# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk09360mrp1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0918.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0918, 966 aa vs ./tmplib.23663 library 1986539 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7892+/-0.00894; mu= -0.4108+/- 0.606 mean_var=315.2558+/-74.963, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.072234 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 2262 250.2 9.7e-67 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 1133 132.2 1.8e-31 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 966 115.0 3.7e-26 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 365 52.3 2.4e-07 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 353 51.5 1e-06 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 345 50.6 1.7e-06 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 304 45.9 2.1e-05 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 279 43.2 0.00011 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 273 42.8 0.00022 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 264 41.8 0.00038 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 262 41.5 0.00041 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 261 41.4 0.00046 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 259 41.3 0.00059 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 252 40.6 0.00095 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 246 39.6 0.001 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 238 39.3 0.0032 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 220 37.0 0.0074 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 217 36.7 0.0094 KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 221 37.4 0.0096 >>KIAA0848 ( 988 res) hk05607 (988 aa) initn: 2348 init1: 1044 opt: 2262 Z-score: 1290.1 bits: 250.2 E(): 9.7e-67 Smith-Waterman score: 2426; 41.904% identity (68.597% similar) in 1019 aa overlap (12-961:6-985) 10 20 30 40 50 KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQD----LHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYY : : :.. . ::: : .:.:.:.. :. . . .: :: KIAA08 EETLFCNQPRTMKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID-- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 KIAA09 GEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNY : : . : :: :.... . :...:. ..:.:. ..: :. : . .:: : :.. 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KIAA08 WIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQ---PGDSHL 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 KIAA09 VTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQ . ....: .. :: :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:. KIAA08 IGAP----TSASPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKL 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 KIAA09 SDHTSTNNS-DVSSFNMQ-YSVY----GGGGGTGGHPHAHVHHRGPAL--PKVKTPAGHV ... ... :.....:: . .. :::::.:: . :.: :. :.::: KIAA08 PFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGHV 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 KIAA09 YEYIPHPLGHMCKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQQ :::::::. .::.::::. :: : .:. :: .. . .. : : : . KIAA08 YEYIPHPVTQMCNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGMG 760 770 780 790 820 830 840 850 KIAA09 PP----PQLQLQPGEE--------ERRESHHLRSPAYSVSTI------EPREDLLSPVQ- :. : :. :... : . ...:: .:.. .. :. KIAA08 EALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVSG 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 KIAA09 -------DADRFYR-----GIL--EPDKHCSTTPAGNSL--PEYPK-FPCS----PAAYT : : . :.. : :.. :. : : :. ::. : KIAA08 VVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLYG 860 870 880 890 900 910 900 910 920 930 940 950 KIAA09 FSPNY-DLR-RPHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFVE--PNRNEYLELKAKLNVEP :. .:. .: . .: :.::.: .:.: .. :.. ....::::.:::...: KIAA08 TVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTKP 920 930 940 950 960 970 960 KIAA09 DYLEVLEKQTTFSQF :::::::: : KIAA08 DYLEVLEKTTYRF 980 >>KIAA1854 ( 572 res) fg02232 (572 aa) initn: 2560 init1: 1071 opt: 1133 Z-score: 656.9 bits: 132.2 E(): 1.8e-31 Smith-Waterman score: 2236; 57.022% identity (81.049% similar) in 591 aa overlap (23-607:1-571) 10 20 30 40 50 KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQDLHR---KMHS--WMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEI :: :: : :.:..:. : .:. .:. .: KIAA18 HRRCLKMLSGVWFLSVLTVA---GILQ-TESRKTAKDI 10 20 30 60 70 80 90 100 110 KIAA09 CDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGA : : ::::...:...:::.:. ..: ..::.. ::.:.:.::::.::::::::::..: KIAA18 CKIRCLCEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNA 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 