# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05279.fasta.nr -Q ../query/KIAA0777.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0777, 1171 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7815807 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1566+/-0.0002; mu= 10.6547+/- 0.011 mean_var=120.5075+/-23.047, 0's: 35 Z-trim: 64 B-trim: 347 in 1/67 Lambda= 0.116833 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|193786486|dbj|BAG51769.1| unnamed protein produ (1200) 8011 1362.4 0 gi|114597139|ref|XP_001164409.1| PREDICTED: sorbin (1188) 7836 1332.9 0 gi|114597125|ref|XP_001164522.1| PREDICTED: sorbin (1202) 7836 1332.9 0 gi|114597147|ref|XP_517563.2| PREDICTED: sorbin an (1171) 7833 1332.4 0 gi|109076378|ref|XP_001087352.1| PREDICTED: simila (1185) 7750 1318.4 0 gi|109076374|ref|XP_001087467.1| PREDICTED: simila (1199) 7750 1318.4 0 gi|109076382|ref|XP_001088305.1| PREDICTED: simila (1205) 7595 1292.3 0 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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: gi|114 MNTGRDSQSPDSAWRSYNDGNQETLNGDATYSSLAAKGFRNVRPNLQDKRSPTQSQIT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA07 VNGNSGGAVSPMSYYQRPFSPSAYSLPASLNSSIVMQHGTSLDSTDTYPQHAQSLDGTTS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|114 VNGNSGGAVSPMSYYQRPFSPSAYSLPASLNSSIVMQHGTSLDSTDTYPQHAQSLDGTSS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA07 SSIPLYRSSEEEKRVTVIKAPHYPGIGPVDESGIPTAIRTTVDRPKDWYKTMFKQIHMVH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 SSIPLYRSSEEEKRVTVIKAPHYPGIGPVDESGIPTAIRTTVDRPKDWYKTMFKQIHMVH 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA07 KPDDDTDMYNTPYTYNAGLYNPPYSAQSHPAAKTQTYRPLSKSHSDNSPNAFKDASSPVP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: gi|114 KPDDDTDMYNTPYTYNAGLYNPPYSAQSHPAAKTQTYRPLSKSHSDNSPNAFKDVSSPVP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 KIAA07 PPHVPPPVPPLRPRDRSSTEKHDWDPPDRKVDTRKFRSEPRSIFEYEPGKSSILQHERPA 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