# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj08124.fasta.huge -Q ../query/KIAA0986.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0986, 1458 aa vs ./tmplib.23663 library 1986047 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5526+/-0.00555; mu= 19.2394+/- 0.379 mean_var=96.3953+/-21.641, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.130631 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0532 ( 1637 res) hg03377 (1637) 308 70.1 3.9e-12 KIAA0453 ( 3209 res) ff02431 (3209) 288 66.7 7.9e-11 >>KIAA0532 ( 1637 res) hg03377 (1637 aa) initn: 461 init1: 282 opt: 308 Z-score: 309.8 bits: 70.1 E(): 3.9e-12 Smith-Waterman score: 382; 28.483% identity (60.372% similar) in 323 aa overlap (1107-1400:1133-1452) 1080 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA09 RLDLGFIYALTDLMTEAEVTENTEVELFHKDIEAFKEEYKTASL-VDQSQV----SLYE- ::. :. : : : : :... : .:.. 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