# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05607.fasta.huge -Q ../query/KIAA0848.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0848, 988 aa vs ./tmplib.23663 library 1986517 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0078+/-0.0079; mu= 3.0850+/- 0.536 mean_var=230.5280+/-56.799, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 106 in 1/39 Lambda= 0.084472 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 2262 289.3 1.6e-78 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 1057 142.2 1.8e-34 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 873 119.9 1.2e-27 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 370 58.9 5.7e-09 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 305 50.6 8.1e-07 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 311 51.7 8.1e-07 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 291 48.9 2.5e-06 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 275 47.4 1.8e-05 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 269 46.3 1.8e-05 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 260 45.2 4e-05 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 239 42.4 0.00015 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 232 41.7 0.00038 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 233 42.0 0.00041 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 231 41.8 0.00056 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 211 39.0 0.0019 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 205 38.5 0.0039 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 202 38.0 0.0046 >>KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) (966 aa) initn: 2348 init1: 1044 opt: 2262 Z-score: 1501.5 bits: 289.3 E(): 1.6e-78 Smith-Waterman score: 2426; 42.157% identity (68.235% similar) in 1020 aa overlap (6-985:12-961) 10 20 30 40 50 KIAA08 EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID-- : : :.. . ::: : .:.:.:.. :. . . .: :: KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQD----LHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 KIAA08 -EPCFDPCYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHL : : . : :: :.... . :...:. ..:.:. ..: :. : . .:: : :.. KIAA09 GEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 KIAA08 NNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNV ..: ..::.:..:::.::::.::. :.::.:..:::...:.:::::::.:::::.::: KIAA09 TGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA08 IKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHI :. :: .:: .: :.::::::::. ::.:::. : ::::::::::::.: : :.:.:. KIAA09 ISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 KIAA08 GRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTEL . ..:::::::::::.::...::.::. : :.:::::..:::::..::.:: :. : :: KIAA09 DK-VVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQEL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 KIAA08 CP--LLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQ :: :.:: :.. :.. : . : :.:. .:: :.::. :: : :: :.: KIAA09 CPRRLISDYEMR-----PQTPLSTTGYLHTTPASV-NSVA-TSSSAVYKPPLKPPKGTRQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 KIAA08 PRTPR--PPSTSQALYPG-PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKER : :: : : . . : : : :::. :.:. :::.:.:::.:.::::.:::.:: KIAA09 PNKPRVRPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQER 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 KIAA08 GFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINL ...:.:: :.: : ::.::. : : . :.:: . ..::::::::::::..:: :: .: KIAA09 KIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDL 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA08 PNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNL ::. :.:::: ::.:.: .: :::::.::....:.::::: ..:. .:::.:::::::: KIAA09 TNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 KIAA08 LRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQ :...:. .:.: .: :::::.:.: :::.:::..:....::::..::::::::.: .: KIAA09 LQAMPSGVFSGLTLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKL 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 KIAA08 WIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQ---PGDSHL :.: .. .: .:.:..:..... :.:.:. :.:::.. :. . .:.. :. . KIAA09 WVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSA 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 KIAA08 IGAP-----TSASPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKK . .: ....: .. :: :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:. KIAA09 V-TPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKN 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 KIAA08 LPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGH ... ... :.....:: . .. :::::.:: . :.: :. :.:: KIAA09 QSDHTSTNNS-DVSSFNMQ-YSVY----GGGGGTGGHPHAHVHHRGPAL--PKVKTPAGH 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 KIAA08 VYEYIPHPVTQMCNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGM ::::::::. .::.::::. :: : .:. :: .. . .. : : : . KIAA09 VYEYIPHPLGHMCKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQ 760 770 780 790 800 810 800 810 820 830 840 850 KIAA08 GEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVS :. : : :...: :: . :: . :: KIAA09 QPP----PQLQLQPGE---------EERRE-----------------SHHLRSPAYS-VS 820 830 840 860 870 880 890 900 910 KIAA08 GVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLY . :: . . .. : :.. :. : : :. ::. : KIAA09 TIEPRE--DLLSPVQDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSL--PEYPK-FPCS----PAAY 850 860 870 880 890 920 930 940 950 960 970 KIAA08 GTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTK :. .:. .: . .: :.::.: .:.: .. :. . ....::::.:::... KIAA09 TFSPNY-DLR-RPHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFV--EPNRNEYLELKAKLNVE 900 910 920 930 940 950 980 KIAA08 PDYLEVLEKTTYRF ::::::::: : KIAA09 PDYLEVLEKQTTFSQF 960 >>KIAA1854 ( 572 res) fg02232 (572 aa) initn: 1928 init1: 989 opt: 1057 Z-score: 710.6 bits: 142.2 E(): 1.8e-34 Smith-Waterman score: 1939; 50.345% identity (77.414% similar) in 580 aa overlap (26-605:11-567) 10 20 30 40 50 60 KIAA08 EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCY .:.. . :.: : : :. . . : : KIAA18 HRRCLKMLSGVWFLSVLTVA-G----ILQTESRKTAKDICKIRCL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 KIAA08 CEVKESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLG :: ::....:.:..::::..: . : ..:.:. : . .:: : :.. .:::...:: KIAA18 CEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 KIAA08 NNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAF ::.::.:.::::.::: ::::.:..:::...:.::::::::::::::::: :. ::.::: KIAA18 NNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAF 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 KIAA08 RNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQL .:.::.::::::::. ::.:.:. : :::::::::::::. . :.:.::: ..::.:: KIAA18 SKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVFRFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIG-GIMEIQL 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA08 EENPWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEV :::::::::... ::.::. : :..::.:.:::::..::::. .. . .::: : : KIAA18 EENPWNCTCDLLPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSAS-- 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA08 EASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQ ..: :... . :: .. . .. .... :: ..: ::: ... KIAA18 DSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPAL--------NPTRAPKASRPPKMRNRP-TPRVTVSKD 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA08 ALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLN : :: :::. :.:. ::..:.:. . .: ::.:::.:: :.:::.: :.: . KIAA18 RQSFG----PIMVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTS 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA08 AKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIE :::::..: .: .:..:. ..:::::::::::::. .:.::: :: .:. :.:::: .: KIAA18 PKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLE 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA08 KLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSL : :.:: :::::.:::.:.:::.::.: .:. . ::.::::::::::.:: . :.::.: KIAA18 VLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTAL 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 KIAA08 ARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDV .:::::.:.: .::: :::..: :..::::.:::::::::.. .:.: : .: ....: KIAA18 TRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEV 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 KIAA08 LCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGG :.:: KIAA18 TCESPAKHAG 570 >>KIAA1910 ( 760 res) fh21867 (760 aa) initn: 1623 init1: 742 opt: 873 Z-score: 588.0 bits: 119.9 E(): 1.2e-27 Smith-Waterman score: 1690; 38.850% identity (72.230% similar) in 713 aa overlap (18-724:59-740) 10 20 30 40 KIAA08 EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIED :.: .:::.:: : .: ... KIAA19 LASDIGALNELELCLWRAGWSLLLCDEIGDELLALKMLLWILLLET-SLCFAA------- 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 KIAA08 SEEIDEPCFDP-CYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTN .. . : . : :. :. .:. :..::::.....: :. ..:.:. ::. .:. : KIAA19 GNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPN 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 KIAA08 SFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQ : .. ::::... ::.:..: ::: ::...:::....::. ::..:::::..::::: KIAA19 EFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQ 150 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 KIAA08 ADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRG ::.:... :. :::..:.::.::::::::: ::.:.:. : .:::::::::::.: :. KIAA19 ADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEE 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 KIAA08 MLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREI .:..: .. :. ::.:::.:::....:: ::: :: .::.: ..::.: ...:::: : KIAA19 VLEQIP-GIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGKDLNET 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 KIAA08 RKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKP . .:::: ..:..:: : ..:... : : . : .. .. . .. :. KIAA19 TEQDLCPL--KNRVDSSLPAP---PAQEETFAPGP---LPTPFKTNGQEDHATPGSAPNG 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 KIAA08 -TKQP---RTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVN :: : . :... : . :.: .: .: :: ::.:. :: :: .: KIAA19 GTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKP-LAN-----SLP--CPGGCSCD-HIPGSGLKMN 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 KIAA08 CKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGA :..:. .....: :. :...:.: .: :..: .: : ....: :: :::: :. :.... KIAA19 CNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATVENNT 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 KIAA08 FINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFL : :: .:. :....: .. :. : :::.:.:: :.:.:. : :..:. ::.:..:.: KIAA19 FKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILIL 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 KIAA08 NNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLV ::::::.::.:.:::.::..:.:..:::.::::::::..:..:.::::. :::.:.: .: KIAA19 NNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECSCTIV 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 KIAA08 PFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEML-HVAPAGESPAQPGDS ::::: : ..: ...:. :..: :. ..: . . .::.. ...:. : .. ... KIAA19 PFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHSK-NST 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 KIAA08 HLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRS : . : .. : . : .:::. .::..: ...:...:.....:: : :. :. KIAA19 GLAETGTHSNSYL---DTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNR-KRSKRRD 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 KIAA08 KRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQM . . .....: : . .: KIAA19 ANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD 720 730 740 750 760 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 377 init1: 211 opt: 370 Z-score: 252.9 bits: 58.9 E(): 5.7e-09 Smith-Waterman score: 463; 25.303% identity (50.433% similar) in 577 aa overlap (55-624:70-543) 30 40 50 60 70 80 KIAA08 MLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQIT : : : : . : . :. . . KIAA08 GWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTKCTC----SAASVDCHGLGLRAVPRGI 40 50 60 70 80 90 90 100 110 120 130 140 KIAA08 EFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLH .. .: :.::.. .. .: :.: ..: .: .. :. :::. :: :.:: :. KIAA08 PRNAE--RLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLN 100 110 120 130 140 150 150 160 170 180 190 200 KIAA08 ENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLF .:::.:. . : . .: :. . : :. : :::... .. : :..: : . . : KIAA08 KNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAF 160 170 180 190 200 210 210 220 230 240 250 260 KIAA08 KAV-SLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPY .:. .: : : .: .. .. . ..:. . . :.:. : : :... :..::.. KIAA08 RALRDLEILTLNNNNISRILVTS-FNHMPK-IRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQ--- 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 KIAA08 TALVGDIT-CETPFHFHGKDLREIRKTE-LCPLLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKP ::..: : .: :..: .. ...: : .:: ::: KIAA08 RRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCP------------APHS------------ 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 KIAA08 SSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIP .::: . KIAA08 --------------------------------EPPSCNAN-------------------S 310 390 400 410 420 430 440 KIAA08 IICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWN : ::. :::. .: :.:. .:. .: ::. . .. : .: :. : . : . KIAA08 ISCPSPCTCSNNI------VDCRGKGLMEIPANLPEGI--VEIRLEQNSIKAIPAGAFTQ 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 KIAA08 FSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFN ...: . ...:.:: . :: .: .: :: : :: : ... :.: :: ::. : .. : KIAA08 YKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNAN 370 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 KIAA08 VIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLE : .. .:. . ::.:: : .: :.:. :: :. :.: .: :. KIAA08 KINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPFV------CDC 430 440 450 460 470 570 580 590 600 610 KIAA08 HLNAIVQIDLNENPWDCT---CDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIE ::. ... :..:: . . :. : . . ::... : . :. : KIAA08 HLKWLADY-LQDNPIETSGARCS-SPRRLANKRISQIKS-KKFRCSGSEDYRSRFSSECF 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 KIAA08 LEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFS ....::: KIAA08 MDLVCPEKCRCEGTIVDCSNQKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLR 540 550 560 570 580 590 >>KIAA0405 ( 706 res) hg01274 (706 aa) initn: 269 init1: 209 opt: 305 Z-score: 214.3 bits: 50.6 E(): 8.1e-07 Smith-Waterman score: 315; 27.857% identity (58.571% similar) in 280 aa overlap (392-663:184-435) 370 380 390 400 410 420 KIAA08 LYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGL-TVNCKERGFNNISELLPRPLN ::..: .. ::. .. .: . .. KIAA04 PKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFR-------EAIS 160 170 180 190 200 430 440 450 460 470 480 KIAA08 AKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIE : :.::.: .... .:. :.. .:::. ..: :: :: .:. :...:: . KIAA04 LKLLFLSKNHLSSV---PVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLT 210 220 230 240 250 260 490 500 510 520 530 KIAA08 K--LTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKL--LFLNNNLLRTLPTDAFA . .. : : : .:. ::...:. .:. .: :.:..: . .: ::. KIAA04 NKGIAEGTFSHLTKLK----EFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFS 270 280 290 300 310 540 550 560 570 580 590 KIAA08 GT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETI-SSV . .: ::.. .: : . . ::...:. . :. .::: : :.. .:.. : ::. KIAA04 NLRKLERLDISNNQ-LRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSL 320 330 340 350 360 370 600 610 620 630 640 650 KIAA08 SVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVL-CPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPY .: : .:..::.. :: .....: :: . :: . ::..::: KIAA04 NVRG-FMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPT-----------TTPGLPLFTPAPSTASPT 380 390 400 410 420 660 670 680 690 700 710 KIAA08 EFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQ .:: .: KIAA04 T-QPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQV 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 576 init1: 248 opt: 311 Z-score: 214.2 bits: 51.7 E(): 8.1e-07 Smith-Waterman score: 318; 26.347% identity (52.096% similar) in 334 aa overlap (338-663:7-292) 310 320 330 340 350 360 KIAA08 HSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTS--QALYPG ..:.. :. . . : :. :: KIAA02 SRPWWLRASERPSAPSAMAKRSRGPGRRCLLALVLF 10 20 30 370 380 390 400 410 420 KIAA08 PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLY .: .: ::. : : . :: : . .. . . :. .. : KIAA02 CAWGTLAVVAQKPGAG--CPSRCLC------FRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQ---TSILD 40 50 60 70 80 430 440 450 460 470 480 KIAA08 LSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPG : : :..: . : . .:. : :.::.:. . .::: .: ::: :.: :.:... KIAA02 LRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQ 90 100 110 120 130 140 490 500 510 520 530 540 KIAA08 MFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNL :.:: ::. ::..:: :. ..: .:. .:.:. :::.:: . : KIAA02 AFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHL--------------- 150 160 170 180 190 550 560 570 580 590 600 KIAA08 RKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS-SVSVVGDVLCRS : :...::... .. :. : : :... . . ..: . : .. . ..:. KIAA02 ---------VPGTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEY 200 210 220 230 240 610 620 630 640 650 KIAA08 PENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESP---AQPGDSHLIGAPTSASPYEFS--PPG :. . :.: :: :: :. : : ..: :. . ::.. :. : KIAA02 PRRIQGRSVATIT-----PEELNC----ERPRITSEPQDADV----TSGNTVYFTCRAEG 250 260 270 280 660 670 680 690 700 710 KIAA08 GPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRL .: : KIAA02 NPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEV 290 300 310 320 330 340 >>KIAA1469 ( 662 res) fj01881 (662 aa) initn: 320 init1: 171 opt: 291 Z-score: 205.4 bits: 48.9 E(): 2.5e-06 Smith-Waterman score: 300; 25.484% identity (58.387% similar) in 310 aa overlap (356-652:116-402) 330 340 350 360 370 380 KIAA08 SSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICP :. . :. :. :.. :: . KIAA14 AGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLE- 90 100 110 120 130 140 390 400 410 420 430 440 KIAA08 TGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFS-S .::..: .... :.: :. : . :.:: : .. : :.. . KIAA14 -----ELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYL------RLLFLSRNHLSTIP----WGLPRT 150 160 170 180 450 460 470 480 490 500 KIAA08 LDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEK--LTPGMFRGLQSLHYLYFEFNV .. :.: .:::: ... .. .: .:: : :.:: ... : .: .: .: :... KIAA14 IEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLT----ELSL 190 200 210 220 230 240 510 520 530 540 550 KIAA08 IREIQPAAFSLMP--NLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVL .:. :: .: ::. :.:..: . .: .::. .: ::.. .: . :: :.. KIAA14 VRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLP-QGIF 250 260 270 280 290 300 560 570 580 590 600 610 KIAA08 EHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS-SVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIEL . :. :.:. : .::: : : . ..:.... .:.: : ..:..::.. .. .. KIAA14 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRG-LMCQAPEKVRGMAIKDLNA 310 320 330 340 350 360 620 630 640 650 660 670 KIAA08 EVL-CPE-----MLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLL :.. : . .... : . . :.... ::.. .: KIAA14 ELFDCKDSGIVSTIQITTAIPNTVYPAQGQW-PAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRK 370 380 390 400 410 420 680 690 700 710 720 730 KIAA08 VLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGG KIAA14 TITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTAL 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618 aa) initn: 477 init1: 200 opt: 275 Z-score: 190.1 bits: 47.4 E(): 1.8e-05 Smith-Waterman score: 422; 24.823% identity (49.645% similar) in 564 aa overlap (55-617:118-565) 30 40 50 60 70 80 KIAA08 MLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIHCDSKGFTNISQIT : : : . . : . :. : . KIAA08 TPGWGSSAGPVRPELWLLLWAAAWRLGASACPALCTC----TGTTVDCHGTGLQAIPKNI 