# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06521.fasta.huge -Q ../query/KIAA0861.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0861, 982 aa vs ./tmplib.23663 library 1986523 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1977+/-0.0062; mu= 4.5306+/- 0.420 mean_var=146.8751+/-34.894, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.105828 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108) 1419 229.1 2.3e-60 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 327 62.5 4e-10 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 213 44.9 4.4e-05 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 205 44.1 0.00028 KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 181 39.9 0.0011 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 167 37.9 0.0064 >>KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108 aa) initn: 2293 init1: 1407 opt: 1419 Z-score: 1175.5 bits: 229.1 E(): 2.3e-60 Smith-Waterman score: 2298; 43.019% identity (70.715% similar) in 881 aa overlap (1-872:179-1016) 10 20 30 KIAA08 FILRPSRFIQRTFTDIGIKYYRNEFKMKVP ..:::. :.:::..::..:. :..:::::: KIAA03 VIDRRRDKWTSVKASVLRIAASFPANLQLVLVLRPTGFFQRTLSDIAFKFNRDDFKMKVP 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 KIAA08 IIMVNSVSDLHGYIDKSQLTRELGGTLEYRHGQWVNHRTAIENFALTLKTTAQMLQTFGS .::..:: ::::::::::::..:::::.: :..:. .:::::.::: .: ::::::.::. 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KIAA03 ------YRRAKSEMSESRQGRGSAG-EEEESLAIL--RRHVMSELLDTERAYVEELLCVL 620 630 640 650 660 520 530 540 550 560 570 KIAA08 DGYITPMDFIWLKHLIPDVLQNNKDFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEKCAENPELLAHCF .:: . :: . ::. :.:.:: ::::..:.:.:::: ::.:::. .. :::...:: KIAA03 EGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHNKKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELENYTDCPELVGRCF 670 680 690 700 710 720 580 590 600 610 620 630 KIAA08 LKRKEDLQIYFKYHKNLPRARAIWQECQDCAYFGVCQRQLDHNLPLFKYLKGPSQRLIKY :.: ::.::: :: .: ::....:..:.:: .: :::.:::.: : .:: : ::. :: KIAA03 LERMEDFQIYEKYCQNKPRSESLWRQCSDCPFFQECQRKLDHKLSLDSYLLKPVQRITKY 730 740 750 760 770 780 640 650 660 670 680 690 KIAA08 QMLLKGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQALAVIEDLIKSCELA :.::: .: : ... . .::.::. : ..:. . . 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KIAA03 KTDPLSLEGYVSSAPLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 >>KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287 aa) initn: 358 init1: 179 opt: 327 Z-score: 273.6 bits: 62.5 E(): 4e-10 Smith-Waterman score: 519; 24.185% identity (52.050% similar) in 951 aa overlap (33-922:327-1220) 10 20 30 40 50 60 KIAA08 LRPSRFIQRTFTDIGIKYYRNEFKMKVPIIMVNSVSDLHGYIDKSQLTRELGGTLEYRHG .:.:.. .: ..:. ::: .: :.. : :: KIAA19 NTSPIIHSILLLVDKESAFRPDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHG 300 310 320 330 340 350 70 80 90 100 110 120 KIAA08 QWVNHRTAIENFALTLKTTAQMLQTFGSCLATAELPRSMLSTEDLLMSH-TRQRDKLQDE .:. : .:.:: . . . .::. : : . ::. . .:. .: : .. :.: KIAA19 DWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDP 360 370 380 390 400 410 130 140 150 160 170 KIAA08 LKL-LGKQGTTLLSCIQEPATKCPNSKLNLNQLENVTTM-ERLLVQLDE-TEKAFSHFWS : . : .: :.:. ... .:. . :: .:.. .:. .. . . . ... . KIAA19 LLVSLRLEGGTVLARLRREELGTEDSR---DTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQ 420 430 440 450 460 470 180 190 200 210 220 230 KIAA08 EHHLKLNQCLQLQHFEHDFCKA--KLALDN--LLEEQAEFTGIGDSVMHVEQILKEHKKL .::. : :. ... :. .:: .: ::... : :.. : : .. .: KIAA19 