# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh04045s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0933.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0933, 2147 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827091 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4143+/-0.000184; mu= 15.0754+/- 0.010 mean_var=76.3430+/-15.005, 0's: 39 Z-trim: 39 B-trim: 404 in 1/65 Lambda= 0.146788 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|6693636|dbj|BAA89431.1| C21orf5 [Homo sapiens] (2298) 13974 2970.3 0 gi|116241321|sp|Q9Y3R5.4|DOP2_HUMAN RecName: Full= (2298) 13958 2966.9 0 gi|114684063|ref|XP_531552.2| PREDICTED: pad-1-lik (2298) 13925 2959.9 0 gi|4688898|emb|CAB41415.1| hypothetical protein [H (2298) 13914 2957.6 0 gi|74001431|ref|XP_544874.2| PREDICTED: similar to (2297) 12595 2678.2 0 gi|156630501|sp|Q3UHQ6.2|DOP2_MOUSE RecName: Full= (2295) 12134 2580.6 0 gi|62243808|ref|NP_081569.1| pad-1-like isoform 1 (2295) 12134 2580.6 0 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