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 KIAA08 EFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGAFNGLKILKRLYLH .. .: :. :.. ... :.: :.. ..: .: . .. :::. .: :.:: :. KIAA08 PRNTE--RLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGVVERGAFDDMKELERLRLN 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 KIAA08 ENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLILNDNLIPMLPTNLF .:.: .. . : . ..: :. . :.:. : :::. . :. : :. : : . . : KIAA08 RNQLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAIQAIPRKAFRGATDLKNLQLDKNQISCIEEGAF 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 KIAA08 KAV-SLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEIVQLKSWLERIPY .:. .: : : .: . .. . ..:. . : ..:. : : :... :..::.. : KIAA08 RALRGLEVLTLNNNNITTIPVSS-FNHMPK-LRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPT 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA08 TALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSSSKENAWPTKPSS .: . : : ..: .. :..:.: KIAA08 IGLFTQ--CSGPASLRGLNVAEVQKSE--------------------------------- 320 330 340 330 340 350 360 370 380 KIAA08 MLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPII :. :. : .. : :. . : : KIAA08 ------FSCSG--------------QGEAGRVPTCT--LSSGS----------------- 350 360 390 400 410 420 430 440 KIAA08 CPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFS ::. :::. : :.:. .:.. : ::. .. .: : : :..: . : . KIAA08 CPAMCTCSNGI------VDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLEL--NGIKSIPPGAFSPYR 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 KIAA08 SLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVI .: . :.::.:. . :: .: .:.:: : :: : : :.: :: .:. : .. : : KIAA08 KLRRIDLSNNQIAEIAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITDLPRGVFGGLYTLQLLLLNANKI 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 KIAA08 REIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLN :.: ::. . ::.:: : .: .. :::. :.. : KIAA08 NCIRPDAFQDLQNLSLLSLYDNKIQ----------SLAK--------------GTFTSLR 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 KIAA08 AIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCP :: . : .::. : :.: . ....: . . . : . : ::. :... . :. KIAA08 AIQTLHLAQNPFICDCNLKWLADFLRT-NPIETSG-ARCASPRRLANKRIGQIKSKKFRC 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 KIAA08 EMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAA KIAA08 SAKEQYFIPGTEDYQLNSECNSDVVCPHKCRCEANVVECSSLKLTKIPERIPQSTAELRL 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1465 ( 785 res) fh13187 (785 aa) initn: 341 init1: 227 opt: 269 Z-score: 190.0 bits: 46.3 E(): 1.8e-05 Smith-Waterman score: 302; 27.090% identity (52.174% similar) in 299 aa overlap (384-670:60-329) 360 370 380 390 400 410 KIAA08 RPPSTSQALYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTC-NLHINDLGLTVNCKERGFNNIS :: :.: . . ... ..: . . .. KIAA14 FTESRRILGAAMFPLRALWLVWALLGVAGSCPEPCACVDKYAHQF---ADCAYKELREVP 30 40 50 60 70 80 420 430 440 450 460 470 KIAA08 ELLPRPLNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSL : :: :. : ::.: : . :. : . ... : :..:.. :. ::. : .::.: KIAA14 EGLP--ANVTTLSLSANKITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEVRTVEPGALAVLSQLKNL 90 100 110 120 130 140 480 490 500 510 520 530 KIAA08 FLNGNDIEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPT :. : : .. . .:.:..:. : .. : . . :.. .:.:. : .::: :::: KIAA14 DLSHNFISSFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLA- 150 160 170 180 190 200 540 550 560 570 580 590 KIAA08 DAFAGTSLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETIS : :... :.:. ...: .::. : : :: .. : . KIAA14 ---------------------P--GTFDALSALSHLQLYHNPFHCGCGLVWLQAWAASTR 210 220 230 240 600 610 620 630 640 KIAA08 -SVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVA--PAGESPAQPGDS------HL :. .. : :: : : . : .:.. : :.:. : . : KIAA14 VSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRLPALPCAPPSVHLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHC 250 260 270 280 290 300 650 660 670 680 690 700 KIAA08 I--GAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRS : : :: .... ::: : : .:: KIAA14 IADGHPTPRLQWQLQIPGGTVVLEPPVLSGEDDGVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPA 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1904 ( 821 res) af00058 (821 aa) initn: 345 init1: 215 opt: 260 Z-score: 183.8 bits: 45.2 E(): 4e-05 Smith-Waterman score: 308; 32.663% identity (60.302% similar) in 199 aa overlap (413-608:48-222) 390 400 410 420 430 440 KIAA08 ICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNA--KKLYLSSNLIQKIYRSDFW : .:. .:. . : :. : .. . :.. 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KIAA19 ------------NPFNCECDLFGFLAWLVVFNNVTKNYDRLQCESPREFAGYPLLVPRPY 190 200 210 220 230 620 630 640 650 660 670 KIAA08 VLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAV KIAA19 HSLNAIIVLQAKCRNGSLPARPVSHPTPYSTDAQREPDENSGFNPDEILSVEPPASSTTD 240 250 260 270 280 290 988 residues in 1 query sequences 1986517 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:18:35 2008 done: Thu Dec 18 15:18:36 2008 Total Scan time: 0.660 Total Display time: 0.300 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]