LEHLRELASL-LEGNDQQSCQKGLQLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAV-VSQAECREGEL 480 490 500 510 520 530 240 250 260 270 280 KIAA08 EEKSQESLEKAQLLALVG--DQLIQSHHYAADAIRPRCVELRHLCDDFINGNKK---KWD . .. : . . .: : .:. .: : . . . : : KIAA19 ARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVAVLKPH 540 550 560 570 580 590 290 300 310 320 330 KIAA08 ILGKSLEFHRQLDKVSQWCEAGIYL---LASQAVDKC-----QS---REGVDIAL---ND ::: . : : :. .. . : :. : : :: .: .. :. . KIAA19 ALGK--PWASQQDLWLQYPQTRLRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQK 600 610 620 630 640 340 350 360 370 380 KIAA08 IATFLGTVKEYPLLSPKEFYNEFE---LLLTLDAKAKAQKVLQRLDDVQEIFH-----KR .: .: . : . . . :: :.. . . : .. . KIAA19 PPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGAT 650 660 670 680 690 700 390 400 410 420 430 440 KIAA08 QVSLMKLAAKQTRPVQPVAPHPESSP-KWVSSKTSQPSTSVPLARPLRTSEEPYTETELN . : .: ...:.: .: .:.. : : . .::.. : . : : : .: .: . KIAA19 TAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGP-RDSCQP-DHTSVF 710 720 730 740 750 760 450 460 470 480 490 KIAA08 SRGKE-----DDETKFEV----KSEEIFESHH---ERGNPELEQQARLGDLSPR-RRIIR :.: : : :. . .: . .:. : :...: : : :.:. KIAA19 SKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMA 770 780 790 800 810 820 500 510 520 530 540 550 KIAA08 DLLETEEIYIKEIKSIIDGYITPMDFIWLKHLIPDVLQNNKDFLFGNIRELYEFHNRTFL ... ::. ::. . .::.:. :. . .:. :.... .:::...:..::.. :: KIAA19 EMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEME----RMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFL 830 840 850 860 870 880 560 570 580 590 600 610 KIAA08 KELEKCAENPELLAHCFLKRKEDLQIYFKYHKNLPRARAIWQECQDCAYFGVCQRQLDHN .:::.: . : ... ::...:.. .: : :: :.. :. . . :.: ::.: . KIAA19 RELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSS-HGNAFFKDKQRELGDK 890 900 910 920 930 940 620 630 640 650 660 670 KIAA08 LPLFKYLKGPSQRLIKYQMLLKGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTEL . : .:: : ::. :: .::. :: : . : :. . . : :. . . .: KIAA19 MDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLK-------EASCG-LAQGQELGELRAAEVVVCFQL 950 960 970 980 990 680 690 700 710 720 730 KIAA08 QQALAVIEDLIKSCELAVDLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIRF ... .:: ::.: :. : .. . :.: . : : . .: KIAA19 RHG----NDL-----LAMD--AIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIV-CCGRKKY-------- 1000 1010 1020 1030 740 750 760 770 780 790 KIAA08 KPSQRQIYLFERGIVFCKIRMEPGDQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEIAS :...::: :.: : . :.. . : .:...: ... . : .::: KIAA19 ---LRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDV---YLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWF 1040 1050 1060 1070 1080 800 810 820 830 840 850 KIAA08 R---NGLEKYILQAASKEIRDCWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQFEMSTSKGSGAGSGP : .. . :::::.: :... : . :...: .: .:.. ..... . : :. : KIAA19 RRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQA--LKSR---ELRIQEMASMGIGNQP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 860 870 880 890 900 KIAA08 WIKNMERATTSKEDPASSTGGIKGCSSREFSSMDTFEDCEGAEDMEKESSALSL---AGL .. : : : : . : :. :.. .:.:.. . :.:.: :. KIAA19 FMDVKPRDRT--PDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSI--VKGTESQMRGSTAVSSSDHAAP 1150 1160 1170 1180 1190 910 920 930 940 950 960 KIAA08 FQ------SDDSHETCSSKSAFLERGESSQGEKEERDEEETATRSTEEERAGASTGRLAP :. ::.: . ::.:. KIAA19 FKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDE 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 (694 aa) initn: 171 