KIAA09 SILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISV ::::.: .:.:.:::: ::. :.::::::::::.::.:::::::.:::::.::::::. KIAA18 VTLHLGNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISA 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA09 IEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKV :: .::.::. :.::::::::: :::.:.:::: ::::::::::::..:..:.:.:. . KIAA18 IEAGAFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVFRFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIGGI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA09 VELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRR .:.:::::::::.:.:. :: :::.: ...::..::::::::::.:. ....:.::::. KIAA18 MEIQLEENPWNCTCDLLPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRK 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 KIAA09 LISDYEMRPQTPLSTTGYLHTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSR :: .: . . : . .: : . :. : . ::..: : : : ::: : KIAA18 SASDSSQRGSH--ADTHVQRLSP-------TMNPALN--PTRAPKASRPP-KMRNRPTPR 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 KIAA09 QP-SKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQP ::: ...:: ..::::::::: ::..: :. : :: ::::::::::. .:..::: KIAA18 VTVSKD--RQSFGPIMVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQP 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 KIAA09 KPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNG :: .:::.::: ::. .: ..:.:: ..:::::::::::..::. :: .::.:::::::: KIAA18 KPTSPKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNG 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 KIAA09 NRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFS : .: : : .: ::::::::.:.::.:.::. ::: . ::::::::::::...:...:. KIAA18 NYLEVLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFG 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 KIAA09 GLTLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVL : .: :::::.:::. :::.:::::: ..:::::..:::::::::.:.: :.:. . :. KIAA18 GTALTRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVI 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 KIAA09 VDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAVTPAVRLNST ..:: :..: : : KIAA18 INEVTCESPAKHAG 560 570 >>KIAA1910 ( 760 res) fh21867 (760 aa) initn: 1760 init1: 907 opt: 966 Z-score: 561.5 bits: 115.0 E(): 3.7e-26 Smith-Waterman score: 1791; 40.922% identity (69.972% similar) in 716 aa overlap (13-718:53-728) 10 20 30 40 KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQDLHRKMHSWMLQTLAFAVTSLV : . .. : :: :.: . ::: KIAA19 PFSSPFLASDIGALNELELCLWRAGWSLLLCDEIG-DELLALKMLLWIL----LLETSL- 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 KIAA09 LSCAETIDYYGEIC-DNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLL : . . :..: .. : :.: .: : :.::..:. ::.... : .:::.: :: : KIAA19 --CFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSL 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA09 NRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLE .::.::::.:. .: ::. .: ...: ::: ::. ..:::.::::.. .: .:::::. KIAA19 TRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLD 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 KIAA09 NLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLK .:::::.:.: . :.:.:: :. :.::::::::.:.:: :.:..::.::::::::::: KIAA19 DLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHLDLRGNRLK 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 KIAA09 LLPYVGLLQHMDKVVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGR ::: .:... ..:. ::.:::.:.:.:.:::.::..: .::.: ::::.: ::.:. KIAA19 TLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGK 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 KIAA09 DLDEVSKQELCP--RRLISDYEMRP-QTPLSTTGYLHTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKP ::.:...:.::: :. :. : : . : : :: ..:. .. : : KIAA19 DLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPL-PTPFKTNGQEDHAT----PGSAP 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 KIAA09 PKGTRQPN--KPRVRPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLG ::. :. . ..:::. . : : : . .: :: .:::. .: : KIAA19 NGGTKIPGNWQIKIRPTAAIAT---GSSRNKP-----LANSLP--CPGGCSCD-HIPGSG 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 KIAA09 LNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMI :..::..:.. :.:.:.:: : ....: .: : .:.. :.. .: :: :::: :. . KIAA19 LKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATV 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 KIAA09 QDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQ .. .: .: .:: ::...: .. :: : : :::.:.:: ..:: :. : :::. .:.:. KIAA19 ENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLR 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 KIAA09 LLFLNNNLLQAMPSGVFSGLTLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCT .:.::::::...: ::.:..: .:.:..:.: :::.:::::: :.:::::: :::.:. KIAA19 ILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECS 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 KIAA09 CDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSI : :: .: :.:.: ::.... :..: .: . :. .... .:: KIAA19 CTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICP--------------- 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 KIAA09 QVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGA----SSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGL :. :: : . . :::: : :. ... : : .:::. .:::::. :.:...:. KIAA19 QLYARISPTLTSHSKNSTGL-AETGTHSNSYLDTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGM 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 KIAA09 FVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTGGHPHAHVHHRGPALPKVKTP .:.... ::... .... :...:. KIAA19 LVFILRNRKRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD 710 720 730 740 750 760 >>KIAA1469 ( 662 res) fj01881 (662 aa) initn: 451 init1: 239 opt: 365 Z-score: 223.6 bits: 52.3 E(): 2.4e-07 Smith-Waterman score: 365; 29.630% identity (64.609% similar) in 243 aa overlap (422-657:172-407) 400 410 420 430 440 450 KIAA09 ISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNN ..:..:..... : : .. :.: .: KIAA14 YLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWG--LPRT-IEELRLDDN 150 160 170 180 190 460 470 480 490 500 KIAA09 RISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIER--LSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTF ::: :.. .. ::.:.:: :.:: .. :. ..:..: .: : : : . . KIAA14 RISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNL- 200 210 220 230 240 250 510 520 530 540 550 560 KIAA09 DPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGLT-LLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDL : ::. :.:..: .. .: ..:: : : ::.. .:....:: .:..:.: .. :. : KIAA14 -PGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLP-QGIFDDLDNITQLIL 260 270 280 290 300 310 570 580 590 600 610 620 KIAA09 HDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELL-CPD---YS ..::: : : . .. :...: : : : ..:.::.: ......::. : : : KIAA14 RNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVS 320 330 340 350 360 370 630 640 650 660 670 680 KIAA09 DVVVSTPTPSSIQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIM . ..: :... ::. . .:... . : KIAA14 TIQITTAIPNTVY-PAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSD 380 390 400 410 420 430 690 700 710 720 730 740 KIAA09 SVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTGGHPHAHVHHRGP KIAA14 TIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVP 440 450 460 470 480 490 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 600 init1: 237 opt: 353 Z-score: 212.7 bits: 51.5 E(): 1e-06 Smith-Waterman score: 503; 25.844% identity (51.542% similar) in 681 aa overlap (9-670:18-593) 10 20 30 40 KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQD---LHRKMHSWM-LQTLAFAVTSLVLSCAE .:. :: . . :: .: . . . : .:.:. : KIAA08 LRRPLPRPPALPARLLGLHASCPAEAASSRSGALHTMAPGWAGVGAAVRARLALALALAS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA09 TIDYYGEI-CDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYP ... . : . : : .:.:.. :. .. . . :: .: :. : ..:. KIAA08 VLSGPPAVACPTKCTCSAA----SVDCHGLGLRAVPR-GIPR-NAERLDLDRNNITRITK 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA09 NEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYL .:.. . .::: .: .. :: :::. :. :.::.::.:::..: . : . .: : KIAA08 MDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA09 QVDYNYISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFV-PLTHLDLRGNRLKLLPY ... : :. : .:: . .. : :..: .: . .. :: . : : : .: .. . KIAA08 DLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRI-L 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 KIAA09 VGLLQHMDKVVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGD-VVCETPFRLHGRDLD : ..:: :. :.:. : :.:.: :.::: . ::. ..: .: .:.: .. KIAA08 VTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLRQ---RRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 KIAA09 EVSKQE-LCPRRLISDYEMRPQTPLSTTGYLHTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTR .:.:.: .:: .: :. : : :. . : KIAA08 DVQKKEYVCP------------AP-------HSEPPSCNANSIS---------------- 300 310 350 360 370 380 390 400 KIAA09 QPNKPRVRPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQE ::. :.:. .: :.:. KIAA08 --------------------------------------CPSPCTCSNNI------VDCRG 320 330 410 420 430 440 450 460 KIAA09 RKIESI-AELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFG . . : :.: : . .. : .: : .. : . : . ...:.:: : :: KIAA08 KGLMEIPANL---PEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQ 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 KIAA09 DLTNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNN : .: : : ::.: ... :: :: ::: :.:. : : .. .::. . ::.:: : . KIAA08 GLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYD 390 400 410 420 430 440 530 540 550 560 570 580 KIAA09 NLLQAMPSGVFSGL-TLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLD-QLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIV : ::.. .:.:. : .. :.: .: : : : .:: : . :.::: . . KIAA08 NKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPF-------VCDCHLKWLADY-LQDNPIETS---- 450 460 470 480 490 590 600 610 620 630 KIAA09 GMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRS-IKSE----LLCPDYS---DVVVSTPT : . . .. .... : . . :.:: ..:: :.::. ..:. . KIAA08 GARCSSPRRLANKRISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPEKCRCEGTIVDCSN 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 KIAA09 PSSIQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGL . ...:.. . .:::.. . . : : : ...: KIAA08 QKLVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEV-SVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIKEVREGAFDG 560 570 580 590 600 610 700 710 720 730 740 750 KIAA09 FVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTGGHPHAHVHHRGPALPKVKTP KIAA08 AASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSSVRLLSLYDN 620 630 640 650 660 670 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 478 init1: 248 opt: 345 Z-score: 208.3 bits: 50.6 E(): 1.7e-06 Smith-Waterman score: 345; 36.139% identity (65.347% similar) in 202 aa overlap (116-312:82-277) 90 100 110 120 130 140 KIAA09 PPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLN ::: : : :..:. :::. ::.: : :: KIAA02 GCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLN 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 KIAA09 NNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLF ::... . . .: ::::.:: . : :. :. .:: : :. : :. : . .: . : KIAA02 NNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSF 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 KIAA09 RFVP-LTHLDLRGNRL-KLLPYVGLLQHMDKVVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISY . .: : .: :..::. .:.: : ..:.... .:.:. : .:.::.. : : : . . KIAA02 QHLPKLERLFLHNNRITHLVP--GTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAE 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 KIAA09 SALV-GDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQEL-CPR-RLISDYEMRPQTPLSTTGYLHTTPAS :. . . ..:: : :..::.. .. .:: : : :. :. :: :.: KIAA02 SGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSE----PQDADVTSGNTVYFTCR 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 KIAA09 VNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPL KIAA02 AEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKT 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0405 ( 706 res) hg01274 (706 aa) initn: 274 init1: 213 opt: 304 Z-score: 189.0 bits: 45.9 E(): 2.1e-05 Smith-Waterman score: 306; 26.510% identity (57.383% similar) in 298 aa overlap (420-700:208-497) 390 400 410 420 430 440 KIAA09 LQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLG : ..:..:... : . :. :.. KIAA04 LLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSV---PVGLPVDLQELRVD 180 190 200 210 220 230 450 460 470 480 490 500 KIAA09 NNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIER--LSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSG .:::..:.: :: .::.:.:: ..:: . .. : : .:. .....:. : KIAA04 ENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLK----EFSIVRNSLSH 240 250 260 270 280 290 510 520 530 540 550 560 KIAA09 TFDPVPNLQL--LFLNNNLLQAMPSGVFSGLTLL-RLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLI .:. .: :.:..: .. .: .::.: : ::.. .:.. : ..::.:.:..: KIAA04 PPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRML-TQGVFDNLSNLK 300 310 320 330 340 570 580 590 600 610 620 KIAA09 QIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELL-CPDY :. ..::: : :.: . :.. . .. : .:..:.. .: .. .:: :: KIAA04 QLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTT 350 360 370 380 390 400 630 640 650 660 670 KIAA09 SD-VVVSTPTPSS---------IQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSV . . . ::.::. ...: . . :: . .: : . :.: KIAA04 TPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISE 410 420 430 440 450 460 680 690 700 710 720 730 KIAA09 LI-LSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTG : ::. .: :. :. . :: . KIAA04 RIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNL 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0416 ( 529 res) hh00236 (529 aa) initn: 488 init1: 212 opt: 279 Z-score: 176.3 bits: 43.2 E(): 0.00011 Smith-Waterman score: 296; 30.342% identity (56.410% similar) in 234 aa overlap (14-243:2-228) 10 20 30 40 50 KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQDLHRKM--H-SWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEICD : .. ... :.: : .: : . .:. . . . : : KIAA04 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACP 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 KIAA09 NACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASI : ::. : :...:. :. . . : : : ...: ..:.... . KIAA04 PKCRCEK----LLFYCDSQGFHSVPNATDK--GSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTW 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA09 LHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIE ::: : :. .. ::.:: :..: :..::. : . :: : ::. :....: .: .. KIAA04 LHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLH 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA09 PNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLF-RFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKVV :. : :. ::.: : .: : ..: :: : ::: :::. : :. . :. KIAA04 PELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGF-AGLIKLR 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA09 ELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRL ::.::.: KIAA04 ELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAI 230 240 250 260 270 280 >>KIAA1246 ( 832 res) hh00149a (832 aa) initn: 318 init1: 184 opt: 273 Z-score: 170.7 bits: 42.8 E(): 0.00022 Smith-Waterman score: 280; 27.434% identity (52.802% similar) in 339 aa overlap (6-303:30-340) 10 20 30 KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQDLHRK-MHSWMLQTLA ::. :: : : : . :.. . :: KIAA12 LESVSGGEGCVAEPGSPGAPRSRPRCHPAGGR---CC----LAQALSDQTMETLLGGLLA 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 KIAA09 FAVTSLVLSCAETIDYYGEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFP--IYH :... :. . : . : :.. . : . : ..:.. . :: . . KIAA12 FGMAFAVV----------DACPKYCVCQNLSESLGTLCPSKGLL----FVPPDIDRRTVE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 KIAA09 LLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLR : :.::.. .. ..:.:.:: : :. :.:. :. .: :..:: :::..:.: : KIAA12 LRLGGNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISHIQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLG 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 KIAA09 DDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHL-LQVLILNDNLLSSLP----------- .::. :: ::..: :. : .. : .:: . : :. : :. : : .:: KIAA12 EDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLTLEDLDLSYNNLHGLPWDSVRRMVNLH 160 170 180 190 200 210 210 220 230 KIAA09 -----NNLFRFVP---------LTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKV----------VE .::. . :..::: .:::. :: .. . . . KIAA12 QLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTSNRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLS 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 KIAA09 LQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDV-VCETPFRLHGRDLDEVSKQEL-CPRR ... :: .:.:::. :: . . :. .: .: :.:: . .: ..:. : KIAA12 FSFGGNPLHCNCELL----WLRRLERD---DDLETCGSPGGLKGRYFWHVREEEFVCEPP 280 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 KIAA09 LISDYEMRPQTPLSTTGYLHTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSR ::... . KIAA12 LITQHTHKLLVLEGQAATLKCKAIGDPSPLIHWVAPDDRLVGNSSRTAVYDNGTLDIFIT 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1497 ( 730 res) hg01608 (730 aa) initn: 275 init1: 224 opt: 264 Z-score: 166.3 bits: 41.8 E(): 0.00038 Smith-Waterman score: 264; 30.000% identity (65.263% similar) in 190 aa overlap (383-571:81-263) 360 370 380 390 400 410 KIAA09 TSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAEL :. : . :. : :. : . .. . .: KIAA14 VCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIPSNLSSDTQV--LLLQSNNIAKTVDELQQL 60 70 80 90 100 420 430 440 450 460 470 KIAA09 QPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYL .: .. ...: .. .... . . : : ::: .:.:. . : . ::.::..::. KIAA14 ----FNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQITEMTDYCLQDLSNLQELYI 110 120 130 140 150 160 480 490 500 510 520 530 KIAA09 NGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGV : :.: .: . : ::..: : :. : .. :.: :: .:::..:....: . .. . KIAA14 NHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMN 170 180 190 200 210 220 540 550 560 570 580 590 KIAA09 FSGLTLLR-LNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKV :. :. :: : : . ..:..: ...: : :: .....:: KIAA14 FKPLANLRSLVLAGMYLTDIP-GNALVGLDSLESLSFYDNKLVKVPQLALQKVPNLKFLD 230 240 250 260 270 280 600 610 620 630 640 650 KIAA09 GVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAVTPAVRL KIAA14 LNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIH 290 300 310 320 330 340 966 residues in 1 query sequences 1986539 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:21:24 2008 done: Thu Dec 18 15:21:25 2008 Total Scan time: 0.650 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]