# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00943.fasta.huge -Q ../query/KIAA0735.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0735, 707 aa vs ./tmplib.23663 library 1986798 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.8609+/-0.00517; mu= 20.3519+/- 0.353 mean_var=88.3073+/-19.856, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 3 in 1/39 Lambda= 0.136482 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0736 ( 748 res) hk03846 ( 748) 2850 572.0 7.1e-164 KIAA1054 ( 480 res) hh05240 ( 480) 2100 424.0 1.6e-119 >>KIAA0736 ( 748 res) hk03846 (748 aa) initn: 2988 init1: 2187 opt: 2850 Z-score: 3034.0 bits: 572.0 E(): 7.1e-164 Smith-Waterman score: 3042; 62.448% identity (84.979% similar) in 719 aa overlap (7-706:31-747) 10 20 30 KIAA07 NSPNLYHRARDIAQGATR---QSQNQGMDDYKYQDN : :. ...: : . . .... .. .:. KIAA07 SAPSPIMEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDD 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 KIAA07 YGGY-APSDGYYRGNESNPEED--AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKM . :::::::::. .. ::. :.::.::::::.::::::::::::. .. .: .: KIAA07 DDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERM 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 KIAA07 APSR-MDSLRGQ-TDLM--------AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLG : . . ..:: .: :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::: KIAA07 ADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLG 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 KIAA07 LALMADGVEVFVVSFALPSAEKDMCLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKR :::::::::::::.:.:::::::::::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. 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