# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03795mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1009.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1009, 1345 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7808788 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4717+/-0.000201; mu= 8.6608+/- 0.011 mean_var=140.9420+/-26.963, 0's: 29 Z-trim: 123 B-trim: 356 in 2/65 Lambda= 0.108032 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119569029|gb|EAW48644.1| chromosome 6 open read (1401) 8458 1331.3 0 gi|109071904|ref|XP_001086275.1| PREDICTED: simila (1325) 8038 1265.8 0 gi|73973878|ref|XP_532220.2| PREDICTED: similar to (1405) 7217 1137.8 0 gi|109485065|ref|XP_001063109.1| PREDICTED: simila (1403) 6396 1009.9 0 gi|158563784|sp|Q4KLH6.2|QN1_RAT RecName: Full=Pro (1403) 6391 1009.1 0 gi|148694577|gb|EDL26524.1| mCG11890, isoform CRA_ (1406) 6333 1000.1 0 gi|148694578|gb|EDL26525.1| mCG11890, isoform CRA_ (1366) 5968 943.2 0 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