# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj06525.fasta.huge -Q ../query/KIAA0969.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0969, 1091 aa vs ./tmplib.23663 library 1986414 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5160+/-0.00969; mu= -6.8709+/- 0.657 mean_var=434.6439+/-105.150, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.061519 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1686 ( 1175 res) fh25862s1 (1175) 693 76.6 2.2e-14 >>KIAA1686 ( 1175 res) fh25862s1 (1175 aa) initn: 1229 init1: 511 opt: 693 Z-score: 350.0 bits: 76.6 E(): 2.2e-14 Smith-Waterman score: 1552; 31.255% identity (57.456% similar) in 1187 aa overlap (1-1078:66-1168) 10 20 30 KIAA09 SFPARGSHLRSRHNERRNTFLHPVTGQVPE .. .:.. ::::. : :::::: . 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