# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04532.fasta.huge -Q ../query/KIAA0755.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0755, 1093 aa vs ./tmplib.23663 library 1986412 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4097+/-0.00721; mu= -28.3156+/- 0.474 mean_var=795.9581+/-192.692, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.045460 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 3887 271.2 5.6e-73 >>KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102 aa) initn: 3844 init1: 3668 opt: 3887 Z-score: 1402.0 bits: 271.2 E(): 5.6e-73 Smith-Waterman score: 3988; 56.538% identity (79.492% similar) in 1063 aa overlap (73-1093:52-1102) 50 60 70 80 90 100 KIAA07 AGAGTDFFCRIILWNDIFIMSQQGYVATPPYSQPQPGIGLSPPHYGHYGDPSHTASPTGM :. : :: .::. . :: : :.. 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