# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06535.fasta.huge -Q ../query/KIAA0863.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0863, 1181 aa vs ./tmplib.23663 library 1986324 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2446+/-0.00859; mu= -5.9572+/- 0.577 mean_var=492.0434+/-119.549, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 24 in 1/39 Lambda= 0.057819 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0784 ( 1073 res) hk05410 (1073) 370 46.5 2.6e-05 KIAA0461 ( 1355 res) hg00867 (1355) 285 39.6 0.004 >>KIAA0784 ( 1073 res) hk05410 (1073 aa) initn: 1084 init1: 351 opt: 370 Z-score: 187.3 bits: 46.5 E(): 2.6e-05 Smith-Waterman score: 1000; 26.264% identity (49.246% similar) in 1127 aa overlap (81-1180:2-814) 60 70 80 90 100 110 KIAA08 MFQIPVENLDNIRKVRKKVKGILVDIGLDSCKELLKDLKGFDPGEKYFHNTSWGDVSLWE ::: ..:.: :.:.. :..::.: ::.::. 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KIAA04 SGPESSMKVTSSIPV----FDL-QDGGRKICPRCNAQFRVTEALRGHMCYCCPEMVEYQK 300 310 320 330 340 350 660 670 680 690 700 710 KIAA08 TGKQVNGIPTYTLAPVSVTLPVPPGGLATVA--PPQMPIQLLPSGAAAPMAGSMPGMPSP ::.... :. .: :.. : : : :: : . :: : . .: . : KIAA04 KGKSLDSEPS---VP-SAAKPPSPEKTAPVASTPSSTPIPALSPPTKVPEPNENVGDAVQ 360 370 380 390 400 720 730 740 750 760 770 KIAA08 PVLVNAAQSVFV-QASSSAADTNQVLKQAKQWKTCPVCNELFPSNV-YQVHMEVAHKHSE :. ... . . ....:. .. : : ... :: :.. . .:. .. ::. : . . KIAA04 TKLIMLVDDFYYGRDGGKVAQLTNFPKVATSFR-CPHCTKRLKNNIRFMNHMK-HHVELD 410 420 430 440 450 460 780 790 800 810 KIAA08 SKSGEKLEPEKLAAC-----APF-----LKWMR---EKTVRCLSCK-CLVSEEELIHHLL ...:: : .:: :. .. :.:..: :. . :: ...:. KIAA04 QQNGEVDGHTICQHCYRQFSTPFQLQCHLENVHSPYESTTKCKICEWAFESEPLFLQHMK 470 480 490 500 510 520 820 830 840 850 860 870 KIAA08 -MHGLG-----CLFCPCTFHDIKGLSEHSRNRHLGKKKLPMDYSNRGFQLDVDANGNLLF : : : : . .. : : : ..: : . :. ::: . 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