# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04110.fasta.huge -Q ../query/KIAA0744.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0744, 619 aa vs ./tmplib.23663 library 1986886 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9617+/-0.00957; mu= -13.8371+/- 0.648 mean_var=342.4863+/-80.629, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.069303 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0288 ( 1097 res) ha06116(revised) (1097) 1649 178.8 2.1e-45 KIAA0600 ( 1080 res) fh08981 (1080) 1319 145.8 1.8e-35 >>KIAA0288 ( 1097 res) ha06116(revised) (1097 aa) initn: 762 init1: 495 opt: 1649 Z-score: 907.1 bits: 178.8 E(): 2.1e-45 Smith-Waterman score: 1780; 51.129% identity (74.516% similar) in 620 aa overlap (13-610:18-607) 10 20 30 40 50 KIAA07 GFLQQNPSSLKNSKPDGVAGREQ---LLAQQRMHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS- :.:::..::.: :: :.. : :.::: . .:. . : . 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