# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ef03552.fasta.nr -Q ../query/KIAA0947.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0947, 2330 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7812868 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5124+/-0.000204; mu= 11.5104+/- 0.011 mean_var=145.1523+/-27.635, 0's: 50 Z-trim: 84 B-trim: 330 in 1/65 Lambda= 0.106454 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|149363685|ref|NP_056140.1| hypothetical protein (2266) 14932 2306.9 0 gi|51476593|emb|CAH18279.1| hypothetical protein [ (2104) 13881 2145.5 0 gi|31874114|emb|CAD97966.1| hypothetical protein [ (1510) 9957 1542.7 0 gi|119628518|gb|EAX08113.1| hCG16543 [Homo sapiens (1369) 9061 1405.0 0 gi|74003103|ref|XP_545182.2| PREDICTED: similar to (2203) 8710 1351.3 0 gi|34533624|dbj|BAC86755.1| unnamed protein produc (1127) 7138 1109.6 0 gi|148705081|gb|EDL37028.1| mCG2901, isoform CRA_b (1373) 5443 849.4 0 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