# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05405s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0782.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0782, 1281 aa vs ./tmplib.23663 library 1986224 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9872+/-0.0103; mu= -5.2835+/- 0.698 mean_var=446.4273+/-106.780, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.060701 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631) 2749 256.6 2.5e-68 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 335 44.7 6.7e-05 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 333 44.6 8.2e-05 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 331 44.8 0.00013 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 310 42.5 0.00031 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 309 42.5 0.00034 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 297 41.4 0.00072 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 294 41.3 0.001 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 293 41.6 0.0015 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 279 39.8 0.0021 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 278 39.9 0.0025 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 274 39.6 0.0033 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 268 38.7 0.0033 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 270 39.1 0.0036 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 275 39.8 0.0038 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 268 39.0 0.0046 KIAA1099 ( 864 res) hk07834 ( 864) 264 38.6 0.0055 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 263 38.6 0.0067 KIAA1975 ( 597 res) aj01061 ( 597) 256 37.7 0.0071 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 258 38.2 0.0089 >>KIAA0580 ( 1631 res) hj00601s1 (1631 aa) initn: 2501 init1: 1026 opt: 2749 Z-score: 1318.6 bits: 256.6 E(): 2.5e-68 Smith-Waterman score: 2904; 41.696% identity (70.804% similar) in 1144 aa overlap (160-1279:411-1518) 130 140 150 160 170 180 KIAA07 SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR .:.::::: :::. ..:::::..: . 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KIAA05 LESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERI 1090 1100 1110 1120 1130 1140 900 910 920 930 940 950 KIAA07 SRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKA ..: .. :: :::::. :.: ::: :: :. :.::.::::.::. :::: :: . KIAA05 KKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 960 970 980 990 1000 1010 KIAA07 GRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKK :.:::::.:: .: : :...... : . :.: . . ...:::.. ::.:.:. KIAA05 VNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWK----DTQVSQAGDLLIEVYVERKE 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA07 AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP- . :.. : ::::: .:: .:. . : :. ::: : :: :::::. :.:: KIAA05 PDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQ 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA07 ILH--GLGT--DSHLVVKKHQAMEAMLLYLASR--VGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSG .:. .:. ...::::. . ... . ..: .:. :.:..:..:. : . : .. 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KIAA15 FFTDGSLDSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLR 250 260 270 280 290 300 600 610 620 630 640 KIAA07 EFSRRWCVLGDGVLSYFENERAVTPN---------GEIRASEIV---CLAVPPPDTHGFE ...: . .: :: ...: : :: .:. . ::. . . KIAA15 QWKRVYAALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRR 310 320 330 340 350 360 650 660 670 680 690 700 KIAA07 HTFEVYTEGERLYLFGLESAEQAHEWVKCI-----AKAFVPPLAED-LLARDFERLGRLP :.:.. : ::: :. .. :.. : :.. : :.. :... .. .. KIAA15 HVFRLTTADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKLNDYRKVS 370 380 390 400 410 420 710 720 730 740 750 760 KIAA07 YKAGLSLQRAQEGWFSLSGSELRAVFPEGPCEEPLQLRKLQELSIQGDSENQVLVLVERR ...: . . . .: .:.: :.. : . . :. . : : . :: KIAA15 HSSGPKADSSPKGSRGLGG--LKSEFLKQSAARGLRTQDLPAGS-KDDSAAA-------P 430 440 450 460 470 770 780 790 800 810 KIAA07 RTLYIQGERRLDFMGWLGAIQKAAA-SMGDTLSEQQLGDSD--IPVIVYRCVDYITQCGL .: . : .. . .::: ..: : : : . . .:.:: : . :: KIAA15 KTPW--G------INIIKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGL 480 490 500 510 520 820 830 840 850 860 870 KIAA07 TSEGIYRKCGQTSKTQRLLESLRQDARSVHLK-EGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTR : :::: :... .. : :.: . ...:. : : .. .:: :: :.: ::. ::: KIAA15 ESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTD 530 540 550 560 570 580 880 890 900 910 920 930 KIAA07 AQRLTWLEASEIEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHN . ..::..::: .:.. :.:. :: :.: :..:: . :. :.:. .: KIAA15 DKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRN 590 600 610 620 630 640 940 950 960 970 980 KIAA07 LAIVFGPTLFQTDGQDYKAG--------RVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIV ::.:::::: .:. ... ..:: ::.: :: :::. KIAA15 LALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFS-DEEDKGERTPVGDKEP 650 660 670 680 690 700 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA07 KMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKKAETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREK KIAA15 QAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLEI 710 720 730 >>KIAA0167 ( 844 res) ha01026 (844 aa) initn: 344 init1: 216 opt: 333 Z-score: 178.3 bits: 44.6 E(): 8.2e-05 Smith-Waterman score: 361; 30.242% identity (59.677% similar) in 248 aa overlap (317-547:519-762) 290 300 310 320 330 340 KIAA07 LYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGIGITFIDMSVGNVKEVDRRSFDLTTPYRIFSFSADSEL :.:...: . . . ... . . : : : KIAA01 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE 490 500 510 520 530 540 350 360 370 380 390 KIAA07 EKEQWLEAMQGAIAEALS---TSEVAER------------IWAAAPNRFCADCGAPQPDW :.. :..:... : .:. .:.: : : : : .:.:::::.: : KIAA01 ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 KIAA07 ASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRKVWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAAN ::.:: ..:: .:.: ::.::. .:.:::: .: : . : .. .:: ..:: : .. 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KIAA01 TRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLF--LAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL 670 680 690 700 710 720 520 530 540 550 560 KIAA07 LLGCG--AGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEFLRNNRTTEVPRLDSMKPLEKHYS ::. . . .. ::. .:: :: . .... ..: KIAA01 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR 730 740 750 760 770 780 570 580 590 600 610 620 KIAA07 VVLPTVSHSGFLYKTASAGKLLQDRRAREEFSRRWCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRA KIAA01 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV 790 800 810 820 830 840 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 323 init1: 168 opt: 331 Z-score: 174.6 bits: 44.8 E(): 0.00013 Smith-Waterman score: 331; 36.184% identity (68.421% similar) in 152 aa overlap (798-949:1258-1408) 770 780 790 800 810 820 KIAA07 ERRLDFMGWLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCG .. ::... ::..:: ::..::::: : KIAA17 KPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSG 1230 1240 1250 1260 1270 1280 830 840 850 860 870 880 KIAA07 QTSKTQRLLESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASE . :. . : ... :: ... : : . :. :..:.: :. .::: : ... .:: . KIAA17 NKSEMESLQRQFDQD-HNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHK 1290 1300 1310 1320 1330 1340 890 900 910 920 930 940 KIAA07 IEDEEEKVSRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQ :.:.:.:. .:.: ..: :. . : .:::: :. . .: :. .::.: : :::.. KIAA17 INDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMR 1350 1360 1370 1380 1390 1400 950 960 970 980 990 1000 KIAA07 TDGQDYKAGRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFIC : KIAA17 PDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTP 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>KIAA0621 ( 753 res) hg04539 (753 aa) initn: 202 init1: 202 opt: 310 Z-score: 167.9 bits: 42.5 E(): 0.00031 Smith-Waterman score: 310; 29.258% identity (61.135% similar) in 229 aa overlap (757-976:280-504) 730 740 750 760 770 780 KIAA07 PEGPCEEPLQLRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMGWLGAI---QKA :.: .. .:. . : :. :. . . 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