# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02781.fasta.huge -Q ../query/KIAA0725.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0725, 573 aa vs ./tmplib.23663 library 1986932 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9457+/-0.00479; mu= 14.3026+/- 0.326 mean_var=88.7234+/-20.957, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 7 in 1/39 Lambda= 0.136162 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1705 ( 498 res) fj17028 ( 498) 288 66.7 4.9e-12 KIAA1457 ( 1359 res) fh16161s1 (1359) 153 40.6 0.00093 >>KIAA1705 ( 498 res) fj17028 (498 aa) initn: 552 init1: 158 opt: 288 Z-score: 308.0 bits: 66.7 E(): 4.9e-12 Smith-Waterman score: 462; 27.599% identity (52.330% similar) in 558 aa overlap (56-562:14-484) 30 40 50 60 70 80 KIAA07 HNPKLMVHYQPVAGSDDWGSTPMEQGRPRTVKRG-VENISVDIHCGEPLQIDHLVFVVHG ..:: ::. ... .: : :.:::::: KIAA17 NYNFSTASSSGTRLHRGYVEEATLE---DKPSQTTHIVFVVHG 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 KIAA07 IGPACDLRFRSIVQCVNDFRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEFLPVNWHSPLHSTGVD :: : :.. . .: .. .. . :: ... .::::::.:.: : : KIAA17 IGQKMDQ--GRIIKNTAMMREAARKIEERHF-----SNHATHVEFLPVEWRSKLTLDGDT 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA07 VDLQRITLPSINRLRHFTNDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEMNRIYTLFLQRNPDF- :: :: .. :: . :.. .:...:.:: : . .: . .:.::.:.:: .::::: KIAA17 VD--SITPDKVRGLRDMLNSSAMDIMYYTSPLYRDELVKGLQQELNRLYSLFCSRNPDFE 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 KIAA07 -KGG-VSIAGHSLGSLILFDILTNQKDSLGDIDSEKGSLNIVMDQGDTPT-LEEDLKKLQ ::: :::..:::: .: .::.: : .:. : :.: :: KIAA17 EKGGKVSIVSHSLGCVITYDIMT----------------------GWNPVRLYEQL--LQ 160 170 180 270 280 290 300 310 320 KIAA07 LSEFFDIFEKEKVDKEALALCTDRDLQEIGIPLGPRKKILNYFSTRKNSMGIKRPAPQPA :.: :.. .. . :.:. : :. :. . : . :.: KIAA17 K-------EEELPDERWMSYEERHLLDELYIT----KRRLKEIEERLH--GLK------- 190 200 210 220 330 340 350 360 370 380 KIAA07 SGANIPKESEFCSSSNTRNGDYLDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFFAFGSPIGMFLTVRGL .:: :.. : : .: : :: .:::...::..::. KIAA17 ------------ASSMTQT---------------PALKFKVENFFCMGSPLAVFLALRGI 230 240 250 260 390 400 410 420 KIAA07 KRIDP---NYRFPT--CKGFFNIYHPFDPVAYRIEPMV------VPGVEFE------PML . . .. .: :. ..::.:: ::::::.::.. . :... :. KIAA17 RPGNTGSQDHILPREICNRLLNIFHPTDPVAYRLEPLILKHYSNISPVQIHWYNTSNPLP 270 280 290 300 310 320 430 440 450 KIAA07 IPHHK------GRKRMHLELREGLTRMSMDL------------------KNNLLGSLRMA : : ... . ::.. . . : ..::. .. KIAA17 YEHMKPSFLNPAKEPTSVSENEGISTIPSPVTSPVLSRRHYGESITNIGKASILGAASIG 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 KIAA07 WKSFTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPSDVNTEETSVAVKEEVLP-INVGMLNGG :.. . . : : . .:. .: .. . : . ....: ..:: . :.:... KIAA17 -KGLGGMLFSRFGRSSTTQSSETSKDSMEDEKKPVASP-SATTVGTQTLPHSSSGFLDSA 