# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj05670.fasta.huge -Q ../query/KIAA0957.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0957, 693 aa vs ./tmplib.23663 library 1986812 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7105+/-0.00651; mu= 2.8160+/- 0.443 mean_var=191.9587+/-46.288, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 288 in 2/38 Lambda= 0.092570 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 451 72.9 1.3e-13 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 447 72.7 3.3e-13 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 415 68.2 4.5e-12 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 384 64.4 1.4e-10 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 374 62.7 1.9e-10 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 371 62.3 2.6e-10 KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180) 348 59.3 2.4e-09 KIAA1323 ( 396 res) fh13878 ( 396) 272 48.7 1.2e-06 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 271 48.9 2.4e-06 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 268 48.5 3.4e-06 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 264 48.2 7.1e-06 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 260 47.6 9.3e-06 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 253 46.3 9.9e-06 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 248 45.7 1.5e-05 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 246 45.7 3.1e-05 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 238 44.8 8.7e-05 KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 225 42.6 0.00013 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 219 42.2 0.00047 KIAA0946 ( 667 res) hj04787 ( 667) 208 40.4 0.00067 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 207 40.6 0.0014 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 200 39.7 0.003 KIAA1518 ( 876 res) sh00483 ( 876) 186 37.5 0.0062 >>KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 (803 aa) initn: 614 init1: 219 opt: 451 Z-score: 336.3 bits: 72.9 E(): 1.3e-13 Smith-Waterman score: 451; 30.108% identity (62.366% similar) in 279 aa overlap (13-287:359-635) 10 20 30 40 KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVAVT-- ..: .: .:. ..:. .. : KIAA18 GLSQGPGKETLESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKME 330 340 350 360 370 380 50 60 70 80 90 KIAA09 -KHGRTPLHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEG .. :.::: ::. ::. . ..:..:: ..:. .. ..: : .:. .. : . ::. : KIAA18 HQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAG 390 400 410 420 430 440 100 110 120 130 140 150 KIAA09 CALDRQDKDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGA-NVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQST .: .: .:.: :: :. .: . .. :.. : .: .. .: : . : . .: . . KIAA18 ALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLV 450 460 470 480 490 500 160 170 180 190 200 210 KIAA09 RVLLLAGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAAL ..:: :: ....: . ::: :: . ..: ..::.: :..: : ::. ::.:: KIAA18 KLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARE 510 520 530 540 550 560 220 230 240 250 260 270 KIAA09 NHKKVAKILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVALLLTKAPQGSVSAGDTPSSEQ :. . ..: .:.:. :. :.:::. : ... :: ..:: : : : : :: . 