# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05590.fasta.huge -Q ../query/KIAA0956.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0956, 672 aa vs ./tmplib.23663 library 1986833 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5035+/- 0.005; mu= 15.2870+/- 0.340 mean_var=84.4083+/-19.791, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.139599 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1021 ( 1102 res) af10412 (1102) 1691 351.5 2.4e-97 KIAA0611 ( 912 res) hg00483 ( 912) 944 200.9 4.1e-52 KIAA1137 ( 933 res) hj03907 ( 933) 828 177.6 4.5e-45 KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082) 817 175.4 2.3e-44 KIAA1487 ( 650 res) fj07249 ( 650) 802 172.1 1.4e-43 KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498) 792 170.6 9.2e-43 KIAA0566 ( 1163 res) hh01910 (1163) 765 165.0 3.4e-41 KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049) 146 40.3 0.0011 KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203) 144 39.9 0.0016 >>KIAA1021 ( 1102 res) af10412 (1102 aa) initn: 2480 init1: 1079 opt: 1691 Z-score: 1839.6 bits: 351.5 E(): 2.4e-97 Smith-Waterman score: 2381; 57.920% identity (82.720% similar) in 625 aa overlap (1-601:454-1077) 10 20 30 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQLEYYASSPDEKALV : . ::: .: . .. : .::::: ::: KIAA10 IDSSPSVNGREREELFFRALCLCHTVQVKDDDSVDGPRKSPDGGKSCVYISSSPDEVALV 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 KIAA09 EAAARIGIVFIGNSEETMEV-KTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKLLFA :.. :.:.... ... ::. . ...::..::.:: ::: ::::::::.. .:: :: KIAA10 EGVQRLGFTYLRLKDNYMEILNRENHIERFELLEILSFDSVRRRMSVIVKSATGEIYLFC 490 500 510 520 530 540 90 100 110 120 130 140 KIAA09 KGAESSILPKCIGGEIEKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEARTAL :::.:::.:. : :.... : .:.. :..::::::.::... ..::: : : . :..:: KIAA10 KGADSSIFPRVIEGKVDQIRARVERNAVEGLRTLCVAYKRLIQEEYEGICKLLQAAKVAL 550 560 570 580 590 600 150 160 170 180 190 200 KIAA09 QQREEKLAAVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAV :.::.::: ... ::::: ::::::::::::.:. .:::::. :::::::::::: :::. KIAA10 QDREKKLAEAYEQIEKDLTLLGATAVEDRLQEKAADTIEALQKAGIKVWVLTGDKMETAA 610 620 630 640 650 660 210 220 230 240 250 KIAA09 SVSLSCGHFHRTMNILEL----INQKSDSECAEQLRQLARR----ITEDHV------IQ- .. .: :.:. ..::: :...: . .: . . : .:.:.. .: KIAA10 ATCYACKLFRRNTQLLELTTKRIEEQSLHDVLFELSKTVLRHSGSLTRDNLSGLSADMQD 670 680 690 700 710 720 260 270 280 290 300 KIAA09 HGLVVDGTSLSLALREHE--------KLFMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISP .::..::..::: .. .: .::.:.::.:::::::::::::::....:::.: KIAA10 YGLIIDGAALSLIMKPREDGSSGNYRELFLEICRSCSAVLCCRMAPLQKAQIVKLIKFSK 730 740 750 760 770 780 310 320 330 340 350 360 KIAA09 EKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFY :.:::::.:::::::::: :::::::..::::::::::::::: .:: :.:.:.:::::: KIAA10 EHPITLAIGDGANDVSMILEAHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFKHLKKMLLVHGHFY 790 800 810 820 830 840 370 380 390 400 410 420 KIAA09 YIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIYSLL ::::. ::::::::::::: :::::::.: ::::::::..::::::: :::::::.:::. KIAA10 YIRISELVQYFFYKNVCFIFPQFLYQFFCGFSQQTLYDTAYLTLYNISFTSLPILLYSLM 850 860 870 880 