# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk06970mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0870.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0870, 1019 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824801 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1010+/-0.000184; mu= 13.9133+/- 0.010 mean_var=72.5178+/-14.030, 0's: 40 Z-trim: 50 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.150609 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|158513219|sp|A2RUS2.2|DEND3_HUMAN RecName: Full (1198) 6820 1492.0 0 gi|119612623|gb|EAW92217.1| DENN/MADD domain conta (1278) 6820 1492.1 0 gi|114621963|ref|XP_519983.2| PREDICTED: hypotheti (1219) 6642 1453.4 0 gi|109087613|ref|XP_001082457.1| PREDICTED: simila (1423) 6258 1370.0 0 gi|194215140|ref|XP_001499398.2| PREDICTED: simila (1261) 5636 1234.8 0 gi|194672882|ref|XP_584806.4| PREDICTED: similar t (1282) 5536 1213.1 0 gi|124376358|gb|AAI33024.1| DENND3 protein [Homo s (1146) 5533 1212.4 0 gi|158513218|sp|A2RT67.2|DEND3_MOUSE RecName: Full (1274) 5418 1187.4 0 gi|109480872|ref|XP_235398.4| PREDICTED: similar t (1408) 5365 1176.0 0 gi|149410182|ref|XP_001513673.1| PREDICTED: simila (1294) 5121 1122.9 0 gi|148697474|gb|EDL29421.1| mCG123968 [Mus musculu (1211) 4293 943.0 0 gi|149066243|gb|EDM16116.1| hypothetical LOC315055 ( 788) 4038 887.4 0 gi|26343225|dbj|BAC35269.1| unnamed protein produc ( 780) 4015 882.4 0 gi|189532738|ref|XP_001338419.2| PREDICTED: simila (1268) 3669 807.4 0 gi|119612624|gb|EAW92218.1| DENN/MADD domain conta ( 554) 2957 652.4 1.8e-184 gi|189529965|ref|XP_686005.3| PREDICTED: similar t (1252) 2330 516.5 3.4e-143 gi|47229374|emb|CAF99362.1| unnamed protein produc (2176) 2202 488.8 1.2e-134 gi|119612625|gb|EAW92219.1| DENN/MADD domain conta ( 248) 1680 374.7 3.2e-101 gi|47225464|emb|CAG11947.1| unnamed protein produc (1308) 1287 289.8 5.8e-75 gi|47077524|dbj|BAD18649.1| unnamed protein produc ( 266) 1251 281.5 3.9e-73 gi|119612626|gb|EAW92220.1| DENN/MADD domain conta ( 146) 980 222.4 1.3e-55 gi|210121322|gb|EEA69035.1| hypothetical protein B ( 665) 687 159.2 6.1e-36 gi|210097221|gb|EEA45352.1| hypothetical protein B ( 618) 456 109.0 7.4e-21 gi|72007554|ref|XP_785531.1| PREDICTED: hypothetic ( 200) 447 106.7 1.2e-20 gi|210097220|gb|EEA45351.1| hypothetical protein B ( 492) 444 106.3 3.8e-20 gi|210121321|gb|EEA69034.1| hypothetical protein B ( 556) 423 101.8 9.9e-19 gi|163775979|gb|EDQ89601.1| predicted protein [Mon (1285) 381 93.0 1e-15 gi|30694474|ref|NP_175333.3| SCD1 (STOMATAL CYTOKI ( 909) 339 83.7 4.5e-13 gi|19743728|gb|AAL92456.1| stomatal cytokinesis de (1187) 339 83.8 5.5e-13 gi|222618718|gb|EEE54850.1| hypothetical protein O (1202) 333 82.5 1.4e-12 gi|222869036|gb|EEF06167.1| predicted protein [Pop (1197) 327 81.2 3.4e-12 gi|222858609|gb|EEE96156.1| predicted protein [Pop (1197) 324 80.6 5.3e-12 gi|157343526|emb|CAO68032.1| unnamed protein produ (1215) 308 77.1 6e-11 gi|116116699|gb|EAA01213.3| AGAP001102-PA [Anophel (1643) 305 76.5 1.2e-10 gi|212506987|gb|EEB11033.1| Rab6-interacting prote (1297) 297 74.7 3.3e-10 gi|47204493|emb|CAF89134.1| unnamed protein produc ( 79) 282 70.5 3.7e-10 gi|167879322|gb|EDS42705.1| CRAG protein [Culex qu (1661) 292 73.7 8.5e-10 gi|163779028|gb|EDQ92642.1| predicted protein [Mon (1360) 287 72.6 1.5e-09 gi|108874390|gb|EAT38615.1| rab6-interacting [Aede (1333) 271 69.1 1.7e-08 gi|190627733|gb|EDV43257.1| GF16615 [Drosophila an (1966) 269 68.8 3.1e-08 gi|194184046|gb|EDW97657.1| GE10084 [Drosophila ya (1973) 268 68.6 3.6e-08 gi|91080183|ref|XP_966320.1| PREDICTED: similar to (1982) 268 68.6 3.6e-08 gi|110750899|ref|XP_394363.3| PREDICTED: similar t (2007) 265 67.9 5.7e-08 gi|28381253|gb|AAN13531.2| SET domain binding fact (1973) 264 67.7 6.6e-08 gi|156228468|gb|EDO49267.1| predicted protein [Nem (1436) 262 67.2 6.9e-08 gi|194120509|gb|EDW42552.1| GM26070 [Drosophila se (1972) 263 67.5 7.6e-08 gi|194199739|gb|EDX13315.1| GD20634 [Drosophila si (1973) 263 67.5 7.6e-08 gi|167864373|gb|EDS27756.1| rab6-interacting [Cule (1421) 261 66.9 8e-08 gi|157019538|gb|EAL41523.3| AGAP011351-PA [Anophel (1434) 261 66.9 8.1e-08 gi|162695911|gb|EDQ82252.1| predicted protein [Phy (1149) 257 66.0 1.2e-07 >>gi|158513219|sp|A2RUS2.2|DEND3_HUMAN RecName: Full=DEN (1198 aa) initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820 Z-score: 7999.9 bits: 1492.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6820; 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