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KIAA12 AGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATM 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 KIAA09 AKILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVA-LLLTKAPQGSV--SAGDTPSSEQAV .. .:. . :: : .. :.::: : : ::. ::: :. . :. . :::: KIAA12 VRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAKVSAVDKKGDTPLHIAIR 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 KIAA09 ARKEEAREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFSDPTPPADQQPGHQKNLHAHNHPKKR .:... : .: : : : ::. .. . : . . .:::.. .. KIAA12 GRSRKLAELLL------RNPKDGRLLYRPNKAGET----PYNIDCSHQKSILTQIFGA-- 390 400 410 420 430 350 360 370 380 390 KIAA09 NRHRCSSPPPPHEFRAYQLYT--LYRGKDGKVMQAPIN-------GCRCEPLINKLENQL :: : .. .:.::. : . .:: :: : :..:::... KIAA12 -RH-LSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSFLLKKLEDEM 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 KIAA09 EATVEEIKAELGSVQDKMNTKLGQMENKTQHQMRVLDKLMVERLSAERTECLNRLQQHSD . KIAA12 KTFAGQQIEPLFQFSWLIVFLTLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFFIVI 490 500 510 520 530 540 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 1335 init1: 363 opt: 415 Z-score: 308.6 bits: 68.2 E(): 4.5e-12 Smith-Waterman score: 428; 33.333% identity (59.524% similar) in 294 aa overlap (18-302:212-505) 10 20 30 40 KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVAVTK-HGRTP :::.:. . : :...:: . . ::.:: KIAA12 LEREDSIRTLLDNGASVNQCDSNGRTLLANAAYSGSLDVVNLLVSRGADLEIEDAHGHTP 190 200 210 220 230 240 50 60 70 80 90 100 KIAA09 LHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCALDRQD : ::: .:: ::. :. : ... :. :::. :. :.::...::.. : .: : KIAA12 LTLAARQGHTKVVNCLIGCGANINHTDQDGWTALRSAAWGGHTEVVSALLYAGVKVDCAD 250 260 270 280 290 300 110 120 130 140 150 160 KIAA09 KDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLLLAGS :. :.:. :.: : . . :.. ::.: .. : ::: : .: . .. :: :. KIAA12 ADSRTVLRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNKADNEGRTALIAAAYMGHREIVEHLLDHGA 310 320 330 340 350 360 170 180 190 200 210 220 KIAA09 RADLKNNAGDTCLHVAA-----RYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALNHK ... .. : : : ::: .: :.. ::. : . .. : : : ::: .: KIAA12 EVNHEDVDGRTALSVAALCVPASKGHASVVSLLIDRGAEVDHCDKDGMTPLLVAAYEGHV 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 KIAA09 KVAKILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVA--LLLTKAPQGSV-SAGDTPSSEQ :. .:::.:::. ..: :.::: .: .. :. ::. : :. : : : : KIAA12 DVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAVDSIDSEGRTVLSIA 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 KIAA09 AVARKEEAREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFSDPTPPADQQPGHQKNLHAHNHPK .. . :. . .:. . . .:: KIAA12 SAQGNVEVVRTLLDRGLDENHRDDAGWTPLHMAAFEGHRLICEALIEQGARTNEIDNDGR 490 500 510 520 530 540 >>KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486 aa) initn: 492 init1: 200 opt: 384 Z-score: 281.6 bits: 64.4 E(): 1.4e-10 Smith-Waterman score: 438; 27.402% identity (54.982% similar) in 562 aa overlap (15-538:289-831) 10 20 30 40 KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGA-RVAVTKHG : .: :::. : : :.. :: . : . KIAA06 GSAGHVEVARLLLENGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLEMVRFLLEAGADQEHKTDEM 260 270 280 290 300 310 50 60 70 80 90 100 KIAA09 RTPLHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCALD .: : : ::. :...:: .: .... :. .. : :. :..:. : ::..: .:. KIAA06 HTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGASLE 320 330 340 350 360 370 110 120 130 140 150 160 KIAA09 RQDKDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGANVLAKNK-AGNTALHLACQNSHSQSTRVLL . . .: : : ::. .: . . ::. :::. :... . .::: ::: .. . . :. KIAA06 EVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLGQGANINAQTEETQETALTLACCGGFLEVADFLI 380 390 400 410 420 430 170 180 190 200 210 220 KIAA09 LAGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALNHKK ::. .: . : : ::. .:: ... ::.: .:: . .::::: : .: KIAA06 KAGADIELGCS---TPLMEAAQEGHLELVKYLLAAGANVHATTATGDTALTYACENGHTD 440 450 460 470 480 490 230 240 250 260 270 KIAA09 VAKILLEAGADTTIVNNAGQTPL-ETARYHNNPEVALLLTKAPQ--GSVSAGDTPSSEQA :: .::.:::: ...:.::: ..:: . : .:..:. . ... .: : KIAA06 VADVLLQAGADLEHESEGGRTPLMKAARAGHVCTVQFLISKGANVNRTTANNDHTVLSLA 500 510 520 530 540 550 280 290 300 310 320 KIAA09 VARKEEAREEFL---SASPEPRAKD------DRRRKSRPKVSAF---------SDPTPPA : . : :.: .:.: : :: . . .. .: . : : : . KIAA06 CAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTSVVCYLLDYPNNLLSAPPPDV 560 570 580 590 600 610 330 340 350 360 370 KIAA09 DQ--QPGHQKNLHAHNHPKKRNRHRCSSPPPPHEFRAYQLYTL-YRGKDGKVMQA----P : :.:. : .: : . : : . : :: :.: .. ... : KIAA06 TQLTPPSHDLN-RAPRVPVQ-ALPMVVPPQEPDKPPANVATTLPIRNKAASKQKSSSHLP 620 630 640 650 660 670 380 390 400 410 420 430 KIAA09 INGCRCEPLINKLENQL-EATVEEIKAELGSVQDKMNTKLGQMENKTQHQMRVLDKLMVE :. . . . . :: :. ::: ...: ...... . . . :.. :. .. KIAA06 ANS---QDVQGYITNQSPESIVEEAQGKLTELEQRIKEAI-----EKNAQLQSLELAHAD 680 690 700 710 720 440 450 460 470 480 490 KIAA09 RLSAERTECLNRLQQHSDTEKHE--GEKRQISLVDELKTWCMLKIQNLEQKLSGDSRACR .:. :. : ::. .... .:.. : ... .::: .:: : :: : . : KIAA06 QLTKEKIEELNKTREEQIQKKQKILEELQKVERELQLKTQQQLKKQYLEVKAQ---RIQL 730 740 750 760 770 780 500 510 520 530 540 KIAA09 AKSTPSTCE-----SSTGVDQLVVTAGPAAASDSSPPVVRPKEKALNSTATQRLQQELSS .. ..:. . .:: . . . : : .. ::. : ..::.: KIAA06 QQQQQQSCQHLGLLTPVGVGEQL-SEGDYARLQQVDPVLLKDEP--QQTAAQMGFAPIQP 790 800 810 820 830 550 560 570 580 590 600 KIAA09 SDCTGSRLRNVKVQTALLPMNEAARSDQQAGPCVNRGTQTKKSGKSGPTRHRAQQPAASS KIAA06 LAMPQALPLAAGPLPPGSIANLTELQGVIVGQPVLGQAQLAGLGQGILTETQQGLMVASP 840 850 860 870 880 890 >>KIAA1334 ( 989 res) fh15842 (989 aa) initn: 360 init1: 308 opt: 374 Z-score: 279.5 bits: 62.7 E(): 1.9e-10 Smith-Waterman score: 405; 22.616% identity (53.815% similar) in 734 aa overlap (13-691:30-717) 10 20 30 40 KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINK-GARVAVTKH .::: :. .:..:.:..:..: :: ..::: KIAA13 SFGRLNALNMKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGA--SATKH 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 KIAA09 ---GRTPLHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEG :.: .:::: :::. ..... : :. .:: ..::: :. .. : : :.. KIAA13 DSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSK 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 KIAA09 CALDRQDKDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTR : . :..:.:::: :. .: :....: . . . :. :: : :: ::.::. . KIAA13 CPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICH 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 KIAA09 VLLLAGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALN :: : :: :. .:..: ::: .: .. KIAA13 FLLDHG--AD-------------------------------VNSRNKSGRTALMLACEIG 180 190 200 220 230 240 250 260 270 KIAA09 HKKVAKILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEV-ALLLTKAPQGS-VSAGDTPSSE ..... :.. ::: ..:.. : . :. .. .: . .:::.: : . ... :... KIAA13 SSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSKISQDADLKTPTKPKQH 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 KIAA09 QAVARKEEARE---EFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFSDPTPPADQQPGHQKNLHAH . :.. : . .: : : . . : :. : : : .. . ..:. KIAA13 DQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPR-SITSTPLSGKESVFFAEPPFKAE 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 KIAA09 NHPKKRNRHRCSSPPPPHEFRAYQLYTLYRGKDGK----VMQAPINGCRCEPLINK-LEN ..:. : :. : .: . : . ..:: . . : :: :.. KIAA13 ISSIRENKDRLSDSTTG----ADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT---LHNKELQD 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 KIAA09 QLEA-TVEEIKAELG-----SVQDKMNTKLGQMENKTQHQMRVLDKLMVERLSAERTECL .:.: . .: .:.:. :.: .. .::. . . . . ..... :. :. KIAA13 KLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSLGKSTTDND 380 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 KIAA09 NRLQQHSDT--------EKHEGEKRQISLVDELKTWCMLKIQNLEQKLSGDSRACRAKST :.:: .. :. :.:..:... . . .. ..: : . .... . . : : KIAA13 VRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSDLSQKLKET 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 KIAA09 PSTCES------STGVDQLVVTAGPAAASDSSP-PVVRPKEKALNSTATQRLQQELSSSD : : :. .. . ..: . .. : .: :. .: . : ::. : :. KIAA13 QSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEIN-VLKQDLQNALEESE 