890 900 430 440 450 460 470 480 KIAA09 EQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAFIFFFGSYLLIGKDTSLLG :::: ::. ::::::..:: :: ..:.:::.::. :..::::.:... ..:.. . KIAA10 EQHVGIDVLKRDPTLYRDVAKNALLRWRVFIYWTLLGLFDALVFFFGAYFVF-ENTTVTS 910 920 930 940 950 960 490 500 510 520 530 540 KIAA09 NGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILW :::.:::::::::::::::.:::.:.::.::.::::::.: :::..:: ::::..::..: KIAA10 NGQIFGNWTFGTLVFTVMVFTVTLKLALDTHYWTWINHFVIWGSLLFYVVFSLLWGGVIW 970 980 990 1000 1010 1020 550 560 570 580 590 600 KIAA09 PFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVFDRHLHPTSTEKAQLTETN :::. : ::.::::.:::: ::.::.:.:. :. :..:::. :.: ::.::..: KIAA10 PFLNYQRMYYVFIQMLSSGPAWLAIVLLVTISLLPDVLKKVLCRQLWPTATERVQTKSQC 1030 1040 1050 1060 1070 1080 610 620 630 640 650 660 KIAA09 AGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHISRSWSASDPFYTNDRSILTLST KIAA10 LSVEQSTIFMLSQTSSSLSF 1090 1100 >>KIAA0611 ( 912 res) hg00483 (912 aa) initn: 818 init1: 299 opt: 944 Z-score: 1027.4 bits: 200.9 E(): 4.1e-52 Smith-Waterman score: 1004; 33.390% identity (65.758% similar) in 587 aa overlap (19-599:360-909) 10 20 30 40 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQLEYYASSPDEKALVEAAARIGIVFIGNSEETM : :::::: :::. . .:....: .. .: KIAA06 LCHNVTPVYESNGVTDQAEAEKQYEDSCRVYQASSPDEVALVQWTESVGLTLVGRDQSSM 330 340 350 360 370 380 50 60 70 80 90 100 KIAA09 EVKTLG-KLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPS-GEKLLFAKGAESSILPKCIGGEIE ...: : .. . .:.:. : . .::..::. : :: .. :::. .. : . KIAA06 QLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGAD--VVMAGIVQYND 390 400 410 420 430 440 110 120 130 140 150 160 KIAA09 KTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEARTALQQREEKLAAVFQFIEKD . . ..: .:::.: .: .... ..:.... : .:. ....: :.:.:.. .: . KIAA06 WLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARYVQAKLSVHDRSLKVATVIESLEME 450 460 470 480 490 500 170 180 190 200 210 220 KIAA09 LILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHF---HRTMN . :: :.:::.:: :: :.:.:: ::::::.::::: ::: . . . .:. .. .. KIAA06 MELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLETA-TCTAKNAHLVTRNQDIH 510 520 530 540 550 560 230 240 250 260 270 280 KIAA09 ILELINQKSDSECAEQLRQLARRITEDHVIQHGLVVDGTSLSLALREHEKLFMEVCRNCS ...:........ .: . :. : . .::..: :: . :. .: :::. .: KIAA06 VFRLVTNRGEAHL--ELNAFRRK----H--DCALVISGDSLEVCLKYYEYEFMELACQCP 570 580 590 600 610 290 300 310 320 330 340 KIAA09 AVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAAR ::.::: :: :::...::.. : .: :::::.::::::::. :.:. ::::.::. KIAA06 AVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGK-LTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQASL 620 630 640 650 660 670 350 360 370 380 390 400 KIAA09 NSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLY .:..:..:: :..::.:::. : : :.: :. .....:. : : ... :.. :: KIAA06 AADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVPLY 680 690 700 710 720 730 410 420 430 440 450 460 KIAA09 DSVYLTLYNICFTSLPILIYSL-LEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTIL .. . :. .: .:. .:: :.. : .: . : ::.:. :.: :: :::: :... KIAA06 QGFLIIGYSTIYTMFPV--FSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWVLI 