# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04668s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0762.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0762, 724 aa vs ./tmplib.23663 library 1986781 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3779+/-0.00548; mu= 19.7066+/- 0.374 mean_var=97.9954+/-22.492, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.129560 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 360 78.5 5.1e-15 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 337 74.0 8.2e-14 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 329 72.7 2.9e-13 KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502) 289 65.2 5.1e-11 KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 255 58.7 3.7e-09 KIAA1679 ( 1536 res) fh22954 (1536) 252 58.3 6.2e-09 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 244 56.7 1.6e-08 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 236 55.1 3.9e-08 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 236 55.2 4.3e-08 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 181 44.8 4.7e-05 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 147 38.3 0.0036 KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 145 38.1 0.0051 >>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa) initn: 336 init1: 183 opt: 360 Z-score: 361.5 bits: 78.5 E(): 5.1e-15 Smith-Waterman score: 459; 26.434% identity (51.122% similar) in 401 aa overlap (354-724:715-1081) 330 340 350 360 370 380 KIAA07 RIARKGEQCNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSPWSACSSSTCDKGKRMR .: :. ... .::.:::. : .:.: : KIAA13 DRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPWQACSKP-C-QGERKR 690 700 710 720 730 740 390 400 410 420 430 440 KIAA07 QRMLKAQLDLSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDED-GSTCTMSEW--ITWSPCSISCGMGMRS . . . : . . : : :: : :. : . .: . : :: .::.:.:. 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