 204; 23.067% identity (47.239% similar) in 815 aa overlap (37-789:664-1423) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 MSKSFQQSSLSRDSQGHGRDLSAAGIGLLAAATQSLSMPASLGRMNQGTARLASLMNL-- : :.: .:.: : .. ..: ::: . KIAA02 DRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKW-VSRWASLADSYS 640 650 660 670 680 690 70 80 90 100 110 KIAA07 --GMS-SSLNQQGAHSALSSASTSSHNLQSIFNIGSRGPL-PLSSQHRG------DADQA :.. ..:...:.. : . : .. . . .: : ::.. : :..: KIAA02 DPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDSEQP 700 710 720 730 740 750 120 130 140 150 160 KIAA07 SNILASFGLSARDLDELS--------RYPEDKITPENLPQILLQLKRRRTEEGPTLSYGR : . :: : : :: : :: . :.. .:: .:::: : :: KIAA02 SRL---FGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDS-------RRRSPQEGPTWSRGR 760 770 780 790 800 170 180 190 200 210 220 KIAA07 DGRSATREP-PYRVPRDDWEEKRHFRRDSFDDRGPSLNPVLDYDHGSRSQES-----GYY . : :: : : . :. .: : : :. .: : : : KIAA02 RSPRAPGEPTPASFFIGDQNG------DAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVY 810 820 830 840 850 230 240 250 260 270 KIAA07 ----DRMDYEDDRLRDGERCRDDSFFGETSHNYHKFDSEYERMGRGPG-P--LQERSLFE :: . :: :. . :. . . ..: .: .:: : .. . :.. KIAA02 VSANGRMVIQ---LRPGRSPEPDGP-APAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQ 860 870 880 890 900 910 280 290 300 310 320 330 KIAA07 K---KRGAPPSSNIEDFHGLLPKGYPHLCSICDLPVHSNKEWSQHINGASHSRRCQLLLE :.: . . .: : .: . : .. . . ::. . . .:.: : . : KIAA02 DLAATRAARMDFHSQDTHLILKETETALAAL-EARLLSNSV-DAECEGGSTPRPPEDALS 920 930 940 950 960 970 340 350 360 370 KIAA07 IYPEWNPDNDTGHTMGDPFMLQQSTNPAPGI---------LGPPPPSFHL-GGPA-VGPR . : ::. :.. . . ...:.: ..: ::. . :: : :. : KIAA02 ----GDSDVDTASTVS---LRSGKSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAR 980 990 1000 1010 1020 380 390 400 410 420 430 KIAA07 GNLGAGNGNLQGPRHMQKGRVETSRVVHIMDFQRGKNLRYQLLQLVEPFGVISNHLILNK . . . . :: : :: : : : .::. : .: : : . :: . KIAA02 EQSSERQHHPLGPTDM--GRGEPVRRSAI---RRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSD 1030 1040 1050 1060 1070 440 450 460 470 480 490 KIAA07 INEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVRVHLSQKYKRIKKPEGKPDQKFDQKQE . . . : : . :. :: . : .. .: . : : . ... KIAA02 VMAS--NHETPEATGAGRLGSRRKPA---APPPSPAAREEQSRSSASSQKGPQALTRSNS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 500 510 520 530 540 550 KIAA07 LG--RVIHLSNLPHSGYSDSAVLKLAE-PYGKIKNYILMRMKSQAFIEMETREDAMAMVD :. : . : : .. .:.. . :. :.. : . . . .: : .:: KIAA02 LSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNPEPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPR 1140 1150 1160 1170 1180 1190 560 570 580 590 600 610 KIAA07 HCLKKALWFQG----RCVKVDLSEKYKKLVLRIPNRGIDLLKKDKSRKRSYSPDGKESPS :.: : : . . . : . ... : .: . . ... . .: KIAA02 ---KRAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPR 1200 1210 1220 1230 1240 1250 620 630 640 650 660 KIAA07 DKKSKT-DGSQKTESSTE----GKEQEEKSGEDGEKDTKDDQTEQEPNMLLESEDELLVD . :.. .:: . :.:. :. .. .: : .:: ::. : .: .. . :. KIAA02 QPFSRARSGSARYTSTTQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEI--- 1260 1270 1280 1290 1300 670 680 690 700 710 720 KIAA07 EEEAAALLESGSSVGDETDLAN-LGDVASDGKKEPSDKAVKKDGSASAAAKKKLKKVDKI : : : : . : : . ::. . :::.:: :.. ... .: : . . .. KIAA02 -AEIARL--SQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHS-ASLSNMPSTPASTISAR 1310 1320 1330 1340 1350 1360 730 740 750 760 770 780 KIAA07 EELDQE-NEAALENGIKNEENTEPGAESSENADDPNKDTSENADGQSDENKD-DYTIPDE ::: :. ::.: : ... ::. .:.. :. .:. :.: ... . .. . .: :. KIAA02 EELVQRIPEASL-----NFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALANKTRPRNREEVIFDN 1370 1380 1390 1400 1410 790 800 810 820 830 840 KIAA07 YRIGPYQPNVPVGIDYVIPKTGFYCKLCSLFYTNEEVAKNTHCSSLPHYQKLKKFLNKLA ..: KIAA02 LMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTSNKEISS 1420 1430 1440 1450 1460 1470 853 residues in 1 query sequences 1986652 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:13:31 2008 done: Thu Dec 18 15:13:32 2008 Total Scan time: 0.620 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]