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 KIAA07 ----QRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTVLLVLKEIYQTQGIFLDQPLQ .:::. :.: .:: .: :. :: :: : :..:..: .:. KIAA17 LELDHRIDFELREGLVES--RYWSAVTSHTAYWSSLDVALFLLTFMYKHEHDDDAKPNLD 440 450 460 470 480 490 KIAA17 PI >>KIAA1457 ( 1359 res) fh16161s1 (1359 aa) initn: 145 init1: 65 opt: 153 Z-score: 159.4 bits: 40.6 E(): 0.00093 Smith-Waterman score: 213; 22.418% identity (50.769% similar) in 455 aa overlap (167-562:530-973) 140 150 160 170 180 190 KIAA07 PLHSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFTNDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEMNRIYTLF : .. .:: : : : :: .. : : : KIAA14 DAFALVSNLSPYSHDEGCLSSSQDHIPLAALPLLATSSPQY-QEAVATVIQRANLAYGDF 500 510 520 530 540 550 200 210 220 230 240 250 KIAA07 L--QRNPDFKGGVSIAGHSLGSLILFDIL--TNQKDSLGDIDSEKGSLNIVMDQGD--TP . :.. :.: : . : .:... :: : .:: : .. .:..::. . :...: .: KIAA14 IKSQEGMTFNGQVCLIGDCVGGILAFDALCYSNQPVSESQSSSRRGSV-VSMQDNDLLSP 560 570 580 590 600 610 260 270 280 290 KIAA07 TLEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKV----DKEALALCTDRDLQE--IGIPLG---------- . . . . . .. . .: ..: :.. . :: . KIAA14 GILMNAAHCCGGGGGGGGGGGSSGGGGSSGGSSLESSRHLSRSNVDIPRSNGTEDPKRQL 620 630 640 650 660 670 300 310 320 330 340 350 KIAA07 PRKKILNYFSTRKNSMGIKRPAPQPASGANIPKESEFCSSSNTRNGDYLDVGIGQVSVKY :::. . :: . . .. : . :.. . .: :: .. .. .:: : : .. KIAA14 PRKR--SDSSTYELDTIQQHQAFLSSLHASVLR-TEPCSR-HSSSSTMLD-GTGALG--- 680 690 700 710 720 360 370 380 390 400 410 KIAA07 PRLIYKPEIFFAFGSPIGMFLTVRG--LKRIDPNYRFPTCKGFFNIYHPFDPVAYRIEPM :. .. .: :: :.:. :..: . .: :.:. .:..:: :: : :.::. KIAA14 -RFDFEITDLFLFGCPLGLVLALRKTVIPALDVFQLRPACQQVYNLFHPADPSASRLEPL 730 740 750 760 770 780 420 430 440 450 KIAA07 VVPGVE-FEPMLIPHHK------GRKRMHLE--------LREGLTRMSMDLKNNLL-GSL . . . :. .:... : . . .: . :: . ...: :. KIAA14 LERRFHALPPFSVPRYQRYPLGDGCSTLLVETVQRNPELVLEGGPLAPLPHGDGFLETSM 790 800 810 820 830 840 460 470 480 490 500 KIAA07 RMAWKSFTRAPYPA------LQASETPEETEAEPESTSEKPSDVN---TEETSVAVK--- . .. .: :. ::. .. . .. : : . :.. . . : :.: . KIAA14 PVPAPTWQDGPRPGCAESDVLQTHNAAFQEHGAPSSPGTAPASRGFRRASEISIASQVSG 850 860 870 880 890 900 510 520 530 540 550 KIAA07 --EEVLPINVGMLN----GGQRIDYVLQ-EKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTVLLVL : ..... : .::::.: . .: . : :::: :.: ..: KIAA14 MAESYTASSIAQIAAKWWGQKRIDYALYCPDALTAFPTVALPHLFHASYWESTDVVSFLL 910 920 930 940 950 960 560 570 KIAA07 KEIYQTQGIFLDQPLQ ..... KIAA14 RQVMRHDNSSILELDGKEVSVFTPSKPREKWQRKRTHVKLRNVTANHRINDALANEDGPQ 970 980 990 1000 1010 1020 573 residues in 1 query sequences 1986932 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:13:36 2008 done: Thu Dec 18 15:13:36 2008 Total Scan time: 0.490 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]