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 KIAA09 CTGSRLRNVKVQ-------TALLPMNEAARSDQQAGPCVNRGTQTKKSGKSGPTRHRAQQ . ..:... . :.. : : ..... : ...:... ..::. KIAA13 RNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEE-YEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEKYQEAQE 560 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 KIAA09 PA--------ASSTCGQPPPATGSEQTGPHIRD--TSQALELTQYFFEAVSTQMEKWYER .. : : ... .. : ..:. ::.: . :: ....: . .: KIAA13 EIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEA-QAELEDYRKR 620 630 640 650 660 670 660 670 680 690 KIAA09 K-IEEARSQANQKAQQDKATLKEHIK--SLEEELAKLRTRVQKEN : .:.. .. .::...: ... . :. :...... .: KIAA13 KSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKE 680 690 700 710 720 730 KIAA13 NSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVP 740 750 760 770 780 790 >>KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059 aa) initn: 865 init1: 355 opt: 371 Z-score: 277.0 bits: 62.3 E(): 2.6e-10 Smith-Waterman score: 399; 33.740% identity (61.382% similar) in 246 aa overlap (18-260:186-430) 10 20 30 40 KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVAVT-KHGRTP ::: :. : : :...::.:. :.. :: KIAA03 SGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSYTP 160 170 180 190 200 210 50 60 70 80 90 100 KIAA09 LHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCALDRQD :: ::..: . ::. :: : :.. . .: :: : :. .. :: : ..... KIAA03 LHAAASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKN 220 230 240 250 260 270 110 120 130 140 150 160 KIAA09 KDGNTALH--EASWHGFSQSAKLLVKAGANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLLLA . : : :: :: :: . .::: ::.: :.: :.: ::.. ... . ..... . KIAA03 EKGFTPLHFAAASTHG-ALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQS 280 290 300 310 320 330 170 180 190 200 210 220 KIAA09 GSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALNHKKVA :. : ... :.: ::.::::.: .: :.:. .. ... : ::.:: . . 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KIAA13 AMRVLLSKLPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQ 10 20 30 40 140 150 160 170 180 190 KIAA09 G-ANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLLLAGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSI : ::. .: .:::::: . .:.: .:.:. ::.. :.... ::: :: : :.. :: KIAA13 GNANLDIQNVNQQTALHLAVERQHTQIVRLLVRAGAKLDIQDKDGDTPLHEALRHHTLSQ 50 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 KIAA09 IRLL--LTAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALN--HKK----VAKILLEAGADTTIVNNAGQ .: : . .: . . ..: .. . . .:: .: .: ::: .: :. :: KIAA13 LRQLQDMQDVGKVDAAWEPSKNTLIMGLGTQGAEKKSAASIACFLAANGADLSIRNKKGQ 110 120 130 140 150 160 250 260 270 280 290 300 KIAA09 TPLETARYHNNPEVALLLTKAPQGSVSAGDTPSSEQAVARKEEAREEFLSASPEPRAKDD .::. .:.. :.: . .::. : . .. :. :: . : : KIAA13 SPLDLC---PDPNLCKALAKCHKEKVSGQVGSRSPSMISNDSETLEECMVCSDMKRDTLF 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 KIAA09 RRRKSRPKVSAFSDPTPPADQQPGHQKNLHAHNHPKKRNRHRCSSPPPPHEFRAYQLYTL KIAA13 GPCGHIATCSLCSPRVKKCLICKEQVQSRTKIEECVVCSDKKAAVLFQPCGHMCACENCA 230 240 250 260 270 280 >>KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) (862 aa) initn: 463 init1: 245 opt: 271 Z-score: 205.9 bits: 48.9 E(): 2.4e-06 Smith-Waterman score: 343; 23.648% identity (53.168% similar) in 647 aa overlap (60-660:22-645) 30 40 50 60 70 80 KIAA09 LINKGARVAVTKHGRTPLHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQDDGDQTA-LHRATVVGN :. : :. .. :: : . : .:. .. 