# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04143.fasta.huge -Q ../query/KIAA0747.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0747, 1072 aa vs ./tmplib.23663 library 1986433 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2218+/-0.00555; mu= 16.4221+/- 0.380 mean_var=109.6944+/-25.710, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.122457 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1228 ( 843 res) fh05620s1 ( 843) 1989 362.9 1.1e-100 KIAA0751 ( 1200 res) hk04424 (1200) 253 56.4 2.8e-08 KIAA0340 ( 1053 res) hg01396 (1053) 243 54.5 8.7e-08 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 224 51.0 6.9e-07 KIAA0538 ( 816 res) hg03944(revised) ( 816) 220 50.4 1.2e-06 KIAA1597 ( 913 res) fj09819 ( 913) 195 46.0 2.8e-05 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 194 46.1 4.7e-05 KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212) 180 43.5 0.00021 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 169 41.4 0.00069 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 148 37.7 0.0095 >>KIAA1228 ( 843 res) fh05620s1 (843 aa) initn: 2166 init1: 709 opt: 1989 Z-score: 1899.8 bits: 362.9 E(): 1.1e-100 Smith-Waterman score: 2025; 37.058% identity (59.870% similar) in 1074 aa overlap (2-1066:19-835) 10 20 30 KIAA07 AGPGAAGEALAV-----LTSFGRRLLVLIPVYLAGAVGLSVGF :: : .:.: :....: . .:.::: : .::: .. KIAA12 AGLSRPGSARAPSPPRPGGPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSW 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 KIAA07 VLFGLALYLGW-RRVRDEKERSLRAARQLLDDEEQLTAKTLYMSHRELPAWVSFPDVEKA ::..::: :.: :: : : : : ::.:::... : . .::::: :::.:.: KIAA12 VLLALAL-LAWCRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVV--RLGVRACDLPAWVHFPDTERA 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 KIAA07 EWLNKIVAQVWPFLGQYMEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRIIGVKVH ::::: : ..:::. :..:::. ::. :::::.: ::.::.::.:..:..:::: ::::. KIAA12 EWLNKTVKHMWPFICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVY 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 KIAA07 PGQ-RKEQILLDLNISYVGDVQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPFVG . :.::.:::.::.::. .::.:.:.:::.::::..:.::..::::::::::.:.:: KIAA12 TENVDKRQIILDLQISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 KIAA07 AVSMFFIRRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLQD :.:.::.:.: :.:::::.:::::.:::..::::.:.: :. .::::::. :::: ..: KIAA12 ALSIFFLRKPLLEINWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQ- 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 KIAA07 VAQLRSPLPRGIIRIHLLAARGLSSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRLGTQTFCSRVIDEEL .:::: :.:.:..:::.. :. :..:: :.:::..::::::...:.:.: : :::: :.: KIAA12 IAQLRFPVPKGVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENL 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 KIAA07 NPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMKLDVGKVLQASVLDDWFPL-QG .:.:.:.::..:.: ::::.:.:.::.::::::::: . .:. .: . .::.:: : . KIAA12 SPKWNEVYEALVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEV 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 KIAA07 GQGQVHLRLEWLSLLSDAEKLEQVL-QWNWGVSSRPDPPSAAILVVYLDRAQDLPMVTSE .:..:::::::.:. .: .:..:: . . .. : :.:.:..::: :..:: KIAA12 PKGKLHLRLEWLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLP----- 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 KIAA07 LYPPQLKKGNKEPNPMVQLSIQDVTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQVK . :: ...:::.::.:. .:::: :.:: ::::: : ::...:. :.:.:.:. KIAA12 ----SGKKISSNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVR 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 KIAA07 