740 750 760 770 780 790 470 480 490 500 510 520 KIAA09 GFSHAFIFFFGSYLLIGKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWI .. .. ...:. ::. .. : . . .. :: ...: . .:: . : :. KIAA06 SIYQGSTIMYGALLLFESE---------FVHIV--AISFTSLILTELLMVALTIQTWHWL 800 810 820 830 840 530 540 550 560 570 580 KIAA09 NHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLD .. :. : . :: . : :. ..: :: :: : . .. .:.:: : KIAA06 MTVAELLSLACY-IASLVF---LHEFI---DVY--FIATLSF--LWKVSVITLVSCLPLY 850 860 870 880 890 590 600 610 620 630 640 KIAA09 IIKKVFDRHLHPTSTEKAQLTETNAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPT ..: . :.. : : : KIAA06 VLK-YLRRRFSPPSYSKLTS 900 910 >>KIAA1137 ( 933 res) hj03907 (933 aa) initn: 1191 init1: 513 opt: 828 Z-score: 901.1 bits: 177.6 E(): 4.5e-45 Smith-Waterman score: 1339; 37.920% identity (68.000% similar) in 625 aa overlap (16-604:229-846) 10 20 30 40 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQLEYYASSPDEKALVEAAARIGIVFIGNSE .: : :.:::: ::: :: .:.:: . . KIAA11 AVKIGDPHTHEFFRLLSLCHTVMSEEKNEGELYYKAQSPDEGALVTAARNFGFVFRSRTP 200 210 220 230 240 250 50 60 70 80 90 100 KIAA09 ETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKLLFAKGAESSILPKCIGG-- .:. :. .: :.:: ::.:.. :.::::::. : :. :. :::.. .: . . KIAA11 KTITVHEMGTAITYQLLAILDFNNIRKRMSVIVRNPEGKIRLYCKGADTILLDRLHHSTQ 260 270 280 290 300 310 110 120 130 140 150 160 KIAA09 EIEKTRI-HVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEARTALQQREEKLAAVFQF :. .: . :..:.: .::::: .::. . . ::: .: ..: : ..::..::.... KIAA11 ELLNTTMDHLNEYAGEGLRTLVLAYKDLDEEYYEEWAERRLQASLAQDSREDRLASIYEE 320 330 340 350 360 370 170 180 190 200 210 220 KIAA09 IEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTM .:....::::::.::.::. : ::: : .:.::.:::::::.::::... :: . : KIAA11 VENNMMLLGATAIEDKLQQGVPETIALLTLANIKIWVLTGDKQETAVNIGYSCKMLTDDM 380 390 400 410 420 430 230 240 250 KIAA09 NILELINQKSDSECAEQLRQL-------ARRITEDHVIQ------------------HGL . . ... .. : :.::. .: . . . : ..: KIAA11 TEVFIVTGHTVLEVREELRKAREKMMDSSRSVGNGFTYQDKLSSSKLTSVLEAVAGEYAL 440 450 460 470 480 490 260 270 280 290 300 310 KIAA09 VVDGTSLSLALREHEKL-FMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGD :..: ::. ::. .: :.:. :.::.:::..:::::.:..:.: . .: .:::.:: KIAA11 VINGHSLAHALEADMELEFLETACACKAVICCRVTPLQKAQVVELVK-KYKKAVTLAIGD 500 510 520 530 540 550 320 330 340 350 360 370 KIAA09 GANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQY :::::::. ::.:.:: :.:: ::. :::....::::..::.:::.. :.:. .. : KIAA11 EANDVSMIKTAHIGVGISGQEGIQAVLASDYSFSQFKFLQRLLLVHGRWSYLRMCKFLCY 560 570 580 590 600 610 380 390 400 410 420 430 KIAA09 FFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIYSLLEQHVDPHVLQ ::::: : .: . :.: :: ::.::. ..::::: .::::.: .....: : . . KIAA11 FFYKNFAFTMVHFWFGFFCGFSAQTVYDQYFITLYNIVYTSLPVLAMGVFDQDVPEQRSM 620 630 640 650 660 670 440 450 460 470 480 490 KIAA09 NKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAFIFFFGSYLLIGKDTSLLGNGQMFGNWTF . : ::. . : :.. . :. :. . ..:: : ... : :. :. .: KIAA11 EYPKLYEPGQLNLLFNKREFFICIAQGIYTSVLMFFIPYGVFADATRDDGT-QLADYQSF 680 690 700 710 720 730 500 510 520 530 540 550 KIAA09 GTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYF--VFSLFYGGILWPFLGSQNM .. : : .::.:.:...:.: .:: :::. :::. :: .:.. .: :. .. .: KIAA11 AVTVATSLVIVVSVQIGLDTGYWTAINHFFIWGSLAVYFAILFAMHSNG-LFDMFPNQ-- 740 750 760 770 780 790 560 570 580 590 600 KIAA09 YFVFI----QLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVFDR-HLHPTSTEKAQLTETNAGI : :. . :.. ..:..:.: .:.:. . .. : : .:.: .. .. :. KIAA11 -FRFVGNAQNTLAQPTVWLTIVLTTVVCI-MPVVAFRFLRLNLKPDLSDTVRYTQLVRKK 800 810 820 830 840 850 610 620 630 640 650 660 KIAA09 KCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHISRSWSASDPFYTNDRSILTLSTMDS KIAA11 QKAQHRCMRRVGRTGSRRSGYAFSHQEGFGELIMSGKNMRLSSLALSSFTTRSSSSWIES 860 870 880 890 900 910 >>KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082 aa) initn: 1329 init1: 506 opt: 817 Z-score: 888.4 bits: 175.4 E(): 2.3e-44 Smith-Waterman score: 1365; 37.660% identity (68.750% similar) in 624 aa overlap (16-599:376-989) 10 20 30 40 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQLEYYASSPDEKALVEAAARIGIVFIGNSE .: : ..:::: ::: :: .:..: . . KIAA19 SIKMGDPKVHEFLRLLALCHTVMSEENSAGELIYQVQSPDEGALVTAARNFGFIFKSRTP 350 360 370 380 390 400 50 60 70 80 90 100 KIAA09 ETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKLLFAKGAESSILPKC-IGGE ::. .. :: : :.:: .:.:.. :.::::::. : :. :..:::.. .. : ..: KIAA19 ETITIEELGTLVTYQLLAFLDFNNTRKRMSVIVRNPEGQIKLYSKGADTILFEKLHPSNE 410 420 430 440 450 460 110 120 130 140 150 160 KIAA09 I--EKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEARTALQQREEKLAAVFQF . : :..::: .::::: :::: . .: ..: : . .: .: ..:.:..: ... KIAA19 VLLSLTSDHLSEFAGEGLRTLAIAYRDLDDKYFKEWHKMLEDANAATEERDERIAELYEE 470 480 490 500 510 520 170 180 190 200 210 220 KIAA09 IEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTM ::.::.:::::::::.::. : ::. .: .:.::.:::::::.:::.... .:. . : KIAA19 IERDLMLLGATAVEDKLQEGVIETVTSLSLANIKIWVLTGDKQETAINIGYACNMLTDDM 530 540 550 560 570 580 230 240 250 KIAA09 NILELINQKSDSECAEQLRQLA-------RRITEDHVI-------------------QHG : . .: .. : :.::. : ... ::. ... KIAA19 NDVFVIAGNNAVEVREELRKAKQNLFGQNRNFSNGHVVCEKKQQLELDSIVEETITGDYA 590 600 610 620 630 640 260 270 280 290 300 310 KIAA09 LVVDGTSLSLALREHEKL-FMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVG :...: ::. ::. : ..:. :..:.:::..:::::.:..:.: . .. .:::.: KIAA19 LIINGHSLAHALESDVKNDLLELACMCKTVICCRVTPLQKAQVVELVK-KYRNAVTLAIG 650 660 670 680 690 700 320 330 340 350 360 370 KIAA09 DGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQ :::::::::. ::.:.:: :.:: ::. :::..:.:..:..::.:::.. :.:. .. KIAA19 DGANDVSMIKSAHIGVGISGQEGLQAVLASDYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYFRMCKFLC 710 720 730 740 750 760 380 390 400 410 420 430 KIAA09 YFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIYSLLEQHVDPHVL :::::: : .: . :.: :: ::.::. ..::.:: .::::.: .....: :. . KIAA19 YFFYKNFAFTLVHFWFGFFCGFSAQTVYDQWFITLFNIVYTSLPVLAMGIFDQDVSDQNS 770 780 790 800 810 820 440 450 460 470 480 490 KIAA09 QNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAFIFFFGSYLLIGKDTSLLG-NGQMFGNW . : ::. . : :.. . :. .. :. ....:: : : .. : .:: .... KIAA19 VDCPQLYKPGQLNLLFNKRKFFICVLHGIYTSLVLFFIPY---GAFYNVAGEDGQHIADY 830 840 850 860 870 880 500 510 520 530 540 KIAA09 -TFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYF--VFSLFYGGIL------ .:.. . : .::.:.:..::.: .::.:::. :::: .:: .:.. .::. KIAA19 QSFAVTMATSLVIVVSVQIALDTSYWTFINHVFIWGSIAIYFSILFTMHSNGIFGIFPNQ 890 900 910 920 930 940 550 560 570 580 590 600 KIAA09 WPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVFDRHLHPTSTEKAQLTET .::.:. . :.. :..:.: .:. .. . . . :.:: ... KIAA19 FPFVGNAR------HSLTQKCIWLVILLTTVASVMPVVAFRFLKVDLYPTLSDQIRRWQK 950 960 970 980 990 610 620 630 640 650 660 KIAA09 NAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHISRSWSASDPFYTNDRSILTLS KIAA19 AQKKARPPSSRRPRTRRSSSRRSGYAFAHQEGYGELITSGKNMRAKNPPPTSGLEKTHYN 1000 1010 1020 1030 1040 1050 >>KIAA1487 ( 650 res) fj07249 (650 aa) initn: 1057 init1: 512 opt: 802 Z-score: 874.5 bits: 172.1 E(): 1.4e-43 Smith-Waterman score: 1144; 36.620% identity (66.549% similar) in 568 aa overlap (72-601:1-557) 50 60 70 80 90 KIAA09 GNSEETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAP-SGEKLLFAKGAESSIL--- .::::.:. : :.. ....:::.: :. KIAA14 KRMSVVVRHPLSNQVVVYTKGADSVIMELL 10 20 30 100 110 120 130 140 KIAA09 ----PKCIGGEI------EKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEART : . : :::. :.:..: .:::::::: . ... :: : . : :.: KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA09 ALQQREEKLAAVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHET ....::: : . .:. : :::::..:::::. : :.::::. ::::.:.:::::.:: KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 KIAA09 AVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKSDSEC----AEQLRQLARR---------ITEDHV-- ::... .: .. . . : ..: .: . : . :..: .. ..:: . KIAA14 AVNIAYAC-KLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKKTQALPEQVSLSEDLLQP 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 KIAA09 -------IQHGLVVDGTSLSLALREH-EKLFMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKI .. ::.. : .: .::.: .: :.:. :.::.::: .::::..:..:.. KIAA14 PVPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVVKLVR- 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 KIAA09 SPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGH : . .:::.::::::::::: : .:::. :.:: ::. ::.:...:: :::::.:::: KIAA14 SHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLLVHGH 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 KIAA09 FYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPILIYS . : :..... ::::::: ... : :::.: :: .. : : ..:. ::: : .::. KIAA14 WCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPPVIYG 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 KIAA09 LLEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAFIFFFGSYLLI-GKDTS .::. :. ..:.. : :::. .:.. .:: . .: .... :: :. :.::. KIAA14 VLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQGSDTD 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 KIAA09 LLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGG ... ::. . :. .. : .....:.. :::. :: :::. ::.:.. .:. KIAA14 IFA---------FGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYFLFAIVFGA 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 KIAA09 ILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVFDRHLHPTSTEKAQLT . .: :... . . . ... :: . :. .. .:.. : :. .:. KIAA14 MCVTCNPPSNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRAKHF 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 KIAA09 ETNAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHISRSWSASDPFYTNDRSILT KIAA14 DRLTPEERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRRPMPGPSAVFAMKSATSCAIEQ 560 570 580 590 600 610 >>KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498 aa) initn: 1087 init1: 535 opt: 792 Z-score: 859.6 bits: 170.6 E(): 9.2e-43 Smith-Waterman score: 1238; 36.971% identity (67.101% similar) in 614 aa overlap (10-580:745-1348) 10 20 30 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQLEYYASSPDEKALVEAAARIGIV ..:: .. : : :::: :::.:: ... KIAA07 GGYRSSMWDQGDILESGSGTSLEEALEAPATDLARPEFCYEAESPDEAALVHAAHAYSFT 720 730 740 750 760 770 40 50 60 70 80 90 KIAA09 FIGNSEETMEVKT-LGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAP-SGEKLLFAKGAESSIL ... . : . :. : ..:: : ::: :.::::.:. : .:: ....:::.: :. KIAA07 LVSRTPEQVTVRLPQGTCLTFSLLCTLGFDSVRKRMSVVVRHPLTGEIVVYTKGADSVIM 780 790 800 810 820 830 100 110 120 130 140 KIAA09 -----PKCIGG-EIEK--------TRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIF : :. ..:: :. :.: .: :::::::: . . ..... . KIAA07 DLLEDPACVPDINMEKKLRKIRARTQKHLDLYARDGLRTLCIAKKVVSEEDFRRWASFRR 840 850 860 870 880 890 150 160 170 180 190 200 KIAA09 EARTALQQREEKLAAVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGD ::...:..:.: : . : .:..: :::::..:::::. : .:: .:: :::..:::::: KIAA07 EAEASLDNRDELLMETAQHLENQLTLLGATGIEDRLQEGVPDTIATLREAGIQLWVLTGD 900 910 920 930 940 950 210 220 230 240 KIAA09 KHETAVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKSDS-----ECA----EQLRQLAR--------- :.::::... :: ...: .. . ...... .:: .:.:.: . KIAA07 KQETAVNIAHSCRLLNQTDTVYTINTENQETCESILNCALEELKQFRELQKPDRKLFGFR 960 970 980 990 1000 1010 250 260 270 280 290 KIAA09 ------RITEDHVI-QHGLVVDGTSLSLALR-EHEKLFMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAK :: . :. . :::.:: .:. .. . :: :.:. . : .::::: .::::. KIAA07 LPSKTPSITSEAVVPEAGLVIDGKTLNAIFQGKLEKKFLELTQYCRSVLCCRSTPLQKSM 1020 1030 1040 1050 1060 1070 300 310 320 330 340 350 KIAA09 VIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSK ...:.. . . .::..::::::::::: : .:::: :.:: ::. .::.::.::: :.: KIAA07 IVKLVR-DKLRVMTLSIGDGANDVSMIQAADIGIGISGQEGMQAVMSSDFAITRFKHLKK 1080 1090 1100 1110 1120 1130 360 370 380 390 400 410 KIAA09 LLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTS ::.::::. : :.: .: :..:::::... : :::.: ::..:. : . ..:. ::: KIAA07 LLLVHGHWCYSRLARMVVYYLYKNVCYVNLLFWYQFFCGFSSSTMIDYWQMIFFNLFFTS 1140 1150 1160 1170 1180 1190 420 430 440 450 460 470 KIAA09 LPILIYSLLEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAFIFFFGSYLL :: :....:.. .. ..: : ::.. .... ...:: . .: ...: :: :: KIAA07 LPPLVFGVLDKDISAETLLALPELYKSGQNSECYNLSTFWISMVDAFYQSLICFFIPYLA 1200 1210 1220 1230 1240 1250 480 490 500 510 520 530 KIAA09 I-GKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFV :.: ... :::: . :. . :. ...:.: . :: .. .: ::...::. KIAA07 YKGSDIDVF---------TFGTPINTISLTTILLHQAMEMKTWTIFHGVVLLGSFLMYFL 1260 1270 1280 1290 1300 540 550 560 570 580 590 KIAA09 FSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVFDRHLHPTS ::.:.. . : :.:. ::. . ... .: :. :. KIAA07 VSLLYNATCVICNSPTNPYWVMEGQLSNPTFYLVCFLTPVVALLPRYFFLSLQGTCGKSL 1310 1320 1330 1340 1350 1360 600 610 620 630 640 650 KIAA09 TEKAQLTETNAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHISRSWSASDPFYT KIAA07 ISKAQKIDKLPPDKRNLEIQSWRSRQRPAPVPEVARPTHHPVSSITGQDFSASTPKSSNP 1370 1380 1390 1400 1410 1420 >>KIAA0566 ( 1163 res) hh01910 (1163 aa) initn: 1089 init1: 510 opt: 765 Z-score: 831.4 bits: 165.0 E(): 3.4e-41 Smith-Waterman score: 1202; 34.406% identity (62.098% similar) in 715 aa overlap (8-670:341-1040) 10 20 30 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQ-----LEYYASSPDEKALVEA : :.:: : :.: : :::: ::: : KIAA05 SDGMLLRLEERLGQPTSAIASNGYSSQADNWASELAQEQESERELRYEAESPDEAALVYA 320 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 KIAA09 AARIGIVFIG--NSEETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAPSGEKL-LFA : . :.. ... ..:. ::.: ..::: : ::: :.::::... : ... ... KIAA05 ARAYNCVLVERLHDQVSVELPHLGRLT-FELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYT 380 390 400 410 420 90 100 110 120 130 KIAA09 KGAESSI---LPKCIGGEIE---------KTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEE :::.: . : : . . . ::. ... .: .:::::::: : ....:: KIAA05 KGADSVVMDLLQPCSSVDARGRHQKKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYAC 430 440 450 460 470 480 140 150 160 170 180 190 KIAA09 IDKRIFEARTALQQREEKLAAVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKV . .::...:.. :: : .: .: :::::..:::::: : ::: ::.::... KIAA05 WLQSHLEAESSLENSEELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQI 490 500 510 520 530 540 200 210 220 230 240 KIAA09 WVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKSDSECAE---------QLRQLAR--R :::::::.::::... .: . . ... : : :. :: : : : : . KIAA05 WVLTGDKQETAVNIAYACKLLDHDEEVITL-NATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPE 550 560 570 580 590 600 250 260 270 280 KIAA09 ITEDHVIQH-----------------GLVVDGTSLSLALREH-EKLFMEVCRNCSAVLCC :. .: .. .::.:: ::. ::... : :. . ..: .:::: KIAA05 KTKGKVSMRFSSLCPPSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCC 610 620 630 640 650 660 290 300 310 320 330 340 KIAA09 RMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYA : .::::. :..:.. : : .:::.::::::::::: : ::.:: :.:: ::. ::.: KIAA05 RSTPLQKSMVVKLVR-SKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFA 670 680 690 700 710 720 350 360 370 380 390 400 KIAA09 IARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYL . .:..: .::..:::. : :.:..: ::::::. :. : .::.: :: .:. :. :: KIAA05 VPKFRYLERLLILHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYL 730 740 750 760 770 780 410 420 430 440 450 460 KIAA09 TLYNICFTSLPILIYSLLEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAF ..:. :.::: :. ..:.. : .:: ..: ::.. .. . .:: . . ... KIAA05 IFFNLLFSSLPPLVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSL 790 800 810 820 830 840 470 480 490 500 510 520 KIAA09 IFFFGSYLLIGKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTW . : :: :. : ..: :.:: . :. ..: .....::. :::.: .. KIAA05 VCFSIPYLAY-YDS----NVDLF---TWGTPIVTIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCG 850 860 870 880 890 530 540 550 560 570 580 KIAA09 GSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVF :....:. .:.:.. .: :... ::.. ... .. :. :. .. . . KIAA05 FSVLLFFTVALIYNASCATCYPPSNPYWTMQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSL 