# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04073s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0742.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0742, 1338 aa vs ./tmplib.23663 library 1986167 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1498+/-0.00619; mu= 7.1342+/- 0.420 mean_var=166.1658+/-40.112, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.099495 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1082 ( 1787 res) fg06837 (1787) 2173 325.2 6.1e-89 KIAA1380 ( 1265 res) fj05118 (1265) 1509 229.8 2.3e-60 >>KIAA1082 ( 1787 res) fg06837 (1787 aa) initn: 3542 init1: 1649 opt: 2173 Z-score: 1688.7 bits: 325.2 E(): 6.1e-89 Smith-Waterman score: 3530; 59.438% identity (79.888% similar) in 890 aa overlap (522-1337:897-1786) 500 510 520 530 540 KIAA07 SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ ..:: . .::: : .:.:::.:::: :.: KIAA10 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ 870 880 890 900 910 920 550 560 570 580 590 600 KIAA07 DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT : ::.:.. .: :::::::. :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::. KIAA10 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS 930 940 950 960 970 980 610 620 630 640 650 660 KIAA07 PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.:::::: .:::..::: KIAA10 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW 990 1000 1010 1020 1030 1040 670 680 690 700 710 720 KIAA07 KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::.. :.. .. . ..:::: KIAA10 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 730 740 750 760 770 780 KIAA07 KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: : .:: KIAA10 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT 1110 1120 1130 1140 1150 1160 790 800 810 820 KIAA07 EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS . ..: .. .:.. :... : .:. . :: . . :.. KIAA10 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN 1170 1180 1190 1200 1210 1220 830 840 850 860 870 KIAA07 KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL . . ...: :: .. : :.:::::.. ....:.:: .:..: . : . KIAA10 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF 1230 1240 1250 1260 1270 1280 880 890 900 910 KIAA07 SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK----------------- .... : . ::: .: :...::. . ::.::.:. :: KIAA10 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS 1290 1300 1310 1320 1330 1340 920 930 940 950 KIAA07 -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T . :.:. :..:: :.::.:.:: ::: ::: .:: .: ..:.. : KIAA10 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT 1350 1360 1370 1380 1390 1400 960 970 980 990 1000 1010 KIAA07 PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::. KIAA10 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA07 QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS :.:::::::. ::. . : ::::::: . .::..: .::::::::::::::::::::. 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KIAA10 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA07 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.: KIAA10 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1320 1330 KIAA07 YHAVKDAVAMLKASESSFGKP ::::::::. ::: ::.... 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KIAA13 DKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKP 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 KIAA07 ------SCCSRSNNKIQNAPSR---KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPK : ::. :.:. . .::: : :.:::.:.::.:.::::: .: .: : KIAA13 NGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQK 400 410 420 430 440 450 570 580 590 600 610 620 KIAA07 CRECRLDSLRKDK-EQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAIGLWL :::::: .:. : :. :::::::..::::.:.:.::.:..:: .:..::.::..:: KIAA13 CRECRL--IRSKKGEEPAHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAMSLWT 460 470 480 490 500 510 630 640 650 660 670 680 KIAA07 PLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVREMCDV . . .:..:.:::: :::.:::.: ::: :.: .. ..::::::.:::::::. KIAA13 HENFEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDA 520 530 540 550 560 570 690 700 710 720 730 740 KIAA07 CDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENLMPTQ :..:.::.:::: .::: ::.:::. :... .. . ..:.::::.: :. ..::::: KIAA13 CEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDK--ELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQ 580 590 600 610 620 630 750 760 770 780 790 KIAA07 IIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQ-FKLFSKPASK--EDLKQTSLA-GEKP ::::..: :. : .:..: :.:::..: :.:.: ... . :. . .. :. : ..: KIAA13 IIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMNGVSQVLQNVLNHSNKI 640 650 660 670 680 690 800 810 820 830 840 850 KIAA07 TL--GAVLQQN-PSVLEPAAVGGEAASKPAGS-MKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKEN .: ::: : : :: . . .:. : . : : :::.:::::. .. .:. KIAA13 SLCMPESQQQNTPPKSEKN--GGSSPESDVGTDNKLTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEK 700 710 720 730 740 750 860 870 880 890 900 910 KIAA07 KEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGK- ::.. :.:.:: .... . .. :. .:.... ::.::....:: KIAA13 KENKEL--TLENQIK-----EEREQDNSESPNGRTSPLVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKL 760 770 780 790 800 920 930 940 KIAA07 ----TENGL----------------KNTPKILDDIFASLVQNKT----TSDLSKRPQGLT :. :. .. :.:::::.::.:.:: :: .. .:. : KIAA13 RVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPE-LK 810 820 830 840 850 860 950 960 970 980 990 KIAA07 IKP--SILGF--------DTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGV .: ::.. : :: :.:....: :.: .:.:::..:.::::::::..:::: KIAA13 EEPEESIISAVENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSGV 870 880 890 900 910 920 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA07 HHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EP :.:.: ::: ::. .::....::.::. . ::..:.: .::::::.: .: ::.. : KIAA13 HKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCK-DSIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGET 930 940 950 960 970 980 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA07 MVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKM .:::::::: ::::. :::.:..::. ..::::: .::.::::.::..::::::::.. KIAA13 VVLKLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPRL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA07 YNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQ-CEQEEEVLKTIQDGDSDELT .:::... .:. ::::::..:::..:..::::: ::. .. .:: ... : :.. KIAA13 CSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDIL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA07 IKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLR ::. ...: :::::::::.::..::::::.:.:.::: : .::::.:::::....:: KIAA13 RKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKLR 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA07 KRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQE .:: .::::. ...:::::.. .:::: :::.:..:::.:.::::::::. . : :::: KIAA13 QRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQE 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1300 1310 1320 1330 KIAA07 FRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP .: :.. . :..:::::::..:::::. : :: : KIAA13 LRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN 1230 1240 1250 1260 1338 residues in 1 query sequences 1986167 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:14:15 2008 done: Thu Dec 18 15:14:16 2008 Total Scan time: 0.790 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]