DDSRALTLGALTLPLARLLTAPELILDQWFQLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLDSSEICFP :... .:: : .::..:::. .. ..: ::::.::::: . ::...:.:.:.. : KIAA12 DEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRE---- 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 KIAA07 TVPGCPGAWDVDSENPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFL :: :: : . .: : KIAA12 --------------------------RP----PDHQH-SAQVKR---------------- 590 640 650 660 670 680 690 KIAA07 GGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFDKDLD : :. . :..::. .. :: KIAA12 ---------PSVSKEGRKTSIKSHM-----------------SGSPGP------------ 600 610 700 710 720 730 740 750 KIAA07 KDDFLGRCKVRLTTVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNSL : .. .: . .: : :. .:: : KIAA12 -----GGSNTAPSTPVIGG--------SDKPG------------------MEEKAQ---- 620 630 640 760 770 780 790 800 810 KIAA07 IQTQKSAELAAALLSIYMERAEDLPLRKGTKHLSPYATLTVGDSSHKTKTISQTSAPVWD : . : : . .: :: KIAA12 ------------------------PPEAG-----PQGLHDLGRSS--------------- 650 820 830 840 850 860 870 KIAA07 ESASFLIRKPHTESLELQVRGEGTGVLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLSSGQGQVLL .:.: : ..:. .. ...::: .: : KIAA12 --SSLLASPGH-----ISVKEPTPSIASDISLP-----IATQ------------------ 660 670 680 880 890 900 910 920 930 KIAA07 RAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELSGGPPHITSSAPELRQRLTHVDSPLE :::::: .... KIAA12 ----------------------------------------------ELRQRLRQLENGTT 690 700 940 950 960 970 980 990 KIAA07 APAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHGCRSLRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNRGTKRRT .::::..::. . :.. ::. .::.::.: ..: :::: . ::::: :. .:.: KIAA12 LGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRRSGRRKT 710 720 730 740 750 760 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA07 SQKKRTLSPEFNERFEWELPLDEAQRRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDLAETDLS .:.::.: :.. :.. . : :.::: :::.::....:.:... ::::: . :: .:. KIAA12 HVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRRTLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEELA 770 780 790 800 810 820 1060 1070 KIAA07 QGVARWYDLMDNKDKGSS .: ..:::: .. KIAA12 KGWTQWYDLTEDGTRPQAMT 830 840 >>KIAA0751 ( 1200 res) hk04424 (1200 aa) initn: 150 init1: 124 opt: 253 Z-score: 240.5 bits: 56.4 E(): 2.8e-08 Smith-Waterman score: 253; 29.744% identity (60.000% similar) in 195 aa overlap (877-1063:536-719) 850 860 870 880 890 900 KIAA07 PLSELLVADQLCLDRWFTLSSGQGQVLLRAQLGILVSQHSG----VEAHSHSYSHSSSSL :. ..::. : . .:. .:::: KIAA07 DEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSS 510 520 530 540 550 560 910 920 930 940 950 960 KIAA07 SEEPELSGGPPHITSSAPELRQRLTHVDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHG : ... : :. ..: : : . : ::... ::. . ..:. . : KIAA07 FESQKMDR--PSISVTSPMSPGMLRDVPQFLS------GQLSIKLWFDKVGHQLIVTILG 570 580 590 600 610 970 980 990 1000 1010 KIAA07 CRSL--RQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNRGTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLD--EA ..: :..:: : .:::.. .:::.. .::::. :.:: :..:. : . :. : KIAA07 AKDLPSREDGR-PRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYS-PVHRREF 620 630 640 650 660 670 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA07 QRRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDLAETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS ..: :.... ... .: :.::.. ..: :: : . .:: : KIAA07 RERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIEL-ETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSP 680 690 700 710 720 730 KIAA07 YMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPEQV 740 750 760 770 780 790 >>KIAA0340 ( 1053 res) hg01396 (1053 aa) initn: 182 init1: 121 opt: 243 Z-score: 231.6 