900 910 920 930 940 950 590 600 610 620 630 640 KIAA09 DRHLHPTSTEKAQLTETNAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTHI---S . .. ::. . :. .. .: : .:. : : :. :: : . . KIAA05 QGRVFPTQLQLARQLTRKSPRRCSAPKETFAQGRLPKDS-GT--EHSSGRTVKTSVPLSQ 960 970 980 990 1000 1010 650 660 670 KIAA09 RSWSASDPFYTNDRSILTLSTMDSSTC :: ...: . . : ::.: : KIAA05 PSWHTQQPVCSLEASGEP-STVDMSMPVREHTLLEGLSAPAPMSSAPGEAVLRSPGGCPE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>KIAA0778 ( 1049 res) fh12074 (1049 aa) initn: 112 init1: 66 opt: 146 Z-score: 158.2 bits: 40.3 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 195; 20.139% identity (53.241% similar) in 432 aa overlap (65-486:507-911) 40 50 60 70 80 90 KIAA09 RIGIVFIGNSEETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDS-DRRRMSVIVQAPSGEK-LLFAKGA . :.: .. ..:. . : .. .: ::: KIAA07 DASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNSTNKYQLSIHEREDSPQSHVLVMKGA 480 490 500 510 520 530 100 110 120 130 140 150 KIAA09 ESSILPKCIGGEIEKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEARTALQQR :: .: .. .: .:. .... :: .. . . . .. .. : KIAA07 PERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQN---AYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPR 540 550 560 570 580 590 160 170 180 190 200 210 KIAA09 EEKLAA-VFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSV :. . ..: . : ..: .. : . : ... : ::::: ..:::. :: .. 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KIAA07 L--LFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAI--SLAYEAAESDIMKRQP---RNSQTDK 820 830 840 850 860 450 460 470 480 490 500 KIAA09 LLSIKTF-LYWTILGFSHAFIFFFGSYLLIGKD----TSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVM :.. . . . . .:. .:. :: ....... . ::: KIAA07 LVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDSYG 870 880 890 900 910 920 510 520 530 540 550 560 KIAA09 VITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSS KIAA07 QEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEETA 930 940 950 960 970 980 >>KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203 aa) initn: 81 init1: 81 opt: 144 Z-score: 155.3 bits: 39.9 E(): 0.0016 Smith-Waterman score: 162; 23.006% identity (53.067% similar) in 326 aa overlap (24-334:588-881) 10 20 30 40 50 KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQLEYYASSPDEKALVEAAARIGIVFIGNSEETMEVKTL : :::.. : . . ...: . ... 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KIAA18 LQPPSEKGRQCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLI 780 790 800 810 820 830 280 290 300 310 320 330 KIAA09 CRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEG . . . :.:: :: :: .: .:: :::.:::. ...: ::.... KIAA18 PH---VQVFARVAPKQKEFVITSLK--ELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAP 840 850 860 870 880 340 350 360 370 380 390 KIAA09 RQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFS KIAA18 ERVVERRRRPRDSPTLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDEST 890 900 910 920 930 940 672 residues in 1 query sequences 1986833 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:23:03 2008 done: Thu Dec 18 15:23:04 2008 Total Scan time: 0.530 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]