# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04165mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0806.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0806, 1073 aa vs ./tmplib.23663 library 1986432 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7936+/-0.00632; mu= 25.9906+/- 0.430 mean_var=146.4208+/-35.702, 0's: 0 Z-trim: 42 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.105992 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 476 85.3 3e-17 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 384 71.1 4.7e-13 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 378 70.2 9.3e-13 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 352 66.6 1.7e-11 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 352 66.9 1.9e-11 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 338 64.7 8.7e-11 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 312 61.4 1.8e-09 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 306 59.6 2.3e-09 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 300 58.4 3.8e-09 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 292 57.0 8.2e-09 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 290 57.1 1.2e-08 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 281 55.6 3e-08 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 282 56.7 4.2e-08 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 274 54.5 6.2e-08 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 271 54.6 1.1e-07 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 271 54.7 1.1e-07 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 271 54.7 1.2e-07 KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189) 268 54.0 1.4e-07 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 264 53.1 1.9e-07 KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598) 263 53.5 2.7e-07 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 259 52.2 3e-07 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 254 51.5 5.4e-07 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 250 50.8 7.8e-07 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 244 50.6 2.1e-06 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 238 49.2 3.2e-06 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 233 48.3 4.9e-06 KIAA1061 ( 693 res) hj00491 ( 693) 232 48.0 5.2e-06 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 231 48.2 6.7e-06 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 226 46.7 8.2e-06 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 215 46.2 4.5e-05 KIAA1263 ( 850 res) hj00608 ( 850) 207 44.4 8e-05 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 200 42.9 0.00014 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 202 43.9 0.00016 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 201 43.8 0.00018 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 198 43.4 0.00025 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 189 41.3 0.00046 KIAA1556 ( 1595 res) fh18619 (1595) 188 42.0 0.00077 KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) ( 980) 177 39.9 0.002 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 175 39.5 0.0024 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 164 38.2 0.0093 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 523 init1: 162 opt: 476 Z-score: 401.6 bits: 85.3 E(): 3e-17 Smith-Waterman score: 524; 29.284% identity (57.701% similar) in 461 aa overlap (194-644:53-485) 170 180 190 200 210 220 KIAA08 ISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLP : ...:. . : :. . .: : KIAA15 FDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICV----RKNLREVPDGIST-- 30 40 50 60 70 230 240 250 260 270 280 KIAA08 HLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNL . ..:.:..:.:.:.. .:. : :. :...:: : .. ::: :: :.. ::: : : KIAA15 NTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRL 80 90 100 110 120 130 290 300 310 320 330 340 KIAA08 TRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLS-YNQLTRLDESAFVGL : . .: . : :..:.. .: :: : :.. : .:::. ..:. ..:.:: :: KIAA15 TTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGL 140 150 160 170 180 190 350 360 370 380 390 400 KIAA08 SLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQ : :. :::. . .: . . : .:. ::: .:..: ::. .: : :: : :: . 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KIAA04 HNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELF 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 350 KIAA08 YGLRMLQQLYVSQNAIERISPDA-WEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNL :::: :: :.. .:... : :. :. : :::: :.: : ...:.:: :..:.: KIAA04 YGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWD-CRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHL 170 180 190 200 210 220 360 370 380 390 400 410 KIAA08 GDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSIT :..:.: . : ::.:.:: :. :.:: . . : : .: :: : ::.::.: KIAA04 EHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKIS-NLTCGMEWTWG--TLEKLDLTGNEIKAID 230 240 250 260 270 280 420 430 440 450 460 KIAA08 KKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAF-SQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWL--V .: . .:. : ..:: . :.. . . : : . :. . :. .. : .:: KIAA04 LTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSF 290 300 310 320 330 340 470 480 490 500 510 520 KIAA08 DNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTC .. ..::. : :. :..::. KIAA04 QGRWEHSI--LCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISS 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0862 ( 584 res) hk06532 (584 aa) initn: 325 init1: 119 opt: 378 Z-score: 320.9 bits: 70.2 E(): 9.3e-13 Smith-Waterman score: 381; 27.228% identity (57.178% similar) in 404 aa overlap (52-449:141-527) 30 40 50 60 70 80 KIAA08 LGCRSRVLSRLLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPLLDCSRRKLPAPSWRALSGLL :: .: . :. . : : .: : KIAA08 KRSIHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLA---LSENSLTSLPDSL 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 KIAA08 P--PDTAILDFSHNRLSNW-NISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFGEPTSNITLLSLVHN .::. ::.: . .. . ..: . . .:..: . . :....::. .: KIAA08 DNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIREN 170 180 190 200 210 220 140 150 160 170 180 190 KIAA08 IIPEINAQALQFYPALESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNL : .. :. .. : .::.. : . .. :. :.:..:.. : . :: KIAA08 KIKQLPAEIGELC-NLITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLP-DTIGNL 230 240 250 260 270 280 200 210 220 230 240 250 KIAA08 SSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNG :: : . : ::.: :: .. : :. :.:. : :. . ...: .: :: . :: KIAA08 SS-LSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNC 290 300 310 320 330 340 260 270 280 290 300 310 KIAA08 ISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPD--AWE .. :. .... :..::: .... : . ..:..: ...: . . : .: KIAA08 FQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWT 350 360 370 380 390 400 320 330 340 350 360 370 KIAA08 FCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRN . ::.:. ::::.. :.. :: :: : :..: . .. :. : .:. :::.. KIAA08 ---SMVELNLATNQLTKIPEDV-SGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGN-LRKLRELDLEE 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 KIAA08 NEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIG-LESLEHLDLNNNAIMSIQE :.. :. . .: : .: ::.: .::. .. . :: : .: :: :..: . . : KIAA08 NKL----ESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRG--IGHLTNLTHLGLGENLLTHLPE 460 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 KIAA08 NAFSQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDL . . .:.:: :: KIAA08 EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQF 520 530 540 550 560 570 >>KIAA0644 ( 887 res) hj03618 (887 aa) initn: 388 init1: 179 opt: 352 Z-score: 298.1 bits: 66.6 E(): 1.7e-11 Smith-Waterman score: 449; 26.953% identity (54.492% similar) in 512 aa overlap (2-502:58-492) 10 20 30 KIAA08 ATSRSRGKMAPAPLGVPEEQLLGCRSRVLSR :. :.: . :: . .: . . :. : KIAA06 TKDGGGAGRRCEVRKRPFSDSGQAKGNAEETQSRRAKRTIRPLHAGREAMEAARAL---R 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 KIAA08 LLFIAQTALLLLPAAGAGLCPAPCSCRIPL-LDCSRRKLPAPSWRALSGLLPPDTAILDF ::... . : :: . .:: :.:. : : :. : : :.. : :. : KIAA06 LLLVV-CGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGL-----RVV-----PKTSSLPS 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 KIAA08 SHNRLSNWNISLESQTLQEVKMNYNELTEIPYFG-EPTSNITLLSLVHNIIPEINAQALQ :. :. ... : .:.: : . ... :.: .: : .. .... KIAA06 PHDVLT-------------YSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFE 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 KIAA08 FYPALESLDLSSNIISEIKTSSF-PRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLN :: : :..:... . ... : .:. : ..:.:. : : :..: : :. ..:. 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KIAA06 T--FGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNG----------------- 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 KIAA08 ILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNNFQH---SVNVSCAHPEWLAGQSILNVD---LKDFVC :::.:. : .:. : . : .: :.: :: : :. . .: :.. : KIAA06 ------WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSC 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 KIAA08 DDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDTENFVRYW : KIAA06 ADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARE 500 510 520 530 540 550 >>KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187 aa) initn: 295 init1: 111 opt: 352 Z-score: 297.2 bits: 66.9 E(): 1.9e-11 Smith-Waterman score: 365; 28.866% identity (56.701% similar) in 291 aa overlap (503-791:258-530) 480 490 500 510 520 530 KIAA08 HSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSS :: :. . . ::: ..: : : . 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KIAA03 IAPDDPSRKIDGDTIIF-SNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPAN 400 410 420 430 440 720 730 740 750 760 770 KIAA08 D-KTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAG : .. :.:.: ::: : ..: : . : . : : : : ...: KIAA03 TLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTG 450 460 470 480 490 500 780 790 800 810 820 830 KIAA08 KYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSL :::. : :: .....:.. KIAA03 TYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDATWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLW 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222 aa) initn: 361 init1: 174 opt: 338 Z-score: 285.6 bits: 64.7 E(): 8.7e-11 Smith-Waterman score: 361; 28.669% identity (55.973% similar) in 293 aa overlap (503-791:310-582) 480 490 500 510 520 530 KIAA08 HSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTCTAVSS :. :: . . . ::::.. : : : :. KIAA07 VLTNHPYNDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMV--LRGMDLLLECIA-SG 280 290 300 310 320 330 540 550 560 570 580 590 KIAA08 SDSPMSTVWRKDSEILYD-VDTENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVT .: . ..: ... : . ::: ..::. : ::. : :.: :... KIAA07 VPTPDIAWYKKGGDLPSDKAKFENF-------NKALRIT------NVSEEDSGEYFCLAS 340 350 360 370 380 600 610 620 630 640 650 KIAA08 NHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDF :..:: . .. :. : .: : .: . : .:: : :.:.: : ..:. .: . KIAA07 NKMGS-IRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNG-EPL 390 400 410 420 430 440 660 670 680 690 700 710 KIAA08 PAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPS-FIRPL .: . . : ..: ...: . ..:.: ..: : : ::: ..::..: .. : KIAA07 QSAPPNPNREVAGDTIIF-RDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPR 450 460 470 480 490 500 720 730 740 750 760 KIAA08 ED--KTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLED .. ... ..: :.: ::: : : : :. . .. . : : : :: KIAA07 NQLIRVILYNRTR-LDCPFFGSPIPTLRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKED 510 520 530 540 550 770 780 790 800 810 820 KIAA08 AGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGT : :::. .: :: .... :.: KIAA07 QGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTV 560 570 580 590 600 610 >>KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584 aa) initn: 275 init1: 201 opt: 312 Z-score: 261.7 bits: 61.4 E(): 1.8e-09 Smith-Waterman score: 312; 31.707% identity (55.122% similar) in 205 aa overlap (600-795:620-818) 570 580 590 600 610 620 KIAA08 TSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARL :. : : . :.: . : : . : ..: KIAA16 EREDSVRKYLLQARTAIIKSSWVKEICGIQQRLALPVWRPPDFEEELADCTAELGETVKL 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 KIAA08 ECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDD----VFFIANVKIEDMGIYSCMA : . : : : ::: ::: :.. :.. :: .... .. : : : :.: KIAA16 ACRVTGTPKPVISWYKDG----KAVQVDPHHILIEDPDGSCALILDSLTGVDSGQYMCFA 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 KIAA08 QNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLL ..::. :. ... : : :. .. . ..:: : . : :.: :.. : :: : :: KIAA16 ASAAGNCSTLGKILVQVPPRFVNKVRASPFVEGEDAQFTCTIEGAPYPQIRWYKD-GALL 710 720 730 740 750 760 750 760 770 780 790 800 KIAA08 VTERHFFAAANQ-----LLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSS .: .: . .. .:.: :. :: : : : . : ::. :. : :.:: KIAA16 TTGNKFQTLSEPRSGLLVLVIRAASKEDLGLYECELVNRLGSARASAELR-IQSPMLQAQ 770 780 790 800 810 820 810 820 830 840 850 860 KIAA08 QSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGTSLIWVIVIYHMRRKNEDYSITNTEELNLPADI KIAA16 EQCHREQLVAAVEDTTLERADQEVTSVLKRLLGPKAPGPSTGDLTGPGPCPRGAPALQET 830 840 850 860 870 880 >>KIAA1496 ( 920 res) fj09513 (920 aa) initn: 240 init1: 117 opt: 306 Z-score: 260.0 bits: 59.6 E(): 2.3e-09 Smith-Waterman score: 365; 27.609% identity (58.249% similar) in 297 aa overlap (505-795:118-391) 480 490 500 510 520 530 KIAA08 VNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTH-PETIIALRGMNVTLTCTAVSSS .:.:... :::. : .: .: : : :... 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KIAA14 LVLEERTQI--ENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPM 250 260 270 280 290 300 720 730 740 750 760 KIAA08 EDKT-VTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQL-LIIVDAGLED . . : : . :.: .:: .: : : . : :.. .. :. : :... : KIAA14 KKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGD--VSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKAD 310 320 330 340 350 360 770 780 790 800 810 820 KIAA08 AGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTTVGIVIIVVVCCVVGT :: :::. : .: : .: :.. : KIAA14 AGTYTCMAENQFGKANGTTHL-VVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDII 370 380 390 400 410 420 >>KIAA1469 ( 662 res) fj01881 (662 aa) initn: 268 init1: 136 opt: 300 Z-score: 256.1 bits: 58.4 E(): 3.8e-09 Smith-Waterman score: 350; 26.857% identity (58.857% similar) in 350 aa overlap (184-520:58-392) 160 170 180 190 200 210 KIAA08 LESLDLSSNIISEIKTSSFPRMQLKYLNLSNNR-ITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRM :.: .:.. .: .. .. : .. :. KIAA14 IGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATT--LYLQNNQINN 30 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 270 KIAA08 SMIPPKIFKLPHLQFLELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNN . :: . .: ... . : .: . . . . .. :..:.:.: . .. . KIAA14 AGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL---DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPY 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 KIAA08 MEELELEHNNLTRVN--KGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQ .:::.:. :... :. .: . .:. :..:.: . : : : . . . :: :. :. KIAA14 LEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTI-P--WGLPRTIEELRLDDNR 150 160 170 180 190 340 350 360 370 380 KIAA08 LTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTH--IADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASE .. .. .. ::. :.:: : : ... ..: :: : :: :.: : .. : . 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