bits: 54.5 E(): 8.7e-08 Smith-Waterman score: 243; 30.693% identity (58.416% similar) in 202 aa overlap (877-1071:698-888) 850 860 870 880 890 900 KIAA07 PLSELLVADQLCLDRWFTLSSGQGQVLLRAQLGILVSQHSG----VEAHSHSYSHSSSSL :. :.::. : . :: .:::: KIAA03 DEVLEWNGKPLPGATNEEVYNIILESKSEPQVEIIVSRPIGDIPRIPESSHPPLESSSSS 670 680 690 700 710 720 910 920 930 940 950 960 KIAA07 SEEPELSGGPPHITSSAPELRQRLTHVDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHG : .. : :. .: : :.: : ::... ::: . ..:. : KIAA03 FESQKMER--PSISVISPTSPGALK--DAPQVLP----GQLSVKLWYDKVGHQLIVNVLQ 730 740 750 760 770 970 980 990 1000 1010 KIAA07 CRSL--RQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNRGTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEW-ELPLDEAQ .: : .:: : .:::.. .:::.. .::::. :. : :..:. : . .. . . KIAA03 ATDLPARVDGR-PRNPYVKMYFLPDRSDKSKRRTKTVKKILEPKWNQTFVYSHVHRRDFR 780 790 800 810 820 830 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA07 RRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDLAETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS .: :...: .. . .: :.::.. ..: :: : . .:: :. ..:..: KIAA03 ERMLEITVWDQPRVQEEESEFLGEILIEL-ETALLDDEPHWYKLQ-THDESSLPLPQPSP 840 850 860 870 880 890 KIAA03 FMPRRHIHGESSSKKLQRSQRISDSDISDYEVDDGIGVVPPVGYRSSARESKSTTLTVPE 900 910 920 930 940 950 >>KIAA0985 ( 697 res) hj08038 (697 aa) initn: 288 init1: 162 opt: 224 Z-score: 215.6 bits: 51.0 E(): 6.9e-07 Smith-Waterman score: 224; 29.545% identity (65.152% similar) in 132 aa overlap (941-1069:555-680) 920 930 940 950 960 KIAA07 GPPHITSSAPELRQRLTHVDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHGC---RSLR :.. ..: : ... :. . : .. KIAA09 MKRAGTTGSARGMALYEEEQVERVGDIEERGKILVSLMYSTQQGGLIVGIIRCVHLAAMD 530 540 550 560 570 580 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA07 QNGRDPPDPYVSLLLLPDKNRGTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLDEAQRRKLDVSV :: . ::.:.: : :: .. .:..:. ::.::.:::::.: ... .. ...::.:: KIAA09 ANGYS--DPFVKLWLKPDMGKKAKHKTQIKKKTLNPEFNEEFFYDIKHSDLAKKSLDISV 590 600 610 620 630 640 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA07 KSNSSFMSRERELLGKVQLDLAETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS . . ... . .: :: .. .. . .::. . :::: KIAA09 WDYD--IGKSNDYIGGCQLGISAK--GERLKHWYECLKNKDKKIERWHQLQNENHVSSD 650 660 670 680 690 >>KIAA0538 ( 816 res) hg03944(revised) (816 aa) initn: 262 init1: 146 opt: 220 Z-score: 210.9 bits: 50.4 E(): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 250; 25.000% identity (48.718% similar) in 312 aa overlap (424-730:5-257) 400 410 420 430 440 450 KIAA07 QGGQGQVHLRLEWLSLLSDAEKLEQVLQWNWGVSSRPDPPSAAILVVYLDRAQDLPMVTS : :: :: : .:. .: . KIAA05 DPGVWLPPSR-DPAMAKRSSLYIR------IVEG 10 20 460 470 480 490 500 510 KIAA07 ELYPPQLKKGNKEPNPMVQLSIQDVTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQV . : . :...: .:... . . . . .:..: :: : : .. : : . . : KIAA05 KNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIR-TATVWKTLCPFWGEEYQVHLP-PTFHAVAFYV 30 40 50 60 70 80 520 530 540 550 560 570 KIAA07 KDD---SRALTLGALTLPLARLLTAPELILDQWFQLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLDSSE :. :: ..: . : . . :. .. : .:. :. .. .. .:. : KIAA05 MDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKG-FSGWAHLTEVDPDEEVQGEIHLRL------E 90 100 110 120 130 580 590 600 610 620 630 KIAA07 ICFPTVPGCPGAWDVDSENPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAK . ::: : :. :: ::::.:: : KIAA05 VW-------PGA------------------RACR------------LRCSVLEARDLAPK 140 150 160 640 650 660 670 680 690 KIAA07 DRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFD :: .: :::.:... ::. .. .:... :::::.:: . . : ::..: KIAA05 DR------NGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRWNETFEFELQEGAMEALCVEAWD 