init1: 78 opt: 213 Z-score: 183.2 bits: 44.9 E(): 4.4e-05 Smith-Waterman score: 233; 27.564% identity (52.885% similar) in 312 aa overlap (488-773:309-599) 460 470 480 490 500 510 KIAA08 EVKSEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIKEIKSIIDGYITPM : .: ..: ::. :::....: .::. KIAA11 DEPADDDAPLAGNSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQC 280 290 300 310 320 330 520 530 540 550 560 570 KIAA08 DFIWLKHLIPDVLQNNK-DFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEK--CAENPEL--LAHCFLK :. :...... .::::...:. . ..:.: ::. : :.: :. :::. KIAA11 R----KR--ADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQ-KAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLE 340 350 360 370 380 390 580 590 600 610 620 KIAA08 RKEDLQIYFKYHKNLPRA----RAIWQECQDCAYFGVC---QRQLDHNLPLFKYLKGPSQ .. :.::: .: .: : : . . . .: .: :...: .: : : : : KIAA11 HQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGF--LLTPVQ 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 680 KIAA08 RLIKYQMLLKGLLDFESPE-----DMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQALAVI .. :: . : :: . :. :.: . . :. .: . .. : . : KIAA11 KICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSI 450 460 470 480 490 500 690 700 710 720 730 KIAA08 ED------LIKSCELAV--DLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIR :: :..: :: .:. ::. :. .. ..: :. : :::.: KIAA11 EDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQ-PQAKSQQRMFFLFD-------HQLIYCKKDLLR 510 520 530 540 550 560 740 750 760 770 780 790 KIAA08 FKPSQRQIYLFERGIVFCKIRMEPG-DQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEI . : :. . .: : :. : : :.:.:..: KIAA11 RDVLYYKGRLDMDGLEV--VDLEDGKDRDL--HVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQ 570 580 590 600 610 800 810 820 830 840 850 KIAA08 ASRNGLEKYILQAASKEIRDCWFSEISKLLMEQQNNIKDQGNPQFEMSTSKGSGAGSGPW KIAA11 KQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKGRRTAAPPPRLPG 620 630 640 650 660 670 >>KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584 aa) initn: 209 init1: 98 opt: 205 Z-score: 168.8 bits: 44.1 E(): 0.00028 Smith-Waterman score: 353; 23.696% identity (52.609% similar) in 460 aa overlap (475-922:302-708) 450 460 470 480 490 500 KIAA08 LNSRGKEDDETKFEVKSEEIFESHHERGNPELEQQARLGDLSPRRRIIRDLLETEEIYIK : : .:::.. .:..:: .:. ... KIAA16 VSPAYLDRRLKLSPEWGAAEAPEFPGEAVSEDEYKARLSS------VIQELLSSEQAFVE 280 290 300 310 320 510 520 530 540 550 560 KIAA08 EIKSIIDGYITPMDFIWLKHLIPDVLQNNKDFLFGNIRELYEFHNRTFLKELEKCAENPE :.. . . .. .. : .: .. ..: .: :.:.. .::. .::.::..: . . KIAA16 ELQFLQSHHLQHLER--CPH-VPIAVAGQKAVIFRNVRDIGRFHSSSFLQELQQCDTDDD 330 340 350 360 370 380 570 580 590 600 610 KIAA08 LLAHCFLKRKEDLQIYFKYHKNLPRARAI---------WQECQDCAYFGVCQRQLDHNLP . : ::.: . .. :... . .:... ... . : .. : : KIAA16 V-AMCFIKNQAAFEQYLEFLVGRVQAESVVVSTAIQEFYKKYAEEALLAGDPSQPPPP-P 390 400 410 420 430 440 620 630 640 650 660 670 KIAA08 LFKYLKGPSQRLIKYQMLLKGLLDFESPEDMEIDPGELGGSAKDGPKRTKDSAFSTELQQ : .::. : .:. .:: ::: :. .. . .. :. :.: KIAA16 LQHYLEQPVERVQRYQALLKELI-------------------RNKARNRQNCAL---LEQ 450 460 470 680 690 700 710 720 730 KIAA08 ALAVIEDLIKSCELAVDLAAVTECPDDIGKLGKLLLHGPFSVWTIHKDRYKMKDLIRFKP : ::. : . : . .. . . : . ::. . .: : :: .: .: KIAA16 AYAVVSALPQRAENKLHVSLMENYPGTLQALGEPIRQGHFIVWE-GAPGARMP----WKG 480 490 500 510 520 530 740 750 760 770 780 790 KIAA08 SQRQIYLFERGIVFCKIRMEPGDQGLSPHYSFKKAMKLMTLSIRQLGRGSHRKFEI--AS .:...::. .:.:: : . . .: : :.. ::: .... . .:. : ::. 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