# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk08775.fasta.nr -Q ../query/KIAA0894.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0894, 553 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824734 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6114+/-0.00019; mu= 10.0898+/- 0.011 mean_var=89.8130+/-17.058, 0's: 41 Z-trim: 45 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.135333 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|51701938|sp|Q62417.2|SRBS1_MOUSE RecName: Full= (1290) 2782 553.6 1.2e-154 gi|148709889|gb|EDL41835.1| sorbin and SH3 domain (1304) 2776 552.5 2.8e-154 gi|194041761|ref|XP_001924696.1| PREDICTED: simila (1313) 2643 526.5 1.8e-146 gi|220675852|emb|CAX14799.1| novel protein similar (1197) 234 56.1 6.6e-05 gi|220678626|emb|CAX12842.1| novel protein similar (1230) 234 56.1 6.7e-05 gi|118090429|ref|XP_420674.2| PREDICTED: similar t (1201) 232 55.7 8.7e-05 gi|73979464|ref|XP_540021.2| PREDICTED: similar to (1200) 226 54.6 0.0002 gi|114597169|ref|XP_001164028.1| PREDICTED: sorbin (1014) 225 54.3 0.0002 gi|114597167|ref|XP_001164114.1| PREDICTED: sorbin (1036) 225 54.3 0.0002 gi|114597151|ref|XP_001164868.1| PREDICTED: sorbin (1102) 225 54.3 0.00021 gi|114597147|ref|XP_517563.2| PREDICTED: sorbin an (1171) 225 54.4 0.00022 gi|114597139|ref|XP_001164409.1| PREDICTED: sorbin (1188) 225 54.4 0.00022 gi|114597125|ref|XP_001164522.1| PREDICTED: sorbin (1202) 225 54.4 0.00022 gi|194226514|ref|XP_001490622.2| PREDICTED: sorbin (1103) 222 53.7 0.00032 gi|205831244|sp|Q3UTJ2.2|SRBS2_MOUSE RecName: Full (1180) 222 53.8 0.00033 gi|219521425|gb|AAI72140.1| Unknown (protein for M (1196) 222 53.8 0.00034 gi|183396993|gb|AAI66027.1| Sorbin and SH3 domain (1272) 222 53.8 0.00035 gi|109076396|ref|XP_001087237.1| PREDICTED: simila (1003) 220 53.3 0.00038 gi|109076394|ref|XP_001086892.1| PREDICTED: simila (1033) 220 53.3 0.00039 gi|109076384|ref|XP_001086996.1| PREDICTED: simila (1099) 220 53.4 0.00041 gi|109076378|ref|XP_001087352.1| PREDICTED: simila (1185) 220 53.4 0.00044 gi|109076374|ref|XP_001087467.1| PREDICTED: simila (1199) 220 53.4 0.00044 gi|193786486|dbj|BAG51769.1| unnamed protein produ (1200) 220 53.4 0.00044 gi|109076382|ref|XP_001088305.1| PREDICTED: simila (1205) 220 53.4 0.00044 gi|149021399|gb|EDL78862.1| Arg/Abl-interacting pr (1195) 216 52.6 0.00075 gi|205831248|sp|O35413.2|SRBS2_RAT RecName: Full=S (1196) 216 52.6 0.00076 gi|2555185|gb|AAB81527.1| SH3-containing protein p (1196) 216 52.6 0.00076 gi|117644794|emb|CAL37863.1| hypothetical protein (1100) 215 52.4 0.00081 gi|117645358|emb|CAL38145.1| hypothetical protein (1100) 214 52.2 0.00093 gi|117645168|emb|CAL38050.1| hypothetical protein (1128) 213 52.0 0.0011 gi|117646118|emb|CAL38526.1| hypothetical protein (1128) 213 52.0 0.0011 gi|149615821|ref|XP_001521490.1| PREDICTED: simila ( 790) 211 51.5 0.0011 gi|221041370|dbj|BAH12362.1| unnamed protein produ (1004) 211 51.6 0.0013 gi|205831246|sp|O94875.3|SRBS2_HUMAN RecName: Full (1100) 211 51.6 0.0014 gi|117645204|emb|CAL38068.1| hypothetical protein (1228) 211 51.6 0.0015 gi|117645558|emb|CAL38245.1| hypothetical protein (1099) 208 51.0 0.0021 gi|117644892|emb|CAL37912.1| hypothetical protein (1099) 208 51.0 0.0021 gi|117646230|emb|CAL38582.1| hypothetical protein (1100) 208 51.0 0.0021 gi|117646642|emb|CAL37436.1| hypothetical protein (1128) 207 50.8 0.0024 gi|117644544|emb|CAL37767.1| hypothetical protein (1100) 206 50.6 0.0027 gi|117644936|emb|CAL37934.1| hypothetical protein (1100) 206 50.6 0.0027 gi|117646484|emb|CAL38709.1| hypothetical protein (1100) 206 50.6 0.0027 gi|221487775|gb|EEE26007.1| conserved hypothetical (1365) 199 49.3 0.0083 >>gi|51701938|sp|Q62417.2|SRBS1_MOUSE RecName: Full=Sorb (1290 aa) initn: 2346 init1: 1129 opt: 2782 Z-score: 2932.5 bits: 553.6 E(): 1.2e-154 Smith-Waterman score: 2782; 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