# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05410.fasta.huge -Q ../query/KIAA0784.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0784, 1073 aa vs ./tmplib.23663 library 1986432 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2124+/-0.00707; mu= 15.3086+/- 0.479 mean_var=190.2383+/-46.649, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 135 in 1/39 Lambda= 0.092988 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0863 ( 1181 res) hk06535 (1181) 370 62.8 3.2e-10 >>KIAA0863 ( 1181 res) hk06535 (1181 aa) initn: 1084 init1: 351 opt: 370 Z-score: 275.3 bits: 62.8 E(): 3.2e-10 Smith-Waterman score: 1000; 26.264% identity (49.335% similar) in 1127 aa overlap (2-814:81-1180) 10 20 30 KIAA07 YCKEHIEDFKQFEPNDFYLKNTTWEDVGLWD ::: ..:.: :.:.. :..::.: ::.::. 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KIAA08 LMYHILTSDIHRDLENKLRSVISEHIKRTGLLKQTHIAPKPAAHLAAPANGSAPSAPAQP 280 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 KIAA07 PLMLIA-PKPQDKKSMGLPPRIGSLASGNVRSLP----SQQMV----------NRLSI-- : . .: :. . . . : : ... : :.. : ...:. : :.. KIAA08 PCFHLALPQNSPSPAAGQPVTVAQGAPGSLTHSPPAAGQSHMTLVSSPLPVGQNSLTLQP 340 350 360 370 380 390 290 300 310 320 KIAA07 --PKPNLNSTGVNMMSSVH-----LQQNNYGV-KSVGQGY-SVGQSMRLGL-------G- :.: . : :: . .::. :.: : :::: . ..:..: :. : KIAA08 PAPQPVFLSHGVPLHQSVNPPVLPLSQPVGPVNKSVGTSVLPINQTVRPGVLPLTQPVGP 400 410 420 430 440 450 330 340 350 KIAA07 -------GNAPVS---------------------IPQQSQSVKQLLPSGNGRSYG----- : ::: .:. . :. :.:. : KIAA08 INRPVGPGVLPVSPSVTPGVLQAVSPGVLSVSRAVPSGVLPAGQMTPAGQMTPAGVIPGQ 460 470 480 490 500 510 360 370 380 KIAA07 ------LGSEQRSQ---------APARY--SLQSANASSLSSGQ-----LKSPS------ : . : : ::.: :.: .:.:: : ::. 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