# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03764s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA0734.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0734, 1190 aa vs ./tmplib.23663 library 1986315 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2429+/-0.00555; mu= 16.9110+/- 0.378 mean_var=120.9252+/-28.703, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.116632 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1032 ( 1702 res) ff09715 (1702) 254 55.1 1.1e-07 KIAA1342 ( 426 res) fj00418 ( 426) 186 42.9 0.00013 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 170 40.5 0.0011 >>KIAA1032 ( 1702 res) ff09715 (1702 aa) initn: 239 init1: 72 opt: 254 Z-score: 230.1 bits: 55.1 E(): 1.1e-07 Smith-Waterman score: 430; 20.882% identity (48.669% similar) in 1202 aa overlap (101-1177:575-1685) 80 90 100 110 120 130 KIAA07 SADPQEPATGAWKPGDGVEFFAHMRLMLKKGEGRQGLPCLEVPLRSGSPAPPEPVDPSLG : .:::. : : .. . .. . 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