# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05119.fasta.huge -Q ../query/KIAA0772.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0772, 469 aa vs ./tmplib.23663 library 1987036 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0434+/-0.00538; mu= 19.8547+/- 0.366 mean_var=96.5149+/-22.836, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 52 in 1/39 Lambda= 0.130550 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 ( 919) 786 158.7 1.5e-39 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 707 143.8 4.6e-35 KIAA1451 ( 939 res) bg00289 ( 939) 455 96.3 9e-21 KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) ( 865) 421 89.9 7.3e-19 >>KIAA0704 ( 919 res) hg02921s2 (919 aa) initn: 701 init1: 306 opt: 786 Z-score: 801.8 bits: 158.7 E(): 1.5e-39 Smith-Waterman score: 963; 38.356% identity (63.014% similar) in 438 aa overlap (24-459:522-903) 10 20 30 40 50 KIAA07 RMNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSL :::. ... .: . . : ... ...:: : KIAA07 SPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQT-LGPVLD--SGREAKSRRRTCL 500 510 520 530 540 60 70 80 90 100 110 KIAA07 PAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQP ::: : :..:.:.::.. .: .:::..::. .::::. :::. : .:. :. .:. : KIAA07 PAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIP 550 560 570 580 590 600 120 130 140 150 160 170 KIAA07 QPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG-KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPIS .::::: :::::.:: ::.. :.: :::::.:::::: :::: ::.:.::::::::::: KIAA07 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS 610 620 630 640 650 660 180 190 200 210 220 230 KIAA07 AFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVI : :.:. : :.: .. : ::::::.: : :: . : .. . :.. : :.::.. 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KIAA16 NPSKSFIEGSLLTPKGEDSEEDEDTEYFDAMEDSTSFITVITEAKEDSRKAEGSTGTSSV 430 440 450 460 470 480 30 40 50 60 70 80 KIAA07 D-TSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPA-PMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMP : .: .: . .. :. . . :.:. .: : .: ...:.:.:.:.: :::.: :: KIAA16 DWSSADNVLDGASLVPKGSSKV-KRRVRIPNKPNYS---LNLWSIMKNCIGRELSRIPMP 490 500 510 520 530 540 90 100 110 120 130 140 KIAA07 IAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNP . ::::::.:::.:: .:. .:. .: . .:.: ::::.::. .. .: .::::: KIAA16 VNFNEPLSMLQRLTEDLEYHHLLDKAVHCTSSVEQMCLVAAFSVSSYSTTVHRIAKPFNP 550 560 570 580 590 600 150 160 170 180 190 200 KIAA07 LLGETYELIR-EDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEA .::::.:: : .:.:.: . :::::::: :: : .: . . : . :: :: . 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KIAA16 KEADAYTPLWFEKRLDPLTGEMACVYKGGYWEAKEKQDWHMCPNIF 880 890 900 910 920 >>KIAA1451 ( 939 res) bg00289 (939 aa) initn: 505 init1: 249 opt: 455 Z-score: 464.8 bits: 96.3 E(): 9e-21 Smith-Waterman score: 468; 26.852% identity (55.787% similar) in 432 aa overlap (30-453:434-793) 10 20 30 40 50 KIAA07 RMNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFS ....:..:: :: . .... :: KIAA14 DTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYTEQSHEELGEAGE-ASQTETVSEENKSL------ 410 420 430 440 450 60 70 80 90 100 110 KIAA07 RSDFSVWTILKKCV-GLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLER .::.::. :..:::...: . :: :::.....:. :. .. .:. . .: : KIAA14 -----IWTLLKQVRPGMDLSKVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFR 460 470 480 490 500 510 120 130 140 150 160 170 KIAA07 MQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELI----REDLGFRFISEQVSHHPPISAF ...:. . .:. .. . ::.::.::::.. . : . .:.:::::::::::: KIAA14 LKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAF 520 530 540 550 560 570 180 190 200 210 220 230 KIAA07 HSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIG . . . : . ::: : ::.:.:. : .: : .:...: :. : : .... : KIAA14 YVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYG 580 590 600 610 620 630 240 250 260 270 280 290 KIAA07 KLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKE--LHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWT . .: :::.: ..::.. .:.:: ..:. .... :... .:. : . :.: KIAA14 TMTLELGGTVNITCQKTGYSAILEFKLKPFLGSSDCVNQISGKLK-LGKEVLATLEGHWD 640 650 660 670 680 690 300 310 320 330 340 350 KIAA07 ECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLL .. : :.:. :... KIAA14 SEVFITDK--------------------------KTDN------------------SEVF 700 360 370 380 390 400 410 KIAA07 WRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDI-RGMENGNMDLASQE : : . ... . ::...: . .:. .: . :... .. :.:: KIAA14 WN----PTPDIKQWRLIRHTVKFEE-QGDFESE------KLWQRVTRAINAKDQTEATQE 710 720 730 740 750 420 430 440 450 460 KIAA07 KERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY : ::: ::.: :.: .. ::. . : .: :: .: : KIAA14 KYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWSCKLFEL--DPLTG--EWHYKFADTRPWDPLNDMIQFE 760 770 780 790 800 810 KIAA14 KDGVIQTKVKHRTPMVSVPKMKHKPTRQQKKVAKGYSSPEPDIQDSSGSEAQSVKPSTRR 820 830 840 850 860 870 >>KIAA1534 ( 865 res) fh03661(revised) (865 aa) initn: 505 init1: 234 opt: 421 Z-score: 430.5 bits: 89.9 E(): 7.3e-19 Smith-Waterman score: 449; 28.463% identity (52.645% similar) in 397 aa overlap (65-453:357-693) 40 50 60 70 80 90 KIAA07 KTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCV-GLELSKITMPIAFNEPLSFL .::.::. :..::....: :: ::: KIAA15 TTYVEQVQEELGELGEASQVETVSEENKSLMWTLLKQLRPGMDLSRVVLPTFVLEPRSFL 330 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 150 KIAA07 QRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELI- .....:. :. :. ::. . . ::. : . .:. .. . ::.::.::::.. KIAA15 NKLSDYYYHADLLSRAAVEEDAYSRMKLVLRWYLSGFYKKPKGIKKPYNPILGETFRCCW 390 400 410 420 430 440 160 170 180 190 200 KIAA07 ---REDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTIT . : .:.::::::::.:::: . . : . ::: : .:.:.:. : : : KIAA15 FHPQTDSRTFYIAEQVSHHPPVSAFHVSNRKDGFCISGSITAKSRFYGNSLSALLDGKAT 450 460 470 480 490 500 210 220 230 240 250 260 KIAA07 LELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFG--K : .:.. : :: : : .... : . .: : : : ... . :.:: .:: KIAA15 LTFLNRAEDYTLTMPYAHCKGILYGTMTLELGGKVTIECAKNNFQAQLEFKLKPFFGGST 510 520 530 540 550 560 270 280 290 300 310 320 KIAA07 ELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGK .... :.: . ... : . :.: . . : :.: :. KIAA15 SINQISGKITS-GEEVLASLSGHWDR----------DVFIKEEGSGS------------- 570 580 590 600 330 340 350 360 370 380 KIAA07 ADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLP : :.: : . .. . . :: :.: .: .:. KIAA15 ---------------------SALFWT----PSGEVRRQRLRQHTVPLEE-QTELESE-- 610 620 630 390 400 410 420 430 440 KIAA07 PTDCRLRPDI-RGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYT :: . :.. .:.. :.::: ::: ::. ::: . :. . :. .: : KIAA15 ----RLWQHVTRAISKGDQHRATQEKFALEEAQRQRARERQESLMPWKPQLFHL--DPIT 640 650 660 670 680 450 460 KIAA07 GTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY .: : KIAA15 --QEWHYRYEDHSPWDPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVARQTTFLGSPGPRHERSGPDQR 690 700 710 720 730 740 469 residues in 1 query sequences 1987036 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:15:24 2008 done: Thu Dec 18 15:15:24 2008 Total Scan time: 0.430 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]