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KIAA19 GATPLIIAAQMCHTDLCRLLLQQGAAANDQDLQGRTALMLACEGASPETVEVLL---QGG 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 KIAA09 VSAGDTPSSEQAVARKEE-AREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFS-DPTPPADQQP .. : : . : .:. : .... . :. : : : ::.. : . :..: KIAA19 AQPGITDALGQDAAHYGALAGDKLILHLLQEAAQ----RPSPP--SALTEDDSGEASSQN 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 KIAA09 GHQKNLHAHNHPKKRNRHRCSSPPP-----PHEFRAYQLYTLYRGKDGKVMQAPINGCRC . ... .. ::::. . ::: : . ::. . : . :...: : : . KIAA19 SMSSH-GKQGAPKKRK----APPPPASIPMPDDRDAYEEIVRLRQERGRLLQK-IRGLEQ 290 300 310 320 330 390 400 410 420 KIAA09 EPLINKLENQ-------LEATVEEI----------KAELGSVQDKMNTKLGQMENK---T . . :. :: :.:. : :: ......:. .::. : KIAA19 HKEQRQQESPEASSLHILERQVQELQQLLVERQEEKESLGREVESLQSRLSLLENERENT 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 KIAA09 QHQMRVLDKLMVERLSAERTECLNRLQQHSDTEKHEGE-KRQISLVDELKTWCMLKIQNL .... .:. : . .: : : ....: . ..:.... . . : :.: : KIAA19 SYDVTTLQDEEGELPDLPGAEVLLSRQLSPSAQEHLASLQEQVAVLTRQNQELMEKVQIL 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 KIAA09 EQKLSGDSRA---CRAKSTPSTCESSTGV--DQLVVTAGPAAASDSSPPVVR-PKEKALN :. . ... :. : . .: . ::: . : . . . . :.:.. KIAA19 ENFEKDETQMEVEALAEVIPLALYDSLRAEFDQLRRQHAEALQALRQQETREVPREEGAA 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 KIAA09 STATQRLQQELSSSDCTGSRLRNVKVQTALLP---MNEAARSDQQAGPCVNRGTQTKKSG ..:.... : . ..... .. : .: : :..:. . ..: .. 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KIAA19 ATGAKATGAEATGAKVTETKPTGAEVREMETTEEEANMETKPTGAQATDTETTGVEAMGV 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 KIAA09 QMEKWYERKIEEARSQANQKAQQDKATLKEHIKSLEEELAKLRTRVQKEN . : : :::. :: KIAA19 EATK---TKAEEAEMQAYGVGAGQAEPPVTGTTNMEATGSRATGMEATGVSATGVENPGV 640 650 660 670 680 >>KIAA2015 ( 996 res) fk09763 (996 aa) initn: 318 init1: 254 opt: 268 Z-score: 203.0 bits: 48.5 E(): 3.4e-06 Smith-Waterman score: 280; 24.115% identity (50.422% similar) in 593 aa overlap (47-601:42-599) 20 30 40 50 60 70 KIAA09 VAAYKGQTENVVQLINKGARVAVTKHGRTPLHLAANKGHLPVVQ-ILLKAGCDLDVQDDG .: :: :: :. : . :::..: KIAA20 GRRLGQALLSSMDQEYAGPGYDIRDWELRKIHRAAIKGDAAEVERCLTRRFRDLDARDRK 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 KIAA09 DQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCALDRQDKDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGANV :.:.:: : . : ..... :.:. : .: :. . : : .: : .:.. ::: KIAA20 DRTVLHLACAHGRVQVVTLLLHRRCQIDICDRLNRTPLMKAVHSQEEACAIVLLECGANP 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 KIAA09 LAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLLLAGSRADLKNNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLL :. :::::: : :. .. .. :: . . :. :.: : : . ....:: KIAA20 NIKDIYGNTALHYAVYNKGTSLAERLLSHHANIEALNKEGNTPLLFAINSRRQHMVEFLL 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 KIAA09 TAFCSVHEKNQAGDTALHVAAALNHKKVAKILLEAGADTTIVNNAGQTP--------LET ..: .. ::: .:. : .... .::. . . . ::: :.. 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KIAA20 R--KEKKYIQEIKSITEINA-NFEKSVRLNEKMITKTVARYSQQLNDLKAE-NARLNSEL 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 KIAA09 NKTQHQMRVLDKLMVERLSA-------ERTECLNR------LQQHSDTEKHEGEKRQIS- .: .:. . :. :: : . : .: ..: : . .:. .:: .:: KIAA20 EKEKHNKERLEA-EVESLHSSLATAINEYNEIVERKDLELVLWRADDVSRHEKMGSNISQ 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA09 LVD--ELKTWCMLKIQNLEQKLSGDSRACRAKSTPSTCESSTGVDQLVVTAGPAAASDSS :.: :: : . : . . :.: : : .: . : :: : KIAA20 LTDKNELLTEQVHKARVKFNTLKGKLRETRDALREKTL--ALGSVQL----------DLR 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 KIAA09 PPVVRPKE-KALNSTATQRLQQELSSSDCTGSRLRNVKVQTALLP--MNEAARSDQQAGP : :: : .. .. . .: ..... :.:. .... :: ...: . .. KIAA20 QAQHRIKEMKQMHPNGEAKESQSIGKQNSLEERIRQQELENLLLERQLEDARKEGDNKEI 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 KIAA09 CVNRGTQTKKSGKSGPTRHRAQQPAASSTCGQPPPATGSEQTGPHIRDTSQALELTQYFF .: . ..:: ..: .. KIAA20 VINIHRDCLENGKEDLLEERNKELMKEYNYLKEKLLQCEKEKAEREVIVREFQEELVDHL 580 590 600 610 620 630 693 residues in 1 query sequences 1986812 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:23:05 2008 done: Thu Dec 18 15:23:06 2008 Total Scan time: 0.550 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]