170 180 190 200 210 700 710 720 730 740 KIAA07 KDL-DKDDFLGRCKVRLTTVLNSGFLDEWLTLE-DVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEV :: ...::::. . . . . :. :. : ..: : KIAA05 WDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLGSLQLEVRLRDET 220 230 240 250 260 270 750 760 770 780 790 800 KIAA07 LQVNSLIQTQKSAELAAALLSIYMERAEDLPLRKGTKHLSPYATLTVGDSSHKTKTISQT KIAA05 VLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKD 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1597 ( 913 res) fj09819 (913 aa) initn: 219 init1: 129 opt: 195 Z-score: 186.5 bits: 46.0 E(): 2.8e-05 Smith-Waterman score: 195; 29.688% identity (61.719% similar) in 128 aa overlap (941-1063:609-734) 920 930 940 950 960 970 KIAA07 GPPHITSSAPELRQRLTHVDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHGCRSLRQNG :...... : ..: .: :..: KIAA15 SKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAAD 580 590 600 610 620 630 980 990 1000 1010 1020 KIAA07 --RDPPDPYVSLLLLPDKNRGTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLDEAQRRKLDVSVK .. ::::. :::::.. :..: :.::.: .:: ..... . . .::..:. KIAA15 VKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIW 640 650 660 670 680 690 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA07 SNSSFMSRERELLGKVQLDLAETDLSQGVA---RWYDLMDNKDKGSS ..: .. .::.:.::: : .. ::: : KIAA15 HRDTF--KRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQ 700 710 720 730 740 750 KIAA15 YVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLRGSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGK 760 770 780 790 800 810 >>KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676 aa) initn: 184 init1: 138 opt: 194 Z-score: 182.5 bits: 46.1 E(): 4.7e-05 Smith-Waterman score: 214; 27.097% identity (63.871% similar) in 155 aa overlap (585-734:1526-1666) 560 570 580 590 600 610 KIAA07 LYMKLVMRILYLDSSEICFPTVPGCPGAWDVDSENPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTE .:.:. :: .. .: .. : .: KIAA12 HIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQA-----RSQKTSGIGR- 1500 1510 1520 1530 1540 620 630 640 650 660 670 KIAA07 HVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEV : .::.:: .: : .:::.:: .......:. ...... :::.:: . KIAA12 --LMVHVIEATELKACKP------NGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQF 1550 1560 1570 1580 1590 1600 680 690 700 710 720 KIAA07 IVTSVPGQELEVEVFDKD-LDKDDFLGRCKVRLTTVL----NSGFLDEWLTLEDVPSGRL .. .. . : . .::.: .. :::::: .. .. . ..: . . : :..::.:.. KIAA12 FIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEV 1610 1620 1630 1640 1650 1660 730 740 750 760 770 780 KIAA07 HLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNSLIQTQKSAELAAALLSIYMERAEDLPLRKGTKHLSP .:.. KIAA12 WVRFDLQLFEQKTLL 1670 >>KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212 aa) initn: 199 init1: 65 opt: 180 Z-score: 170.8 bits: 43.5 E(): 0.00021 Smith-Waterman score: 188; 26.425% identity (56.477% similar) in 193 aa overlap (577-741:942-1127) 550 560 570 580 590 600 KIAA07 SSSGPNSRLYMKLVMRILYLDSSEICFPTVPGCPGAWDVD-----SENPQRGSSVDAPPR :: ::. .:. : .: :..: . : KIAA05 QSPLVLSSVVEKGSHVHSGPTSAGSSSVPSPGQPGSPSVSKKKHGSSKPTDGTKVVSHPI 920 930 940 950 960 970 610 620 630 640 650 KIAA07 PCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKL-AGRS------ . . .. ... ::.:.:..:. .: .: :::.::. : ::. KIAA05 TGEIQLQINYDLGNLI-IHILQARNLVPRDN------NGYSDPFVKVYLLPGRGQVMVVQ 980 990 1000 1010 1020 660 670 680 690 700 KIAA07 -------FRSHVVREDLNPRWNE--VFEVI-VTSVPGQELEVEVFDKD-LDKDDFLGRCK :.. :...:::.::. ... : . .. . ::: :.: : ....::::. KIAA05 NASAEYKRRTKHVQKSLNPEWNQTVIYKSISMEQLKKKTLEVTVWDYDRFSSNDFLGEVL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 710 720 730 740 750 KIAA07 VRLTTVLNSGFLDEWLTL----EDVPSGRLHL-RLERLTPRPTAAELEEVLQVNSLIQTQ . :... . .: : :.. :. : . . .:.:. KIAA05 IDLSSTSHLDNTPRWYPLKEQTESIDHGKSHSSQSSQQSPKPSVIKSRSHGIFPDPSKDM 1090 1100 1110 1120 1130 1140 760 770 780 790 800 810 KIAA07 KSAELAAALLSIYMERAEDLPLRKGTKHLSPYATLTVGDSSHKTKTISQTSAPVWDESAS KIAA05 QVPTIEKSHSSPGSSKSSSEGHLRSHGPSRSQSKTSVTQTHLEDAGAAIAAAEAAVQQLR 1150 1160 1170 1180 1190 1200 >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 129 init1: 91 opt: 169 Z-score: 161.6 bits: 41.4 E(): 0.00069 Smith-Waterman score: 181; 24.339% identity (48.942% similar) in 378 aa overlap (288-614:47-413) 260 270 280 290 300 310 KIAA07 AFLVLPNRLLVPLVPDLQDVAQLRSPLPRGIIRIHLLAARGLSSKDKYVKGLIEGKSDPY :.:....:. ::..:: : : :::: KIAA00 RARPVCWKRSEMATCAVEVFGLLEDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKD------ILGASDPY 20 30 40 50 60 70 320 330 340 350 360 KIAA07 ALVRL-----GTQTFC-SRVIDEELNPQWGETYEVMVHEVPGQE-IEVEVFDKDP-DKDD . : : :. : ...: . :::.:.: :: : :. . ::::.. .:: KIAA00 VRVTLYDPMNGVLTSVQTKTIKKSLNPKWNEEILFRVH--PQQHRLLFEVFDENRLTRDD 80 90 100 110 120 370 380 390 400 410 KIAA07 FLGRM------------KLDVGKVLQASVLDDWFPLQGGQGQVHLRLEWLSLLSDAE--K :::.. .:. ... :: . .: ..:.. .: : .: . KIAA00 FLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDN 130 140 150 160 170 180 420 430 440 450 460 KIAA07 LEQV--LQWNWGVSSRPDP---------PSAAILVVYLDRAQDLPMVTSELYPPQLKKGN ::. :. .: : ..:: :: : .. ::. : . . . KIAA00 AEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQQEPSP--LPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQW 190 200 210 220 230 240 470 480 490 500 510 520 KIAA07 KEPNPMVQLSIQD---VTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQVKDDSRALT :.:.:. .:. . . ... ...: . ::. :. .:.. .. .:.. . KIAA00 KRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQRAFTTRRQISEETESVDNQE-SSENWEIIREDEATMYS 250 260 270 280 290 300 530 540 550 560 KIAA07 LGALTLP-----------LARLLTAPELILDQWF---QLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLD :. : ::. :.: :. . :::. .:: .. . KIAA00 SQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELNARLTIFGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQP 310 320 330 340 350 360 570 580 590 600 610 620 KIAA07 SSEICFPTVPGCPGAWDVDSENPQRGSSVDAPPRPCH-TTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQD . . .:: : : .:. ... :. :: : : : : .: KIAA00 TLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAG 370 380 390 400 410 420 630 640 650 660 670 680 KIAA07 LIAKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEV KIAA00 PQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPA 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0439 ( 995 res) hj00462 (995 aa) initn: 122 init1: 89 opt: 148 Z-score: 141.2 bits: 37.7 E(): 0.0095 Smith-Waterman score: 148; 37.975% identity (65.823% similar) in 79 aa overlap (637-707:76-153) 610 620 630 640 650 KIAA07 PDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKL----AGRSF---RSHV .. : ::::::.: .: . .... KIAA04 FSSPPLLLLGETDHLHLDLPLSPLPTSDELFLPGICDPYVKLSLYVADENRELALVQTKT 50 60 70 80 90 100 660 670 680 690 700 710 KIAA07 VREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFDKD-LDKDDFLGRCKVRLTTVLNSGFLDEW ... :::.::: : :. ...: ::::.. : .:::::. : :. KIAA04 IKKTLNPKWNEEFYFRVNP-SNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSHLPTEDPTMER 110 120 130 140 150 160 720 730 740 750 760 770 KIAA07 LTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNSLIQTQKSAELAAALLSIYMERAEDL KIAA04 PYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSAS 170 180 190 200 210 220 1072 residues in 1 query sequences 1986433 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:14:27 2008 done: Thu Dec 18 15:14:28 2008 Total Scan time: 0.710 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]